MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020127	T	7	7	539784	539790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_020127	ATCA	2	8	539792	539799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14503	NC_020127	A	7	7	539808	539814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_020127	AT	3	6	539832	539837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_020127	TAA	2	6	539852	539857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_020127	ATA	2	6	539862	539867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_020127	TA	3	6	539874	539879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_020127	A	7	7	539881	539887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_020127	ATA	6	18	539917	539934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_020127	ACA	2	6	539935	539940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_020127	AT	3	6	539963	539968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_020127	T	6	6	539968	539973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_020127	TAA	2	6	539983	539988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_020127	A	7	7	540046	540052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_020127	ATT	2	6	540085	540090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_020127	TGGTT	2	10	540097	540106	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_020127	A	6	6	540110	540115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_020127	TA	3	6	540116	540121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_020127	ATA	2	6	540128	540133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_020127	A	6	6	540137	540142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_020127	CAA	2	6	540143	540148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_020127	CTAA	2	8	540196	540203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14523	NC_020127	TATAA	2	10	540246	540255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_020127	GGA	2	6	540287	540292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020127	AAG	2	6	540354	540359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555716
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14527	NC_020127	A	8	8	540462	540469	100 %	0 %	0 %	0 %	442555716
14528	NC_020127	AATA	2	8	540482	540489	75 %	25 %	0 %	0 %	442555716
14529	NC_020127	TTA	2	6	540592	540597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555716
14530	NC_020127	A	6	6	540684	540689	100 %	0 %	0 %	0 %	442555716
14531	NC_020127	CTT	2	6	540722	540727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555717
14532	NC_020127	GTG	2	6	540740	540745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555717
14533	NC_020127	AT	3	6	540760	540765	50 %	50 %	0 %	0 %	442555717
14534	NC_020127	A	7	7	540843	540849	100 %	0 %	0 %	0 %	442555717
14535	NC_020127	CAAAA	2	10	540890	540899	80 %	0 %	0 %	20 %	442555717
14536	NC_020127	A	6	6	540896	540901	100 %	0 %	0 %	0 %	442555717
14537	NC_020127	ATT	2	6	540915	540920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555717
14538	NC_020127	ATA	2	6	540956	540961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555717
14539	NC_020127	TGG	2	6	540982	540987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555717
14540	NC_020127	A	7	7	541144	541150	100 %	0 %	0 %	0 %	442555717
14541	NC_020127	CAA	2	6	541193	541198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555717
14542	NC_020127	TTG	2	6	541262	541267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555717
14543	NC_020127	ATT	2	6	541299	541304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555717
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14545	NC_020127	ACT	2	6	541445	541450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555717
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14547	NC_020127	ATT	2	6	541591	541596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555717
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14549	NC_020127	GAA	2	6	541666	541671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555717
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14551	NC_020127	CTAA	2	8	541766	541773	50 %	25 %	0 %	25 %	442555717
14552	NC_020127	AAT	2	6	541787	541792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_020127	ATA	2	6	541797	541802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_020127	AAAAAT	2	12	541803	541814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_020127	A	6	6	541818	541823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_020127	CTA	2	6	541833	541838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_020127	TTC	2	6	541847	541852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_020127	TAA	2	6	541863	541868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_020127	ATG	2	6	541896	541901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555718
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14562	NC_020127	CTT	2	6	542081	542086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555718
14563	NC_020127	CTT	2	6	542172	542177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555718
14564	NC_020127	ATA	2	6	542217	542222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555718
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14570	NC_020127	TTA	2	6	542402	542407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555719
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14579	NC_020127	CAT	2	6	542878	542883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555719
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14583	NC_020127	TAA	2	6	542980	542985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555719
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14585	NC_020127	AAG	2	6	543011	543016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555719
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14593	NC_020127	CAT	2	6	543271	543276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555719
