MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15004	NC_020127	ATA	2	6	559560	559565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555736
15005	NC_020127	T	7	7	559615	559621	0 %	100 %	0 %	0 %	442555736
15006	NC_020127	TCC	2	6	559663	559668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555736
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15008	NC_020127	AGT	2	6	559696	559701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555736
15009	NC_020127	TTCT	2	8	559724	559731	0 %	75 %	0 %	25 %	442555736
15010	NC_020127	TAA	2	6	559738	559743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555736
15011	NC_020127	GAAAA	2	10	559746	559755	80 %	0 %	20 %	0 %	442555736
15012	NC_020127	ACTT	2	8	559756	559763	25 %	50 %	0 %	25 %	442555736
15013	NC_020127	GCT	2	6	559781	559786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555736
15014	NC_020127	TAA	2	6	559798	559803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555736
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15016	NC_020127	TAAA	2	8	559860	559867	75 %	25 %	0 %	0 %	442555736
15017	NC_020127	TG	3	6	559883	559888	0 %	50 %	50 %	0 %	442555736
15018	NC_020127	AAAT	2	8	559902	559909	75 %	25 %	0 %	0 %	442555736
15019	NC_020127	ACAA	2	8	559976	559983	75 %	0 %	0 %	25 %	442555736
15020	NC_020127	TGC	2	6	559984	559989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555736
15021	NC_020127	ATT	2	6	560008	560013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555736
15022	NC_020127	TAA	2	6	560046	560051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555736
15023	NC_020127	GAT	2	6	560052	560057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555736
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15026	NC_020127	CA	3	6	560248	560253	50 %	0 %	0 %	50 %	442555736
15027	NC_020127	GGTT	2	8	560281	560288	0 %	50 %	50 %	0 %	442555736
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15030	NC_020127	ATAA	2	8	560427	560434	75 %	25 %	0 %	0 %	442555736
15031	NC_020127	TA	3	6	560469	560474	50 %	50 %	0 %	0 %	442555736
15032	NC_020127	TTTC	2	8	560480	560487	0 %	75 %	0 %	25 %	442555736
15033	NC_020127	TAA	2	6	560494	560499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555736
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15037	NC_020127	GCTGTT	2	12	560643	560654	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	442555736
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15040	NC_020127	CTC	2	6	560852	560857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555737
15041	NC_020127	CTG	2	6	560858	560863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555737
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15045	NC_020127	CATT	2	8	561044	561051	25 %	50 %	0 %	25 %	442555737
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15054	NC_020127	TGC	2	6	561393	561398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555737
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15075	NC_020127	TTA	2	6	562135	562140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15077	NC_020127	ATA	2	6	562214	562219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15088	NC_020127	A	6	6	562378	562383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_020127	AATA	2	8	562404	562411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15104	NC_020127	AT	3	6	563001	563006	50 %	50 %	0 %	0 %	442555738
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15139	NC_020127	CTAA	2	8	564459	564466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15253	NC_020127	GAA	2	6	568442	568447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555742
15254	NC_020127	CAA	2	6	568466	568471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555742
15255	NC_020127	CT	3	6	568519	568524	0 %	50 %	0 %	50 %	442555742
15256	NC_020127	CATT	2	8	568608	568615	25 %	50 %	0 %	25 %	442555742
15257	NC_020127	GAT	2	6	568655	568660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555742
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15273	NC_020127	TTA	2	6	569403	569408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555742
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15275	NC_020127	ACT	2	6	569470	569475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15279	NC_020127	A	7	7	569665	569671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15281	NC_020127	TTA	2	6	569688	569693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15282	NC_020127	ATT	2	6	569738	569743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15285	NC_020127	TAT	2	6	569813	569818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15307	NC_020127	TA	3	6	570537	570542	50 %	50 %	0 %	0 %	442555744
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15360	NC_020127	GA	3	6	572662	572667	50 %	0 %	50 %	0 %	442555745
15361	NC_020127	TCC	2	6	572757	572762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15362	NC_020127	TCTA	2	8	572769	572776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15363	NC_020127	A	7	7	572783	572789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15364	NC_020127	AT	3	6	572801	572806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15365	NC_020127	TA	3	6	572851	572856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15366	NC_020127	ATTAT	2	10	572857	572866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15367	NC_020127	TA	3	6	572869	572874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15368	NC_020127	A	7	7	572901	572907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15369	NC_020127	A	7	7	572970	572976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15370	NC_020127	TTA	2	6	573044	573049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15371	NC_020127	TAA	2	6	573050	573055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15372	NC_020127	CAA	2	6	573137	573142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15373	NC_020127	ACA	2	6	573154	573159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15374	NC_020127	TGC	2	6	573176	573181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15375	NC_020127	CTG	2	6	573225	573230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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