MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482

Total Repeats: 67031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018591	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018591	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018591	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018591	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018591	G	6	6	307	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018591	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	404285368
7	NC_018591	A	8	8	364	371	100 %	0 %	0 %	0 %	404285368
8	NC_018591	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285368
9	NC_018591	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285368
10	NC_018591	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285368
11	NC_018591	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285368
12	NC_018591	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285368
13	NC_018591	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404285368
14	NC_018591	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404285368
15	NC_018591	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285368
16	NC_018591	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285368
17	NC_018591	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285368
18	NC_018591	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285368
19	NC_018591	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	404285368
20	NC_018591	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285368
21	NC_018591	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285368
22	NC_018591	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	404285368
23	NC_018591	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285368
24	NC_018591	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285368
25	NC_018591	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	404285368
26	NC_018591	GAAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	25 %	0 %	404285368
27	NC_018591	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404285368
28	NC_018591	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	404285368
29	NC_018591	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285368
30	NC_018591	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404285368
31	NC_018591	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285368
32	NC_018591	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404285368
33	NC_018591	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285368
34	NC_018591	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285368
35	NC_018591	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285368
36	NC_018591	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	404285368
37	NC_018591	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	404285368
38	NC_018591	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285368
39	NC_018591	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404285368
40	NC_018591	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	404285368
41	NC_018591	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404285368
42	NC_018591	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	404285368
43	NC_018591	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018591	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018591	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018591	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018591	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285369
48	NC_018591	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285369
49	NC_018591	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285369
50	NC_018591	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404285369
51	NC_018591	TCAA	2	8	2098	2105	50 %	25 %	0 %	25 %	404285369
52	NC_018591	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404285369
53	NC_018591	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285369
54	NC_018591	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	404285369
55	NC_018591	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	404285369
56	NC_018591	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285369
57	NC_018591	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285369
58	NC_018591	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	404285369
59	NC_018591	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285369
60	NC_018591	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285369
61	NC_018591	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	404285369
62	NC_018591	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285369
63	NC_018591	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285369
64	NC_018591	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285369
65	NC_018591	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404285369
66	NC_018591	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285369
67	NC_018591	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285369
68	NC_018591	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018591	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285370
70	NC_018591	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285370
71	NC_018591	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	404285370
72	NC_018591	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285370
73	NC_018591	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404285370
74	NC_018591	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	404285370
75	NC_018591	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	404285370
76	NC_018591	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285370
77	NC_018591	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285370
78	NC_018591	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404285370
79	NC_018591	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	404285370
80	NC_018591	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285370
81	NC_018591	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285370
82	NC_018591	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404285370
83	NC_018591	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	404285370
84	NC_018591	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	404285370
85	NC_018591	TA	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	404285370
86	NC_018591	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404285370
87	NC_018591	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	404285370
88	NC_018591	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404285370
89	NC_018591	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	404285370
90	NC_018591	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404285370
91	NC_018591	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285370
92	NC_018591	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404285370
93	NC_018591	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404285370
94	NC_018591	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404285370
95	NC_018591	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285370
96	NC_018591	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285370
97	NC_018591	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404285370
98	NC_018591	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285370
99	NC_018591	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	404285370
100	NC_018591	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404285370
101	NC_018591	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	404285370
102	NC_018591	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404285370
103	NC_018591	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	404285370
104	NC_018591	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285370
105	NC_018591	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018591	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018591	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018591	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_018591	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018591	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018591	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018591	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018591	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	404285371
114	NC_018591	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404285371
115	NC_018591	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	404285372
116	NC_018591	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404285372
117	NC_018591	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404285372
118	NC_018591	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285372
119	NC_018591	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285372
120	NC_018591	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	404285372
121	NC_018591	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285372
122	NC_018591	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	404285372
123	NC_018591	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404285372
124	NC_018591	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404285372
125	NC_018591	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	404285372
126	NC_018591	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	404285372
127	NC_018591	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404285372
128	NC_018591	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285372
129	NC_018591	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285372
130	NC_018591	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404285372
131	NC_018591	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285372
132	NC_018591	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285372
133	NC_018591	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285372
134	NC_018591	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404285372
135	NC_018591	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	404285372
136	NC_018591	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018591	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018591	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_018591	ACCG	2	8	18393	18400	25 %	0 %	25 %	50 %	404285381
402	NC_018591	TGT	2	6	18495	18500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404285381
403	NC_018591	TGG	2	6	18501	18506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404285381
404	NC_018591	CTT	2	6	18564	18569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404285381
405	NC_018591	A	6	6	18671	18676	100 %	0 %	0 %	0 %	404285381
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408	NC_018591	GTTT	2	8	18718	18725	0 %	75 %	25 %	0 %	404285381
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440	NC_018591	T	9	9	20303	20311	0 %	100 %	0 %	0 %	404285384
441	NC_018591	AT	3	6	20322	20327	50 %	50 %	0 %	0 %	404285384
442	NC_018591	TAATT	2	10	20372	20381	40 %	60 %	0 %	0 %	404285384
443	NC_018591	ATA	2	6	20429	20434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404285384
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462	NC_018591	CAG	2	6	21297	21302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404285384
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464	NC_018591	ATG	2	6	21347	21352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404285384
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468	NC_018591	T	7	7	21412	21418	0 %	100 %	0 %	0 %	404285384
469	NC_018591	T	6	6	21429	21434	0 %	100 %	0 %	0 %	404285384
470	NC_018591	CTC	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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473	NC_018591	ATT	2	6	21577	21582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_018591	ATC	2	6	21869	21874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404285385
479	NC_018591	AGA	2	6	21882	21887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404285385
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497	NC_018591	CA	3	6	22564	22569	50 %	0 %	0 %	50 %	404285385
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499	NC_018591	TTC	2	6	22596	22601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404285385
500	NC_018591	A	6	6	22665	22670	100 %	0 %	0 %	0 %	404285385

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