MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020127	A	7	7	425842	425848	100 %	0 %	0 %	0 %	442555610
11502	NC_020127	ACA	2	6	425869	425874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555610
11503	NC_020127	AAG	2	6	425922	425927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555610
11504	NC_020127	CAATAG	2	12	425975	425986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442555610
11505	NC_020127	TATG	2	8	426033	426040	25 %	50 %	25 %	0 %	442555610
11506	NC_020127	TAA	2	6	426152	426157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555610
11507	NC_020127	A	6	6	426165	426170	100 %	0 %	0 %	0 %	442555610
11508	NC_020127	TAG	2	6	426181	426186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_020127	AGTT	2	8	426211	426218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_020127	ATT	2	6	426229	426234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555611
11511	NC_020127	TCA	2	6	426258	426263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555611
11512	NC_020127	ATA	2	6	426266	426271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555611
11513	NC_020127	TCA	2	6	426306	426311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555611
11514	NC_020127	TAAA	2	8	426359	426366	75 %	25 %	0 %	0 %	442555611
11515	NC_020127	AAT	2	6	426410	426415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555611
11516	NC_020127	T	6	6	426476	426481	0 %	100 %	0 %	0 %	442555611
11517	NC_020127	A	6	6	426491	426496	100 %	0 %	0 %	0 %	442555611
11518	NC_020127	AGG	2	6	426533	426538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555611
11519	NC_020127	A	8	8	426543	426550	100 %	0 %	0 %	0 %	442555611
11520	NC_020127	AGC	2	6	426560	426565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555611
11521	NC_020127	TAT	2	6	426595	426600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555611
11522	NC_020127	TTG	2	6	426601	426606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555611
11523	NC_020127	TAA	2	6	426659	426664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555611
11524	NC_020127	A	7	7	426690	426696	100 %	0 %	0 %	0 %	442555611
11525	NC_020127	TGT	2	6	426710	426715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555611
11526	NC_020127	A	6	6	426770	426775	100 %	0 %	0 %	0 %	442555611
11527	NC_020127	ACA	2	6	426777	426782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555611
11528	NC_020127	T	8	8	426791	426798	0 %	100 %	0 %	0 %	442555611
11529	NC_020127	TC	3	6	426804	426809	0 %	50 %	0 %	50 %	442555611
11530	NC_020127	AAG	2	6	426838	426843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555611
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11533	NC_020127	A	6	6	426938	426943	100 %	0 %	0 %	0 %	442555611
11534	NC_020127	TAA	2	6	427015	427020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555611
11535	NC_020127	AAT	2	6	427061	427066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555611
11536	NC_020127	AGC	2	6	427097	427102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555611
11537	NC_020127	TGC	2	6	427106	427111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555611
11538	NC_020127	CAT	2	6	427129	427134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555611
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11540	NC_020127	ATT	2	6	427178	427183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555611
11541	NC_020127	TAA	2	6	427196	427201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555611
11542	NC_020127	AT	3	6	427306	427311	50 %	50 %	0 %	0 %	442555611
11543	NC_020127	TAA	2	6	427328	427333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555611
11544	NC_020127	TTC	2	6	427347	427352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555611
11545	NC_020127	TA	3	6	427367	427372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020127	AAC	2	6	427383	427388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_020127	A	6	6	427397	427402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020127	ATA	2	6	427418	427423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020127	CATATT	2	12	427424	427435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11550	NC_020127	T	6	6	427434	427439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_020127	AT	3	6	427462	427467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_020127	TA	3	6	427484	427489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020127	ATA	2	6	427506	427511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020127	T	6	6	427518	427523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020127	TAA	2	6	427552	427557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_020127	AT	3	6	427630	427635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020127	AATC	2	8	427649	427656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11558	NC_020127	ATT	2	6	427663	427668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_020127	AAT	2	6	427669	427674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_020127	TTTCGT	2	12	427822	427833	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442555612
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11566	NC_020127	A	7	7	428025	428031	100 %	0 %	0 %	0 %	442555612
11567	NC_020127	T	8	8	428112	428119	0 %	100 %	0 %	0 %	442555612
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11572	NC_020127	ATGG	2	8	428251	428258	25 %	25 %	50 %	0 %	442555612
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11578	NC_020127	TTGT	2	8	428507	428514	0 %	75 %	25 %	0 %	442555612
11579	NC_020127	ATT	2	6	428515	428520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555612
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11582	NC_020127	GTAG	2	8	428539	428546	25 %	25 %	50 %	0 %	442555612
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11584	NC_020127	TAC	2	6	428728	428733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11588	NC_020127	ATT	2	6	428817	428822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_020127	TTTA	2	8	428848	428855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_020127	TAT	2	6	428869	428874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_020127	TA	3	6	428880	428885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_020127	ATTA	2	8	428925	428932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020127	CAT	2	6	428940	428945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11595	NC_020127	ACA	2	6	429192	429197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555613
11596	NC_020127	T	6	6	429207	429212	0 %	100 %	0 %	0 %	442555613
11597	NC_020127	TAT	2	6	429237	429242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555613
11598	NC_020127	AT	3	6	429369	429374	50 %	50 %	0 %	0 %	442555613
11599	NC_020127	GTG	2	6	429401	429406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555613
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11607	NC_020127	A	7	7	429592	429598	100 %	0 %	0 %	0 %	442555613
11608	NC_020127	AAG	2	6	429626	429631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555613
11609	NC_020127	TAC	2	6	429696	429701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_020127	TAT	2	6	429761	429766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020127	TTAAT	2	10	429779	429788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020127	AT	3	6	429787	429792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_020127	GAA	2	6	429827	429832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555614
11614	NC_020127	TC	3	6	429850	429855	0 %	50 %	0 %	50 %	442555614
11615	NC_020127	ATT	2	6	429884	429889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555614
11616	NC_020127	TATC	2	8	429939	429946	25 %	50 %	0 %	25 %	442555614
11617	NC_020127	CTT	2	6	430010	430015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555614
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11624	NC_020127	TAA	2	6	430144	430149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555614
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11998	NC_020127	CTA	2	6	445417	445422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11999	NC_020127	TAAC	2	8	445436	445443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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