MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 43538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_018631	GT	3	6	1514771	1514776	0 %	50 %	50 %	0 %	406600423
35003	NC_018631	TGC	2	6	1514829	1514834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600423
35004	NC_018631	A	6	6	1514868	1514873	100 %	0 %	0 %	0 %	406600423
35005	NC_018631	CAA	2	6	1514930	1514935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600423
35006	NC_018631	TCA	2	6	1514947	1514952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600423
35007	NC_018631	GCAACA	2	12	1514953	1514964	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406600423
35008	NC_018631	TAA	2	6	1514997	1515002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600423
35009	NC_018631	TCG	2	6	1515060	1515065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35010	NC_018631	CTAA	2	8	1515095	1515102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35011	NC_018631	AT	3	6	1515164	1515169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35012	NC_018631	T	6	6	1515230	1515235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35013	NC_018631	T	6	6	1515274	1515279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35014	NC_018631	GCT	2	6	1515286	1515291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35015	NC_018631	A	6	6	1515312	1515317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35016	NC_018631	ACA	2	6	1515327	1515332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35017	NC_018631	CAA	2	6	1515402	1515407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600424
35018	NC_018631	ATCA	2	8	1515481	1515488	50 %	25 %	0 %	25 %	406600424
35019	NC_018631	TGC	2	6	1515508	1515513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600424
35020	NC_018631	TGT	2	6	1515535	1515540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600424
35021	NC_018631	TTG	2	6	1515589	1515594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600424
35022	NC_018631	T	6	6	1515707	1515712	0 %	100 %	0 %	0 %	406600424
35023	NC_018631	TGT	2	6	1515728	1515733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600424
35024	NC_018631	AAT	3	9	1515741	1515749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600424
35025	NC_018631	CTC	2	6	1515769	1515774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35026	NC_018631	ACC	2	6	1515882	1515887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600425
35027	NC_018631	AAT	2	6	1515954	1515959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600425
35028	NC_018631	TGC	2	6	1516002	1516007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600425
35029	NC_018631	CTG	2	6	1516052	1516057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600425
35030	NC_018631	GTA	2	6	1516172	1516177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600425
35031	NC_018631	A	7	7	1516197	1516203	100 %	0 %	0 %	0 %	406600425
35032	NC_018631	TAAT	2	8	1516205	1516212	50 %	50 %	0 %	0 %	406600425
35033	NC_018631	CAA	2	6	1516244	1516249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600425
35034	NC_018631	A	7	7	1516276	1516282	100 %	0 %	0 %	0 %	406600425
35035	NC_018631	ACA	2	6	1516309	1516314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600425
35036	NC_018631	CCA	2	6	1516345	1516350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600425
35037	NC_018631	GCT	2	6	1516354	1516359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600425
35038	NC_018631	CCTG	2	8	1516369	1516376	0 %	25 %	25 %	50 %	406600425
35039	NC_018631	GCA	2	6	1516378	1516383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600425
35040	NC_018631	A	6	6	1516402	1516407	100 %	0 %	0 %	0 %	406600425
35041	NC_018631	T	6	6	1516418	1516423	0 %	100 %	0 %	0 %	406600425
35042	NC_018631	AAC	2	6	1516431	1516436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600425
35043	NC_018631	AAAGA	2	10	1516468	1516477	80 %	0 %	20 %	0 %	406600425
35044	NC_018631	AAC	2	6	1516603	1516608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600426
35045	NC_018631	TCA	2	6	1516631	1516636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600426
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35049	NC_018631	CG	3	6	1516838	1516843	0 %	0 %	50 %	50 %	406600426
35050	NC_018631	GCT	2	6	1516844	1516849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600426
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35052	NC_018631	ACA	2	6	1516895	1516900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600426
35053	NC_018631	TA	3	6	1516941	1516946	50 %	50 %	0 %	0 %	406600426
35054	NC_018631	TCA	2	6	1516988	1516993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600426
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35056	NC_018631	CAA	2	6	1517145	1517150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600426
35057	NC_018631	CTG	3	9	1517151	1517159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600426
35058	NC_018631	TTC	2	6	1517218	1517223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600426
35059	NC_018631	CCA	2	6	1517228	1517233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600426
35060	NC_018631	CTG	2	6	1517361	1517366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600426
35061	NC_018631	CAA	2	6	1517379	1517384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600426
35062	NC_018631	CAG	2	6	1517421	1517426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600426
35063	NC_018631	GTT	2	6	1517523	1517528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600426
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35065	NC_018631	A	6	6	1517681	1517686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35066	NC_018631	ATA	2	6	1517705	1517710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35067	NC_018631	AAAATG	2	12	1517726	1517737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35068	NC_018631	ACA	2	6	1517822	1517827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600427
35069	NC_018631	TTA	2	6	1517838	1517843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600427
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35071	NC_018631	TGC	2	6	1517887	1517892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600427
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35074	NC_018631	TTTG	2	8	1518028	1518035	0 %	75 %	25 %	0 %	406600427
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35087	NC_018631	AGA	2	6	1518553	1518558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600427
