MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 99570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
99501	NC_019683	CGA	2	6	5122754	5122759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99502	NC_019683	A	6	6	5122788	5122793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99503	NC_019683	CCA	2	6	5122797	5122802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99504	NC_019683	AATC	2	8	5122866	5122873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99505	NC_019683	CAA	2	6	5122923	5122928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99506	NC_019683	GTT	2	6	5122967	5122972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99507	NC_019683	AAC	2	6	5122989	5122994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99508	NC_019683	CTT	2	6	5123007	5123012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99509	NC_019683	GCT	2	6	5123103	5123108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99510	NC_019683	A	6	6	5123109	5123114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99511	NC_019683	T	6	6	5123119	5123124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99512	NC_019683	AGC	2	6	5123125	5123130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99513	NC_019683	TGT	2	6	5123148	5123153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99514	NC_019683	TGA	2	6	5123236	5123241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726246
99515	NC_019683	TTC	2	6	5123367	5123372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726247
99516	NC_019683	TCT	2	6	5123428	5123433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726247
99517	NC_019683	ATA	2	6	5123484	5123489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726247
99518	NC_019683	CAT	2	6	5123498	5123503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726247
99519	NC_019683	CAG	2	6	5123703	5123708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726247
99520	NC_019683	AG	3	6	5123707	5123712	50 %	0 %	50 %	0 %	427726247
99521	NC_019683	ATA	2	6	5123742	5123747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726247
99522	NC_019683	AAT	2	6	5123767	5123772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726247
99523	NC_019683	TTC	2	6	5123794	5123799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726247
99524	NC_019683	ATC	2	6	5123805	5123810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726247
99525	NC_019683	ATTG	2	8	5123852	5123859	25 %	50 %	25 %	0 %	427726247
99526	NC_019683	TGGT	2	8	5123876	5123883	0 %	50 %	50 %	0 %	427726247
99527	NC_019683	AAT	2	6	5123978	5123983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99528	NC_019683	ACA	2	6	5124021	5124026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427726248
99529	NC_019683	ACG	2	6	5124183	5124188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726248
99530	NC_019683	AT	3	6	5124193	5124198	50 %	50 %	0 %	0 %	427726248
99531	NC_019683	GAC	2	6	5124218	5124223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726248
99532	NC_019683	AGA	2	6	5124247	5124252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726248
99533	NC_019683	TA	3	6	5124281	5124286	50 %	50 %	0 %	0 %	427726248
99534	NC_019683	GGC	2	6	5124307	5124312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726248
99535	NC_019683	TGA	2	6	5124331	5124336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726248
99536	NC_019683	CG	3	6	5124344	5124349	0 %	0 %	50 %	50 %	427726248
99537	NC_019683	TAT	2	6	5124431	5124436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726248
99538	NC_019683	GAG	2	6	5124452	5124457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427726248
99539	NC_019683	TGA	2	6	5124517	5124522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726248
99540	NC_019683	AAGA	2	8	5124542	5124549	75 %	0 %	25 %	0 %	427726248
99541	NC_019683	AAG	2	6	5124585	5124590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726248
99542	NC_019683	GGC	2	6	5124698	5124703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726248
99543	NC_019683	CAC	2	6	5124722	5124727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726248
99544	NC_019683	GCC	2	6	5124752	5124757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427726248
99545	NC_019683	A	6	6	5124816	5124821	100 %	0 %	0 %	0 %	427726248
99546	NC_019683	TTG	2	6	5124860	5124865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726248
99547	NC_019683	TTAT	2	8	5124893	5124900	25 %	75 %	0 %	0 %	427726248
99548	NC_019683	CTG	2	6	5125026	5125031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726248
99549	NC_019683	ATG	2	6	5125032	5125037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726248
99550	NC_019683	TTG	2	6	5125062	5125067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726248
99551	NC_019683	AAAGA	2	10	5125130	5125139	80 %	0 %	20 %	0 %	427726248
99552	NC_019683	ACA	2	6	5125168	5125173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427726248
99553	NC_019683	TTG	2	6	5125233	5125238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726248
99554	NC_019683	A	6	6	5125245	5125250	100 %	0 %	0 %	0 %	427726248
99555	NC_019683	AAC	2	6	5125258	5125263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427726248
99556	NC_019683	TGG	2	6	5125365	5125370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427726248
99557	NC_019683	CAT	2	6	5125378	5125383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726248
99558	NC_019683	TTGA	2	8	5125385	5125392	25 %	50 %	25 %	0 %	427726248
99559	NC_019683	CGG	2	6	5125399	5125404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726248
99560	NC_019683	CGT	2	6	5125418	5125423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726248
99561	NC_019683	T	6	6	5125475	5125480	0 %	100 %	0 %	0 %	427726249
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99564	NC_019683	TTG	2	6	5125611	5125616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726249
99565	NC_019683	CTG	2	6	5125632	5125637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726249
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99568	NC_019683	CAAAAG	2	12	5125695	5125706	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	427726249
99569	NC_019683	AAAC	2	8	5125736	5125743	75 %	0 %	0 %	25 %	427726249
99570	NC_019683	CAG	2	6	5125797	5125802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726249

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.