MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 48598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_018610	ATC	2	6	1785001	1785006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027561
35003	NC_018610	ATCG	2	8	1785067	1785074	25 %	25 %	25 %	25 %	406027561
35004	NC_018610	TCA	2	6	1785140	1785145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027561
35005	NC_018610	GTG	2	6	1785157	1785162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027561
35006	NC_018610	TCA	2	6	1785209	1785214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027561
35007	NC_018610	TCA	2	6	1785224	1785229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027561
35008	NC_018610	GCA	2	6	1785260	1785265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027561
35009	NC_018610	AATT	2	8	1785310	1785317	50 %	50 %	0 %	0 %	406027561
35010	NC_018610	CAC	2	6	1785378	1785383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027561
35011	NC_018610	GT	3	6	1785398	1785403	0 %	50 %	50 %	0 %	406027561
35012	NC_018610	AAT	2	6	1785421	1785426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027561
35013	NC_018610	TCA	2	6	1785446	1785451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027561
35014	NC_018610	CAC	2	6	1785480	1785485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027561
35015	NC_018610	CAT	2	6	1785523	1785528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027561
35016	NC_018610	CTT	2	6	1785535	1785540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027561
35017	NC_018610	CGC	2	6	1785561	1785566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027561
35018	NC_018610	GTT	2	6	1785637	1785642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027561
35019	NC_018610	CGA	2	6	1785650	1785655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027561
35020	NC_018610	TTG	2	6	1785759	1785764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027561
35021	NC_018610	TTG	2	6	1785787	1785792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027561
35022	NC_018610	GTT	2	6	1785801	1785806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027561
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35024	NC_018610	TCA	2	6	1785926	1785931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027561
35025	NC_018610	TTC	2	6	1785980	1785985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027561
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35028	NC_018610	CTG	2	6	1786129	1786134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027561
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35031	NC_018610	CT	3	6	1786289	1786294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35032	NC_018610	TCGT	2	8	1786300	1786307	0 %	50 %	25 %	25 %	406027562
35033	NC_018610	ATG	2	6	1786334	1786339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027562
35034	NC_018610	ATG	2	6	1786409	1786414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027562
35035	NC_018610	CGA	2	6	1786424	1786429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027562
35036	NC_018610	TTAA	2	8	1786430	1786437	50 %	50 %	0 %	0 %	406027562
35037	NC_018610	ATT	2	6	1786441	1786446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027562
35038	NC_018610	TAA	2	6	1786537	1786542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027562
35039	NC_018610	TTCTA	2	10	1786552	1786561	20 %	60 %	0 %	20 %	406027562
35040	NC_018610	GCC	3	9	1786567	1786575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027562
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35042	NC_018610	TAT	3	9	1786796	1786804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35043	NC_018610	CGA	2	6	1786846	1786851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35044	NC_018610	AGAA	2	8	1786981	1786988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35045	NC_018610	GAAC	2	8	1787025	1787032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35046	NC_018610	TG	3	6	1787059	1787064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35047	NC_018610	AGC	2	6	1787170	1787175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35048	NC_018610	AG	3	6	1787214	1787219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35049	NC_018610	AAT	2	6	1787228	1787233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35050	NC_018610	TGG	2	6	1787241	1787246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35051	NC_018610	A	7	7	1787303	1787309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35052	NC_018610	A	7	7	1787371	1787377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35053	NC_018610	GAT	2	6	1787451	1787456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35054	NC_018610	AATATA	2	12	1787477	1787488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35055	NC_018610	A	6	6	1787606	1787611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35056	NC_018610	ATA	2	6	1787686	1787691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35057	NC_018610	ATTAA	2	10	1787695	1787704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35058	NC_018610	TTGA	2	8	1787724	1787731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35059	NC_018610	CCA	2	6	1787762	1787767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35060	NC_018610	ACT	2	6	1787793	1787798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35061	NC_018610	GGA	2	6	1788091	1788096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35062	NC_018610	CCT	2	6	1788117	1788122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35063	NC_018610	TCC	2	6	1788157	1788162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35064	NC_018610	CAT	2	6	1788195	1788200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35065	NC_018610	TCAAG	2	10	1788236	1788245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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35069	NC_018610	TAT	2	6	1788309	1788314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35070	NC_018610	AATT	2	8	1788350	1788357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35073	NC_018610	TTCA	2	8	1788470	1788477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35074	NC_018610	AT	3	6	1788516	1788521	50 %	50 %	0 %	0 %	406027563
