MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 48598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_018610	GTT	2	6	2253913	2253918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027967
44003	NC_018610	ATT	2	6	2253931	2253936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027967
44004	NC_018610	AACC	2	8	2253952	2253959	50 %	0 %	0 %	50 %	406027967
44005	NC_018610	GCT	2	6	2254072	2254077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027967
44006	NC_018610	GCG	2	6	2254187	2254192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027967
44007	NC_018610	TAA	2	6	2254206	2254211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027967
44008	NC_018610	TCT	2	6	2254383	2254388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027967
44009	NC_018610	CGG	2	6	2254415	2254420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027967
44010	NC_018610	TATT	2	8	2254552	2254559	25 %	75 %	0 %	0 %	406027968
44011	NC_018610	CCA	2	6	2254589	2254594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027968
44012	NC_018610	AGCC	2	8	2254642	2254649	25 %	0 %	25 %	50 %	406027968
44013	NC_018610	TGCTG	2	10	2254736	2254745	0 %	40 %	40 %	20 %	406027968
44014	NC_018610	TGC	2	6	2254799	2254804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027968
44015	NC_018610	TTGGTA	2	12	2254858	2254869	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406027968
44016	NC_018610	CGA	2	6	2254911	2254916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027968
44017	NC_018610	TTG	2	6	2254927	2254932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027968
44018	NC_018610	CGT	2	6	2254944	2254949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027968
44019	NC_018610	AGT	3	9	2254971	2254979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027968
44020	NC_018610	CGA	3	9	2254986	2254994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027968
44021	NC_018610	GTC	2	6	2255008	2255013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027968
44022	NC_018610	CGT	2	6	2255022	2255027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027968
44023	NC_018610	AACC	2	8	2255091	2255098	50 %	0 %	0 %	50 %	406027968
44024	NC_018610	TTTC	2	8	2255202	2255209	0 %	75 %	0 %	25 %	406027968
44025	NC_018610	AGT	2	6	2255285	2255290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027968
44026	NC_018610	TGTT	2	8	2255377	2255384	0 %	75 %	25 %	0 %	406027968
44027	NC_018610	GTC	2	6	2255386	2255391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027968
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44029	NC_018610	TTA	2	6	2255461	2255466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027968
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44031	NC_018610	CTT	2	6	2255535	2255540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027968
44032	NC_018610	GAT	2	6	2255572	2255577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027968
44033	NC_018610	GAA	2	6	2255593	2255598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027968
44034	NC_018610	TGA	2	6	2255601	2255606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027968
44035	NC_018610	TAA	2	6	2255621	2255626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027968
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44050	NC_018610	TCG	2	6	2256662	2256667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027968
44051	NC_018610	GCG	2	6	2256751	2256756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027968
44052	NC_018610	CCA	2	6	2256781	2256786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027968
44053	NC_018610	AATA	2	8	2256824	2256831	75 %	25 %	0 %	0 %	406027968
44054	NC_018610	TCT	2	6	2256839	2256844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027968
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44056	NC_018610	CAA	2	6	2256891	2256896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44057	NC_018610	A	7	7	2256895	2256901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44059	NC_018610	A	6	6	2256912	2256917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44060	NC_018610	TAA	2	6	2256958	2256963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44065	NC_018610	CTC	2	6	2257298	2257303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44066	NC_018610	T	7	7	2257304	2257310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44102	NC_018610	CCAG	2	8	2259739	2259746	25 %	0 %	25 %	50 %	406027970
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44117	NC_018610	CTT	2	6	2260445	2260450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027970
44118	NC_018610	TTC	2	6	2260503	2260508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027970
44119	NC_018610	GGCC	2	8	2260544	2260551	0 %	0 %	50 %	50 %	406027970
44120	NC_018610	TGA	2	6	2260643	2260648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027970
44121	NC_018610	GCT	2	6	2260678	2260683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027970
44122	NC_018610	TAT	2	6	2260700	2260705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027970
44123	NC_018610	TCC	2	6	2260719	2260724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44124	NC_018610	GTT	2	6	2260741	2260746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44125	NC_018610	TAA	2	6	2260774	2260779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44126	NC_018610	A	6	6	2260815	2260820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44127	NC_018610	ATTT	2	8	2260826	2260833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44128	NC_018610	T	6	6	2260831	2260836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44129	NC_018610	CAAAA	2	10	2260868	2260877	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44130	NC_018610	ATT	2	6	2260919	2260924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44131	NC_018610	AAT	2	6	2260982	2260987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027971
44132	NC_018610	GGATT	2	10	2261003	2261012	20 %	40 %	40 %	0 %	406027971
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44134	NC_018610	TTCTT	2	10	2261061	2261070	0 %	80 %	0 %	20 %	406027971
44135	NC_018610	CTG	2	6	2261144	2261149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027971
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44137	NC_018610	GGCT	2	8	2261207	2261214	0 %	25 %	50 %	25 %	406027971
44138	NC_018610	TTG	2	6	2261304	2261309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027971
44139	NC_018610	TTC	2	6	2261462	2261467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027971
