MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 48477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018649	AGTC	2	8	4	11	25 %	25 %	25 %	25 %	410477578
2	NC_018649	GA	3	6	31	36	50 %	0 %	50 %	0 %	410477578
3	NC_018649	TTCA	2	8	154	161	25 %	50 %	0 %	25 %	410477578
4	NC_018649	TTA	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477578
5	NC_018649	TTTC	2	8	233	240	0 %	75 %	0 %	25 %	410477578
6	NC_018649	A	7	7	274	280	100 %	0 %	0 %	0 %	410477578
7	NC_018649	GTC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477578
8	NC_018649	TCCGG	2	10	298	307	0 %	20 %	40 %	40 %	410477578
9	NC_018649	G	6	6	310	315	0 %	0 %	100 %	0 %	410477578
10	NC_018649	CTCC	2	8	362	369	0 %	25 %	0 %	75 %	410477578
11	NC_018649	T	7	7	396	402	0 %	100 %	0 %	0 %	410477578
12	NC_018649	GTC	2	6	412	417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477578
13	NC_018649	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477578
14	NC_018649	TGAA	2	8	608	615	50 %	25 %	25 %	0 %	410477578
15	NC_018649	GAT	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477578
16	NC_018649	GAA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477578
17	NC_018649	ATC	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477578
18	NC_018649	TTC	2	6	1124	1129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477578
19	NC_018649	A	6	6	1177	1182	100 %	0 %	0 %	0 %	410477578
20	NC_018649	TGG	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477578
21	NC_018649	A	8	8	1372	1379	100 %	0 %	0 %	0 %	410477578
22	NC_018649	AAC	2	6	1385	1390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477578
23	NC_018649	AGG	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018649	GGAC	2	8	1449	1456	25 %	0 %	50 %	25 %	410477579
25	NC_018649	AG	3	6	1460	1465	50 %	0 %	50 %	0 %	410477579
26	NC_018649	CTG	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477579
27	NC_018649	AGG	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477579
28	NC_018649	A	7	7	1629	1635	100 %	0 %	0 %	0 %	410477579
29	NC_018649	TCA	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477579
30	NC_018649	ATT	2	6	1787	1792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477579
31	NC_018649	TCA	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477579
32	NC_018649	CTC	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477579
33	NC_018649	CTGG	2	8	1996	2003	0 %	25 %	50 %	25 %	410477579
34	NC_018649	CAGA	2	8	2005	2012	50 %	0 %	25 %	25 %	410477579
35	NC_018649	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477579
36	NC_018649	TCT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477579
37	NC_018649	TTA	2	6	2145	2150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477579
38	NC_018649	TCCC	2	8	2199	2206	0 %	25 %	0 %	75 %	410477579
39	NC_018649	GCT	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477579
40	NC_018649	TCC	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477579
41	NC_018649	CCG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477579
42	NC_018649	TTA	2	6	2552	2557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477579
43	NC_018649	AGG	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018649	GAA	3	9	2672	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
45	NC_018649	GGTCCG	2	12	2722	2733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410477580
46	NC_018649	CAC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410477580
47	NC_018649	ACA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
48	NC_018649	ATGC	2	8	2909	2916	25 %	25 %	25 %	25 %	410477580
49	NC_018649	CAA	3	9	2977	2985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
50	NC_018649	AG	3	6	3150	3155	50 %	0 %	50 %	0 %	410477580
51	NC_018649	AC	3	6	3216	3221	50 %	0 %	0 %	50 %	410477580
52	NC_018649	GAA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
53	NC_018649	GGA	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477580
54	NC_018649	AGG	2	6	3319	3324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477580
55	NC_018649	ATG	2	6	3372	3377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477580
56	NC_018649	T	7	7	3381	3387	0 %	100 %	0 %	0 %	410477580
57	NC_018649	ACA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
58	NC_018649	ATC	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477580
59	NC_018649	GAA	2	6	3743	3748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
60	NC_018649	A	7	7	3764	3770	100 %	0 %	0 %	0 %	410477580
61	NC_018649	GCC	2	6	3809	3814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477580
62	NC_018649	A	6	6	3841	3846	100 %	0 %	0 %	0 %	410477580
63	NC_018649	CCG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477580
64	NC_018649	TTC	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
65	NC_018649	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477580
66	NC_018649	CGGATG	2	12	4152	4163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410477580
67	NC_018649	CTT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
68	NC_018649	TTGA	2	8	4223	4230	25 %	50 %	25 %	0 %	410477580
69	NC_018649	C	7	7	4256	4262	0 %	0 %	0 %	100 %	410477580
70	NC_018649	ACGG	2	8	4278	4285	25 %	0 %	50 %	25 %	410477580
71	NC_018649	ATG	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477580
72	NC_018649	TGGC	2	8	4382	4389	0 %	25 %	50 %	25 %	410477580
73	NC_018649	GA	3	6	4390	4395	50 %	0 %	50 %	0 %	410477580
74	NC_018649	CTT	2	6	4412	4417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
75	NC_018649	GAA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
76	NC_018649	GAA	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
77	NC_018649	GCC	2	6	4538	4543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477580
