MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 48598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12007	NC_018610	ATG	2	6	618871	618876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026419
12008	NC_018610	CGC	2	6	618890	618895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026419
12009	NC_018610	TCG	2	6	618905	618910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026419
12010	NC_018610	TGAT	2	8	618931	618938	25 %	50 %	25 %	0 %	406026419
12011	NC_018610	AAAGT	2	10	618972	618981	60 %	20 %	20 %	0 %	406026419
12012	NC_018610	TCT	2	6	619000	619005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026419
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12018	NC_018610	TGT	2	6	619144	619149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_018610	ATT	2	6	619173	619178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12059	NC_018610	AGC	2	6	621330	621335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026422
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12101	NC_018610	TAC	2	6	623698	623703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12105	NC_018610	GAA	2	6	624150	624155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026425
12106	NC_018610	TCGGT	2	10	624295	624304	0 %	40 %	40 %	20 %	406026425
12107	NC_018610	CGAC	2	8	624328	624335	25 %	0 %	25 %	50 %	406026425
12108	NC_018610	GCCA	2	8	624423	624430	25 %	0 %	25 %	50 %	406026425
12109	NC_018610	AT	3	6	624525	624530	50 %	50 %	0 %	0 %	406026425
12110	NC_018610	TTGG	2	8	624576	624583	0 %	50 %	50 %	0 %	406026425
12111	NC_018610	AGGCGA	2	12	624599	624610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	406026425
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12113	NC_018610	ACC	2	6	624642	624647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026426
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12117	NC_018610	ATC	2	6	624744	624749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026426
12118	NC_018610	GCC	2	6	624806	624811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026426
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12122	NC_018610	GAA	2	6	624869	624874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026426
12123	NC_018610	AAT	2	6	624948	624953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026426
12124	NC_018610	CCA	2	6	625009	625014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026426
12125	NC_018610	GCCA	2	8	625036	625043	25 %	0 %	25 %	50 %	406026426
12126	NC_018610	ATG	2	6	625057	625062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026426
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12129	NC_018610	ATG	2	6	625113	625118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026426
12130	NC_018610	T	6	6	625159	625164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_018610	TTA	2	6	625205	625210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12132	NC_018610	TG	3	6	625215	625220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12133	NC_018610	TGAAT	2	10	625257	625266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_018610	ATT	3	9	625276	625284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12135	NC_018610	GCA	2	6	625352	625357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026427
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12140	NC_018610	TGA	2	6	625519	625524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026427
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12144	NC_018610	A	6	6	626002	626007	100 %	0 %	0 %	0 %	406026427
12145	NC_018610	ATT	2	6	626017	626022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026427
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12203	NC_018610	CCACA	2	10	629331	629340	40 %	0 %	0 %	60 %	406026429
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12210	NC_018610	ATC	2	6	629764	629769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026430
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12215	NC_018610	CTG	2	6	629890	629895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026430
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12228	NC_018610	CAAAA	2	10	630553	630562	80 %	0 %	0 %	20 %	406026431
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12232	NC_018610	GTTGA	2	10	630821	630830	20 %	40 %	40 %	0 %	406026432
12233	NC_018610	TAA	2	6	630856	630861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026432
12234	NC_018610	ATC	2	6	630891	630896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026432
12235	NC_018610	TTGG	2	8	630899	630906	0 %	50 %	50 %	0 %	406026432
12236	NC_018610	AGT	2	6	630956	630961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026432
12237	NC_018610	TTGA	2	8	631019	631026	25 %	50 %	25 %	0 %	406026432
12238	NC_018610	TTC	2	6	631055	631060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12239	NC_018610	TAC	2	6	631210	631215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12240	NC_018610	ACT	2	6	631260	631265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026433
12241	NC_018610	TGCGG	2	10	631297	631306	0 %	20 %	60 %	20 %	406026433
12242	NC_018610	CGA	2	6	631307	631312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026433
12243	NC_018610	ATG	2	6	631341	631346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026433
12244	NC_018610	TCA	2	6	631357	631362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026433
12245	NC_018610	GCT	2	6	631459	631464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026433
12246	NC_018610	CGC	2	6	631517	631522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026433
12247	NC_018610	GCT	2	6	631553	631558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026433
12248	NC_018610	TTG	2	6	631653	631658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026433
12249	NC_018610	GTT	2	6	631677	631682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026433
12250	NC_018610	CGC	2	6	631712	631717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026433
