MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 48598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_018610	AGCC	2	8	1002588	1002595	25 %	0 %	25 %	50 %	406026803
19503	NC_018610	AAG	2	6	1002599	1002604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026803
19504	NC_018610	TTC	2	6	1002615	1002620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026803
19505	NC_018610	GAA	2	6	1002679	1002684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026803
19506	NC_018610	TAAT	2	8	1002692	1002699	50 %	50 %	0 %	0 %	406026803
19507	NC_018610	TA	3	6	1002720	1002725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19508	NC_018610	T	6	6	1002771	1002776	0 %	100 %	0 %	0 %	406026804
19509	NC_018610	ATT	2	6	1002820	1002825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026804
19510	NC_018610	ATC	2	6	1002910	1002915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026804
19511	NC_018610	ATT	2	6	1003023	1003028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026804
19512	NC_018610	AGCA	2	8	1003048	1003055	50 %	0 %	25 %	25 %	406026804
19513	NC_018610	GTT	2	6	1003156	1003161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026804
19514	NC_018610	TTG	2	6	1003205	1003210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026804
19515	NC_018610	GCCA	2	8	1003243	1003250	25 %	0 %	25 %	50 %	406026804
19516	NC_018610	GAC	2	6	1003270	1003275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026804
19517	NC_018610	TGC	2	6	1003427	1003432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026804
19518	NC_018610	ACA	2	6	1003437	1003442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026804
19519	NC_018610	ATT	2	6	1003471	1003476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026804
19520	NC_018610	ATC	2	6	1003536	1003541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026804
19521	NC_018610	CAT	2	6	1003590	1003595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026804
19522	NC_018610	ATTA	2	8	1003640	1003647	50 %	50 %	0 %	0 %	406026804
19523	NC_018610	AGC	2	6	1003703	1003708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19524	NC_018610	T	6	6	1003804	1003809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19525	NC_018610	AT	3	6	1003838	1003843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_018610	AGTT	2	8	1003844	1003851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19527	NC_018610	TAAC	2	8	1003863	1003870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19528	NC_018610	GGA	2	6	1003875	1003880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_018610	AGA	2	6	1003910	1003915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026805
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19532	NC_018610	A	6	6	1004148	1004153	100 %	0 %	0 %	0 %	406026805
19533	NC_018610	GGC	2	6	1004243	1004248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026805
19534	NC_018610	CTG	2	6	1004260	1004265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026805
19535	NC_018610	GCC	2	6	1004274	1004279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026805
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19538	NC_018610	CGC	2	6	1004351	1004356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026805
19539	NC_018610	ATT	2	6	1004385	1004390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026805
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19541	NC_018610	CAAC	2	8	1004422	1004429	50 %	0 %	0 %	50 %	406026805
19542	NC_018610	ATCA	2	8	1004460	1004467	50 %	25 %	0 %	25 %	406026805
19543	NC_018610	TTTA	2	8	1004531	1004538	25 %	75 %	0 %	0 %	406026805
19544	NC_018610	AATC	2	8	1004638	1004645	50 %	25 %	0 %	25 %	406026805
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19553	NC_018610	TCA	2	6	1004955	1004960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026806
19554	NC_018610	ATC	2	6	1004969	1004974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026806
19555	NC_018610	CATTGG	2	12	1005022	1005033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406026806
19556	NC_018610	GCA	2	6	1005235	1005240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026806
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19559	NC_018610	T	6	6	1005398	1005403	0 %	100 %	0 %	0 %	406026806
19560	NC_018610	TGC	2	6	1005408	1005413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026806
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19586	NC_018610	TGA	2	6	1007118	1007123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026808
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19588	NC_018610	CCAC	2	8	1007436	1007443	25 %	0 %	0 %	75 %	406026808
19589	NC_018610	ATG	2	6	1007612	1007617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026808
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19591	NC_018610	CAAT	2	8	1007725	1007732	50 %	25 %	0 %	25 %	406026808
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19595	NC_018610	ACT	2	6	1007914	1007919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19597	NC_018610	TCA	2	6	1007955	1007960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026809
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19601	NC_018610	TTA	2	6	1008196	1008201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026809
19602	NC_018610	A	7	7	1008213	1008219	100 %	0 %	0 %	0 %	406026809
19603	NC_018610	CGA	2	6	1008231	1008236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026809
19604	NC_018610	TTCG	2	8	1008263	1008270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19605	NC_018610	ACCGCT	2	12	1008300	1008311	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19606	NC_018610	TGG	2	6	1008329	1008334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19607	NC_018610	AAG	2	6	1008336	1008341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19608	NC_018610	ATG	2	6	1008486	1008491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026810
