MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 43538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_018631	AATC	2	8	1559381	1559388	50 %	25 %	0 %	25 %	406600475
36002	NC_018631	CAC	2	6	1559413	1559418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600475
36003	NC_018631	CTT	2	6	1559431	1559436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600475
36004	NC_018631	ACG	2	6	1559444	1559449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600475
36005	NC_018631	T	6	6	1559532	1559537	0 %	100 %	0 %	0 %	406600475
36006	NC_018631	ATTTT	2	10	1559541	1559550	20 %	80 %	0 %	0 %	406600475
36007	NC_018631	TGGA	2	8	1559636	1559643	25 %	25 %	50 %	0 %	406600475
36008	NC_018631	GCA	2	6	1559712	1559717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600475
36009	NC_018631	ACC	2	6	1559738	1559743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600475
36010	NC_018631	AGC	2	6	1559744	1559749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600475
36011	NC_018631	CCA	2	6	1559820	1559825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600475
36012	NC_018631	T	6	6	1559861	1559866	0 %	100 %	0 %	0 %	406600475
36013	NC_018631	CAT	2	6	1559870	1559875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600475
36014	NC_018631	AAT	2	6	1559912	1559917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600475
36015	NC_018631	ACA	2	6	1559973	1559978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600475
36016	NC_018631	CTT	2	6	1559986	1559991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600475
36017	NC_018631	AAT	2	6	1559993	1559998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600475
36018	NC_018631	CGA	2	6	1560090	1560095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600475
36019	NC_018631	GCT	2	6	1560159	1560164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600475
36020	NC_018631	T	6	6	1560224	1560229	0 %	100 %	0 %	0 %	406600475
36021	NC_018631	TGC	2	6	1560319	1560324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600476
36022	NC_018631	TGT	2	6	1560358	1560363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600476
36023	NC_018631	TGT	2	6	1560469	1560474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600476
36024	NC_018631	TCT	2	6	1560491	1560496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600476
36025	NC_018631	CTA	2	6	1560510	1560515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600476
36026	NC_018631	TGTC	2	8	1560546	1560553	0 %	50 %	25 %	25 %	406600476
36027	NC_018631	ATTCT	2	10	1560557	1560566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36028	NC_018631	ATTT	2	8	1560623	1560630	25 %	75 %	0 %	0 %	406600477
36029	NC_018631	GC	3	6	1560646	1560651	0 %	0 %	50 %	50 %	406600477
36030	NC_018631	ACC	2	6	1560662	1560667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600477
36031	NC_018631	CAA	2	6	1560676	1560681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600477
36032	NC_018631	CAA	2	6	1560731	1560736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600477
36033	NC_018631	TGC	2	6	1560749	1560754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600477
36034	NC_018631	AATA	2	8	1560855	1560862	75 %	25 %	0 %	0 %	406600477
36035	NC_018631	CTG	2	6	1560877	1560882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600477
36036	NC_018631	TCT	2	6	1560894	1560899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600477
36037	NC_018631	TGA	2	6	1560963	1560968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600477
36038	NC_018631	TTA	2	6	1561011	1561016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600477
36039	NC_018631	CTA	2	6	1561030	1561035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600477
36040	NC_018631	CGTA	2	8	1561054	1561061	25 %	25 %	25 %	25 %	406600477
36041	NC_018631	TGT	3	9	1561094	1561102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600477
36042	NC_018631	CAA	2	6	1561105	1561110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600477
36043	NC_018631	CTG	2	6	1561117	1561122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600477
36044	NC_018631	CTG	2	6	1561141	1561146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600477
36045	NC_018631	CTA	2	6	1561165	1561170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600477
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36048	NC_018631	TAG	2	6	1561231	1561236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600477
36049	NC_018631	GCA	2	6	1561269	1561274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600477
36050	NC_018631	CAAAAG	2	12	1561282	1561293	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406600477
36051	NC_018631	TGC	2	6	1561325	1561330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600477
36052	NC_018631	AAT	2	6	1561370	1561375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600477
36053	NC_018631	CTG	2	6	1561390	1561395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600477
36054	NC_018631	TAA	2	6	1561412	1561417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600477
36055	NC_018631	TGT	2	6	1561457	1561462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600477
