MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 43538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_018631	ATA	2	6	1424792	1424797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600342
33003	NC_018631	A	7	7	1424822	1424828	100 %	0 %	0 %	0 %	406600342
33004	NC_018631	TGG	2	6	1424830	1424835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600342
33005	NC_018631	GCC	2	6	1424849	1424854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406600342
33006	NC_018631	CTG	2	6	1424859	1424864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600342
33007	NC_018631	TGC	2	6	1424869	1424874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600342
33008	NC_018631	GCA	2	6	1425011	1425016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600342
33009	NC_018631	AAT	2	6	1425148	1425153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600342
33010	NC_018631	A	6	6	1425190	1425195	100 %	0 %	0 %	0 %	406600342
33011	NC_018631	TAAAA	2	10	1425319	1425328	80 %	20 %	0 %	0 %	406600342
33012	NC_018631	CAAT	2	8	1425339	1425346	50 %	25 %	0 %	25 %	406600342
33013	NC_018631	GCT	2	6	1425359	1425364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600342
33014	NC_018631	AACT	2	8	1425393	1425400	50 %	25 %	0 %	25 %	406600342
33015	NC_018631	A	7	7	1425406	1425412	100 %	0 %	0 %	0 %	406600342
33016	NC_018631	A	6	6	1425573	1425578	100 %	0 %	0 %	0 %	406600342
33017	NC_018631	AT	4	8	1425713	1425720	50 %	50 %	0 %	0 %	406600342
33018	NC_018631	TGAC	2	8	1425795	1425802	25 %	25 %	25 %	25 %	406600342
33019	NC_018631	TAG	2	6	1425805	1425810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600342
33020	NC_018631	GAA	2	6	1425820	1425825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600342
33021	NC_018631	TAG	2	6	1425857	1425862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600342
33022	NC_018631	TAA	2	6	1425880	1425885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600342
33023	NC_018631	TAA	3	9	1425897	1425905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600342
33024	NC_018631	TCA	2	6	1425912	1425917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600342
33025	NC_018631	ATC	2	6	1426092	1426097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600343
33026	NC_018631	AT	3	6	1426108	1426113	50 %	50 %	0 %	0 %	406600343
33027	NC_018631	ATG	2	6	1426121	1426126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600343
33028	NC_018631	TGC	2	6	1426137	1426142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600343
33029	NC_018631	CTG	2	6	1426208	1426213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600343
33030	NC_018631	TGC	2	6	1426218	1426223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600343
33031	NC_018631	TTTG	2	8	1426285	1426292	0 %	75 %	25 %	0 %	406600343
33032	NC_018631	TCT	2	6	1426330	1426335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600343
33033	NC_018631	TAACAC	2	12	1426373	1426384	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406600343
33034	NC_018631	ATA	2	6	1426404	1426409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600343
33035	NC_018631	GAT	2	6	1426433	1426438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600343
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33037	NC_018631	ATC	2	6	1426449	1426454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600343
33038	NC_018631	AAT	2	6	1426521	1426526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600343
33039	NC_018631	CGT	2	6	1426543	1426548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600343
33040	NC_018631	CAG	2	6	1426553	1426558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600343
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33042	NC_018631	T	7	7	1426581	1426587	0 %	100 %	0 %	0 %	406600343
33043	NC_018631	CTG	2	6	1426599	1426604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600343
33044	NC_018631	T	6	6	1426659	1426664	0 %	100 %	0 %	0 %	406600343
33045	NC_018631	GCT	2	6	1426817	1426822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600344
33046	NC_018631	T	6	6	1426828	1426833	0 %	100 %	0 %	0 %	406600344
33047	NC_018631	TCA	2	6	1426856	1426861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600344
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33049	NC_018631	CAT	2	6	1426933	1426938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600344
33050	NC_018631	A	7	7	1427052	1427058	100 %	0 %	0 %	0 %	406600345
33051	NC_018631	TGC	2	6	1427075	1427080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600345
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33053	NC_018631	ACA	2	6	1427148	1427153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600345
33054	NC_018631	AACA	2	8	1427167	1427174	75 %	0 %	0 %	25 %	406600345
33055	NC_018631	ACAAGC	2	12	1427204	1427215	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	406600345
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33057	NC_018631	A	6	6	1427314	1427319	100 %	0 %	0 %	0 %	406600345
33058	NC_018631	AAC	2	6	1427352	1427357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600345
33059	NC_018631	A	6	6	1427383	1427388	100 %	0 %	0 %	0 %	406600345
33060	NC_018631	TGA	2	6	1427389	1427394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600345
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33062	NC_018631	CGT	2	6	1427522	1427527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600345