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35089	NC_018631	ATT	2	6	1518623	1518628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600427
35090	NC_018631	AGC	2	6	1518643	1518648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600427
35091	NC_018631	CAGA	2	8	1518756	1518763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35092	NC_018631	TAA	2	6	1518769	1518774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35093	NC_018631	TCTG	2	8	1518777	1518784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35094	NC_018631	GTG	2	6	1518816	1518821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600428
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35102	NC_018631	TAT	2	6	1519209	1519214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600428
35103	NC_018631	T	6	6	1519266	1519271	0 %	100 %	0 %	0 %	406600428
35104	NC_018631	TGT	2	6	1519335	1519340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600428
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35110	NC_018631	CAT	2	6	1519570	1519575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600428
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35113	NC_018631	TCA	2	6	1519691	1519696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600428
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35115	NC_018631	T	6	6	1519708	1519713	0 %	100 %	0 %	0 %	406600428
35116	NC_018631	AAT	2	6	1519738	1519743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35117	NC_018631	TAG	2	6	1519802	1519807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600429
35118	NC_018631	ATTA	2	8	1519830	1519837	50 %	50 %	0 %	0 %	406600429
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35130	NC_018631	TATT	2	8	1520230	1520237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35131	NC_018631	AAT	2	6	1520252	1520257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35211	NC_018631	ATAA	2	8	1523703	1523710	75 %	25 %	0 %	0 %	406600432
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35218	NC_018631	AGC	2	6	1523967	1523972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600432
35219	NC_018631	ATTTT	2	10	1524001	1524010	20 %	80 %	0 %	0 %	406600432
35220	NC_018631	TTA	2	6	1524055	1524060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600432
35221	NC_018631	TCA	2	6	1524065	1524070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600432
35222	NC_018631	GCCAT	2	10	1524079	1524088	20 %	20 %	20 %	40 %	406600432
35223	NC_018631	ACA	2	6	1524148	1524153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600432
35224	NC_018631	T	6	6	1524301	1524306	0 %	100 %	0 %	0 %	406600432
35225	NC_018631	TAA	2	6	1524334	1524339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600432
35226	NC_018631	CTT	2	6	1524359	1524364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600432
35227	NC_018631	AAT	2	6	1524393	1524398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600432
35228	NC_018631	T	6	6	1524654	1524659	0 %	100 %	0 %	0 %	406600432
35229	NC_018631	A	6	6	1524691	1524696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35230	NC_018631	T	6	6	1524715	1524720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35231	NC_018631	ATA	2	6	1524742	1524747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35232	NC_018631	CATTT	2	10	1524753	1524762	20 %	60 %	0 %	20 %	406600433
35233	NC_018631	ATGC	2	8	1524763	1524770	25 %	25 %	25 %	25 %	406600433
35234	NC_018631	AAT	2	6	1524917	1524922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600433
35235	NC_018631	TTC	2	6	1524948	1524953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600433
35236	NC_018631	CACC	2	8	1524970	1524977	25 %	0 %	0 %	75 %	406600433
35237	NC_018631	GCAATG	2	12	1525047	1525058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406600433
35238	NC_018631	ACC	2	6	1525070	1525075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600433
35239	NC_018631	T	6	6	1525142	1525147	0 %	100 %	0 %	0 %	406600433
35240	NC_018631	GCA	2	6	1525152	1525157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600433
35241	NC_018631	CAGTA	2	10	1525205	1525214	40 %	20 %	20 %	20 %	406600433
35242	NC_018631	TTA	2	6	1525218	1525223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600433
35243	NC_018631	ATACC	2	10	1525243	1525252	40 %	20 %	0 %	40 %	406600433
35244	NC_018631	GAA	2	6	1525357	1525362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600433
35245	NC_018631	ACC	2	6	1525398	1525403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600433
35246	NC_018631	TACTTT	2	12	1525484	1525495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406600433
35247	NC_018631	T	8	8	1525493	1525500	0 %	100 %	0 %	0 %	406600433
35248	NC_018631	TCA	2	6	1525510	1525515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600433
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35250	NC_018631	TAA	2	6	1525713	1525718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600434
35251	NC_018631	CAT	2	6	1525726	1525731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600434
35252	NC_018631	GA	3	6	1525789	1525794	50 %	0 %	50 %	0 %	406600434
35253	NC_018631	AGC	2	6	1525849	1525854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600434
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35255	NC_018631	ATG	2	6	1525991	1525996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600434
35256	NC_018631	GTT	2	6	1525997	1526002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600434
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35259	NC_018631	TGC	2	6	1526175	1526180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600434
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35264	NC_018631	ACC	2	6	1526319	1526324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600434
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35267	NC_018631	T	6	6	1526587	1526592	0 %	100 %	0 %	0 %	406600434
35268	NC_018631	CAGCC	2	10	1526595	1526604	20 %	0 %	20 %	60 %	406600434
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35282	NC_018631	T	7	7	1527014	1527020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35283	NC_018631	ATT	3	9	1527026	1527034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35284	NC_018631	A	6	6	1527077	1527082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35285	NC_018631	TAAT	2	8	1527163	1527170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35286	NC_018631	AAT	2	6	1527207	1527212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600435
