MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 99570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019683	TCA	2	6	151095	151100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722140
3002	NC_019683	T	6	6	151162	151167	0 %	100 %	0 %	0 %	427722140
3003	NC_019683	A	6	6	151247	151252	100 %	0 %	0 %	0 %	427722140
3004	NC_019683	TTC	2	6	151253	151258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722140
3005	NC_019683	CAAT	2	8	151287	151294	50 %	25 %	0 %	25 %	427722140
3006	NC_019683	TCT	2	6	151394	151399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722141
3007	NC_019683	GCTGA	2	10	151489	151498	20 %	20 %	40 %	20 %	427722141
3008	NC_019683	CAC	2	6	151510	151515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722141
3009	NC_019683	CCA	2	6	151526	151531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722141
3010	NC_019683	ACA	2	6	151688	151693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722141
3011	NC_019683	GA	3	6	151717	151722	50 %	0 %	50 %	0 %	427722141
3012	NC_019683	CCG	2	6	151803	151808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722141
3013	NC_019683	CCA	2	6	151824	151829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722141
3014	NC_019683	T	6	6	151900	151905	0 %	100 %	0 %	0 %	427722141
3015	NC_019683	TGA	2	6	151910	151915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722141
3016	NC_019683	ATA	2	6	151919	151924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722141
3017	NC_019683	CAA	2	6	151957	151962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722141
3018	NC_019683	CAA	2	6	151975	151980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722141
3019	NC_019683	ATC	2	6	151981	151986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722141
3020	NC_019683	TAA	2	6	152023	152028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722141
3021	NC_019683	TTCTGG	2	12	152035	152046	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427722141
3022	NC_019683	TCT	2	6	152108	152113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722141
3023	NC_019683	GAT	2	6	152124	152129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722141
3024	NC_019683	ACTTT	2	10	152132	152141	20 %	60 %	0 %	20 %	427722141
3025	NC_019683	AAT	2	6	152155	152160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722141
3026	NC_019683	CGG	2	6	152172	152177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722141
3027	NC_019683	CTA	2	6	152274	152279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722141
3028	NC_019683	TAA	2	6	152287	152292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722141
3029	NC_019683	TCG	2	6	152445	152450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722141
3030	NC_019683	CAA	2	6	152463	152468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722141
3031	NC_019683	ATC	2	6	152477	152482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722141
3032	NC_019683	TTG	2	6	152623	152628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722141
3033	NC_019683	CGA	2	6	152708	152713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722141
3034	NC_019683	T	7	7	152731	152737	0 %	100 %	0 %	0 %	427722141
3035	NC_019683	CAG	2	6	152797	152802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722141
3036	NC_019683	CAC	2	6	152896	152901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722141
3037	NC_019683	CAA	2	6	152910	152915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722141
3038	NC_019683	A	6	6	152914	152919	100 %	0 %	0 %	0 %	427722141
3039	NC_019683	TCA	2	6	152940	152945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722141
3040	NC_019683	ATGA	2	8	153003	153010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019683	AAT	2	6	153026	153031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019683	TAAC	2	8	153067	153074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_019683	GCC	2	6	153133	153138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722142
3044	NC_019683	TTC	2	6	153140	153145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722142
3045	NC_019683	GCTAGC	2	12	153235	153246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427722142
3046	NC_019683	TCG	2	6	153248	153253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722142
3047	NC_019683	CAA	2	6	153274	153279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722142
3048	NC_019683	GTA	2	6	153299	153304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722142
3049	NC_019683	T	6	6	153314	153319	0 %	100 %	0 %	0 %	427722142
3050	NC_019683	TTG	2	6	153335	153340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722142
3051	NC_019683	TTTTCT	2	12	153356	153367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	427722142
3052	NC_019683	GAA	2	6	153423	153428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722142
3053	NC_019683	ATG	2	6	153481	153486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722142
3054	NC_019683	TCG	2	6	153512	153517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722142
3055	NC_019683	T	6	6	153560	153565	0 %	100 %	0 %	0 %	427722142
3056	NC_019683	CAA	2	6	153681	153686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722142
3057	NC_019683	TGA	2	6	153763	153768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722143
3058	NC_019683	GGC	2	6	153807	153812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722143
3059	NC_019683	TAT	2	6	153826	153831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722143
3060	NC_019683	CTG	2	6	153836	153841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722143
3061	NC_019683	GTT	2	6	153863	153868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722143
3062	NC_019683	CAC	2	6	153871	153876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722143
3063	NC_019683	GCC	2	6	153960	153965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722143
3064	NC_019683	TTG	2	6	154068	154073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722143
3065	NC_019683	TGC	2	6	154111	154116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_019683	AGC	2	6	154205	154210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_019683	TCC	2	6	154325	154330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722144
3068	NC_019683	CGC	2	6	154359	154364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722144
3069	NC_019683	A	6	6	154418	154423	100 %	0 %	0 %	0 %	427722144
3070	NC_019683	TTG	2	6	154445	154450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722144
3071	NC_019683	GAA	2	6	154504	154509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3072	NC_019683	GGC	2	6	154684	154689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722144
3073	NC_019683	GTA	2	6	154694	154699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722144
