MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 1220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018888	TTTCCT	2	12	116	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850652
3	NC_018888	AGGG	2	8	166	173	25 %	0 %	75 %	0 %	452850652
4	NC_018888	T	6	6	183	188	0 %	100 %	0 %	0 %	452850652
5	NC_018888	AG	3	6	214	219	50 %	0 %	50 %	0 %	452850652
6	NC_018888	GA	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	452850652
7	NC_018888	AGC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
8	NC_018888	AGC	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
9	NC_018888	AAG	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850652
10	NC_018888	GCT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452850652
11	NC_018888	CAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850652
12	NC_018888	GTCGAT	2	12	602	613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452850652
13	NC_018888	ACA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850652
14	NC_018888	TTTTA	2	10	679	688	20 %	80 %	0 %	0 %	452850652
15	NC_018888	TAC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850652
16	NC_018888	CGAA	2	8	813	820	50 %	0 %	25 %	25 %	452850652
17	NC_018888	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850652
18	NC_018888	CTT	2	6	889	894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850652
19	NC_018888	ATTTCA	2	12	910	921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452850652
20	NC_018888	TGA	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850652
21	NC_018888	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850652
22	NC_018888	AAGC	2	8	989	996	50 %	0 %	25 %	25 %	452850652
23	NC_018888	GCA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
24	NC_018888	ATGTT	2	10	1089	1098	20 %	60 %	20 %	0 %	452850652
25	NC_018888	CTTG	2	8	1109	1116	0 %	50 %	25 %	25 %	452850652
26	NC_018888	CTGAA	2	10	1185	1194	40 %	20 %	20 %	20 %	452850652
27	NC_018888	GT	3	6	1350	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	452850652
28	NC_018888	A	6	6	1367	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	452850652
29	NC_018888	GAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850652
30	NC_018888	A	6	6	1523	1528	100 %	0 %	0 %	0 %	452850652
31	NC_018888	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850652
32	NC_018888	A	8	8	1647	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	452850652
33	NC_018888	TTG	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850652
34	NC_018888	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
35	NC_018888	AG	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	452850652
36	NC_018888	AGT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850652
37	NC_018888	AATT	2	8	1934	1941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018888	ACA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850653
39	NC_018888	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850653
40	NC_018888	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018888	A	8	8	2147	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	452850654
42	NC_018888	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	452850654
43	NC_018888	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850654
44	NC_018888	TAT	3	9	2406	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850654
45	NC_018888	TGGA	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	452850654
46	NC_018888	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850654
47	NC_018888	TTA	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850654
48	NC_018888	TGG	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452850654
49	NC_018888	AAT	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850654
50	NC_018888	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452850654
51	NC_018888	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850654
52	NC_018888	ATT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850654
53	NC_018888	GTAT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	25 %	0 %	452850654
54	NC_018888	AAG	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850654
55	NC_018888	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	452850654
56	NC_018888	TTG	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850654
57	NC_018888	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018888	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850655
59	NC_018888	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850655
60	NC_018888	CTT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850655
61	NC_018888	CGA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850655
62	NC_018888	TTC	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850655
63	NC_018888	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850655
64	NC_018888	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	452850655
65	NC_018888	GCTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	452850655
66	NC_018888	GA	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	452850655
67	NC_018888	T	7	7	3378	3384	0 %	100 %	0 %	0 %	452850655
68	NC_018888	AGA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850655
69	NC_018888	CTT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850656
