MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020127	AAT	2	6	521459	521464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020127	A	6	6	521549	521554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_020127	TCA	2	6	521555	521560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_020127	AT	4	8	521585	521592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020127	TA	3	6	521601	521606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_020127	TAT	2	6	521609	521614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_020127	AAG	2	6	521627	521632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_020127	TTTAT	2	10	521700	521709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_020127	A	6	6	521712	521717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_020127	TCT	3	9	521755	521763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_020127	T	8	8	521765	521772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_020127	TA	3	6	521803	521808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_020127	ATT	2	6	521842	521847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_020127	AT	3	6	521861	521866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_020127	ACA	2	6	521873	521878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_020127	AAAATA	2	12	521902	521913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_020127	T	6	6	521920	521925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_020127	TAT	2	6	521948	521953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_020127	AG	3	6	521964	521969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_020127	TA	3	6	521986	521991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_020127	TAAT	2	8	522027	522034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_020127	AAAT	2	8	522041	522048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_020127	GGC	2	6	522162	522167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_020127	GCC	2	6	522227	522232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_020127	TAC	2	6	522276	522281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_020127	ATA	2	6	522284	522289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_020127	AT	3	6	522357	522362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_020127	ATT	2	6	522407	522412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_020127	A	6	6	522460	522465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_020127	TGCT	2	8	522466	522473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14031	NC_020127	TCT	2	6	522487	522492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_020127	AAT	2	6	522507	522512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_020127	AATA	2	8	522514	522521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_020127	TA	3	6	522520	522525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_020127	GCA	2	6	522602	522607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555703
14036	NC_020127	AT	3	6	522636	522641	50 %	50 %	0 %	0 %	442555703
14037	NC_020127	GGA	2	6	522671	522676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555703
14038	NC_020127	CAT	2	6	522678	522683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555703
14039	NC_020127	TTC	2	6	522684	522689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555703
14040	NC_020127	TAT	2	6	522697	522702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555703
14041	NC_020127	TTG	2	6	522711	522716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555703
14042	NC_020127	A	6	6	522788	522793	100 %	0 %	0 %	0 %	442555703
14043	NC_020127	TTC	2	6	522796	522801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555703
14044	NC_020127	TGG	2	6	522809	522814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555703
14045	NC_020127	CT	3	6	522836	522841	0 %	50 %	0 %	50 %	442555703
14046	NC_020127	AT	3	6	522884	522889	50 %	50 %	0 %	0 %	442555703
14047	NC_020127	ACA	2	6	522926	522931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555703
14048	NC_020127	TGT	2	6	522937	522942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555703
14049	NC_020127	CTT	2	6	522965	522970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555703
14050	NC_020127	TAT	2	6	522990	522995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555703
14051	NC_020127	ATT	2	6	523010	523015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555703
14052	NC_020127	TTG	2	6	523017	523022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555703
14053	NC_020127	GTA	2	6	523119	523124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555703
14054	NC_020127	T	6	6	523223	523228	0 %	100 %	0 %	0 %	442555703
14055	NC_020127	GAT	2	6	523280	523285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555703
14056	NC_020127	TC	3	6	523342	523347	0 %	50 %	0 %	50 %	442555703
14057	NC_020127	AGT	2	6	523366	523371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555703
14058	NC_020127	CTG	2	6	523449	523454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555703
14059	NC_020127	T	6	6	523475	523480	0 %	100 %	0 %	0 %	442555703
14060	NC_020127	GCA	2	6	523487	523492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555703
14061	NC_020127	A	6	6	523570	523575	100 %	0 %	0 %	0 %	442555703
14062	NC_020127	TAC	2	6	523576	523581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555703
14063	NC_020127	ATT	3	9	523583	523591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555703
14064	NC_020127	TTTC	2	8	523672	523679	0 %	75 %	0 %	25 %	442555703
14065	NC_020127	TCC	2	6	523697	523702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555703
14066	NC_020127	AGG	2	6	523720	523725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555703
14067	NC_020127	AACA	2	8	523760	523767	75 %	0 %	0 %	25 %	442555703
14068	NC_020127	ATGC	2	8	523775	523782	25 %	25 %	25 %	25 %	442555703
14069	NC_020127	CTT	2	6	523826	523831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555703
14070	NC_020127	TTA	2	6	523860	523865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555703
14071	NC_020127	ATTT	2	8	523893	523900	25 %	75 %	0 %	0 %	442555703
14072	NC_020127	AT	4	8	523903	523910	50 %	50 %	0 %	0 %	442555703
14073	NC_020127	TTAA	2	8	523911	523918	50 %	50 %	0 %	0 %	442555703
14074	NC_020127	ACTT	2	8	523992	523999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14075	NC_020127	A	7	7	524014	524020	100 %	0 %	0 %	0 %	442555704
14076	NC_020127	A	8	8	524117	524124	100 %	0 %	0 %	0 %	442555704
14077	NC_020127	AAAC	2	8	524143	524150	75 %	0 %	0 %	25 %	442555704
