MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020127	AGC	2	6	239253	239258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555452
6502	NC_020127	ATT	2	6	239278	239283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555452
6503	NC_020127	AACCT	2	10	239309	239318	40 %	20 %	0 %	40 %	442555452
6504	NC_020127	GAA	2	6	239419	239424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555452
6505	NC_020127	TTA	2	6	239425	239430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555452
6506	NC_020127	TTC	2	6	239434	239439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555452
6507	NC_020127	TTA	2	6	239456	239461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555452
6508	NC_020127	GAAA	2	8	239516	239523	75 %	0 %	25 %	0 %	442555452
6509	NC_020127	A	6	6	239521	239526	100 %	0 %	0 %	0 %	442555452
6510	NC_020127	ATA	2	6	239539	239544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555452
6511	NC_020127	GA	3	6	239557	239562	50 %	0 %	50 %	0 %	442555452
6512	NC_020127	TA	4	8	239585	239592	50 %	50 %	0 %	0 %	442555452
6513	NC_020127	TC	3	6	239595	239600	0 %	50 %	0 %	50 %	442555452
6514	NC_020127	T	6	6	239611	239616	0 %	100 %	0 %	0 %	442555452
6515	NC_020127	T	6	6	239623	239628	0 %	100 %	0 %	0 %	442555452
6516	NC_020127	TGA	2	6	239649	239654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555452
6517	NC_020127	ATC	2	6	239702	239707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555452
6518	NC_020127	ATG	2	6	239714	239719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555452
6519	NC_020127	ATA	2	6	239790	239795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_020127	ACTT	2	8	239867	239874	25 %	50 %	0 %	25 %	442555453
6521	NC_020127	ACATT	2	10	239876	239885	40 %	40 %	0 %	20 %	442555453
6522	NC_020127	TTAT	2	8	239897	239904	25 %	75 %	0 %	0 %	442555453
6523	NC_020127	TTA	2	6	239914	239919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555453
6524	NC_020127	CTTATT	2	12	239965	239976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442555453
6525	NC_020127	TTA	2	6	240019	240024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555453
6526	NC_020127	TC	3	6	240040	240045	0 %	50 %	0 %	50 %	442555453
6527	NC_020127	ATT	3	9	240055	240063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555453
6528	NC_020127	ATG	2	6	240071	240076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555453
6529	NC_020127	GAA	2	6	240120	240125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555453
6530	NC_020127	AAAG	2	8	240126	240133	75 %	0 %	25 %	0 %	442555453
6531	NC_020127	ATA	2	6	240155	240160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555453
6532	NC_020127	AG	3	6	240220	240225	50 %	0 %	50 %	0 %	442555453
6533	NC_020127	ATG	2	6	240241	240246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555453
6534	NC_020127	AAG	2	6	240248	240253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555453
6535	NC_020127	ATTCT	2	10	240266	240275	20 %	60 %	0 %	20 %	442555453
6536	NC_020127	ACT	2	6	240285	240290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555453
6537	NC_020127	T	6	6	240299	240304	0 %	100 %	0 %	0 %	442555453
6538	NC_020127	ATG	2	6	240323	240328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555453
6539	NC_020127	TTA	2	6	240335	240340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555453
6540	NC_020127	GAA	2	6	240350	240355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555453
6541	NC_020127	TGC	2	6	240357	240362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555453
6542	NC_020127	AAGT	2	8	240443	240450	50 %	25 %	25 %	0 %	442555453
6543	NC_020127	TTG	2	6	240464	240469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555453
6544	NC_020127	GAA	2	6	240475	240480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555453
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6546	NC_020127	AG	3	6	240546	240551	50 %	0 %	50 %	0 %	442555453
6547	NC_020127	AGAA	2	8	240664	240671	75 %	0 %	25 %	0 %	442555454
6548	NC_020127	GTTAG	2	10	240680	240689	20 %	40 %	40 %	0 %	442555454
6549	NC_020127	TAA	2	6	240736	240741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555454
6550	NC_020127	ATC	2	6	240856	240861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555454
6551	NC_020127	ATT	2	6	240893	240898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555454
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6553	NC_020127	AAG	2	6	240942	240947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555454
6554	NC_020127	TCT	2	6	240977	240982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555454
6555	NC_020127	T	6	6	240984	240989	0 %	100 %	0 %	0 %	442555454
6556	NC_020127	AGA	2	6	241006	241011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555454
6557	NC_020127	ATT	2	6	241019	241024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555454
