MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020127	A	6	6	502267	502272	100 %	0 %	0 %	0 %	442555685
13502	NC_020127	TCC	2	6	502305	502310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555685
13503	NC_020127	AAT	2	6	502368	502373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555685
13504	NC_020127	GAAA	2	8	502458	502465	75 %	0 %	25 %	0 %	442555685
13505	NC_020127	AGT	2	6	502487	502492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555685
13506	NC_020127	GTA	2	6	502504	502509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555685
13507	NC_020127	AAT	2	6	502569	502574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555685
13508	NC_020127	AT	3	6	502582	502587	50 %	50 %	0 %	0 %	442555685
13509	NC_020127	ATG	2	6	502607	502612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555685
13510	NC_020127	A	6	6	502659	502664	100 %	0 %	0 %	0 %	442555685
13511	NC_020127	TCTTG	2	10	502674	502683	0 %	60 %	20 %	20 %	442555685
13512	NC_020127	T	6	6	502700	502705	0 %	100 %	0 %	0 %	442555685
13513	NC_020127	ATA	2	6	502743	502748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555685
13514	NC_020127	GCA	3	9	502764	502772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555685
13515	NC_020127	CAT	2	6	502792	502797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555685
13516	NC_020127	CT	3	6	502803	502808	0 %	50 %	0 %	50 %	442555685
13517	NC_020127	GAC	2	6	502838	502843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555685
13518	NC_020127	CCA	2	6	502893	502898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555685
13519	NC_020127	AAC	2	6	502900	502905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555685
13520	NC_020127	CAA	2	6	502906	502911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555685
13521	NC_020127	TTC	2	6	502943	502948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555685
13522	NC_020127	ATC	2	6	503028	503033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555685
13523	NC_020127	TC	3	6	503040	503045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13524	NC_020127	ATT	2	6	503057	503062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_020127	TTA	2	6	503063	503068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_020127	AT	3	6	503084	503089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_020127	A	6	6	503106	503111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_020127	GT	3	6	503202	503207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_020127	TCT	2	6	503252	503257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_020127	T	7	7	503270	503276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_020127	A	8	8	503385	503392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_020127	AG	3	6	503513	503518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_020127	CAAG	2	8	503534	503541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13534	NC_020127	CAA	2	6	503568	503573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_020127	TAA	2	6	503609	503614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_020127	TGA	2	6	503629	503634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_020127	ACAA	2	8	503650	503657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13538	NC_020127	TCTA	2	8	503682	503689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13539	NC_020127	CAC	2	6	503741	503746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_020127	CTA	2	6	503795	503800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_020127	AAT	2	6	503812	503817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_020127	ATA	2	6	503855	503860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_020127	CAT	2	6	503926	503931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_020127	CCA	2	6	503945	503950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13545	NC_020127	CAA	2	6	503964	503969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_020127	ATT	2	6	503974	503979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_020127	A	6	6	504040	504045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_020127	TGC	2	6	504091	504096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_020127	ATG	2	6	504148	504153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_020127	TAA	2	6	504188	504193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_020127	CTA	2	6	504194	504199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_020127	TAA	2	6	504231	504236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_020127	GAT	2	6	504248	504253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_020127	ATT	2	6	504288	504293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_020127	CAA	2	6	504351	504356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_020127	CTT	2	6	504358	504363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_020127	AAT	2	6	504373	504378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_020127	GCT	2	6	504425	504430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_020127	GAT	2	6	504592	504597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555686
13560	NC_020127	CTC	2	6	504654	504659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555686
13561	NC_020127	TTG	2	6	504681	504686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555686
13562	NC_020127	ATA	2	6	504714	504719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555686
13563	NC_020127	TA	3	6	504741	504746	50 %	50 %	0 %	0 %	442555686
13564	NC_020127	TGT	2	6	504768	504773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555686
13565	NC_020127	AGCAT	2	10	504814	504823	40 %	20 %	20 %	20 %	442555686
13566	NC_020127	CTT	2	6	504836	504841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555686
