MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020127	GGA	3	9	482137	482145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555665
13002	NC_020127	ATA	2	6	482149	482154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555665
13003	NC_020127	GCA	2	6	482185	482190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555665
13004	NC_020127	CCATAA	2	12	482222	482233	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	442555665
13005	NC_020127	TCA	2	6	482251	482256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555665
13006	NC_020127	A	7	7	482259	482265	100 %	0 %	0 %	0 %	442555665
13007	NC_020127	CATT	2	8	482267	482274	25 %	50 %	0 %	25 %	442555665
13008	NC_020127	CATCTG	2	12	482363	482374	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442555665
13009	NC_020127	TAA	2	6	482375	482380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555665
13010	NC_020127	GAA	2	6	482432	482437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555665
13011	NC_020127	TTA	2	6	482452	482457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555665
13012	NC_020127	ATA	2	6	482503	482508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555665
13013	NC_020127	CAG	2	6	482513	482518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555665
13014	NC_020127	TGA	2	6	482563	482568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555665
13015	NC_020127	TTA	2	6	482591	482596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555665
13016	NC_020127	CT	3	6	482637	482642	0 %	50 %	0 %	50 %	442555665
13017	NC_020127	TTA	2	6	482671	482676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555665
13018	NC_020127	TTG	2	6	482706	482711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555665
13019	NC_020127	AAC	2	6	482766	482771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555665
13020	NC_020127	GAG	2	6	482810	482815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555665
13021	NC_020127	TGC	2	6	482823	482828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555665
13022	NC_020127	TGC	2	6	482841	482846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555665
13023	NC_020127	TCT	2	6	482878	482883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555665
13024	NC_020127	TCC	2	6	482922	482927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555665
13025	NC_020127	TCA	2	6	483109	483114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555665
13026	NC_020127	GAAC	2	8	483163	483170	50 %	0 %	25 %	25 %	442555665
13027	NC_020127	CTT	2	6	483197	483202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555665
13028	NC_020127	AAG	2	6	483252	483257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555665
13029	NC_020127	CAG	2	6	483302	483307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555665
13030	NC_020127	TTC	2	6	483330	483335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555665
13031	NC_020127	CTATT	2	10	483341	483350	20 %	60 %	0 %	20 %	442555665
13032	NC_020127	CTT	2	6	483358	483363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555665
13033	NC_020127	ATA	2	6	483364	483369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555665
13034	NC_020127	TTA	2	6	483379	483384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555665
13035	NC_020127	AAGT	2	8	483425	483432	50 %	25 %	25 %	0 %	442555665
13036	NC_020127	TAA	2	6	483456	483461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555665
13037	NC_020127	CTT	2	6	483494	483499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555665
13038	NC_020127	ATT	2	6	483545	483550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_020127	ATA	2	6	483551	483556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_020127	AAC	2	6	483626	483631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_020127	A	6	6	483632	483637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_020127	ATTT	2	8	483639	483646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_020127	ACA	2	6	483706	483711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555666
13044	NC_020127	TA	3	6	483803	483808	50 %	50 %	0 %	0 %	442555666
13045	NC_020127	CAA	3	9	483815	483823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555666
13046	NC_020127	ATA	2	6	483852	483857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555666
13047	NC_020127	AGTAT	2	10	483883	483892	40 %	40 %	20 %	0 %	442555666
13048	NC_020127	AAACAT	2	12	483899	483910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442555666
13049	NC_020127	TCTA	2	8	483948	483955	25 %	50 %	0 %	25 %	442555666
13050	NC_020127	AACAT	2	10	483997	484006	60 %	20 %	0 %	20 %	442555666
13051	NC_020127	AAT	2	6	484041	484046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555666
13052	NC_020127	AGA	2	6	484065	484070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555666
13053	NC_020127	TCA	2	6	484099	484104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555666
13054	NC_020127	T	6	6	484170	484175	0 %	100 %	0 %	0 %	442555666
13055	NC_020127	AGA	2	6	484251	484256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555666
13056	NC_020127	GTAG	2	8	484295	484302	25 %	25 %	50 %	0 %	442555666
13057	NC_020127	TA	3	6	484314	484319	50 %	50 %	0 %	0 %	442555666
13058	NC_020127	AC	3	6	484421	484426	50 %	0 %	0 %	50 %	442555666
13059	NC_020127	CT	3	6	484449	484454	0 %	50 %	0 %	50 %	442555666
13060	NC_020127	CGA	2	6	484513	484518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555666
13061	NC_020127	ATT	2	6	484533	484538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555666
13062	NC_020127	CAG	2	6	484562	484567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_020127	ATTA	2	8	484610	484617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_020127	TGT	2	6	484758	484763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555667
13065	NC_020127	AAC	2	6	484789	484794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555667
