MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 43538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_018631	TGT	2	6	1205824	1205829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600145
28003	NC_018631	TCA	2	6	1205912	1205917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600145
28004	NC_018631	AAT	2	6	1205921	1205926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600145
28005	NC_018631	TGT	2	6	1205948	1205953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600145
28006	NC_018631	GCA	2	6	1205999	1206004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600145
28007	NC_018631	CTG	2	6	1206009	1206014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600145
28008	NC_018631	GATCT	2	10	1206061	1206070	20 %	40 %	20 %	20 %	406600145
28009	NC_018631	TCAAAC	2	12	1206092	1206103	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406600145
28010	NC_018631	T	7	7	1206256	1206262	0 %	100 %	0 %	0 %	406600145
28011	NC_018631	TGA	2	6	1206276	1206281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600145
28012	NC_018631	CAT	2	6	1206300	1206305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600145
28013	NC_018631	ATTAA	2	10	1206311	1206320	60 %	40 %	0 %	0 %	406600145
28014	NC_018631	CAA	2	6	1206342	1206347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600145
28015	NC_018631	T	6	6	1206348	1206353	0 %	100 %	0 %	0 %	406600145
28016	NC_018631	T	6	6	1206360	1206365	0 %	100 %	0 %	0 %	406600145
28017	NC_018631	TGA	2	6	1206402	1206407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600145
28018	NC_018631	CTT	2	6	1206411	1206416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600145
28019	NC_018631	AAT	2	6	1206544	1206549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600145
28020	NC_018631	TTC	2	6	1206580	1206585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600145
28021	NC_018631	T	6	6	1206657	1206662	0 %	100 %	0 %	0 %	406600145
28022	NC_018631	GTT	3	9	1206666	1206674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600145
28023	NC_018631	TCA	2	6	1206713	1206718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28024	NC_018631	TGT	2	6	1206774	1206779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600146
28025	NC_018631	ATT	2	6	1206780	1206785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600146
28026	NC_018631	TCA	2	6	1206790	1206795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600146
28027	NC_018631	CAAG	2	8	1206887	1206894	50 %	0 %	25 %	25 %	406600146
28028	NC_018631	AT	3	6	1206938	1206943	50 %	50 %	0 %	0 %	406600146
28029	NC_018631	TAAT	2	8	1207081	1207088	50 %	50 %	0 %	0 %	406600146
28030	NC_018631	CTA	2	6	1207100	1207105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600146
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28032	NC_018631	ATC	2	6	1207281	1207286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600146
28033	NC_018631	TAA	2	6	1207299	1207304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600146
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28038	NC_018631	TTA	2	6	1207466	1207471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600147
28039	NC_018631	AT	3	6	1207479	1207484	50 %	50 %	0 %	0 %	406600147
28040	NC_018631	CAG	2	6	1207503	1207508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600147
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28043	NC_018631	T	6	6	1207660	1207665	0 %	100 %	0 %	0 %	406600147
28044	NC_018631	CAT	2	6	1207692	1207697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600147
28045	NC_018631	TAT	2	6	1207731	1207736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28046	NC_018631	TG	3	6	1207737	1207742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28047	NC_018631	AACA	2	8	1207768	1207775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28048	NC_018631	TCC	2	6	1207780	1207785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28049	NC_018631	A	6	6	1207811	1207816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28050	NC_018631	CCA	2	6	1207879	1207884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28051	NC_018631	TAA	2	6	1207951	1207956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600148
28052	NC_018631	T	6	6	1207970	1207975	0 %	100 %	0 %	0 %	406600148
28053	NC_018631	GCT	2	6	1207983	1207988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600148
28054	NC_018631	CTG	3	9	1207990	1207998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600148
28055	NC_018631	TAAA	2	8	1208015	1208022	75 %	25 %	0 %	0 %	406600148
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28057	NC_018631	ATTTTT	2	12	1208069	1208080	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406600148
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28067	NC_018631	TAG	2	6	1208518	1208523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600148
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28084	NC_018631	A	7	7	1209152	1209158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28118	NC_018631	TAGA	2	8	1210903	1210910	50 %	25 %	25 %	0 %	406600150