36056	NC_018631	TGA	2	6	1561476	1561481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600477
36057	NC_018631	TCA	2	6	1561506	1561511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600477
36058	NC_018631	TAA	2	6	1561696	1561701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600478
36059	NC_018631	TGA	2	6	1561730	1561735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600478
36060	NC_018631	ACA	2	6	1561745	1561750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600478
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36062	NC_018631	TCT	2	6	1561804	1561809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600478
36063	NC_018631	T	6	6	1561899	1561904	0 %	100 %	0 %	0 %	406600478
36064	NC_018631	TG	3	6	1561930	1561935	0 %	50 %	50 %	0 %	406600478
36065	NC_018631	AGC	2	6	1561978	1561983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600478
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36070	NC_018631	GT	3	6	1562055	1562060	0 %	50 %	50 %	0 %	406600478
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36072	NC_018631	T	7	7	1562215	1562221	0 %	100 %	0 %	0 %	406600479
36073	NC_018631	CAT	2	6	1562230	1562235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600479
36074	NC_018631	TGA	2	6	1562276	1562281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600479
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36081	NC_018631	ATTT	2	8	1562622	1562629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36082	NC_018631	TAAAA	2	10	1562651	1562660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36083	NC_018631	GAT	2	6	1562700	1562705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600480
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36085	NC_018631	GCA	2	6	1562771	1562776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600480
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36087	NC_018631	GTT	2	6	1562788	1562793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600480
36088	NC_018631	ATC	2	6	1562857	1562862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600480
36089	NC_018631	TAC	2	6	1562883	1562888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600480
36090	NC_018631	TCG	2	6	1563070	1563075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600480
36091	NC_018631	CTG	2	6	1563100	1563105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600480
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36098	NC_018631	AATA	2	8	1563401	1563408	75 %	25 %	0 %	0 %	406600480
36099	NC_018631	CATG	2	8	1563420	1563427	25 %	25 %	25 %	25 %	406600480
36100	NC_018631	TGA	2	6	1563469	1563474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600480
36101	NC_018631	A	6	6	1563538	1563543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36102	NC_018631	A	7	7	1563554	1563560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36103	NC_018631	TTTTA	2	10	1563576	1563585	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36104	NC_018631	T	6	6	1563599	1563604	0 %	100 %	0 %	0 %	406600481
36105	NC_018631	CAA	2	6	1563621	1563626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600481
36106	NC_018631	AGT	2	6	1563705	1563710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600481
36107	NC_018631	TG	3	6	1563745	1563750	0 %	50 %	50 %	0 %	406600481
36108	NC_018631	ATG	2	6	1563757	1563762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600481
36109	NC_018631	TGATTC	2	12	1563798	1563809	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406600481
36110	NC_018631	CTT	2	6	1563813	1563818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600481
36111	NC_018631	TGC	2	6	1563822	1563827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600481
36112	NC_018631	TCA	2	6	1563835	1563840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600481
36113	NC_018631	CTT	2	6	1563848	1563853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600481
36114	NC_018631	AGC	2	6	1563963	1563968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600481
36115	NC_018631	TGA	2	6	1563972	1563977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600481
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36117	NC_018631	TTG	2	6	1564011	1564016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600481
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36218	NC_018631	T	7	7	1568891	1568897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36219	NC_018631	AAAC	2	8	1568953	1568960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36220	NC_018631	GC	3	6	1568976	1568981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36221	NC_018631	TAG	2	6	1569016	1569021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36222	NC_018631	AAGA	2	8	1569032	1569039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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36231	NC_018631	CT	3	6	1569234	1569239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36232	NC_018631	ATT	2	6	1569244	1569249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600486
36233	NC_018631	ATT	2	6	1569257	1569262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600486
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