3074	NC_019683	TGA	2	6	154716	154721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722144
3075	NC_019683	GTCG	2	8	154774	154781	0 %	25 %	50 %	25 %	427722144
3076	NC_019683	GTC	2	6	154817	154822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3077	NC_019683	AAT	2	6	154831	154836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722144
3078	NC_019683	GAA	2	6	154930	154935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3079	NC_019683	GAA	2	6	154999	155004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3080	NC_019683	GTAAT	2	10	155042	155051	40 %	40 %	20 %	0 %	427722144
3081	NC_019683	GCA	2	6	155092	155097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3082	NC_019683	CTCG	2	8	155137	155144	0 %	25 %	25 %	50 %	427722144
3083	NC_019683	CGT	2	6	155221	155226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3084	NC_019683	TGGT	2	8	155240	155247	0 %	50 %	50 %	0 %	427722144
3085	NC_019683	GAA	2	6	155260	155265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3086	NC_019683	TGA	2	6	155328	155333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722144
3087	NC_019683	GCA	2	6	155347	155352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3088	NC_019683	CTTC	2	8	155382	155389	0 %	50 %	0 %	50 %	427722144
3089	NC_019683	TTGA	2	8	155407	155414	25 %	50 %	25 %	0 %	427722144
3090	NC_019683	CGTC	2	8	155430	155437	0 %	25 %	25 %	50 %	427722144
3091	NC_019683	CTG	2	6	155456	155461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3092	NC_019683	GTTC	2	8	155518	155525	0 %	50 %	25 %	25 %	427722144
3093	NC_019683	CGC	2	6	155595	155600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722144
3094	NC_019683	GAA	2	6	155647	155652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3095	NC_019683	CAA	2	6	155691	155696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722144
3096	NC_019683	CCA	2	6	155714	155719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722144
3097	NC_019683	CTC	2	6	155722	155727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722144
3098	NC_019683	CCG	2	6	155799	155804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722144
3099	NC_019683	GAA	2	6	155820	155825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3100	NC_019683	GTTTT	2	10	155846	155855	0 %	80 %	20 %	0 %	427722144
3101	NC_019683	AGC	2	6	155901	155906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3102	NC_019683	CTT	2	6	155910	155915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722144
3103	NC_019683	TCC	2	6	155994	155999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722144
3104	NC_019683	GGT	2	6	156022	156027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722144
3105	NC_019683	TCG	3	9	156045	156053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3106	NC_019683	TGA	2	6	156075	156080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722144
3107	NC_019683	GTC	2	6	156137	156142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722144
3108	NC_019683	GGT	4	12	156229	156240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722144
3109	NC_019683	TGA	2	6	156258	156263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722144
3110	NC_019683	TTC	2	6	156410	156415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722144
3111	NC_019683	GAA	2	6	156493	156498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3112	NC_019683	GAA	2	6	156571	156576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3113	NC_019683	TC	3	6	156579	156584	0 %	50 %	0 %	50 %	427722144
3114	NC_019683	GAA	2	6	156628	156633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3115	NC_019683	AGA	2	6	156654	156659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722144
3116	NC_019683	ATT	2	6	156699	156704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_019683	AAG	2	6	156746	156751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_019683	CTT	2	6	156760	156765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_019683	T	7	7	156764	156770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_019683	GTG	2	6	156900	156905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722145
3121	NC_019683	TCG	2	6	156982	156987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722145
3122	NC_019683	GTTGT	2	10	156990	156999	0 %	60 %	40 %	0 %	427722145
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3232	NC_019683	AATA	2	8	162894	162901	75 %	25 %	0 %	0 %	427722150
3233	NC_019683	AAAAC	2	10	162927	162936	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3234	NC_019683	AAT	2	6	162940	162945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_019683	CAAA	2	8	162996	163003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3236	NC_019683	TGC	2	6	163059	163064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722151
3237	NC_019683	T	6	6	163070	163075	0 %	100 %	0 %	0 %	427722151
3238	NC_019683	AATT	2	8	163109	163116	50 %	50 %	0 %	0 %	427722151
3239	NC_019683	TTC	2	6	163139	163144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722151
3240	NC_019683	AC	3	6	163148	163153	50 %	0 %	0 %	50 %	427722151
3241	NC_019683	TTC	2	6	163178	163183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722151
3242	NC_019683	GTT	3	9	163228	163236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722151
3243	NC_019683	GTC	2	6	163283	163288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722151
3244	NC_019683	TCGTAA	2	12	163395	163406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427722151
3245	NC_019683	CTC	2	6	163567	163572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722151
3246	NC_019683	ATG	2	6	163612	163617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722151
3247	NC_019683	GATTT	2	10	163693	163702	20 %	60 %	20 %	0 %	427722151
3248	NC_019683	TAAA	2	8	163750	163757	75 %	25 %	0 %	0 %	427722151
3249	NC_019683	CTTC	2	8	163856	163863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_019683	TCAAA	2	10	163973	163982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3251	NC_019683	A	6	6	164017	164022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3363	NC_019683	GTT	2	6	170552	170557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3364	NC_019683	AAGCA	2	10	170561	170570	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3366	NC_019683	GAA	2	6	170600	170605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3367	NC_019683	GGCTA	2	10	170622	170631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3368	NC_019683	CAT	2	6	170637	170642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3370	NC_019683	CGG	2	6	170841	170846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3371	NC_019683	ATA	2	6	170863	170868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_019683	ATG	2	6	170904	170909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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