44140	NC_018610	TAT	2	6	2261499	2261504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44141	NC_018610	TGGAG	2	10	2261543	2261552	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44142	NC_018610	ATTA	2	8	2261589	2261596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44143	NC_018610	AAT	2	6	2261610	2261615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44144	NC_018610	TGC	2	6	2261650	2261655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44145	NC_018610	GTG	2	6	2261675	2261680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44146	NC_018610	GTC	2	6	2261709	2261714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027972
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44154	NC_018610	CCAA	2	8	2261943	2261950	50 %	0 %	0 %	50 %	406027972
44155	NC_018610	AC	3	6	2261972	2261977	50 %	0 %	0 %	50 %	406027972
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44157	NC_018610	TGC	2	6	2262058	2262063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027972
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44162	NC_018610	CCA	2	6	2262153	2262158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027972
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44173	NC_018610	GCA	2	6	2262599	2262604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027972
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44192	NC_018610	ACGT	2	8	2263385	2263392	25 %	25 %	25 %	25 %	406027972
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44194	NC_018610	GAC	2	6	2263630	2263635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027972
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44197	NC_018610	ATTT	2	8	2264114	2264121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44198	NC_018610	CAA	2	6	2264127	2264132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44201	NC_018610	A	6	6	2264429	2264434	100 %	0 %	0 %	0 %	406027973
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44210	NC_018610	ACCC	2	8	2264729	2264736	25 %	0 %	0 %	75 %	406027973
44211	NC_018610	CAG	2	6	2264747	2264752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027973
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44218	NC_018610	AGA	2	6	2265114	2265119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027974
44219	NC_018610	AAG	2	6	2265172	2265177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027974
44220	NC_018610	TCA	2	6	2265201	2265206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027974
44221	NC_018610	GAA	2	6	2265220	2265225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027974
44222	NC_018610	CTG	2	6	2265256	2265261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027974
44223	NC_018610	AAC	2	6	2265274	2265279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406027974
44224	NC_018610	CCG	2	6	2265292	2265297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027974
44225	NC_018610	GAT	2	6	2265334	2265339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027974
44226	NC_018610	TCT	2	6	2265362	2265367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027974
44227	NC_018610	TGC	2	6	2265429	2265434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027974
44228	NC_018610	CAAT	2	8	2265462	2265469	50 %	25 %	0 %	25 %	406027974
44229	NC_018610	GCCAA	2	10	2265481	2265490	40 %	0 %	20 %	40 %	406027974
44230	NC_018610	GAT	2	6	2265502	2265507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027974
44231	NC_018610	CGG	2	6	2265516	2265521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027974
44232	NC_018610	GGT	2	6	2265582	2265587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027974
44233	NC_018610	GGC	2	6	2265615	2265620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027974
44234	NC_018610	CTG	3	9	2265653	2265661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027974
44235	NC_018610	ATA	2	6	2265711	2265716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027974
44236	NC_018610	TAA	2	6	2265727	2265732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44237	NC_018610	ATGGC	2	10	2265740	2265749	20 %	20 %	40 %	20 %	406027975
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44239	NC_018610	CTG	2	6	2265865	2265870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027975
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44263	NC_018610	AACG	2	8	2266877	2266884	50 %	0 %	25 %	25 %	406027976
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44276	NC_018610	AT	3	6	2267407	2267412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44277	NC_018610	GAATT	2	10	2267428	2267437	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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44351	NC_018610	ATC	2	6	2271975	2271980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027978
44352	NC_018610	GAAC	2	8	2271996	2272003	50 %	0 %	25 %	25 %	406027978
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44463	NC_018610	AAAT	2	8	2277456	2277463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44464	NC_018610	CAA	2	6	2277520	2277525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44467	NC_018610	GTA	2	6	2277682	2277687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44468	NC_018610	TA	3	6	2277693	2277698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44469	NC_018610	GTT	2	6	2277744	2277749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027984
44470	NC_018610	TCG	2	6	2277923	2277928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027984
44471	NC_018610	ATT	2	6	2277930	2277935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027984
44472	NC_018610	AACC	2	8	2277955	2277962	50 %	0 %	0 %	50 %	406027984
44473	NC_018610	TGA	2	6	2277974	2277979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027984
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44483	NC_018610	TGA	2	6	2278316	2278321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027984
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44488	NC_018610	TGA	2	6	2278463	2278468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027984
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44495	NC_018610	GCT	2	6	2278761	2278766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027984
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44498	NC_018610	CTG	3	9	2278896	2278904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027984
44499	NC_018610	AAG	2	6	2278929	2278934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027984
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