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33069	NC_018631	CAG	2	6	1427817	1427822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600345
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33071	NC_018631	GATT	2	8	1427845	1427852	25 %	50 %	25 %	0 %	406600345
33072	NC_018631	ATG	3	9	1427857	1427865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600345
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33074	NC_018631	CTA	2	6	1428004	1428009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600345
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33076	NC_018631	TAA	2	6	1428107	1428112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33077	NC_018631	AAC	2	6	1428123	1428128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33091	NC_018631	TACT	2	8	1428819	1428826	25 %	50 %	0 %	25 %	406600346
33092	NC_018631	ATCA	2	8	1429022	1429029	50 %	25 %	0 %	25 %	406600346
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33104	NC_018631	A	7	7	1429528	1429534	100 %	0 %	0 %	0 %	406600346
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33107	NC_018631	GAT	2	6	1429551	1429556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600346
33108	NC_018631	ACT	2	6	1429586	1429591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600346
33109	NC_018631	CA	3	6	1429640	1429645	50 %	0 %	0 %	50 %	406600346
33110	NC_018631	AAT	2	6	1429701	1429706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600346
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33113	NC_018631	TTA	2	6	1429798	1429803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600346
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33115	NC_018631	TGC	2	6	1429859	1429864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600346
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33237	NC_018631	A	6	6	1434370	1434375	100 %	0 %	0 %	0 %	406600351
33238	NC_018631	GAATT	2	10	1434411	1434420	40 %	40 %	20 %	0 %	406600351
33239	NC_018631	CTG	2	6	1434580	1434585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
33240	NC_018631	TTG	2	6	1434613	1434618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600351
33241	NC_018631	A	6	6	1434627	1434632	100 %	0 %	0 %	0 %	406600351
33242	NC_018631	GCTATT	2	12	1434645	1434656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406600351
33243	NC_018631	TGT	2	6	1434689	1434694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600351
33244	NC_018631	TGC	2	6	1434695	1434700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
33245	NC_018631	CTG	2	6	1434736	1434741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
33246	NC_018631	TGAT	2	8	1434745	1434752	25 %	50 %	25 %	0 %	406600351
33247	NC_018631	CAT	2	6	1434783	1434788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600351
33248	NC_018631	TGC	2	6	1434940	1434945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33249	NC_018631	AAT	2	6	1434955	1434960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33250	NC_018631	CAAAAT	2	12	1434970	1434981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33251	NC_018631	TTA	2	6	1435004	1435009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33252	NC_018631	TATTTT	2	12	1435015	1435026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33253	NC_018631	TGATT	2	10	1435057	1435066	20 %	60 %	20 %	0 %	406600352
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33255	NC_018631	CTG	2	6	1435165	1435170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600352
33256	NC_018631	TGGT	2	8	1435292	1435299	0 %	50 %	50 %	0 %	406600352
33257	NC_018631	ATC	2	6	1435427	1435432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600352
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33259	NC_018631	ATT	2	6	1435478	1435483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600352
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33261	NC_018631	T	6	6	1435551	1435556	0 %	100 %	0 %	0 %	406600352
33262	NC_018631	TAA	2	6	1435660	1435665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600352
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33264	NC_018631	CAT	2	6	1435786	1435791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600352
33265	NC_018631	GTT	2	6	1435794	1435799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600352
33266	NC_018631	TAAA	2	8	1435827	1435834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33267	NC_018631	TTTAT	2	10	1435855	1435864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33268	NC_018631	TA	3	6	1435871	1435876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33269	NC_018631	AT	3	6	1435978	1435983	50 %	50 %	0 %	0 %	406600353
33270	NC_018631	AAATC	2	10	1436026	1436035	60 %	20 %	0 %	20 %	406600353
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33273	NC_018631	TCT	2	6	1436283	1436288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600353
33274	NC_018631	TAT	2	6	1436443	1436448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600353
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33328	NC_018631	ATG	2	6	1438548	1438553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600354
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33332	NC_018631	AAC	4	12	1438805	1438816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600355