12251	NC_018610	ATG	2	6	631720	631725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026433
12252	NC_018610	GAAT	2	8	631748	631755	50 %	25 %	25 %	0 %	406026433
12253	NC_018610	TTA	2	6	631783	631788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12254	NC_018610	TCA	2	6	631801	631806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12255	NC_018610	GTTG	2	8	631932	631939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12256	NC_018610	ACC	2	6	632024	632029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12257	NC_018610	AAAT	2	8	632071	632078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12258	NC_018610	A	6	6	632122	632127	100 %	0 %	0 %	0 %	406026434
12259	NC_018610	CAT	2	6	632156	632161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026434
12260	NC_018610	CGGC	2	8	632166	632173	0 %	0 %	50 %	50 %	406026434
12261	NC_018610	ATTGAA	2	12	632298	632309	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406026434
12262	NC_018610	GAT	2	6	632319	632324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026434
12263	NC_018610	AAG	2	6	632329	632334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026434
12264	NC_018610	GGCA	2	8	632339	632346	25 %	0 %	50 %	25 %	406026434
12265	NC_018610	AAG	2	6	632365	632370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026434
12266	NC_018610	TCG	2	6	632374	632379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026434
12267	NC_018610	GGACGC	2	12	632393	632404	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406026434
12268	NC_018610	TAA	2	6	632521	632526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12269	NC_018610	AAAAG	2	10	632541	632550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12270	NC_018610	AGC	2	6	632594	632599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026435
12271	NC_018610	CTG	2	6	632600	632605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026435
12272	NC_018610	GAA	2	6	632656	632661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026435
12273	NC_018610	ACA	2	6	632721	632726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026435
12274	NC_018610	CAG	2	6	632740	632745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026435
12275	NC_018610	TACA	2	8	632807	632814	50 %	25 %	0 %	25 %	406026435
12276	NC_018610	ATT	2	6	632826	632831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026435
12277	NC_018610	CCAGGC	2	12	632848	632859	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406026435
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12279	NC_018610	ATC	2	6	632955	632960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026435
12280	NC_018610	CGT	2	6	632967	632972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026435
12281	NC_018610	CGA	2	6	633027	633032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026435
12282	NC_018610	AAG	2	6	633041	633046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026435
12283	NC_018610	AAG	2	6	633050	633055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026435
12284	NC_018610	AAG	2	6	633080	633085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026435
12285	NC_018610	AAG	2	6	633092	633097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026435
12286	NC_018610	CCAC	2	8	633102	633109	25 %	0 %	0 %	75 %	406026435
12287	NC_018610	CGA	2	6	633129	633134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026435
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12290	NC_018610	GAT	2	6	633221	633226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026435
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12292	NC_018610	ACG	2	6	633333	633338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026435
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12294	NC_018610	GAC	2	6	633514	633519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026435
12295	NC_018610	ACA	2	6	633537	633542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026435
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12297	NC_018610	CTG	2	6	633674	633679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026435
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12299	NC_018610	CAT	2	6	633766	633771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026435
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12302	NC_018610	GGT	2	6	633923	633928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026435
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12313	NC_018610	CAA	2	6	634465	634470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026435
12314	NC_018610	CAA	2	6	634474	634479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026435
12315	NC_018610	TTGA	2	8	634505	634512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12316	NC_018610	ATG	2	6	634516	634521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12317	NC_018610	TGAT	2	8	634526	634533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12318	NC_018610	CAC	2	6	634707	634712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026436
12319	NC_018610	GAA	2	6	634737	634742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026436
12320	NC_018610	CCG	2	6	634826	634831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026436
12321	NC_018610	CAT	2	6	634844	634849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026436
12322	NC_018610	CGC	2	6	634862	634867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026436
12323	NC_018610	TGG	2	6	634873	634878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026436
12324	NC_018610	GGAA	2	8	634892	634899	50 %	0 %	50 %	0 %	406026436
12325	NC_018610	TGG	2	6	635025	635030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12326	NC_018610	T	7	7	635038	635044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12327	NC_018610	TGA	2	6	635048	635053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12328	NC_018610	ATC	2	6	635082	635087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026437