70	NC_018888	TTTC	2	8	3785	3792	0 %	75 %	0 %	25 %	452850656
71	NC_018888	AAGT	2	8	3817	3824	50 %	25 %	25 %	0 %	452850656
72	NC_018888	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850656
73	NC_018888	TCG	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452850656
74	NC_018888	T	7	7	3892	3898	0 %	100 %	0 %	0 %	452850656
75	NC_018888	AACA	2	8	3968	3975	75 %	0 %	0 %	25 %	452850656
76	NC_018888	CGAT	2	8	3986	3993	25 %	25 %	25 %	25 %	452850656
77	NC_018888	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850656
78	NC_018888	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850656
79	NC_018888	T	6	6	4112	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	452850656
80	NC_018888	T	7	7	4190	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	452850656
81	NC_018888	CTTT	2	8	4199	4206	0 %	75 %	0 %	25 %	452850656
82	NC_018888	T	6	6	4204	4209	0 %	100 %	0 %	0 %	452850656
83	NC_018888	TTG	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850656
84	NC_018888	TTTC	2	8	4302	4309	0 %	75 %	0 %	25 %	452850656
85	NC_018888	AATTC	2	10	4320	4329	40 %	40 %	0 %	20 %	452850656
86	NC_018888	CAT	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850656
87	NC_018888	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018888	ATC	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850657
89	NC_018888	TTC	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
90	NC_018888	TCT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
91	NC_018888	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	452850657
92	NC_018888	CTT	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
93	NC_018888	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	452850657
94	NC_018888	GATG	2	8	4702	4709	25 %	25 %	50 %	0 %	452850657
95	NC_018888	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850657
96	NC_018888	AT	3	6	4802	4807	50 %	50 %	0 %	0 %	452850657
97	NC_018888	TTTG	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	452850657
98	NC_018888	GAC	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850657
99	NC_018888	TG	3	6	4983	4988	0 %	50 %	50 %	0 %	452850657
100	NC_018888	TAC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850657
101	NC_018888	TTTC	2	8	5212	5219	0 %	75 %	0 %	25 %	452850657
102	NC_018888	TTC	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
103	NC_018888	T	6	6	5339	5344	0 %	100 %	0 %	0 %	452850657
104	NC_018888	AAT	2	6	5399	5404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850657
105	NC_018888	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
106	NC_018888	AGG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452850657
107	NC_018888	TC	4	8	5444	5451	0 %	50 %	0 %	50 %	452850657
108	NC_018888	ATA	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850657
109	NC_018888	TCAT	2	8	5556	5563	25 %	50 %	0 %	25 %	452850657
110	NC_018888	GTA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850657
111	NC_018888	GAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018888	CAAG	2	8	5835	5842	50 %	0 %	25 %	25 %	452850658
113	NC_018888	ATTA	2	8	5853	5860	50 %	50 %	0 %	0 %	452850658
114	NC_018888	ATAA	2	8	5868	5875	75 %	25 %	0 %	0 %	452850658
115	NC_018888	TTA	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018888	ACA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018888	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018888	T	6	6	6017	6022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018888	AG	4	8	6055	6062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018888	A	7	7	6069	6075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018888	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018888	AGAA	2	8	6122	6129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018888	TGA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850659
124	NC_018888	A	7	7	6157	6163	100 %	0 %	0 %	0 %	452850659
125	NC_018888	T	7	7	6170	6176	0 %	100 %	0 %	0 %	452850659
126	NC_018888	T	6	6	6184	6189	0 %	100 %	0 %	0 %	452850659
127	NC_018888	TTC	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850659
128	NC_018888	CCACT	2	10	6373	6382	20 %	20 %	0 %	60 %	452850659
129	NC_018888	T	6	6	6382	6387	0 %	100 %	0 %	0 %	452850659
130	NC_018888	T	6	6	6438	6443	0 %	100 %	0 %	0 %	452850659
131	NC_018888	ACAAAA	2	12	6459	6470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452850659
132	NC_018888	CAA	2	6	6514	6519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850659
133	NC_018888	GAA	2	6	6540	6545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
134	NC_018888	A	6	6	6559	6564	100 %	0 %	0 %	0 %	452850660
135	NC_018888	AAGA	2	8	6579	6586	75 %	0 %	25 %	0 %	452850660
136	NC_018888	A	7	7	6588	6594	100 %	0 %	0 %	0 %	452850660
137	NC_018888	CAAA	3	12	6600	6611	75 %	0 %	0 %	25 %	452850660
138	NC_018888	TTC	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850660
139	NC_018888	TTATC	2	10	6634	6643	20 %	60 %	0 %	20 %	452850660
140	NC_018888	ATC	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850660
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270	NC_018888	T	8	8	11118	11125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018888	GAA	3	9	11166	11174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850666
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