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35308	NC_018631	CCTCT	2	10	1528277	1528286	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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35310	NC_018631	A	6	6	1528355	1528360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35312	NC_018631	TCGT	2	8	1528389	1528396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35313	NC_018631	AAT	2	6	1528438	1528443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35336	NC_018631	TTTA	2	8	1529465	1529472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35337	NC_018631	TAA	2	6	1529477	1529482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35339	NC_018631	TAAA	2	8	1529597	1529604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35340	NC_018631	T	7	7	1529615	1529621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35341	NC_018631	ACA	3	9	1529626	1529634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35343	NC_018631	CAC	2	6	1529778	1529783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600437
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35347	NC_018631	CAA	2	6	1530113	1530118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35348	NC_018631	ACT	2	6	1530121	1530126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35349	NC_018631	ATTT	2	8	1530177	1530184	25 %	75 %	0 %	0 %	406600438
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35352	NC_018631	TAA	2	6	1530262	1530267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600438
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35354	NC_018631	ATC	2	6	1530424	1530429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600438
35355	NC_018631	TCT	2	6	1530443	1530448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600438
35356	NC_018631	CTG	2	6	1530488	1530493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600439
35357	NC_018631	GTAC	2	8	1530504	1530511	25 %	25 %	25 %	25 %	406600439
35358	NC_018631	TCA	2	6	1530583	1530588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600439
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35362	NC_018631	GCT	2	6	1530804	1530809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600439
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35366	NC_018631	ATA	2	6	1531068	1531073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600439
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35369	NC_018631	A	6	6	1531155	1531160	100 %	0 %	0 %	0 %	406600439
35370	NC_018631	CGAC	2	8	1531179	1531186	25 %	0 %	25 %	50 %	406600439
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35374	NC_018631	CCTT	2	8	1531248	1531255	0 %	50 %	0 %	50 %	406600440
35375	NC_018631	CCAA	2	8	1531264	1531271	50 %	0 %	0 %	50 %	406600440
35376	NC_018631	ATA	2	6	1531358	1531363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600440
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35378	NC_018631	AATA	2	8	1531420	1531427	75 %	25 %	0 %	0 %	406600440
35379	NC_018631	ACA	2	6	1531434	1531439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600440
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35382	NC_018631	TG	3	6	1531625	1531630	0 %	50 %	50 %	0 %	406600440
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35389	NC_018631	ATA	2	6	1531869	1531874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600440
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35433	NC_018631	TAAC	2	8	1533510	1533517	50 %	25 %	0 %	25 %	406600442
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35437	NC_018631	TTGT	2	8	1533778	1533785	0 %	75 %	25 %	0 %	406600442
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35470	NC_018631	CCA	2	6	1535300	1535305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600444
35471	NC_018631	TAT	2	6	1535317	1535322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600444
35472	NC_018631	AAT	2	6	1535354	1535359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600444
35473	NC_018631	AAT	2	6	1535477	1535482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600444
35474	NC_018631	ACA	2	6	1535505	1535510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600444
35475	NC_018631	TAA	2	6	1535548	1535553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600444
35476	NC_018631	A	6	6	1535564	1535569	100 %	0 %	0 %	0 %	406600444
35477	NC_018631	TCAA	2	8	1535636	1535643	50 %	25 %	0 %	25 %	406600444
35478	NC_018631	AAAT	2	8	1535661	1535668	75 %	25 %	0 %	0 %	406600444
35479	NC_018631	A	6	6	1535709	1535714	100 %	0 %	0 %	0 %	406600444
35480	NC_018631	TTG	2	6	1535716	1535721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600444
35481	NC_018631	ACT	2	6	1535755	1535760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600444
35482	NC_018631	ATA	2	6	1535792	1535797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600444
35483	NC_018631	ATC	2	6	1535804	1535809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600444
35484	NC_018631	GTT	2	6	1535816	1535821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600444
35485	NC_018631	AAT	2	6	1535842	1535847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600444
35486	NC_018631	TTCAC	2	10	1535912	1535921	20 %	40 %	0 %	40 %	406600444
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35488	NC_018631	ATG	2	6	1536137	1536142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600445
35489	NC_018631	ATA	2	6	1536168	1536173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600445
35490	NC_018631	A	6	6	1536303	1536308	100 %	0 %	0 %	0 %	406600445
35491	NC_018631	T	6	6	1536320	1536325	0 %	100 %	0 %	0 %	406600445
35492	NC_018631	CCA	2	6	1536343	1536348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600445
35493	NC_018631	CAT	2	6	1536409	1536414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600445
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35497	NC_018631	TAA	2	6	1536605	1536610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600445
35498	NC_018631	ACC	2	6	1536728	1536733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600445
35499	NC_018631	AATT	2	8	1536737	1536744	50 %	50 %	0 %	0 %	406600445
35500	NC_018631	CGA	2	6	1536756	1536761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600445

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