MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 48598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_018610	AAAG	2	8	2414261	2414268	75 %	0 %	25 %	0 %	406028102
47002	NC_018610	TCC	2	6	2414305	2414310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47003	NC_018610	TAAA	2	8	2414311	2414318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47004	NC_018610	TAA	2	6	2414321	2414326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47005	NC_018610	AGAAT	2	10	2414335	2414344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47006	NC_018610	ATT	2	6	2414371	2414376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47007	NC_018610	GCAA	2	8	2414415	2414422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47008	NC_018610	ATA	2	6	2414504	2414509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47009	NC_018610	ATA	2	6	2414573	2414578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47010	NC_018610	A	8	8	2414621	2414628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47011	NC_018610	ATT	2	6	2414658	2414663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47012	NC_018610	GTC	2	6	2414683	2414688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47013	NC_018610	CTTA	2	8	2414715	2414722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47014	NC_018610	A	6	6	2414732	2414737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47015	NC_018610	T	6	6	2414758	2414763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47016	NC_018610	TAAA	2	8	2414943	2414950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47017	NC_018610	ATG	2	6	2414979	2414984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47018	NC_018610	GTT	2	6	2415120	2415125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028103
47019	NC_018610	GTA	2	6	2415162	2415167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028103
47020	NC_018610	ATT	2	6	2415168	2415173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028103
47021	NC_018610	ACG	2	6	2415353	2415358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028103
47022	NC_018610	ATA	2	6	2415456	2415461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028103
47023	NC_018610	CAA	2	6	2415499	2415504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028103
47024	NC_018610	TGGCC	2	10	2415701	2415710	0 %	20 %	40 %	40 %	406028103
47025	NC_018610	AAC	2	6	2415920	2415925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028103
47026	NC_018610	AAT	2	6	2415928	2415933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028103
47027	NC_018610	TAA	2	6	2416017	2416022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47028	NC_018610	AATG	2	8	2416186	2416193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47029	NC_018610	TGC	2	6	2416220	2416225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47030	NC_018610	TAATAT	2	12	2416226	2416237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47031	NC_018610	AGA	2	6	2416251	2416256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47032	NC_018610	ATT	2	6	2416257	2416262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47033	NC_018610	TTG	2	6	2416270	2416275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47034	NC_018610	AAT	2	6	2416296	2416301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47035	NC_018610	TAT	2	6	2416325	2416330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47036	NC_018610	A	7	7	2416332	2416338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47037	NC_018610	ATT	2	6	2416496	2416501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028104
47038	NC_018610	CTGATC	2	12	2416528	2416539	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406028104
47039	NC_018610	CCT	2	6	2416554	2416559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028104
47040	NC_018610	AAT	2	6	2416584	2416589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028104
47041	NC_018610	CCG	2	6	2416591	2416596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028104
47042	NC_018610	ACG	2	6	2416608	2416613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028104
47043	NC_018610	CTC	2	6	2416615	2416620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028104
47044	NC_018610	ATA	2	6	2416649	2416654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028104
47045	NC_018610	CGTA	2	8	2416655	2416662	25 %	25 %	25 %	25 %	406028104
47046	NC_018610	TAG	2	6	2416768	2416773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028104
47047	NC_018610	CAT	2	6	2416810	2416815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028104
47048	NC_018610	ATTT	2	8	2416816	2416823	25 %	75 %	0 %	0 %	406028104
47049	NC_018610	ATA	2	6	2416876	2416881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028104
47050	NC_018610	CCA	2	6	2416990	2416995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406028104
47051	NC_018610	AAC	2	6	2417055	2417060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028104
47052	NC_018610	CAT	2	6	2417069	2417074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028104
47053	NC_018610	TTTC	2	8	2417096	2417103	0 %	75 %	0 %	25 %	406028104
47054	NC_018610	ATTT	2	8	2417140	2417147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47055	NC_018610	ATT	2	6	2417162	2417167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47056	NC_018610	AC	3	6	2417178	2417183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47057	NC_018610	TTGC	2	8	2417198	2417205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47058	NC_018610	ATA	2	6	2417260	2417265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47059	NC_018610	CA	3	6	2417290	2417295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47060	NC_018610	ATT	2	6	2417414	2417419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47061	NC_018610	GTC	2	6	2417439	2417444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47062	NC_018610	TAAA	2	8	2417573	2417580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47063	NC_018610	CA	3	6	2417607	2417612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47064	NC_018610	ATT	2	6	2417673	2417678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47065	NC_018610	GAGTA	2	10	2417734	2417743	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47066	NC_018610	CCT	2	6	2417898	2417903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406028105
47067	NC_018610	AATC	2	8	2418033	2418040	50 %	25 %	0 %	25 %	406028105
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47070	NC_018610	CAG	2	6	2418285	2418290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028105
47071	NC_018610	CAA	2	6	2418315	2418320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028105
47072	NC_018610	CGG	2	6	2418420	2418425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47073	NC_018610	AGCA	2	8	2418430	2418437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47074	NC_018610	GGA	2	6	2418511	2418516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028106