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35078	NC_018610	CTGGG	2	10	1788731	1788740	0 %	20 %	60 %	20 %	406027563
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35080	NC_018610	GTC	2	6	1788792	1788797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027563
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35088	NC_018610	TCA	2	6	1789677	1789682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027563
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35090	NC_018610	ACC	2	6	1789834	1789839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35091	NC_018610	GCA	2	6	1789894	1789899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35092	NC_018610	ACCA	2	8	1789945	1789952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35093	NC_018610	TC	3	6	1789956	1789961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35094	NC_018610	AATC	2	8	1790013	1790020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35095	NC_018610	AAATT	2	10	1790043	1790052	60 %	40 %	0 %	0 %	406027564
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35104	NC_018610	TCA	2	6	1790470	1790475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027564
35105	NC_018610	T	6	6	1790487	1790492	0 %	100 %	0 %	0 %	406027564
35106	NC_018610	CGA	2	6	1790506	1790511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027564
35107	NC_018610	A	6	6	1790515	1790520	100 %	0 %	0 %	0 %	406027564
35108	NC_018610	AAG	2	6	1790533	1790538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027564
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35112	NC_018610	TGT	2	6	1790620	1790625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027564
35113	NC_018610	ATT	2	6	1790686	1790691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35114	NC_018610	ATC	2	6	1790713	1790718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35115	NC_018610	AGA	2	6	1790756	1790761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35116	NC_018610	TGT	2	6	1790819	1790824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027565
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35118	NC_018610	CCAA	2	8	1790966	1790973	50 %	0 %	0 %	50 %	406027565
35119	NC_018610	CCAG	2	8	1791019	1791026	25 %	0 %	25 %	50 %	406027565
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35358	NC_018610	TTG	2	6	1803589	1803594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027580
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35404	NC_018610	TA	3	6	1805633	1805638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35405	NC_018610	A	6	6	1805643	1805648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35427	NC_018610	AT	3	6	1806615	1806620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35471	NC_018610	TTTC	2	8	1809115	1809122	0 %	75 %	0 %	25 %	406027589
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35473	NC_018610	A	6	6	1809199	1809204	100 %	0 %	0 %	0 %	406027589
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35476	NC_018610	ACA	2	6	1809371	1809376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406027589
35477	NC_018610	ACA	2	6	1809497	1809502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406027589
35478	NC_018610	CAT	2	6	1809543	1809548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027589
35479	NC_018610	GTT	2	6	1809580	1809585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027589
35480	NC_018610	ACC	2	6	1809673	1809678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027589
35481	NC_018610	GTT	2	6	1809703	1809708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027589
35482	NC_018610	TCA	2	6	1809967	1809972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027589
35483	NC_018610	ATC	2	6	1810060	1810065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027589
35484	NC_018610	TGG	2	6	1810152	1810157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027589
35485	NC_018610	GTAT	2	8	1810207	1810214	25 %	50 %	25 %	0 %	406027589
35486	NC_018610	GAT	2	6	1810234	1810239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027589
35487	NC_018610	TGA	2	6	1810418	1810423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35488	NC_018610	TCGG	2	8	1810474	1810481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35489	NC_018610	AAT	2	6	1810564	1810569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027590
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35495	NC_018610	TGA	2	6	1810812	1810817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027590
35496	NC_018610	CAGT	2	8	1810853	1810860	25 %	25 %	25 %	25 %	406027590
35497	NC_018610	TAAGTA	2	12	1810882	1810893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406027590
35498	NC_018610	T	6	6	1810942	1810947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35499	NC_018610	CCCT	2	8	1810985	1810992	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35500	NC_018610	CAG	2	6	1811060	1811065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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