28119	NC_018631	ATTGC	2	10	1210911	1210920	20 %	40 %	20 %	20 %	406600150
28120	NC_018631	ATT	2	6	1210943	1210948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600150
28121	NC_018631	AAT	2	6	1210968	1210973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600150
28122	NC_018631	ATA	2	6	1210998	1211003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600150
28123	NC_018631	ATT	2	6	1211072	1211077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600150
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28132	NC_018631	GTA	2	6	1211545	1211550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28133	NC_018631	T	6	6	1211575	1211580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28134	NC_018631	TAT	2	6	1211591	1211596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28135	NC_018631	ATC	2	6	1211652	1211657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28137	NC_018631	CAA	2	6	1211715	1211720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28140	NC_018631	A	7	7	1211780	1211786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28141	NC_018631	T	6	6	1211801	1211806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28142	NC_018631	TAT	2	6	1211848	1211853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600151
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28144	NC_018631	A	7	7	1211871	1211877	100 %	0 %	0 %	0 %	406600151
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28147	NC_018631	TAA	2	6	1212026	1212031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600151
28148	NC_018631	A	6	6	1212060	1212065	100 %	0 %	0 %	0 %	406600151
28149	NC_018631	TAA	2	6	1212162	1212167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600151
28150	NC_018631	ATC	2	6	1212196	1212201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600151
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28152	NC_018631	CAAA	2	8	1212351	1212358	75 %	0 %	0 %	25 %	406600152
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28168	NC_018631	CA	3	6	1213112	1213117	50 %	0 %	0 %	50 %	406600152
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28195	NC_018631	ATC	2	6	1214326	1214331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600152
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28197	NC_018631	GTTG	2	8	1214579	1214586	0 %	50 %	50 %	0 %	406600152
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28221	NC_018631	TGA	2	6	1215634	1215639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600152
28222	NC_018631	TAG	2	6	1215642	1215647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600152
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28229	NC_018631	TTC	2	6	1216132	1216137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600152
28230	NC_018631	TTG	2	6	1216141	1216146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600152
28231	NC_018631	CAT	2	6	1216155	1216160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600152
28232	NC_018631	TA	3	6	1216248	1216253	50 %	50 %	0 %	0 %	406600152
28233	NC_018631	TTG	2	6	1216324	1216329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600152
28234	NC_018631	TCA	2	6	1216394	1216399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600152
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28236	NC_018631	TAC	2	6	1216426	1216431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600152
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28245	NC_018631	T	6	6	1216699	1216704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28353	NC_018631	GCA	2	6	1221815	1221820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28354	NC_018631	AAT	2	6	1221904	1221909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600157
28355	NC_018631	CAG	2	6	1221924	1221929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28356	NC_018631	AAT	2	6	1221997	1222002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600157
28357	NC_018631	CCAG	2	8	1222046	1222053	25 %	0 %	25 %	50 %	406600157
28358	NC_018631	GAA	2	6	1222241	1222246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600157
28359	NC_018631	GCA	2	6	1222325	1222330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28360	NC_018631	GCT	2	6	1222349	1222354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28361	NC_018631	TGC	2	6	1222360	1222365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28362	NC_018631	AAT	2	6	1222366	1222371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600157
28363	NC_018631	TCA	3	9	1222373	1222381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600157
28364	NC_018631	TCA	2	6	1222403	1222408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600157
28365	NC_018631	ATGT	2	8	1222425	1222432	25 %	50 %	25 %	0 %	406600157
28366	NC_018631	TCA	2	6	1222448	1222453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600157
28367	NC_018631	GTA	2	6	1222468	1222473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600157
28368	NC_018631	AAATG	2	10	1222514	1222523	60 %	20 %	20 %	0 %	406600157
28369	NC_018631	CAAA	2	8	1222554	1222561	75 %	0 %	0 %	25 %	406600157
