MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 99570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_019683	CTT	3	9	2833628	2833636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55002	NC_019683	AAATT	2	10	2833656	2833665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55003	NC_019683	GTAA	2	8	2833755	2833762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55004	NC_019683	GCTGT	2	10	2833794	2833803	0 %	40 %	40 %	20 %	427724361
55005	NC_019683	GGTT	2	8	2833817	2833824	0 %	50 %	50 %	0 %	427724361
55006	NC_019683	CTTT	2	8	2833830	2833837	0 %	75 %	0 %	25 %	427724361
55007	NC_019683	TCA	2	6	2833850	2833855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724361
55008	NC_019683	T	6	6	2833861	2833866	0 %	100 %	0 %	0 %	427724361
55009	NC_019683	ACA	2	6	2833907	2833912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427724361
55010	NC_019683	CCA	2	6	2834008	2834013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724361
55011	NC_019683	CCA	2	6	2834108	2834113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724361
55012	NC_019683	T	7	7	2834149	2834155	0 %	100 %	0 %	0 %	427724361
55013	NC_019683	ACC	2	6	2834252	2834257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724361
55014	NC_019683	GATC	2	8	2834289	2834296	25 %	25 %	25 %	25 %	427724361
55015	NC_019683	CAAAC	2	10	2834338	2834347	60 %	0 %	0 %	40 %	427724361
55016	NC_019683	CAGT	2	8	2834361	2834368	25 %	25 %	25 %	25 %	427724361
55017	NC_019683	ATT	2	6	2834384	2834389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427724361
55018	NC_019683	TCA	2	6	2834394	2834399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724361
55019	NC_019683	ATTT	2	8	2834483	2834490	25 %	75 %	0 %	0 %	427724361
55020	NC_019683	T	7	7	2834488	2834494	0 %	100 %	0 %	0 %	427724361
55021	NC_019683	A	6	6	2834534	2834539	100 %	0 %	0 %	0 %	427724361
55022	NC_019683	AGC	2	6	2834557	2834562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427724361
55023	NC_019683	CCA	2	6	2834576	2834581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724361
55024	NC_019683	CAA	2	6	2834612	2834617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427724361
55025	NC_019683	CAG	2	6	2834655	2834660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55026	NC_019683	ACA	2	6	2834753	2834758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55027	NC_019683	GA	3	6	2834802	2834807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55028	NC_019683	AAT	2	6	2834857	2834862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55029	NC_019683	CTT	2	6	2834903	2834908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55030	NC_019683	CAAAC	2	10	2834949	2834958	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55031	NC_019683	CAACC	2	10	2834992	2835001	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
55032	NC_019683	A	6	6	2835016	2835021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55033	NC_019683	TTTAAA	2	12	2835026	2835037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55034	NC_019683	ATT	2	6	2835046	2835051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55035	NC_019683	TTTA	2	8	2835055	2835062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55036	NC_019683	AGG	2	6	2835077	2835082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55037	NC_019683	CAT	2	6	2835238	2835243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724362
55038	NC_019683	CTG	2	6	2835249	2835254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724362
55039	NC_019683	GTT	2	6	2835284	2835289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427724362
55040	NC_019683	CGG	2	6	2835295	2835300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427724362
55041	NC_019683	GAA	2	6	2835314	2835319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427724362
55042	NC_019683	TCA	2	6	2835363	2835368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724362
55043	NC_019683	GTT	2	6	2835377	2835382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427724362
55044	NC_019683	TC	3	6	2835443	2835448	0 %	50 %	0 %	50 %	427724362
55045	NC_019683	ATG	2	6	2835509	2835514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724362
55046	NC_019683	TGA	2	6	2835520	2835525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724362
55047	NC_019683	CT	3	6	2835632	2835637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55048	NC_019683	CTG	2	6	2835710	2835715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724363
55049	NC_019683	GCA	2	6	2835742	2835747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427724363
55050	NC_019683	TC	3	6	2835781	2835786	0 %	50 %	0 %	50 %	427724363
55051	NC_019683	CTT	2	6	2835856	2835861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724363
55052	NC_019683	TGG	2	6	2835882	2835887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427724363
55053	NC_019683	CGT	2	6	2835904	2835909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724363
55054	NC_019683	GCA	2	6	2835913	2835918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427724363
55055	NC_019683	TCC	2	6	2835941	2835946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427724363
55056	NC_019683	ATCC	3	12	2835977	2835988	25 %	25 %	0 %	50 %	427724363
55057	NC_019683	TGA	2	6	2835990	2835995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724363
55058	NC_019683	CT	3	6	2836029	2836034	0 %	50 %	0 %	50 %	427724363
55059	NC_019683	TC	3	6	2836051	2836056	0 %	50 %	0 %	50 %	427724363
55060	NC_019683	AAG	2	6	2836079	2836084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427724363
55061	NC_019683	CTG	2	6	2836088	2836093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724363
55062	NC_019683	TCG	2	6	2836097	2836102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724363
55063	NC_019683	GTA	2	6	2836193	2836198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55064	NC_019683	GTT	2	6	2836254	2836259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55066	NC_019683	TGG	2	6	2836277	2836282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55067	NC_019683	GTG	2	6	2836288	2836293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55068	NC_019683	T	7	7	2836341	2836347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55069	NC_019683	A	6	6	2836350	2836355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55070	NC_019683	TTTGG	2	10	2836610	2836619	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55071	NC_019683	CT	3	6	2836641	2836646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55072	NC_019683	TCAA	2	8	2836672	2836679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55073	NC_019683	TA	3	6	2836711	2836716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55074	NC_019683	A	7	7	2836726	2836732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55098	NC_019683	CAAG	2	8	2837708	2837715	50 %	0 %	25 %	25 %	427724365
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55103	NC_019683	AGC	2	6	2837809	2837814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427724365
55104	NC_019683	CTCGA	2	10	2837820	2837829	20 %	20 %	20 %	40 %	427724365
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55115	NC_019683	CGC	2	6	2838644	2838649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427724365
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55237	NC_019683	CAT	2	6	2845957	2845962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724371
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55240	NC_019683	ATCT	2	8	2846051	2846058	25 %	50 %	0 %	25 %	427724371
55241	NC_019683	GGT	2	6	2846075	2846080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427724371
55242	NC_019683	CACG	2	8	2846222	2846229	25 %	0 %	25 %	50 %	427724371
55243	NC_019683	CAT	2	6	2846230	2846235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724371
55244	NC_019683	TGG	2	6	2846251	2846256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427724371
55245	NC_019683	GTC	3	9	2846265	2846273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724371
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55250	NC_019683	TTA	2	6	2846521	2846526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55251	NC_019683	T	6	6	2846537	2846542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55252	NC_019683	AATTCC	2	12	2846588	2846599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724372
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55257	NC_019683	GA	3	6	2846919	2846924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55258	NC_019683	TGA	2	6	2847005	2847010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55260	NC_019683	TCT	2	6	2847057	2847062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55333	NC_019683	A	8	8	2850056	2850063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55334	NC_019683	TAG	2	6	2850081	2850086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55357	NC_019683	TCT	2	6	2851287	2851292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55358	NC_019683	ATT	2	6	2851354	2851359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55360	NC_019683	TTA	2	6	2851412	2851417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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