12329	NC_018610	GGC	2	6	635105	635110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026437
12330	NC_018610	TCG	2	6	635146	635151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026437
12331	NC_018610	GTC	2	6	635225	635230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026437
12332	NC_018610	ACG	2	6	635271	635276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026437
12333	NC_018610	TTCT	2	8	635294	635301	0 %	75 %	0 %	25 %	406026437
12334	NC_018610	CAG	3	9	635417	635425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026437
12335	NC_018610	TTC	2	6	635427	635432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026437
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12337	NC_018610	ATC	2	6	635462	635467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026437
12338	NC_018610	GGT	2	6	635485	635490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026437
12339	NC_018610	CCG	2	6	635495	635500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026437
12340	NC_018610	CTT	2	6	635536	635541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026437
12341	NC_018610	GTT	2	6	635698	635703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12342	NC_018610	CAC	2	6	635708	635713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12343	NC_018610	AAC	2	6	635792	635797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026438
12344	NC_018610	TGG	2	6	635856	635861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026438
12345	NC_018610	GAA	2	6	635875	635880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026438
12346	NC_018610	GAT	2	6	635932	635937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026438
12347	NC_018610	TCG	2	6	635943	635948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026438
12348	NC_018610	A	6	6	635975	635980	100 %	0 %	0 %	0 %	406026438
12349	NC_018610	GAA	2	6	636074	636079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026438
12350	NC_018610	AAG	2	6	636119	636124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026438
12351	NC_018610	CAT	2	6	636151	636156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026438
12352	NC_018610	TGA	2	6	636160	636165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026438
12353	NC_018610	GAC	2	6	636268	636273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026438
12354	NC_018610	AAT	2	6	636315	636320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026438
12355	NC_018610	TTCGT	2	10	636338	636347	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12356	NC_018610	AAG	2	6	636469	636474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026439
12357	NC_018610	CAC	2	6	636647	636652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026439
12358	NC_018610	AGG	2	6	636676	636681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12359	NC_018610	GTT	2	6	636893	636898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026440
12360	NC_018610	AC	3	6	636901	636906	50 %	0 %	0 %	50 %	406026440
12361	NC_018610	AAT	2	6	636913	636918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026440
12362	NC_018610	ATG	2	6	637056	637061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12363	NC_018610	CGG	2	6	637067	637072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12364	NC_018610	TTG	2	6	637089	637094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12365	NC_018610	AAG	2	6	637147	637152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12366	NC_018610	GGA	2	6	637272	637277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12367	NC_018610	AAT	2	6	637283	637288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026441
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12398	NC_018610	T	7	7	638811	638817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12399	NC_018610	CAA	2	6	638829	638834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12402	NC_018610	TAG	2	6	638943	638948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12474	NC_018610	GATTTG	2	12	641641	641652	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406026445
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12480	NC_018610	TGA	2	6	642063	642068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026446
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12482	NC_018610	CAGCG	2	10	642180	642189	20 %	0 %	40 %	40 %	406026446
12483	NC_018610	CCA	2	6	642398	642403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026446
12484	NC_018610	GAT	2	6	642424	642429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026446
12485	NC_018610	AGCC	2	8	642494	642501	25 %	0 %	25 %	50 %	406026446
12486	NC_018610	CAAC	2	8	642547	642554	50 %	0 %	0 %	50 %	406026446
12487	NC_018610	GAT	2	6	642583	642588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026446
12488	NC_018610	ATT	2	6	642673	642678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026446
12489	NC_018610	ACG	2	6	642868	642873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026446
12490	NC_018610	TAAA	2	8	643038	643045	75 %	25 %	0 %	0 %	406026446
12491	NC_018610	A	6	6	643130	643135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12492	NC_018610	GATAT	2	10	643164	643173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12493	NC_018610	TA	3	6	643174	643179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12494	NC_018610	AAGG	2	8	643183	643190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12495	NC_018610	AAG	2	6	643194	643199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12496	NC_018610	TTC	2	6	643235	643240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12497	NC_018610	TGT	2	6	643256	643261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12498	NC_018610	ATT	2	6	643273	643278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12499	NC_018610	GTT	2	6	643307	643312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12500	NC_018610	ATG	2	6	643372	643377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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