MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 99570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_019683	GCGA	2	8	98629	98636	25 %	0 %	50 %	25 %	427722100
2004	NC_019683	GAT	2	6	98640	98645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722100
2005	NC_019683	GAA	2	6	98902	98907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722100
2006	NC_019683	AC	3	6	98927	98932	50 %	0 %	0 %	50 %	427722100
2007	NC_019683	CCA	2	6	98933	98938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722100
2008	NC_019683	GTC	2	6	98939	98944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722100
2009	NC_019683	ATT	2	6	98997	99002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722100
2010	NC_019683	CAAAA	2	10	99017	99026	80 %	0 %	0 %	20 %	427722100
2011	NC_019683	TC	3	6	99080	99085	0 %	50 %	0 %	50 %	427722100
2012	NC_019683	GC	3	6	99220	99225	0 %	0 %	50 %	50 %	427722100
2013	NC_019683	TCG	2	6	99230	99235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722100
2014	NC_019683	A	6	6	99260	99265	100 %	0 %	0 %	0 %	427722100
2015	NC_019683	AAG	2	6	99272	99277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722100
2016	NC_019683	GAT	2	6	99307	99312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722100
2017	NC_019683	CTA	2	6	99323	99328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722100
2018	NC_019683	A	6	6	99388	99393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_019683	CTA	2	6	99414	99419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_019683	TAG	2	6	99437	99442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_019683	TCA	2	6	99486	99491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_019683	TTA	2	6	99572	99577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722101
2023	NC_019683	TGA	2	6	99613	99618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722101
2024	NC_019683	TGA	2	6	99637	99642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722101
2025	NC_019683	A	7	7	99715	99721	100 %	0 %	0 %	0 %	427722101
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2040	NC_019683	CTG	2	6	100612	100617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722102
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2053	NC_019683	GCT	2	6	101680	101685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722102
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2058	NC_019683	A	6	6	101863	101868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_019683	AT	3	6	101904	101909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_019683	GGA	2	6	102021	102026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_019683	GAA	2	6	102074	102079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722103
2063	NC_019683	AGCA	2	8	102106	102113	50 %	0 %	25 %	25 %	427722103
2064	NC_019683	CTT	2	6	102155	102160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722103
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2083	NC_019683	GCA	2	6	102895	102900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722103
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2087	NC_019683	TGG	2	6	103132	103137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722103
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2089	NC_019683	CAATAC	2	12	103288	103299	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	427722103
2090	NC_019683	GAAG	2	8	103300	103307	50 %	0 %	50 %	0 %	427722103
2091	NC_019683	TTAA	2	8	103353	103360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_019683	T	8	8	103394	103401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_019683	GAT	2	6	103414	103419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_019683	GAT	2	6	103455	103460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722104
2095	NC_019683	T	6	6	103474	103479	0 %	100 %	0 %	0 %	427722104
2096	NC_019683	T	7	7	103494	103500	0 %	100 %	0 %	0 %	427722104
2097	NC_019683	CAT	2	6	103524	103529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722104
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2100	NC_019683	AGA	2	6	103851	103856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722104
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2102	NC_019683	ATT	2	6	103917	103922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722104
2103	NC_019683	GGC	2	6	103951	103956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722104
2104	NC_019683	AG	3	6	104095	104100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_019683	CTG	2	6	104208	104213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722105
2106	NC_019683	ACC	2	6	104230	104235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722105
2107	NC_019683	TAA	2	6	104277	104282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722105
2108	NC_019683	A	6	6	104281	104286	100 %	0 %	0 %	0 %	427722105
2109	NC_019683	ATTC	2	8	104488	104495	25 %	50 %	0 %	25 %	427722105
2110	NC_019683	AAT	2	6	104510	104515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722106
2111	NC_019683	CGC	2	6	104524	104529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722106
2112	NC_019683	GCT	2	6	104668	104673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722106
2113	NC_019683	GTTC	2	8	104690	104697	0 %	50 %	25 %	25 %	427722106
2114	NC_019683	TAA	2	6	104704	104709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722106
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2116	NC_019683	CAT	2	6	104760	104765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722106
2117	NC_019683	AGC	2	6	104776	104781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722106
2118	NC_019683	A	6	6	104915	104920	100 %	0 %	0 %	0 %	427722106
2119	NC_019683	A	6	6	104981	104986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_019683	TAA	2	6	105095	105100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722107
2121	NC_019683	ACG	2	6	105137	105142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722107
2122	NC_019683	TAC	2	6	105154	105159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722107
2123	NC_019683	GGT	2	6	105217	105222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722107
2124	NC_019683	AGC	2	6	105345	105350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722107
