MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_020127	TTC	2	6	674989	674994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18002	NC_020127	AGG	2	6	675000	675005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_020127	GAC	2	6	675074	675079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_020127	GTG	2	6	675128	675133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_020127	GT	3	6	675143	675148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_020127	T	6	6	675252	675257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_020127	TGC	2	6	675282	675287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_020127	TG	3	6	675292	675297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_020127	GTA	2	6	675305	675310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_020127	GT	3	6	675312	675317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_020127	ATG	2	6	675337	675342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_020127	CGT	2	6	675349	675354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_020127	TCC	2	6	675363	675368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18014	NC_020127	TC	3	6	675385	675390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18015	NC_020127	GAC	2	6	675477	675482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18016	NC_020127	GCA	2	6	675489	675494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_020127	TTC	2	6	675567	675572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_020127	GCC	2	6	675807	675812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18019	NC_020127	TCC	2	6	675827	675832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18020	NC_020127	TA	3	6	675947	675952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_020127	ACC	2	6	675953	675958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18022	NC_020127	CG	3	6	675961	675966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18023	NC_020127	GCT	2	6	676017	676022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18024	NC_020127	CCAT	2	8	676083	676090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18025	NC_020127	C	6	6	676096	676101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18026	NC_020127	CTG	2	6	676186	676191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18027	NC_020127	GTTCCA	2	12	676215	676226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_020127	CAT	2	6	676259	676264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_020127	TACA	2	8	676331	676338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18030	NC_020127	CGC	2	6	676507	676512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18031	NC_020127	TA	3	6	676564	676569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_020127	AAC	2	6	676629	676634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_020127	CTT	2	6	676645	676650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_020127	CAG	2	6	676663	676668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_020127	AG	3	6	676667	676672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_020127	CAA	2	6	676703	676708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_020127	T	6	6	676710	676715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_020127	A	7	7	676720	676726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_020127	A	6	6	676763	676768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_020127	TAC	2	6	676870	676875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_020127	A	6	6	676900	676905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_020127	TA	3	6	676988	676993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_020127	A	6	6	677076	677081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_020127	ACT	2	6	677086	677091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18045	NC_020127	A	6	6	677102	677107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_020127	TTA	2	6	677153	677158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555828
18047	NC_020127	T	6	6	677170	677175	0 %	100 %	0 %	0 %	442555828
18048	NC_020127	ATTT	3	12	677190	677201	25 %	75 %	0 %	0 %	442555828
18049	NC_020127	TAA	2	6	677235	677240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555828
18050	NC_020127	ATA	2	6	677249	677254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555828
18051	NC_020127	GAA	2	6	677284	677289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555828
18052	NC_020127	TAT	2	6	677301	677306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555828
18053	NC_020127	ATT	2	6	677325	677330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555828
18054	NC_020127	ATCA	2	8	677345	677352	50 %	25 %	0 %	25 %	442555828
18055	NC_020127	TC	4	8	677376	677383	0 %	50 %	0 %	50 %	442555828
18056	NC_020127	TCA	2	6	677404	677409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555828
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18058	NC_020127	CAA	2	6	677471	677476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555828
18059	NC_020127	TTC	2	6	677484	677489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555828
18060	NC_020127	TAAT	2	8	677588	677595	50 %	50 %	0 %	0 %	442555828
18061	NC_020127	ATA	2	6	677606	677611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555828
18062	NC_020127	TA	4	8	677651	677658	50 %	50 %	0 %	0 %	442555828
18063	NC_020127	A	8	8	677706	677713	100 %	0 %	0 %	0 %	442555828
18064	NC_020127	TAT	2	6	677750	677755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555828
18065	NC_020127	TTGC	2	8	677758	677765	0 %	50 %	25 %	25 %	442555828
18066	NC_020127	TAA	2	6	677852	677857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555828
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18069	NC_020127	TATT	2	8	677942	677949	25 %	75 %	0 %	0 %	442555828
18070	NC_020127	CA	3	6	677954	677959	50 %	0 %	0 %	50 %	442555828
18071	NC_020127	TGA	2	6	677972	677977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555828
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18093	NC_020127	TGG	2	6	678993	678998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555828
18094	NC_020127	AAC	2	6	679029	679034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555828
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18096	NC_020127	ATG	2	6	679094	679099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555828
18097	NC_020127	TAC	3	9	679107	679115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555828
18098	NC_020127	CAA	2	6	679124	679129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555828
18099	NC_020127	ATT	3	9	679144	679152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555828
18100	NC_020127	TAC	2	6	679189	679194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555828
18101	NC_020127	TAC	2	6	679236	679241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555828
18102	NC_020127	TA	3	6	679253	679258	50 %	50 %	0 %	0 %	442555828
18103	NC_020127	CTATTG	2	12	679307	679318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442555828
18104	NC_020127	CTTC	2	8	679359	679366	0 %	50 %	0 %	50 %	442555828
18105	NC_020127	AAAG	2	8	679405	679412	75 %	0 %	25 %	0 %	442555828
18106	NC_020127	A	7	7	679549	679555	100 %	0 %	0 %	0 %	442555828
18107	NC_020127	ACAG	2	8	679560	679567	50 %	0 %	25 %	25 %	442555828
18108	NC_020127	CTA	2	6	679571	679576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555828
18109	NC_020127	CATG	2	8	679625	679632	25 %	25 %	25 %	25 %	442555828
18110	NC_020127	CTC	2	6	679661	679666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555828
18111	NC_020127	CT	4	8	679671	679678	0 %	50 %	0 %	50 %	442555828
18112	NC_020127	ATA	2	6	679688	679693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555828
18113	NC_020127	A	7	7	679712	679718	100 %	0 %	0 %	0 %	442555828
18114	NC_020127	A	7	7	679758	679764	100 %	0 %	0 %	0 %	442555828
18115	NC_020127	TCT	2	6	679798	679803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555828
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18121	NC_020127	TCA	2	6	679966	679971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555828
18122	NC_020127	CCTATT	2	12	679987	679998	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442555828
18123	NC_020127	A	7	7	680007	680013	100 %	0 %	0 %	0 %	442555828
18124	NC_020127	CCA	2	6	680014	680019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555828
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18126	NC_020127	AAC	3	9	680117	680125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555828
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