MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 99570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_019683	GAT	2	6	2629768	2629773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724157
51002	NC_019683	AATC	2	8	2629826	2629833	50 %	25 %	0 %	25 %	427724157
51003	NC_019683	AG	3	6	2629942	2629947	50 %	0 %	50 %	0 %	427724158
51004	NC_019683	AATTT	2	10	2630100	2630109	40 %	60 %	0 %	0 %	427724158
51005	NC_019683	T	6	6	2630113	2630118	0 %	100 %	0 %	0 %	427724158
51006	NC_019683	AACCA	2	10	2630143	2630152	60 %	0 %	0 %	40 %	427724158
51007	NC_019683	ACC	2	6	2630170	2630175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724158
51008	NC_019683	CACCTC	2	12	2630187	2630198	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	427724158
51009	NC_019683	GCCTGA	2	12	2630209	2630220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427724158
51010	NC_019683	ACC	2	6	2630269	2630274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724158
51011	NC_019683	TCA	2	6	2630297	2630302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724158
51012	NC_019683	GCC	2	6	2630356	2630361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427724158
51013	NC_019683	TATT	2	8	2630534	2630541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51014	NC_019683	T	6	6	2630564	2630569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51015	NC_019683	TTATT	2	10	2630614	2630623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51016	NC_019683	AC	3	6	2630785	2630790	50 %	0 %	0 %	50 %	427724159
51017	NC_019683	A	7	7	2630802	2630808	100 %	0 %	0 %	0 %	427724159
51018	NC_019683	CTGG	2	8	2630912	2630919	0 %	25 %	50 %	25 %	427724159
51019	NC_019683	AGG	2	6	2630949	2630954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427724159
51020	NC_019683	CAT	2	6	2630981	2630986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724159
51021	NC_019683	TGG	2	6	2631055	2631060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427724159
51022	NC_019683	TCT	2	6	2631112	2631117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724159
51023	NC_019683	ATT	2	6	2631120	2631125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427724159
51024	NC_019683	A	6	6	2631127	2631132	100 %	0 %	0 %	0 %	427724159
51025	NC_019683	TGTAGG	2	12	2631152	2631163	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427724159
51026	NC_019683	GGC	2	6	2631336	2631341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427724159
51027	NC_019683	TCA	2	6	2631373	2631378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724159
51028	NC_019683	CTT	2	6	2631430	2631435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51029	NC_019683	GTA	2	6	2631441	2631446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51030	NC_019683	ACAA	2	8	2631520	2631527	75 %	0 %	0 %	25 %	427724160
51031	NC_019683	TGA	2	6	2631562	2631567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724160
51032	NC_019683	AATC	2	8	2631621	2631628	50 %	25 %	0 %	25 %	427724160
51033	NC_019683	ATG	2	6	2631715	2631720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51034	NC_019683	TAAT	2	8	2631724	2631731	50 %	50 %	0 %	0 %	427724161
51035	NC_019683	AT	3	6	2631832	2631837	50 %	50 %	0 %	0 %	427724161
51036	NC_019683	TTG	2	6	2631932	2631937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427724161
51037	NC_019683	TAT	2	6	2632040	2632045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51038	NC_019683	GTT	2	6	2632071	2632076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51039	NC_019683	TTTTAT	2	12	2632092	2632103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51040	NC_019683	T	7	7	2632155	2632161	0 %	100 %	0 %	0 %	427724162
51041	NC_019683	AAC	2	6	2632168	2632173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427724162
51042	NC_019683	TCT	3	9	2632176	2632184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724162
51043	NC_019683	TCT	2	6	2632212	2632217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724162
51044	NC_019683	GAT	2	6	2632339	2632344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724162
51045	NC_019683	CCG	2	6	2632350	2632355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427724162
51046	NC_019683	CCA	2	6	2632385	2632390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724162
51047	NC_019683	T	6	6	2632395	2632400	0 %	100 %	0 %	0 %	427724162
51048	NC_019683	CTG	2	6	2632405	2632410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724162
51049	NC_019683	GA	3	6	2632494	2632499	50 %	0 %	50 %	0 %	427724162
51050	NC_019683	GAC	2	6	2632549	2632554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427724162
51051	NC_019683	TTC	3	9	2632616	2632624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724162
51052	NC_019683	CTG	2	6	2632645	2632650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724162
51053	NC_019683	ACA	2	6	2632783	2632788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51054	NC_019683	CCG	2	6	2632878	2632883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427724163
51055	NC_019683	AGC	2	6	2632918	2632923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427724163
51056	NC_019683	AAT	2	6	2632924	2632929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427724163
51057	NC_019683	TTC	2	6	2632937	2632942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724163
51058	NC_019683	ACT	2	6	2632980	2632985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724163
51059	NC_019683	T	6	6	2633025	2633030	0 %	100 %	0 %	0 %	427724163
51060	NC_019683	TGC	2	6	2633042	2633047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724163
51061	NC_019683	A	6	6	2633062	2633067	100 %	0 %	0 %	0 %	427724163
51062	NC_019683	GT	3	6	2633211	2633216	0 %	50 %	50 %	0 %	427724163
51063	NC_019683	CAC	2	6	2633260	2633265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724163
51064	NC_019683	CCA	2	6	2633286	2633291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724163
51065	NC_019683	CGC	2	6	2633328	2633333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427724163
51066	NC_019683	CAA	2	6	2633342	2633347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427724163
51067	NC_019683	ACC	2	6	2633384	2633389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724163
51068	NC_019683	CTG	2	6	2633400	2633405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724163
51069	NC_019683	TCT	2	6	2633454	2633459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724163
51070	NC_019683	CTT	2	6	2633467	2633472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724163
51071	NC_019683	AAT	2	6	2633715	2633720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427724163
51072	NC_019683	GCGATC	2	12	2633724	2633735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427724163
51073	NC_019683	CAA	2	6	2633834	2633839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427724163