13567	NC_020127	GGA	2	6	504844	504849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555686
13568	NC_020127	GCT	2	6	504880	504885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555686
13569	NC_020127	GAA	2	6	504896	504901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555686
13570	NC_020127	GTAA	2	8	504936	504943	50 %	25 %	25 %	0 %	442555686
13571	NC_020127	TTA	2	6	504977	504982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555686
13572	NC_020127	TAT	2	6	505098	505103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555686
13573	NC_020127	ATA	2	6	505129	505134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555686
13574	NC_020127	TTG	2	6	505139	505144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555686
13575	NC_020127	ATA	2	6	505171	505176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555686
13576	NC_020127	TGC	2	6	505209	505214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555686
13577	NC_020127	TCC	2	6	505229	505234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555687
13578	NC_020127	AAT	2	6	505366	505371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555687
13579	NC_020127	CTT	2	6	505410	505415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555687
13580	NC_020127	GTC	2	6	505534	505539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555687
13581	NC_020127	AC	3	6	505569	505574	50 %	0 %	0 %	50 %	442555687
13582	NC_020127	CCA	2	6	505583	505588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555687
13583	NC_020127	ACC	2	6	505627	505632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555687
13584	NC_020127	TAC	2	6	505698	505703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555687
13585	NC_020127	CCA	2	6	505706	505711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555687
13586	NC_020127	TCA	2	6	505739	505744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555687
13587	NC_020127	GAT	2	6	505780	505785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555687
13588	NC_020127	TAG	2	6	505847	505852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555687
13589	NC_020127	CTGC	2	8	505929	505936	0 %	25 %	25 %	50 %	442555687
13590	NC_020127	TAC	2	6	505963	505968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555687
13591	NC_020127	TGC	2	6	505976	505981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555687
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13593	NC_020127	GTTGCA	2	12	506042	506053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	442555687
13594	NC_020127	TAT	2	6	506133	506138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555687
13595	NC_020127	TG	3	6	506155	506160	0 %	50 %	50 %	0 %	442555687
13596	NC_020127	CT	4	8	506170	506177	0 %	50 %	0 %	50 %	442555687
13597	NC_020127	AT	3	6	506182	506187	50 %	50 %	0 %	0 %	442555687
13598	NC_020127	CAC	2	6	506193	506198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555687
13599	NC_020127	AGTG	2	8	506253	506260	25 %	25 %	50 %	0 %	442555687
13600	NC_020127	CAC	2	6	506364	506369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555687
13601	NC_020127	T	6	6	506389	506394	0 %	100 %	0 %	0 %	442555687
13602	NC_020127	TAGC	2	8	506431	506438	25 %	25 %	25 %	25 %	442555688
13603	NC_020127	TTC	2	6	506459	506464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555688
13604	NC_020127	TGC	2	6	506510	506515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555688
13605	NC_020127	ATT	2	6	506528	506533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555688
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13607	NC_020127	GAT	2	6	506697	506702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555688
13608	NC_020127	AT	3	6	506759	506764	50 %	50 %	0 %	0 %	442555688
13609	NC_020127	GATCA	2	10	506768	506777	40 %	20 %	20 %	20 %	442555688
13610	NC_020127	CATCT	2	10	506798	506807	20 %	40 %	0 %	40 %	442555688
13611	NC_020127	AAT	2	6	506812	506817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555688
13612	NC_020127	TGC	2	6	506945	506950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555688
13613	NC_020127	TCT	2	6	506961	506966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_020127	AC	3	6	507000	507005	50 %	0 %	0 %	50 %	442555689
13615	NC_020127	TCA	2	6	507050	507055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555689
13616	NC_020127	CAT	2	6	507093	507098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555689
13617	NC_020127	TATC	2	8	507119	507126	25 %	50 %	0 %	25 %	442555689
13618	NC_020127	TA	3	6	507159	507164	50 %	50 %	0 %	0 %	442555689
13619	NC_020127	ATT	2	6	507219	507224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555689
13620	NC_020127	AAT	2	6	507231	507236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555689
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13622	NC_020127	CAT	2	6	507275	507280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555689
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13742	NC_020127	ATA	2	6	512754	512759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13743	NC_020127	T	7	7	512760	512766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13744	NC_020127	GT	3	6	512768	512773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13996	NC_020127	TAC	2	6	521308	521313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13997	NC_020127	GTA	2	6	521335	521340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13998	NC_020127	AT	3	6	521345	521350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13999	NC_020127	ACT	2	6	521368	521373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14000	NC_020127	TAAG	2	8	521410	521417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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