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2243	NC_019683	CAT	2	6	112464	112469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722112
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2245	NC_019683	CTA	2	6	112650	112655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722112
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2247	NC_019683	TCA	2	6	112865	112870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722112
2248	NC_019683	TCA	2	6	112874	112879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722112
2249	NC_019683	CTG	2	6	112881	112886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722112
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2252	NC_019683	GCT	2	6	113023	113028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722112
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2279	NC_019683	CCT	2	6	114032	114037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722112
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2330	NC_019683	GCA	2	6	117242	117247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722112
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2333	NC_019683	ACC	2	6	117455	117460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2334	NC_019683	TCT	2	6	117466	117471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2335	NC_019683	TATG	2	8	117510	117517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2336	NC_019683	AAT	2	6	117528	117533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2338	NC_019683	TAT	2	6	117564	117569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2354	NC_019683	TCGG	2	8	118643	118650	0 %	25 %	50 %	25 %	427722113
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2368	NC_019683	T	8	8	119779	119786	0 %	100 %	0 %	0 %	427722114
2369	NC_019683	TTC	2	6	119801	119806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722114
2370	NC_019683	TCA	2	6	119863	119868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722114
2371	NC_019683	TTG	2	6	119955	119960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722114
2372	NC_019683	T	6	6	119967	119972	0 %	100 %	0 %	0 %	427722114
2373	NC_019683	GAG	2	6	120006	120011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722114
2374	NC_019683	ACT	2	6	120054	120059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722114
2375	NC_019683	CAC	2	6	120068	120073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722114
2376	NC_019683	TTC	2	6	120141	120146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722114
2377	NC_019683	TAC	2	6	120167	120172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2378	NC_019683	TTCC	2	8	120213	120220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2379	NC_019683	ATTT	2	8	120227	120234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2380	NC_019683	CTA	2	6	120248	120253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722115
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2382	NC_019683	GAT	2	6	120305	120310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722115
2383	NC_019683	CTG	2	6	120313	120318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722115
2384	NC_019683	ATT	2	6	120335	120340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722115
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2389	NC_019683	TTA	2	6	120507	120512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722115
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2398	NC_019683	TCA	2	6	120936	120941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722115
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2402	NC_019683	TCA	2	6	121044	121049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722115
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2459	NC_019683	CAG	2	6	124008	124013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2461	NC_019683	TA	3	6	124062	124067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2462	NC_019683	TATTT	2	10	124161	124170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2463	NC_019683	GTT	2	6	124375	124380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2478	NC_019683	CTT	2	6	125222	125227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2479	NC_019683	TGAAA	2	10	125252	125261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2480	NC_019683	CAA	2	6	125267	125272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2481	NC_019683	TGT	2	6	125326	125331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_019683	GCC	3	9	125347	125355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2483	NC_019683	TGT	2	6	125386	125391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_019683	ATG	2	6	125522	125527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2486	NC_019683	TAAAGA	2	12	125550	125561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2487	NC_019683	T	6	6	125611	125616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2488	NC_019683	GAA	2	6	125649	125654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2489	NC_019683	GATTT	2	10	125707	125716	20 %	60 %	20 %	0 %	427722118
2490	NC_019683	GAT	2	6	125802	125807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722118
2491	NC_019683	CAC	2	6	125823	125828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722118
2492	NC_019683	CTT	2	6	125895	125900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722118
2493	NC_019683	CAA	2	6	125940	125945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722118
2494	NC_019683	CTT	2	6	126009	126014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722118
2495	NC_019683	TAA	2	6	126016	126021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722118
2496	NC_019683	GCTG	2	8	126033	126040	0 %	25 %	50 %	25 %	427722118
2497	NC_019683	GAC	2	6	126075	126080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722118
2498	NC_019683	AATCA	2	10	126118	126127	60 %	20 %	0 %	20 %	427722118
2499	NC_019683	CGC	2	6	126147	126152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722118
2500	NC_019683	GCT	2	6	126153	126158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722118

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