28370	NC_018631	T	6	6	1222570	1222575	0 %	100 %	0 %	0 %	406600157
28371	NC_018631	AAT	2	6	1222579	1222584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600157
28372	NC_018631	TAA	2	6	1222600	1222605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600157
28373	NC_018631	TGC	3	9	1222636	1222644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28374	NC_018631	AGC	2	6	1222705	1222710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28375	NC_018631	ATC	2	6	1222765	1222770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600157
28376	NC_018631	CAA	2	6	1222771	1222776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600157
28377	NC_018631	ATT	2	6	1222813	1222818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600157
28378	NC_018631	ATCA	2	8	1222834	1222841	50 %	25 %	0 %	25 %	406600157
28379	NC_018631	TCA	2	6	1222910	1222915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600157
28380	NC_018631	CCA	2	6	1222997	1223002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600157
28381	NC_018631	CTG	2	6	1223031	1223036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600157
28382	NC_018631	T	6	6	1223054	1223059	0 %	100 %	0 %	0 %	406600157
28383	NC_018631	CAA	2	6	1223220	1223225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600157
28384	NC_018631	CA	3	6	1223229	1223234	50 %	0 %	0 %	50 %	406600157
28385	NC_018631	AT	3	6	1223238	1223243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28386	NC_018631	T	6	6	1223248	1223253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28387	NC_018631	AAC	2	6	1223282	1223287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28388	NC_018631	AT	4	8	1223323	1223330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28389	NC_018631	A	6	6	1223416	1223421	100 %	0 %	0 %	0 %	406600158
28390	NC_018631	A	6	6	1223444	1223449	100 %	0 %	0 %	0 %	406600158
28391	NC_018631	ATT	2	6	1223463	1223468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600158
28392	NC_018631	TGA	2	6	1223504	1223509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600158
28393	NC_018631	ATT	2	6	1223538	1223543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600158
28394	NC_018631	TACA	2	8	1223575	1223582	50 %	25 %	0 %	25 %	406600158
28395	NC_018631	ATT	2	6	1223648	1223653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600158
28396	NC_018631	AT	3	6	1223756	1223761	50 %	50 %	0 %	0 %	406600158
28397	NC_018631	AGG	2	6	1223767	1223772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406600158
28398	NC_018631	CAT	2	6	1223809	1223814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600158
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28400	NC_018631	CTG	2	6	1223926	1223931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600158
28401	NC_018631	A	6	6	1223959	1223964	100 %	0 %	0 %	0 %	406600158
28402	NC_018631	AAC	2	6	1224025	1224030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600158
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28404	NC_018631	CAAT	2	8	1224185	1224192	50 %	25 %	0 %	25 %	406600158
28405	NC_018631	TGA	2	6	1224212	1224217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600158
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28407	NC_018631	AATC	2	8	1224395	1224402	50 %	25 %	0 %	25 %	406600158
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28409	NC_018631	A	7	7	1224423	1224429	100 %	0 %	0 %	0 %	406600158
28410	NC_018631	GAT	2	6	1224431	1224436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600158
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28413	NC_018631	ATC	2	6	1224702	1224707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600158
28414	NC_018631	ATC	2	6	1224768	1224773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600158
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28424	NC_018631	AAC	2	6	1225122	1225127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600159
28425	NC_018631	TAT	2	6	1225182	1225187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600159
28426	NC_018631	CTGC	2	8	1225236	1225243	0 %	25 %	25 %	50 %	406600159
28427	NC_018631	ATT	2	6	1225244	1225249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600159
28428	NC_018631	AC	4	8	1225303	1225310	50 %	0 %	0 %	50 %	406600159
28429	NC_018631	GAC	2	6	1225331	1225336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600159
28430	NC_018631	A	8	8	1225392	1225399	100 %	0 %	0 %	0 %	406600159
28431	NC_018631	ATG	2	6	1225422	1225427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600159
28432	NC_018631	ATA	2	6	1225473	1225478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600159
28433	NC_018631	TGC	2	6	1225555	1225560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600159
28434	NC_018631	T	6	6	1225627	1225632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28435	NC_018631	CCA	2	6	1225743	1225748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600160
28436	NC_018631	ATC	2	6	1225757	1225762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