14078	NC_020127	AGA	2	6	524151	524156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555704
14079	NC_020127	ATAA	2	8	524187	524194	75 %	25 %	0 %	0 %	442555704
14080	NC_020127	AAT	2	6	524200	524205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555704
14081	NC_020127	TGT	2	6	524355	524360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555704
14082	NC_020127	AT	3	6	524396	524401	50 %	50 %	0 %	0 %	442555704
14083	NC_020127	CAA	2	6	524420	524425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555704
14084	NC_020127	CTG	2	6	524498	524503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555704
14085	NC_020127	CCTAA	2	10	524536	524545	40 %	20 %	0 %	40 %	442555704
14086	NC_020127	CAG	2	6	524549	524554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555704
14087	NC_020127	ATA	2	6	524555	524560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555704
14088	NC_020127	CTT	2	6	524573	524578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555704
14089	NC_020127	TAA	2	6	524579	524584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555704
14090	NC_020127	TGT	2	6	524587	524592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555704
14091	NC_020127	AGTA	2	8	524682	524689	50 %	25 %	25 %	0 %	442555704
14092	NC_020127	TAG	2	6	524714	524719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555704
14093	NC_020127	GTAG	2	8	524794	524801	25 %	25 %	50 %	0 %	442555704
14094	NC_020127	CCA	2	6	524815	524820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555704
14095	NC_020127	T	7	7	524863	524869	0 %	100 %	0 %	0 %	442555704
14096	NC_020127	T	6	6	524871	524876	0 %	100 %	0 %	0 %	442555704
14097	NC_020127	TCC	2	6	524925	524930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555704
14098	NC_020127	TGTT	2	8	524943	524950	0 %	75 %	25 %	0 %	442555704
14099	NC_020127	A	7	7	524998	525004	100 %	0 %	0 %	0 %	442555704
14100	NC_020127	T	7	7	525025	525031	0 %	100 %	0 %	0 %	442555704
14101	NC_020127	GGAA	2	8	525050	525057	50 %	0 %	50 %	0 %	442555704
14102	NC_020127	TACA	2	8	525076	525083	50 %	25 %	0 %	25 %	442555704
14103	NC_020127	AT	3	6	525099	525104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_020127	TCAAA	2	10	525157	525166	60 %	20 %	0 %	20 %	442555705
14105	NC_020127	T	6	6	525176	525181	0 %	100 %	0 %	0 %	442555705
14106	NC_020127	A	9	9	525194	525202	100 %	0 %	0 %	0 %	442555705
14107	NC_020127	CAACA	2	10	525290	525299	60 %	0 %	0 %	40 %	442555705
14108	NC_020127	TAT	2	6	525351	525356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555705
14109	NC_020127	GCT	2	6	525430	525435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555705
14110	NC_020127	AAG	2	6	525440	525445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555705
14111	NC_020127	ATC	2	6	525524	525529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555705
14112	NC_020127	GATA	2	8	525537	525544	50 %	25 %	25 %	0 %	442555705
14113	NC_020127	ATT	2	6	525578	525583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555705
14114	NC_020127	TATT	2	8	525598	525605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_020127	TTC	2	6	525618	525623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_020127	ACTA	2	8	525674	525681	50 %	25 %	0 %	25 %	442555706
14117	NC_020127	A	6	6	525709	525714	100 %	0 %	0 %	0 %	442555706
14118	NC_020127	AAC	2	6	525720	525725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555706
14119	NC_020127	TATC	2	8	525760	525767	25 %	50 %	0 %	25 %	442555706
14120	NC_020127	ATA	2	6	525790	525795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555706
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14122	NC_020127	A	7	7	525920	525926	100 %	0 %	0 %	0 %	442555706
14123	NC_020127	TAA	2	6	525941	525946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555706
14124	NC_020127	AGA	2	6	525972	525977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_020127	TAA	2	6	525982	525987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14127	NC_020127	AGG	2	6	526070	526075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14253	NC_020127	AATA	2	8	530470	530477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14380	NC_020127	AAG	2	6	535511	535516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555712
14381	NC_020127	GTG	2	6	535544	535549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555712
14382	NC_020127	TTG	2	6	535572	535577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555712
14383	NC_020127	GCT	2	6	535609	535614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
14384	NC_020127	ATCCTA	2	12	535616	535627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555712
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14386	NC_020127	TGT	2	6	535716	535721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555712
14387	NC_020127	AT	3	6	535725	535730	50 %	50 %	0 %	0 %	442555712
14388	NC_020127	GA	3	6	535741	535746	50 %	0 %	50 %	0 %	442555712
14389	NC_020127	A	6	6	535766	535771	100 %	0 %	0 %	0 %	442555712
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14394	NC_020127	GCT	2	6	535994	535999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
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14403	NC_020127	CTG	2	6	536270	536275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
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14452	NC_020127	GTA	3	9	538221	538229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14454	NC_020127	TAGG	2	8	538279	538286	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14485	NC_020127	AGC	2	6	539501	539506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555715
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14488	NC_020127	T	6	6	539576	539581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14489	NC_020127	CTT	2	6	539590	539595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14493	NC_020127	AT	3	6	539658	539663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_020127	A	6	6	539680	539685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14495	NC_020127	TA	3	6	539686	539691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14496	NC_020127	TACTAT	2	12	539695	539706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14497	NC_020127	AAT	2	6	539712	539717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14498	NC_020127	TAA	2	6	539738	539743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_020127	A	6	6	539767	539772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_020127	ACA	2	6	539774	539779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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