MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_020127	ATA	2	6	351418	351423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555550
9503	NC_020127	T	6	6	351475	351480	0 %	100 %	0 %	0 %	442555550
9504	NC_020127	TTA	2	6	351574	351579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555550
9505	NC_020127	AGT	2	6	351594	351599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555550
9506	NC_020127	GAAC	2	8	351623	351630	50 %	0 %	25 %	25 %	442555550
9507	NC_020127	CTG	2	6	351726	351731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555550
9508	NC_020127	CCA	2	6	351735	351740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555550
9509	NC_020127	GAA	2	6	351782	351787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555550
9510	NC_020127	A	6	6	351856	351861	100 %	0 %	0 %	0 %	442555550
9511	NC_020127	TTC	2	6	351873	351878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555550
9512	NC_020127	TGG	2	6	351918	351923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555550
9513	NC_020127	CAAA	2	8	351941	351948	75 %	0 %	0 %	25 %	442555550
9514	NC_020127	TAA	2	6	351978	351983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555550
9515	NC_020127	TTC	2	6	352104	352109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555550
9516	NC_020127	GTTG	2	8	352114	352121	0 %	50 %	50 %	0 %	442555550
9517	NC_020127	TAA	2	6	352169	352174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555550
9518	NC_020127	CAT	2	6	352181	352186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555550
9519	NC_020127	CAA	2	6	352238	352243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555550
9520	NC_020127	ACT	2	6	352307	352312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_020127	TTA	2	6	352320	352325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555551
9522	NC_020127	CAC	2	6	352401	352406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555551
9523	NC_020127	TCA	2	6	352506	352511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555551
9524	NC_020127	ATG	2	6	352512	352517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555551
9525	NC_020127	T	10	10	352577	352586	0 %	100 %	0 %	0 %	442555551
9526	NC_020127	A	8	8	352641	352648	100 %	0 %	0 %	0 %	442555551
9527	NC_020127	TTC	2	6	352672	352677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555551
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9529	NC_020127	AAAT	2	8	352735	352742	75 %	25 %	0 %	0 %	442555551
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9532	NC_020127	A	7	7	352896	352902	100 %	0 %	0 %	0 %	442555552
9533	NC_020127	AAT	2	6	352932	352937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555552
9534	NC_020127	ATCC	2	8	352954	352961	25 %	25 %	0 %	50 %	442555552
9535	NC_020127	CACAA	2	10	352968	352977	60 %	0 %	0 %	40 %	442555552
9536	NC_020127	GTT	2	6	352984	352989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555552
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9538	NC_020127	AATA	2	8	353019	353026	75 %	25 %	0 %	0 %	442555552
9539	NC_020127	ACTT	2	8	353091	353098	25 %	50 %	0 %	25 %	442555552
9540	NC_020127	TA	3	6	353129	353134	50 %	50 %	0 %	0 %	442555552
9541	NC_020127	ATT	2	6	353154	353159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555552
9542	NC_020127	GCA	2	6	353179	353184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555552
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9544	NC_020127	AAT	2	6	353284	353289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555552
9545	NC_020127	TCCT	2	8	353348	353355	0 %	50 %	0 %	50 %	442555552
9546	NC_020127	ATCT	2	8	353382	353389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9547	NC_020127	TA	3	6	353399	353404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_020127	CTA	2	6	353424	353429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_020127	TTA	2	6	353462	353467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_020127	TAA	2	6	353486	353491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_020127	TAA	5	15	353498	353512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_020127	ACT	2	6	353521	353526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555553
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9554	NC_020127	TACA	2	8	353580	353587	50 %	25 %	0 %	25 %	442555553
9555	NC_020127	ATT	2	6	353639	353644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555553
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9557	NC_020127	T	6	6	353652	353657	0 %	100 %	0 %	0 %	442555553
9558	NC_020127	CTG	2	6	353731	353736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555553
9559	NC_020127	TGT	2	6	353790	353795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555553
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9562	NC_020127	CAATC	2	10	353875	353884	40 %	20 %	0 %	40 %	442555553
9563	NC_020127	TTG	3	9	353891	353899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555553
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9569	NC_020127	ATTT	2	8	354143	354150	25 %	75 %	0 %	0 %	442555553
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9581	NC_020127	AACT	2	8	354428	354435	50 %	25 %	0 %	25 %	442555553
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9591	NC_020127	CTT	2	6	354895	354900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555553
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9594	NC_020127	TGC	2	6	355097	355102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555553
9595	NC_020127	ACCTA	2	10	355132	355141	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9596	NC_020127	TAAAA	2	10	355147	355156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_020127	ATAC	2	8	355193	355200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9598	NC_020127	TAA	2	6	355215	355220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9599	NC_020127	AAT	2	6	355236	355241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_020127	CTA	2	6	355277	355282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555554
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9602	NC_020127	AGA	2	6	355333	355338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555554
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9607	NC_020127	ATA	2	6	355766	355771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555554
9608	NC_020127	AAC	2	6	355805	355810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555554
9609	NC_020127	GTA	2	6	355842	355847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555554
9610	NC_020127	A	6	6	355856	355861	100 %	0 %	0 %	0 %	442555554
9611	NC_020127	TAA	2	6	355894	355899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555554
9612	NC_020127	CAT	2	6	355905	355910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555554
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9614	NC_020127	CAA	2	6	355971	355976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555554
9615	NC_020127	TC	3	6	355982	355987	0 %	50 %	0 %	50 %	442555554
9616	NC_020127	ACCC	2	8	355988	355995	25 %	0 %	0 %	75 %	442555554
9617	NC_020127	AT	3	6	356040	356045	50 %	50 %	0 %	0 %	442555554
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9622	NC_020127	TTCT	2	8	356172	356179	0 %	75 %	0 %	25 %	442555554
9623	NC_020127	GCA	2	6	356222	356227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555554
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