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28438	NC_018631	GTA	2	6	1225807	1225812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600160
28439	NC_018631	ATG	2	6	1225813	1225818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600160
28440	NC_018631	TGT	2	6	1225830	1225835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600160
28441	NC_018631	AAT	2	6	1225838	1225843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28442	NC_018631	TCA	3	9	1225920	1225928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28443	NC_018631	TTG	2	6	1225961	1225966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600160
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28445	NC_018631	TGA	2	6	1226008	1226013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600160
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28449	NC_018631	CTG	2	6	1226227	1226232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600160
28450	NC_018631	TCA	2	6	1226290	1226295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28451	NC_018631	TCA	2	6	1226307	1226312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28452	NC_018631	GCT	2	6	1226484	1226489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600160
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28454	NC_018631	CAT	2	6	1226570	1226575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28455	NC_018631	TCACT	2	10	1226581	1226590	20 %	40 %	0 %	40 %	406600160
28456	NC_018631	AAT	2	6	1226615	1226620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28457	NC_018631	TAA	2	6	1226669	1226674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28458	NC_018631	ATA	2	6	1226703	1226708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28459	NC_018631	ATC	2	6	1226753	1226758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28460	NC_018631	TGC	2	6	1226873	1226878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600160
28461	NC_018631	TAATGC	2	12	1226879	1226890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406600160
28462	NC_018631	TCG	2	6	1226895	1226900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600160
28463	NC_018631	CCCTG	2	10	1226931	1226940	0 %	20 %	20 %	60 %	406600160
28464	NC_018631	AC	3	6	1226977	1226982	50 %	0 %	0 %	50 %	406600160
28465	NC_018631	AGT	2	6	1227012	1227017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600160
28466	NC_018631	TAA	2	6	1227092	1227097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28467	NC_018631	TCT	2	6	1227132	1227137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600160
28468	NC_018631	TCAA	2	8	1227156	1227163	50 %	25 %	0 %	25 %	406600160
28469	NC_018631	TCA	2	6	1227165	1227170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28470	NC_018631	T	6	6	1227195	1227200	0 %	100 %	0 %	0 %	406600160
28471	NC_018631	CAT	2	6	1227208	1227213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28472	NC_018631	CTT	2	6	1227223	1227228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600160
28473	NC_018631	TG	4	8	1227282	1227289	0 %	50 %	50 %	0 %	406600160
28474	NC_018631	TTC	2	6	1227311	1227316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600160
28475	NC_018631	TGA	2	6	1227339	1227344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600160
28476	NC_018631	ATC	2	6	1227356	1227361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600160
28477	NC_018631	CTTT	2	8	1227380	1227387	0 %	75 %	0 %	25 %	406600160
28478	NC_018631	T	6	6	1227398	1227403	0 %	100 %	0 %	0 %	406600160
28479	NC_018631	GTG	2	6	1227409	1227414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600160
28480	NC_018631	GTG	2	6	1227418	1227423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600160
28481	NC_018631	TGT	2	6	1227435	1227440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600160
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28487	NC_018631	AGG	2	6	1227730	1227735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406600160
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28489	NC_018631	ATA	2	6	1227762	1227767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28490	NC_018631	T	6	6	1227803	1227808	0 %	100 %	0 %	0 %	406600160
28491	NC_018631	ATA	2	6	1227818	1227823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28492	NC_018631	AGA	2	6	1227874	1227879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600160
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28494	NC_018631	AAT	2	6	1227942	1227947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600160
28495	NC_018631	T	6	6	1227993	1227998	0 %	100 %	0 %	0 %	406600160
28496	NC_018631	ACG	2	6	1228013	1228018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600160
28497	NC_018631	TAAT	2	8	1228061	1228068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28498	NC_018631	AAAC	2	8	1228101	1228108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28499	NC_018631	GA	3	6	1228188	1228193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28500	NC_018631	CCG	2	6	1228209	1228214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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