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19613	NC_018610	ATT	2	6	1008765	1008770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19614	NC_018610	CGG	2	6	1008804	1008809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026811
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19616	NC_018610	T	6	6	1008895	1008900	0 %	100 %	0 %	0 %	406026811
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19618	NC_018610	TTG	2	6	1009085	1009090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026811
19619	NC_018610	GTT	2	6	1009138	1009143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026811
19620	NC_018610	GAT	2	6	1009318	1009323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026811
19621	NC_018610	TTG	3	9	1009352	1009360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026811
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19624	NC_018610	ATG	2	6	1009588	1009593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026812
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19626	NC_018610	TGA	2	6	1009663	1009668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026812
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19634	NC_018610	TC	3	6	1010037	1010042	0 %	50 %	0 %	50 %	406026812
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19644	NC_018610	ATCG	2	8	1010556	1010563	25 %	25 %	25 %	25 %	406026812
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19649	NC_018610	T	7	7	1010694	1010700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19650	NC_018610	T	6	6	1010714	1010719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19852	NC_018610	CAA	2	6	1020487	1020492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026822
19853	NC_018610	TCA	2	6	1020504	1020509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026822
19854	NC_018610	GAT	2	6	1020555	1020560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026822
19855	NC_018610	AC	3	6	1020601	1020606	50 %	0 %	0 %	50 %	406026822
19856	NC_018610	TGA	2	6	1020608	1020613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026822
19857	NC_018610	GAA	2	6	1020651	1020656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026822
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19859	NC_018610	AGC	2	6	1020756	1020761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026823
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19862	NC_018610	CAA	2	6	1021054	1021059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026823
19863	NC_018610	GAAT	2	8	1021146	1021153	50 %	25 %	25 %	0 %	406026823
19864	NC_018610	TC	3	6	1021162	1021167	0 %	50 %	0 %	50 %	406026823
19865	NC_018610	CGG	2	6	1021189	1021194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026823
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19868	NC_018610	TGG	2	6	1021237	1021242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026823
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19870	NC_018610	TTCA	2	8	1021397	1021404	25 %	50 %	0 %	25 %	406026823
19871	NC_018610	TGA	2	6	1021461	1021466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026823
19872	NC_018610	ATG	2	6	1021481	1021486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026823
19873	NC_018610	TGC	2	6	1021495	1021500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026823
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19880	NC_018610	TGT	2	6	1021712	1021717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026823
19881	NC_018610	CCG	2	6	1021730	1021735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026823
19882	NC_018610	TGA	2	6	1021803	1021808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026823
19883	NC_018610	A	6	6	1021808	1021813	100 %	0 %	0 %	0 %	406026823
19884	NC_018610	ACA	2	6	1021821	1021826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026823
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19887	NC_018610	GCT	2	6	1021891	1021896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026823
19888	NC_018610	GTTT	2	8	1021923	1021930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19889	NC_018610	AGA	2	6	1021998	1022003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026824
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19904	NC_018610	AGAA	2	8	1022553	1022560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19905	NC_018610	GCT	2	6	1022611	1022616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19942	NC_018610	AAT	2	6	1025547	1025552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026826
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19950	NC_018610	CGA	2	6	1025867	1025872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026826
19951	NC_018610	GGC	2	6	1025902	1025907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026826
19952	NC_018610	ATG	2	6	1025935	1025940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026826
19953	NC_018610	TGG	2	6	1025994	1025999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026826
19954	NC_018610	TTA	2	6	1026041	1026046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026826
19955	NC_018610	ATT	2	6	1026118	1026123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026826
19956	NC_018610	GTC	2	6	1026142	1026147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026826
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19963	NC_018610	A	6	6	1026461	1026466	100 %	0 %	0 %	0 %	406026826
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19966	NC_018610	ATC	2	6	1026646	1026651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026826
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