MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 58899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35005	NC_018641	TGA	2	6	1836418	1836423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35006	NC_018641	A	6	6	1836458	1836463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35102	NC_018641	GTC	2	6	1841787	1841792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997534
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35120	NC_018641	ATC	2	6	1842893	1842898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997534
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35356	NC_018641	TAA	2	6	1855953	1855958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409997551
35357	NC_018641	GTC	2	6	1855970	1855975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35358	NC_018641	TCA	2	6	1856019	1856024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997551
35359	NC_018641	TTC	2	6	1856135	1856140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997551
35360	NC_018641	CAA	2	6	1856158	1856163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409997551
35361	NC_018641	CAT	2	6	1856240	1856245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997551
35362	NC_018641	GT	3	6	1856443	1856448	0 %	50 %	50 %	0 %	409997551
35363	NC_018641	CGA	2	6	1856505	1856510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35364	NC_018641	GAA	2	6	1856567	1856572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409997551
35365	NC_018641	CAG	2	6	1856611	1856616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35366	NC_018641	CTT	2	6	1856617	1856622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997551
35367	NC_018641	CGT	2	6	1856625	1856630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35368	NC_018641	CAT	2	6	1856635	1856640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997551
35369	NC_018641	TGCCG	2	10	1856666	1856675	0 %	20 %	40 %	40 %	409997551
35370	NC_018641	GCA	2	6	1856686	1856691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35371	NC_018641	TGC	2	6	1856698	1856703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35372	NC_018641	CTTGC	2	10	1856705	1856714	0 %	40 %	20 %	40 %	409997551
35373	NC_018641	CAG	2	6	1856735	1856740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35374	NC_018641	TTC	2	6	1856783	1856788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997551
35375	NC_018641	CAG	2	6	1856833	1856838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35376	NC_018641	CAAC	2	8	1856842	1856849	50 %	0 %	0 %	50 %	409997551
35377	NC_018641	CTT	2	6	1856852	1856857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997551
35378	NC_018641	ATC	2	6	1856969	1856974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997551
35379	NC_018641	GTA	2	6	1857008	1857013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409997551
35380	NC_018641	AGC	2	6	1857074	1857079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35381	NC_018641	GCT	2	6	1857093	1857098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997551
35382	NC_018641	CAT	2	6	1857127	1857132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997551
35383	NC_018641	CTT	2	6	1857218	1857223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997551
35384	NC_018641	T	6	6	1857342	1857347	0 %	100 %	0 %	0 %	409997551
35385	NC_018641	GAA	2	6	1857349	1857354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409997551
35386	NC_018641	A	6	6	1857358	1857363	100 %	0 %	0 %	0 %	409997551
35387	NC_018641	CT	3	6	1857540	1857545	0 %	50 %	0 %	50 %	409997552
35388	NC_018641	TTG	2	6	1857559	1857564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409997552
35389	NC_018641	CT	3	6	1857635	1857640	0 %	50 %	0 %	50 %	409997552
35390	NC_018641	AG	3	6	1857738	1857743	50 %	0 %	50 %	0 %	409997552
35391	NC_018641	TCCG	2	8	1857771	1857778	0 %	25 %	25 %	50 %	409997552
35392	NC_018641	CAT	2	6	1857806	1857811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997552
35393	NC_018641	CCG	2	6	1857882	1857887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409997553
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35395	NC_018641	A	6	6	1857906	1857911	100 %	0 %	0 %	0 %	409997553
35396	NC_018641	ATG	2	6	1857924	1857929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409997553
35397	NC_018641	T	6	6	1858027	1858032	0 %	100 %	0 %	0 %	409997553
35398	NC_018641	ATG	2	6	1858053	1858058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409997553
35399	NC_018641	TCG	2	6	1858068	1858073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997553
35400	NC_018641	ATC	2	6	1858106	1858111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997553
35401	NC_018641	GC	3	6	1858126	1858131	0 %	0 %	50 %	50 %	409997553
35402	NC_018641	GTT	2	6	1858163	1858168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409997553
35403	NC_018641	TTTCA	2	10	1858181	1858190	20 %	60 %	0 %	20 %	409997553
35404	NC_018641	TGA	2	6	1858314	1858319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409997553
35405	NC_018641	CAA	2	6	1858336	1858341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409997553
35406	NC_018641	GCC	2	6	1858362	1858367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409997553
35407	NC_018641	CATC	2	8	1858375	1858382	25 %	25 %	0 %	50 %	409997553
35408	NC_018641	TCA	2	6	1858386	1858391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997553
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35411	NC_018641	CCA	2	6	1858537	1858542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409997553
35412	NC_018641	TTCG	2	8	1858594	1858601	0 %	50 %	25 %	25 %	409997553
35413	NC_018641	CAT	2	6	1858642	1858647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997553
35414	NC_018641	TGT	2	6	1858665	1858670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409997553
35415	NC_018641	CTT	2	6	1858705	1858710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997553
35416	NC_018641	CCT	2	6	1858796	1858801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409997554