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33336	NC_018631	A	7	7	1439073	1439079	100 %	0 %	0 %	0 %	406600355
33337	NC_018631	TGCA	2	8	1439195	1439202	25 %	25 %	25 %	25 %	406600355
33338	NC_018631	GCC	2	6	1439219	1439224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406600355
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33340	NC_018631	ATCGAT	2	12	1439272	1439283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406600355
33341	NC_018631	GTC	2	6	1439370	1439375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600355
33342	NC_018631	CCA	2	6	1439391	1439396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600355
33343	NC_018631	GT	3	6	1439416	1439421	0 %	50 %	50 %	0 %	406600355
33344	NC_018631	TTGC	2	8	1439446	1439453	0 %	50 %	25 %	25 %	406600355
33345	NC_018631	ACC	2	6	1439477	1439482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600355
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33347	NC_018631	GT	3	6	1439648	1439653	0 %	50 %	50 %	0 %	406600356
33348	NC_018631	ATC	2	6	1439709	1439714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600356
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33350	NC_018631	T	6	6	1439811	1439816	0 %	100 %	0 %	0 %	406600356
33351	NC_018631	AGC	2	6	1439820	1439825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600356
33352	NC_018631	ATC	2	6	1439859	1439864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600356
33353	NC_018631	CAG	2	6	1439867	1439872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600356
33354	NC_018631	CAA	3	9	1439990	1439998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600356
33355	NC_018631	TGC	2	6	1440042	1440047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600356
33356	NC_018631	TGA	2	6	1440159	1440164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600356
33357	NC_018631	ACC	2	6	1440165	1440170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600356
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33363	NC_018631	CTT	2	6	1440455	1440460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600356
33364	NC_018631	CAG	2	6	1440464	1440469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600356
33365	NC_018631	A	6	6	1440477	1440482	100 %	0 %	0 %	0 %	406600356
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33375	NC_018631	TGC	2	6	1440954	1440959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600357
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33389	NC_018631	A	6	6	1441790	1441795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33390	NC_018631	A	7	7	1441816	1441822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33422	NC_018631	ATT	2	6	1443056	1443061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33455	NC_018631	AGG	2	6	1444492	1444497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33461	NC_018631	A	6	6	1445229	1445234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33462	NC_018631	GCAC	2	8	1445265	1445272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33463	NC_018631	CCT	2	6	1445298	1445303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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33467	NC_018631	TGG	2	6	1445655	1445660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33468	NC_018631	AT	3	6	1445719	1445724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33469	NC_018631	CATA	2	8	1445801	1445808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33470	NC_018631	GA	3	6	1445918	1445923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33471	NC_018631	T	6	6	1445981	1445986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33472	NC_018631	CTT	2	6	1446202	1446207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33473	NC_018631	CGT	2	6	1446213	1446218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33474	NC_018631	AAG	2	6	1446376	1446381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33475	NC_018631	TA	3	6	1446466	1446471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33476	NC_018631	TCGC	2	8	1446523	1446530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33477	NC_018631	TTTC	2	8	1446551	1446558	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33478	NC_018631	CTG	2	6	1446564	1446569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33479	NC_018631	AAT	2	6	1446605	1446610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33480	NC_018631	TAGT	2	8	1446707	1446714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33481	NC_018631	CCA	2	6	1446748	1446753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33482	NC_018631	TTA	2	6	1446761	1446766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33483	NC_018631	TCT	2	6	1446812	1446817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33485	NC_018631	CTT	2	6	1446854	1446859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33486	NC_018631	TAA	2	6	1446888	1446893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33487	NC_018631	CTT	2	6	1447107	1447112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33491	NC_018631	GT	3	6	1447469	1447474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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33499	NC_018631	CCT	2	6	1447860	1447865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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