MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 48598

< Previous12...86878889909192939495969798Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_018610	CAG	2	6	2495475	2495480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028173
48502	NC_018610	CAC	2	6	2495500	2495505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028173
48503	NC_018610	GTT	2	6	2495658	2495663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028173
48504	NC_018610	CTG	2	6	2495683	2495688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028173
48505	NC_018610	GCC	2	6	2495731	2495736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028173
48506	NC_018610	ACC	2	6	2495773	2495778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028173
48507	NC_018610	TGA	2	6	2495831	2495836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028173
48508	NC_018610	TGG	2	6	2495892	2495897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028173
48509	NC_018610	TGC	2	6	2496049	2496054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028173
48510	NC_018610	CCA	2	6	2496060	2496065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028173
48511	NC_018610	AAT	2	6	2496114	2496119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028173
48512	NC_018610	TCCGA	2	10	2496130	2496139	20 %	20 %	20 %	40 %	406028173
48513	NC_018610	TTC	2	6	2496140	2496145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028173
48514	NC_018610	TCA	2	6	2496164	2496169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028173
48515	NC_018610	AAC	2	6	2496205	2496210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028173
48516	NC_018610	GCA	2	6	2496314	2496319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028173
48517	NC_018610	TTG	2	6	2496348	2496353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028173
48518	NC_018610	TGC	3	9	2496380	2496388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028173
48519	NC_018610	TCA	2	6	2496414	2496419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028173
48520	NC_018610	ATT	2	6	2496428	2496433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028173
48521	NC_018610	CAAG	2	8	2496507	2496514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48522	NC_018610	CAG	2	6	2496636	2496641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028174
48523	NC_018610	GCAA	2	8	2496672	2496679	50 %	0 %	25 %	25 %	406028174
48524	NC_018610	CCA	2	6	2496771	2496776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028174
48525	NC_018610	CTA	2	6	2496837	2496842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028174
48526	NC_018610	TCAT	2	8	2496905	2496912	25 %	50 %	0 %	25 %	406028174
48527	NC_018610	A	6	6	2496933	2496938	100 %	0 %	0 %	0 %	406028174
48528	NC_018610	ATTG	2	8	2496941	2496948	25 %	50 %	25 %	0 %	406028175
48529	NC_018610	GGC	2	6	2497074	2497079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028175
48530	NC_018610	CGA	2	6	2497202	2497207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028175
48531	NC_018610	CTA	2	6	2497220	2497225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028175
48532	NC_018610	GGC	2	6	2497230	2497235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028175
48533	NC_018610	AGA	2	6	2497415	2497420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028175
48534	NC_018610	ATT	2	6	2497422	2497427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028175
48535	NC_018610	A	6	6	2497434	2497439	100 %	0 %	0 %	0 %	406028175
48536	NC_018610	GGT	2	6	2497482	2497487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406028175
48537	NC_018610	AAG	2	6	2497497	2497502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028175
48538	NC_018610	CAC	2	6	2497564	2497569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028175
48539	NC_018610	TAAA	2	8	2497605	2497612	75 %	25 %	0 %	0 %	406028175
48540	NC_018610	TGA	2	6	2497709	2497714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028176
48541	NC_018610	TCAA	2	8	2497750	2497757	50 %	25 %	0 %	25 %	406028176
48542	NC_018610	GAG	2	6	2497760	2497765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028176
48543	NC_018610	CTT	2	6	2497778	2497783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028176
48544	NC_018610	GTC	2	6	2497801	2497806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028176
48545	NC_018610	GCC	2	6	2497855	2497860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028176
48546	NC_018610	CGGCAA	2	12	2497868	2497879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028176
48547	NC_018610	CCA	2	6	2498009	2498014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028176
48548	NC_018610	CCG	2	6	2498083	2498088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028176