47075	NC_018610	AAAT	2	8	2418635	2418642	75 %	25 %	0 %	0 %	406028106
47076	NC_018610	AACC	2	8	2418653	2418660	50 %	0 %	0 %	50 %	406028106
47077	NC_018610	GGC	2	6	2418709	2418714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406028106
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47080	NC_018610	ATT	2	6	2418840	2418845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47081	NC_018610	ATA	2	6	2418904	2418909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47082	NC_018610	TTA	2	6	2418985	2418990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47083	NC_018610	GCC	2	6	2419125	2419130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406028107
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47086	NC_018610	CCGG	2	8	2419396	2419403	0 %	0 %	50 %	50 %	406028107
47087	NC_018610	CCAA	2	8	2419432	2419439	50 %	0 %	0 %	50 %	406028107
47088	NC_018610	AAC	2	6	2419449	2419454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028107
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47090	NC_018610	AAAG	2	8	2419550	2419557	75 %	0 %	25 %	0 %	406028107
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47093	NC_018610	TGAT	2	8	2419648	2419655	25 %	50 %	25 %	0 %	406028107
47094	NC_018610	ACA	2	6	2419732	2419737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028107
47095	NC_018610	CCAAG	2	10	2419748	2419757	40 %	0 %	20 %	40 %	406028107
47096	NC_018610	GGAAT	2	10	2419827	2419836	40 %	20 %	40 %	0 %	406028107
47097	NC_018610	ATT	2	6	2420002	2420007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47098	NC_018610	AAT	2	6	2420061	2420066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47099	NC_018610	TAAT	2	8	2420240	2420247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47100	NC_018610	AAT	2	6	2420259	2420264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47101	NC_018610	AAT	2	6	2420280	2420285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47102	NC_018610	AAC	2	6	2420316	2420321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028108
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47104	NC_018610	ATT	2	6	2420374	2420379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028108
47105	NC_018610	CTA	2	6	2420432	2420437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028108
47106	NC_018610	CGA	2	6	2420493	2420498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028108
47107	NC_018610	ATT	2	6	2420527	2420532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406028108
47108	NC_018610	ATTA	2	8	2420548	2420555	50 %	50 %	0 %	0 %	406028108
47109	NC_018610	AATT	2	8	2420620	2420627	50 %	50 %	0 %	0 %	406028108
47110	NC_018610	ACT	2	6	2420679	2420684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406028108
47111	NC_018610	TCG	2	6	2420723	2420728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028108
47112	NC_018610	AGG	2	6	2420743	2420748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406028108
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47114	NC_018610	GGT	2	6	2420851	2420856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47115	NC_018610	GTT	2	6	2420887	2420892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406028109
47116	NC_018610	GCA	2	6	2420921	2420926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406028109
47117	NC_018610	GCCA	2	8	2421027	2421034	25 %	0 %	25 %	50 %	406028109
47118	NC_018610	GGATTT	2	12	2421091	2421102	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47119	NC_018610	AC	3	6	2421128	2421133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47120	NC_018610	TGC	2	6	2421183	2421188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47121	NC_018610	T	6	6	2421208	2421213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47122	NC_018610	GTG	2	6	2421259	2421264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47123	NC_018610	ATTC	2	8	2421343	2421350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47124	NC_018610	TCAT	2	8	2421391	2421398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47125	NC_018610	A	6	6	2421448	2421453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47128	NC_018610	GGCC	2	8	2421588	2421595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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47225	NC_018610	A	7	7	2426274	2426280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47228	NC_018610	ACCA	2	8	2426477	2426484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47229	NC_018610	CT	3	6	2426489	2426494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47230	NC_018610	CAA	2	6	2426585	2426590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47231	NC_018610	T	6	6	2426592	2426597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47232	NC_018610	TGG	2	6	2426681	2426686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47233	NC_018610	TGAAT	2	10	2426730	2426739	40 %	40 %	20 %	0 %	406028114
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47236	NC_018610	A	6	6	2426909	2426914	100 %	0 %	0 %	0 %	406028114
47237	NC_018610	ATT	2	6	2426919	2426924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47239	NC_018610	TGA	2	6	2426961	2426966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028115
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47360	NC_018610	A	6	6	2433975	2433980	100 %	0 %	0 %	0 %	406028121
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47477	NC_018610	CTG	2	6	2440197	2440202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028126
47478	NC_018610	TCGT	2	8	2440281	2440288	0 %	50 %	25 %	25 %	406028126
47479	NC_018610	CTT	2	6	2440310	2440315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406028126
47480	NC_018610	AAC	2	6	2440335	2440340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406028126
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47488	NC_018610	AGT	2	6	2440869	2440874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028127
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47490	NC_018610	AAT	2	6	2440906	2440911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406028127
47491	NC_018610	TGA	2	6	2440969	2440974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028127
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47493	NC_018610	TTG	2	6	2441182	2441187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47497	NC_018610	ATG	2	6	2441426	2441431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406028128
47498	NC_018610	AT	3	6	2441511	2441516	50 %	50 %	0 %	0 %	406028128
47499	NC_018610	CTG	2	6	2441558	2441563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406028128
47500	NC_018610	T	6	6	2441583	2441588	0 %	100 %	0 %	0 %	406028128

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