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14595	NC_020127	TA	3	6	543362	543367	50 %	50 %	0 %	0 %	442555719
14596	NC_020127	GCT	2	6	543390	543395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555719
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14605	NC_020127	TAT	2	6	543642	543647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_020127	GAA	2	6	543648	543653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020127	TAA	2	6	543659	543664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_020127	TCAT	2	8	543710	543717	25 %	50 %	0 %	25 %	442555720
14609	NC_020127	TAT	2	6	543878	543883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555720
14610	NC_020127	TAA	2	6	543884	543889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555720
14611	NC_020127	AAT	2	6	544040	544045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_020127	AT	4	8	544044	544051	50 %	50 %	0 %	0 %	442555721
14613	NC_020127	CT	3	6	544055	544060	0 %	50 %	0 %	50 %	442555721
14614	NC_020127	TTC	2	6	544063	544068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555721
14615	NC_020127	TCT	2	6	544088	544093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555721
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14618	NC_020127	ATGT	2	8	544172	544179	25 %	50 %	25 %	0 %	442555721
14619	NC_020127	GAG	2	6	544182	544187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555721
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14625	NC_020127	TTC	2	6	544456	544461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555721
14626	NC_020127	TTC	3	9	544477	544485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555721
14627	NC_020127	TCA	2	6	544595	544600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555721
14628	NC_020127	ATG	2	6	544612	544617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555721
14629	NC_020127	CTTT	2	8	544631	544638	0 %	75 %	0 %	25 %	442555721
14630	NC_020127	AGC	2	6	544696	544701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555721
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14632	NC_020127	CAT	2	6	544758	544763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555721
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14634	NC_020127	CT	3	6	544846	544851	0 %	50 %	0 %	50 %	442555722
14635	NC_020127	ACG	2	6	544946	544951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555722
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14638	NC_020127	GCT	2	6	545064	545069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555722
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14640	NC_020127	GCTCCA	2	12	545085	545096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442555722
14641	NC_020127	TA	3	6	545113	545118	50 %	50 %	0 %	0 %	442555722
14642	NC_020127	AT	3	6	545171	545176	50 %	50 %	0 %	0 %	442555722
14643	NC_020127	ACAGGT	2	12	545196	545207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	442555722
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14645	NC_020127	GAC	2	6	545244	545249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555722
14646	NC_020127	ATGT	2	8	545350	545357	25 %	50 %	25 %	0 %	442555722
14647	NC_020127	AC	3	6	545398	545403	50 %	0 %	0 %	50 %	442555722
14648	NC_020127	TAA	2	6	545406	545411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555722
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14650	NC_020127	ATGG	2	8	545449	545456	25 %	25 %	50 %	0 %	442555722
14651	NC_020127	A	6	6	545536	545541	100 %	0 %	0 %	0 %	442555722
14652	NC_020127	CTTGA	2	10	545548	545557	20 %	40 %	20 %	20 %	442555722
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14655	NC_020127	TAA	2	6	545626	545631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555722
14656	NC_020127	TAT	3	9	545632	545640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555722
14657	NC_020127	AT	6	12	545683	545694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14658	NC_020127	A	9	9	545751	545759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14659	NC_020127	ATT	3	9	545766	545774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555723
14660	NC_020127	ATT	2	6	545813	545818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555723
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14662	NC_020127	ATG	2	6	545869	545874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555723
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14682	NC_020127	TAA	2	6	546627	546632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14683	NC_020127	TAT	2	6	546692	546697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14684	NC_020127	TTA	2	6	546815	546820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14685	NC_020127	AGG	2	6	546861	546866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555724
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14696	NC_020127	CAACA	2	10	547421	547430	60 %	0 %	0 %	40 %	442555724
14697	NC_020127	TGA	2	6	547503	547508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555724
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14716	NC_020127	AGA	2	6	548247	548252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555724
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14725	NC_020127	AT	7	14	548495	548508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14731	NC_020127	AGCA	2	8	548801	548808	50 %	0 %	25 %	25 %	442555725
14732	NC_020127	AGAC	3	12	548860	548871	50 %	0 %	25 %	25 %	442555725
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14737	NC_020127	A	6	6	548983	548988	100 %	0 %	0 %	0 %	442555725
14738	NC_020127	TAA	2	6	549024	549029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555725
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14742	NC_020127	GCTT	2	8	549165	549172	0 %	50 %	25 %	25 %	442555725
14743	NC_020127	TGC	3	9	549174	549182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555725
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