51074	NC_019683	ATGACC	2	12	2633892	2633903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427724163
51075	NC_019683	CTG	2	6	2633908	2633913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724163
51076	NC_019683	TGA	2	6	2633933	2633938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724163
51077	NC_019683	GTAA	2	8	2633950	2633957	50 %	25 %	25 %	0 %	427724163
51078	NC_019683	GAAAAA	2	12	2634151	2634162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51079	NC_019683	ATG	2	6	2634250	2634255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51080	NC_019683	GCG	2	6	2634284	2634289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427724164
51081	NC_019683	TCA	2	6	2634308	2634313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724164
51082	NC_019683	CCA	2	6	2634488	2634493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724164
51083	NC_019683	TTGT	2	8	2634545	2634552	0 %	75 %	25 %	0 %	427724164
51084	NC_019683	CAG	2	6	2634666	2634671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427724164
51085	NC_019683	ACC	2	6	2634700	2634705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724164
51086	NC_019683	ACC	3	9	2634724	2634732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724164
51087	NC_019683	GTT	2	6	2634749	2634754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427724164
51088	NC_019683	CAC	2	6	2634786	2634791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724164
51089	NC_019683	TCA	2	6	2634821	2634826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724164
51090	NC_019683	CTT	2	6	2634967	2634972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427724164
51091	NC_019683	GTT	2	6	2635016	2635021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427724164
51092	NC_019683	T	6	6	2635131	2635136	0 %	100 %	0 %	0 %	427724164
51093	NC_019683	GC	3	6	2635151	2635156	0 %	0 %	50 %	50 %	427724164
51094	NC_019683	TGA	2	6	2635233	2635238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724164
51095	NC_019683	AT	3	6	2635376	2635381	50 %	50 %	0 %	0 %	427724164
51096	NC_019683	CCAC	2	8	2635442	2635449	25 %	0 %	0 %	75 %	427724164
51097	NC_019683	ACC	2	6	2635480	2635485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427724164
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51099	NC_019683	ATT	2	6	2635555	2635560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51100	NC_019683	TG	3	6	2635630	2635635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51101	NC_019683	TAT	2	6	2635658	2635663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51102	NC_019683	CGA	2	6	2635731	2635736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51103	NC_019683	TAT	2	6	2635741	2635746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51104	NC_019683	GGA	2	6	2635755	2635760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51105	NC_019683	ACA	2	6	2635764	2635769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51106	NC_019683	ATG	2	6	2635803	2635808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724165
51107	NC_019683	GCG	2	6	2635852	2635857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427724165
51108	NC_019683	CAT	2	6	2635864	2635869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724165
51109	NC_019683	TCATG	2	10	2635895	2635904	20 %	40 %	20 %	20 %	427724165
51110	NC_019683	ATTT	2	8	2635989	2635996	25 %	75 %	0 %	0 %	427724165
51111	NC_019683	ACC	2	6	2636015	2636020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51112	NC_019683	ATT	2	6	2636045	2636050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51113	NC_019683	ACA	2	6	2636081	2636086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51114	NC_019683	GCT	2	6	2636217	2636222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51115	NC_019683	AGCA	2	8	2636470	2636477	50 %	0 %	25 %	25 %	427724166
51116	NC_019683	GAT	2	6	2636496	2636501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427724166
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51118	NC_019683	CTG	2	6	2636569	2636574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724166
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51236	NC_019683	ATC	2	6	2641820	2641825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427724171
51237	NC_019683	CCT	2	6	2641855	2641860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427724171
51238	NC_019683	GTT	2	6	2641916	2641921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51239	NC_019683	TCC	2	6	2641923	2641928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51240	NC_019683	TA	3	6	2641949	2641954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51241	NC_019683	CTG	2	6	2641993	2641998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427724172
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51286	NC_019683	AGAT	2	8	2644489	2644496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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51340	NC_019683	T	7	7	2647312	2647318	0 %	100 %	0 %	0 %	427724175
51341	NC_019683	TC	3	6	2647509	2647514	0 %	50 %	0 %	50 %	427724175
51342	NC_019683	AAG	2	6	2647556	2647561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427724175
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51346	NC_019683	GT	4	8	2647760	2647767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51347	NC_019683	A	7	7	2647769	2647775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51348	NC_019683	A	6	6	2647830	2647835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51349	NC_019683	T	7	7	2647845	2647851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51350	NC_019683	GAC	2	6	2647855	2647860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51351	NC_019683	A	7	7	2647861	2647867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51352	NC_019683	A	7	7	2647932	2647938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51353	NC_019683	CTG	2	6	2647950	2647955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51354	NC_019683	AG	3	6	2648034	2648039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51355	NC_019683	ATTA	2	8	2648063	2648070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51357	NC_019683	TCT	2	6	2648152	2648157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51478	NC_019683	TA	3	6	2654466	2654471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51479	NC_019683	GGA	2	6	2654507	2654512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51481	NC_019683	TATC	2	8	2654604	2654611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51482	NC_019683	T	6	6	2654682	2654687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51483	NC_019683	TCT	2	6	2654702	2654707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51485	NC_019683	TGT	2	6	2654788	2654793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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