48549	NC_018610	GCT	2	6	2498089	2498094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028176
48550	NC_018610	AGC	2	6	2498133	2498138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028176
48551	NC_018610	AGTC	2	8	2498139	2498146	25 %	25 %	25 %	25 %	406028176
48552	NC_018610	CCA	2	6	2498338	2498343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028176
48553	NC_018610	ACC	2	6	2498385	2498390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028176
48554	NC_018610	CCA	2	6	2498413	2498418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028176
48555	NC_018610	GTTG	2	8	2498421	2498428	0 %	50 %	50 %	0 %	406028176
48556	NC_018610	ATC	2	6	2498583	2498588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028176
48557	NC_018610	TCG	2	6	2498639	2498644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028176
48558	NC_018610	CAGC	2	8	2498702	2498709	25 %	0 %	25 %	50 %	406028176
48559	NC_018610	T	6	6	2498715	2498720	0 %	100 %	0 %	0 %	406028176
48560	NC_018610	TAAC	2	8	2498845	2498852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48561	NC_018610	CAA	2	6	2498886	2498891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48562	NC_018610	A	6	6	2498890	2498895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48563	NC_018610	GCT	2	6	2498917	2498922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48564	NC_018610	ATT	2	6	2498928	2498933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028177
48565	NC_018610	CTT	2	6	2498944	2498949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028177
48566	NC_018610	T	6	6	2498965	2498970	0 %	100 %	0 %	0 %	406028177
48567	NC_018610	GTT	2	6	2498979	2498984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028177
48568	NC_018610	GTT	2	6	2499000	2499005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028177
48569	NC_018610	GAA	2	6	2499133	2499138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028177
48570	NC_018610	TCA	2	6	2499153	2499158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028177
48571	NC_018610	GCCA	2	8	2499197	2499204	25 %	0 %	25 %	50 %	406028177
48572	NC_018610	GAA	2	6	2499206	2499211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028177
48573	NC_018610	AGA	2	6	2499279	2499284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406028177
48574	NC_018610	GGCA	2	8	2499362	2499369	25 %	0 %	50 %	25 %	406028177
48575	NC_018610	CTT	2	6	2499406	2499411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028177
48576	NC_018610	TGA	2	6	2499451	2499456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028177
48577	NC_018610	T	6	6	2499460	2499465	0 %	100 %	0 %	0 %	406028177
48578	NC_018610	CTT	2	6	2499492	2499497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028177
48579	NC_018610	ATC	2	6	2499527	2499532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028177
48580	NC_018610	GAT	2	6	2499616	2499621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028177
48581	NC_018610	AAC	2	6	2499640	2499645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028177
48582	NC_018610	TAC	2	6	2499690	2499695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028177
48583	NC_018610	TAC	2	6	2499706	2499711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028177
48584	NC_018610	T	6	6	2499767	2499772	0 %	100 %	0 %	0 %	406028178
48585	NC_018610	CAG	2	6	2499860	2499865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028178
48586	NC_018610	CAA	2	6	2499921	2499926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028178
48587	NC_018610	TTC	2	6	2499938	2499943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028178
48588	NC_018610	TCT	2	6	2499977	2499982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028178
48589	NC_018610	ATTG	2	8	2500013	2500020	25 %	50 %	25 %	0 %	406028178
48590	NC_018610	ACA	2	6	2500039	2500044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028178
48591	NC_018610	CTT	2	6	2500082	2500087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028178
48592	NC_018610	CT	3	6	2500096	2500101	0 %	50 %	0 %	50 %	406028178
48593	NC_018610	T	7	7	2500101	2500107	0 %	100 %	0 %	0 %	406028178
48594	NC_018610	AAAT	2	8	2500152	2500159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48595	NC_018610	TCC	2	6	2500329	2500334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48596	NC_018610	AT	3	6	2500396	2500401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48597	NC_018610	A	6	6	2500453	2500458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48598	NC_018610	AAT	2	6	2500504	2500509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...86878889909192939495969798Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.