6558	NC_020127	GTG	2	6	241044	241049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555454
6559	NC_020127	TCA	2	6	241064	241069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555454
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6563	NC_020127	CGT	2	6	241211	241216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555454
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6567	NC_020127	CAG	3	9	241434	241442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555454
6568	NC_020127	TTA	2	6	241449	241454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555454
6569	NC_020127	TCG	2	6	241483	241488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555454
6570	NC_020127	AAT	2	6	241491	241496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555454
6571	NC_020127	TTG	2	6	241507	241512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_020127	GCA	2	6	241613	241618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555455
6573	NC_020127	TA	3	6	241688	241693	50 %	50 %	0 %	0 %	442555455
6574	NC_020127	TCT	2	6	241717	241722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555455
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6576	NC_020127	CTG	2	6	241767	241772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555455
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6578	NC_020127	AATTA	2	10	241852	241861	60 %	40 %	0 %	0 %	442555455
6579	NC_020127	AT	3	6	242002	242007	50 %	50 %	0 %	0 %	442555455
6580	NC_020127	A	6	6	242017	242022	100 %	0 %	0 %	0 %	442555455
6581	NC_020127	GAA	2	6	242114	242119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555455
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6584	NC_020127	TTG	2	6	242274	242279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555455
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6587	NC_020127	GAAA	2	8	242416	242423	75 %	0 %	25 %	0 %	442555455
6588	NC_020127	A	8	8	242421	242428	100 %	0 %	0 %	0 %	442555455
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6591	NC_020127	ATT	2	6	242635	242640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555455
6592	NC_020127	TAC	2	6	242757	242762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555455
6593	NC_020127	TAA	2	6	242893	242898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_020127	GCAA	2	8	242978	242985	50 %	0 %	25 %	25 %	442555456
6595	NC_020127	AT	3	6	243011	243016	50 %	50 %	0 %	0 %	442555456
6596	NC_020127	TGT	2	6	243037	243042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555456
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6599	NC_020127	GA	3	6	243152	243157	50 %	0 %	50 %	0 %	442555456
6600	NC_020127	TGTC	2	8	243216	243223	0 %	50 %	25 %	25 %	442555456
6601	NC_020127	TGA	2	6	243283	243288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555456
6602	NC_020127	TGGT	2	8	243303	243310	0 %	50 %	50 %	0 %	442555456
6603	NC_020127	AGA	2	6	243406	243411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555456
6604	NC_020127	TAT	2	6	243430	243435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555456
6605	NC_020127	AACC	2	8	243489	243496	50 %	0 %	0 %	50 %	442555456
6606	NC_020127	TTG	2	6	243525	243530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555456
6607	NC_020127	TTAT	2	8	243535	243542	25 %	75 %	0 %	0 %	442555456
6608	NC_020127	TGG	2	6	243589	243594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555456
6609	NC_020127	GCA	2	6	243620	243625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555456
6610	NC_020127	GGA	2	6	243662	243667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555456
6611	NC_020127	GAT	2	6	243724	243729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555456
6612	NC_020127	GAT	2	6	243746	243751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555456
6613	NC_020127	TAA	2	6	243757	243762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555456
6614	NC_020127	AAT	2	6	243795	243800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555456
6615	NC_020127	ATT	3	9	243808	243816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_020127	ATGA	2	8	243834	243841	50 %	25 %	25 %	0 %	442555457
6617	NC_020127	TAT	2	6	243859	243864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555457
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6621	NC_020127	GTT	2	6	244023	244028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555457
6622	NC_020127	A	6	6	244054	244059	100 %	0 %	0 %	0 %	442555457
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6872	NC_020127	AGA	2	6	252215	252220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555462
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7000	NC_020127	AT	3	6	256527	256532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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