35417	NC_018641	GCT	2	6	1858835	1858840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35418	NC_018641	TTTTC	2	10	1858869	1858878	0 %	80 %	0 %	20 %	409997554
35419	NC_018641	CTT	2	6	1858890	1858895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997554
35420	NC_018641	AGC	2	6	1858999	1859004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35421	NC_018641	TGAT	2	8	1859063	1859070	25 %	50 %	25 %	0 %	409997554
35422	NC_018641	AATC	2	8	1859094	1859101	50 %	25 %	0 %	25 %	409997554
35423	NC_018641	TCG	2	6	1859112	1859117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35424	NC_018641	CTCA	2	8	1859137	1859144	25 %	25 %	0 %	50 %	409997554
35425	NC_018641	GCT	2	6	1859145	1859150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35426	NC_018641	GTT	2	6	1859167	1859172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409997554
35427	NC_018641	T	6	6	1859192	1859197	0 %	100 %	0 %	0 %	409997554
35428	NC_018641	GGC	2	6	1859206	1859211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409997554
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35430	NC_018641	CGT	2	6	1859290	1859295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35431	NC_018641	GTC	2	6	1859297	1859302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35432	NC_018641	CGG	2	6	1859419	1859424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409997554
35433	NC_018641	GCC	3	9	1859536	1859544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409997554
35434	NC_018641	CTT	2	6	1859568	1859573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997554
35435	NC_018641	CCA	2	6	1859598	1859603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409997554
35436	NC_018641	CTG	2	6	1859604	1859609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35437	NC_018641	T	6	6	1859730	1859735	0 %	100 %	0 %	0 %	409997554
35438	NC_018641	GTA	2	6	1859821	1859826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409997554
35439	NC_018641	AAT	2	6	1859897	1859902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409997554
35440	NC_018641	ATCAAT	2	12	1859905	1859916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	409997554
35441	NC_018641	CAG	2	6	1859929	1859934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997554
35442	NC_018641	CCTG	2	8	1860098	1860105	0 %	25 %	25 %	50 %	409997554
35443	NC_018641	TGCA	2	8	1860128	1860135	25 %	25 %	25 %	25 %	409997554
35444	NC_018641	GAT	2	6	1860204	1860209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35445	NC_018641	CTT	2	6	1860215	1860220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997555
35446	NC_018641	TCTTT	2	10	1860223	1860232	0 %	80 %	0 %	20 %	409997555
35447	NC_018641	TCA	2	6	1860235	1860240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997555
35448	NC_018641	CAT	2	6	1860316	1860321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997555
35449	NC_018641	CGCA	2	8	1860389	1860396	25 %	0 %	25 %	50 %	409997555
35450	NC_018641	CAG	2	6	1860457	1860462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997555
35451	NC_018641	TCT	2	6	1860484	1860489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997555
35452	NC_018641	TTC	2	6	1860500	1860505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997555
35453	NC_018641	CGG	2	6	1860597	1860602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409997555
35454	NC_018641	TAT	2	6	1860652	1860657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409997555
35455	NC_018641	TTA	2	6	1860711	1860716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35456	NC_018641	ATT	2	6	1860800	1860805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409997556
35457	NC_018641	ATCA	2	8	1860806	1860813	50 %	25 %	0 %	25 %	409997556
35458	NC_018641	TGC	2	6	1860827	1860832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997556
35459	NC_018641	ACA	2	6	1860982	1860987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409997556
35460	NC_018641	CTGA	2	8	1861043	1861050	25 %	25 %	25 %	25 %	409997556
35461	NC_018641	CTGG	2	8	1861102	1861109	0 %	25 %	50 %	25 %	409997556
35462	NC_018641	A	6	6	1861111	1861116	100 %	0 %	0 %	0 %	409997556
35463	NC_018641	CG	3	6	1861154	1861159	0 %	0 %	50 %	50 %	409997556
35464	NC_018641	CGA	2	6	1861216	1861221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409997556
35465	NC_018641	CCA	2	6	1861246	1861251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409997556
35466	NC_018641	GCC	2	6	1861341	1861346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409997556
35467	NC_018641	TCG	2	6	1861416	1861421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997557
35468	NC_018641	GC	3	6	1861515	1861520	0 %	0 %	50 %	50 %	409997557
35469	NC_018641	GCC	2	6	1861525	1861530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409997557
35470	NC_018641	GCTG	2	8	1861607	1861614	0 %	25 %	50 %	25 %	409997557
35471	NC_018641	TCA	2	6	1861646	1861651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997557
35472	NC_018641	ATG	2	6	1861714	1861719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409997557
35473	NC_018641	CGTG	2	8	1861756	1861763	0 %	25 %	50 %	25 %	409997557
35474	NC_018641	AATC	2	8	1861822	1861829	50 %	25 %	0 %	25 %	409997557
35475	NC_018641	CCGA	2	8	1861834	1861841	25 %	0 %	25 %	50 %	409997557
35476	NC_018641	AACGT	2	10	1861889	1861898	40 %	20 %	20 %	20 %	409997557
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35479	NC_018641	AGCG	2	8	1862141	1862148	25 %	0 %	50 %	25 %	409997557
35480	NC_018641	CTG	2	6	1862257	1862262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409997558
35481	NC_018641	TCT	2	6	1862304	1862309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409997558
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35491	NC_018641	TCA	2	6	1862931	1862936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409997558
35492	NC_018641	CAA	2	6	1863044	1863049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409997558
35493	NC_018641	ACA	2	6	1863054	1863059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409997558
35494	NC_018641	AATTT	2	10	1863067	1863076	40 %	60 %	0 %	0 %	409997558
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