78	NC_018649	TGGG	2	8	4579	4586	0 %	25 %	75 %	0 %	410477580
79	NC_018649	GGA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477580
80	NC_018649	GAA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
81	NC_018649	T	6	6	4673	4678	0 %	100 %	0 %	0 %	410477580
82	NC_018649	CTT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
83	NC_018649	TC	3	6	4754	4759	0 %	50 %	0 %	50 %	410477580
84	NC_018649	CTT	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
85	NC_018649	GAA	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
86	NC_018649	TCCA	2	8	4895	4902	25 %	25 %	0 %	50 %	410477580
87	NC_018649	AAC	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
88	NC_018649	ACC	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410477580
89	NC_018649	C	6	6	5049	5054	0 %	0 %	0 %	100 %	410477580
90	NC_018649	GGAG	2	8	5055	5062	25 %	0 %	75 %	0 %	410477580
91	NC_018649	AT	3	6	5100	5105	50 %	50 %	0 %	0 %	410477580
92	NC_018649	T	6	6	5108	5113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018649	AGGG	2	8	5151	5158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018649	TGA	3	9	5198	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477581
95	NC_018649	ATT	2	6	5227	5232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477581
96	NC_018649	GTCG	2	8	5247	5254	0 %	25 %	50 %	25 %	410477581
97	NC_018649	G	6	6	5336	5341	0 %	0 %	100 %	0 %	410477581
98	NC_018649	CCG	2	6	5422	5427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
99	NC_018649	GCC	2	6	5511	5516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
100	NC_018649	GAA	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
101	NC_018649	ATG	2	6	5559	5564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477581
102	NC_018649	TTC	2	6	5632	5637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
103	NC_018649	CTT	3	9	5652	5660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
104	NC_018649	TCCC	2	8	5704	5711	0 %	25 %	0 %	75 %	410477581
105	NC_018649	ATT	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477581
106	NC_018649	TCT	2	6	5738	5743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
107	NC_018649	CGA	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477581
108	NC_018649	TCT	2	6	5780	5785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
109	NC_018649	GGT	2	6	5817	5822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477581
110	NC_018649	GTG	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477581
111	NC_018649	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
112	NC_018649	ATC	3	9	5934	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477581
113	NC_018649	GATC	2	8	6071	6078	25 %	25 %	25 %	25 %	410477581
114	NC_018649	CGC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
115	NC_018649	TC	3	6	6191	6196	0 %	50 %	0 %	50 %	410477581
116	NC_018649	T	6	6	6218	6223	0 %	100 %	0 %	0 %	410477581
117	NC_018649	GTC	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477581
118	NC_018649	CCG	2	6	6248	6253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
119	NC_018649	AG	3	6	6310	6315	50 %	0 %	50 %	0 %	410477581
120	NC_018649	GATCA	2	10	6330	6339	40 %	20 %	20 %	20 %	410477581
121	NC_018649	GAA	2	6	6492	6497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
122	NC_018649	AGA	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
123	NC_018649	GGA	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477581
124	NC_018649	GA	3	6	6634	6639	50 %	0 %	50 %	0 %	410477581
125	NC_018649	TCGA	2	8	6642	6649	25 %	25 %	25 %	25 %	410477581
126	NC_018649	AT	3	6	6698	6703	50 %	50 %	0 %	0 %	410477581
127	NC_018649	CCCA	2	8	6729	6736	25 %	0 %	0 %	75 %	410477581
128	NC_018649	GGA	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477581
129	NC_018649	T	6	6	6831	6836	0 %	100 %	0 %	0 %	410477581
130	NC_018649	CG	3	6	6896	6901	0 %	0 %	50 %	50 %	410477581
131	NC_018649	GAA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
132	NC_018649	GTCTT	2	10	6991	7000	0 %	60 %	20 %	20 %	410477581
133	NC_018649	CTC	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477581
134	NC_018649	ATC	2	6	7068	7073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477581
135	NC_018649	TTG	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477581
136	NC_018649	CCAT	2	8	7177	7184	25 %	25 %	0 %	50 %	410477581
137	NC_018649	GTG	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477581
138	NC_018649	GGA	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477581
139	NC_018649	TGT	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477581
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267	NC_018649	TGA	2	6	14215	14220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_018649	T	6	6	14323	14328	0 %	100 %	0 %	0 %	410477590
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270	NC_018649	ACC	2	6	14447	14452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410477590
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272	NC_018649	GAT	2	6	14514	14519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477590
273	NC_018649	TCC	2	6	14564	14569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477590
274	NC_018649	ATCC	2	8	14608	14615	25 %	25 %	0 %	50 %	410477590
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276	NC_018649	GAT	2	6	14709	14714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477590
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292	NC_018649	CGG	2	6	15820	15825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_018649	AT	3	6	19005	19010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
353	NC_018649	ATT	2	6	19195	19200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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