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13067	NC_020127	GCT	3	9	485077	485085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555667
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13070	NC_020127	TAT	2	6	485232	485237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555667
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13072	NC_020127	ATTAAA	2	12	485293	485304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555667
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13076	NC_020127	AACA	2	8	485468	485475	75 %	0 %	0 %	25 %	442555667
13077	NC_020127	CCT	2	6	485476	485481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555667
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13079	NC_020127	TAGA	2	8	485501	485508	50 %	25 %	25 %	0 %	442555667
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13084	NC_020127	TGT	3	9	485613	485621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555667
13085	NC_020127	ATT	2	6	485715	485720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_020127	ATAAA	2	10	485744	485753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_020127	GAA	2	6	485785	485790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_020127	TTAT	2	8	485836	485843	25 %	75 %	0 %	0 %	442555668
13089	NC_020127	AGG	2	6	485846	485851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555668
13090	NC_020127	TGTTT	2	10	485936	485945	0 %	80 %	20 %	0 %	442555668
13091	NC_020127	A	6	6	485973	485978	100 %	0 %	0 %	0 %	442555668
13092	NC_020127	GAA	2	6	486003	486008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555668
13093	NC_020127	A	7	7	486020	486026	100 %	0 %	0 %	0 %	442555668
13094	NC_020127	AG	3	6	486045	486050	50 %	0 %	50 %	0 %	442555668
13095	NC_020127	GAGC	2	8	486069	486076	25 %	0 %	50 %	25 %	442555668
13096	NC_020127	TCC	2	6	486113	486118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555668
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13102	NC_020127	TGT	2	6	486332	486337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555668
13103	NC_020127	A	7	7	486343	486349	100 %	0 %	0 %	0 %	442555668
13104	NC_020127	CTT	2	6	486441	486446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555668
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13107	NC_020127	CAA	2	6	486594	486599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555668
13108	NC_020127	TGA	2	6	486632	486637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555668
13109	NC_020127	ACA	2	6	486641	486646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555668
13110	NC_020127	AGTGTG	2	12	486654	486665	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	442555668
13111	NC_020127	TGG	2	6	486692	486697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555669
13112	NC_020127	ATT	2	6	486721	486726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555669
13113	NC_020127	A	6	6	486729	486734	100 %	0 %	0 %	0 %	442555669
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13117	NC_020127	TTAC	2	8	486815	486822	25 %	50 %	0 %	25 %	442555669
13118	NC_020127	ATT	3	9	486824	486832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555669
13119	NC_020127	AAG	2	6	486837	486842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555669
13120	NC_020127	T	6	6	486902	486907	0 %	100 %	0 %	0 %	442555669
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13122	NC_020127	ATT	2	6	486947	486952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555669
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13245	NC_020127	TGG	2	6	491995	492000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555675
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13347	NC_020127	T	6	6	496429	496434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13348	NC_020127	TA	3	6	496436	496441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13349	NC_020127	TAT	2	6	496453	496458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13353	NC_020127	A	6	6	496751	496756	100 %	0 %	0 %	0 %	442555680
13354	NC_020127	ACT	2	6	496806	496811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555680
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13366	NC_020127	GAAC	2	8	497314	497321	50 %	0 %	25 %	25 %	442555680
13367	NC_020127	ACA	2	6	497331	497336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555680
13368	NC_020127	GCT	2	6	497368	497373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555680
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13371	NC_020127	CTAT	2	8	497480	497487	25 %	50 %	0 %	25 %	442555680
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13373	NC_020127	A	8	8	497577	497584	100 %	0 %	0 %	0 %	442555680
13374	NC_020127	AAC	2	6	497600	497605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555680
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13378	NC_020127	TAA	2	6	497693	497698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555680
13379	NC_020127	TTTC	2	8	497703	497710	0 %	75 %	0 %	25 %	442555680
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13383	NC_020127	AG	3	6	497789	497794	50 %	0 %	50 %	0 %	442555680
13384	NC_020127	TA	3	6	497805	497810	50 %	50 %	0 %	0 %	442555680
13385	NC_020127	AAG	2	6	497843	497848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555680
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13387	NC_020127	AT	3	6	497937	497942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13390	NC_020127	T	6	6	497980	497985	0 %	100 %	0 %	0 %	442555681
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13443	NC_020127	TCTAG	2	10	499917	499926	20 %	40 %	20 %	20 %	442555683
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13473	NC_020127	TATT	2	8	501264	501271	25 %	75 %	0 %	0 %	442555684
13474	NC_020127	ATG	2	6	501308	501313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555684
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