MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_018528	CTT	2	6	2007239	2007244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44002	NC_018528	GATT	2	8	2007287	2007294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_018528	TCA	2	6	2007303	2007308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44004	NC_018528	CA	3	6	2007492	2007497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44005	NC_018528	TAG	3	9	2007544	2007552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44006	NC_018528	TCTT	2	8	2007672	2007679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44007	NC_018528	TCA	3	9	2007927	2007935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44008	NC_018528	TAA	2	6	2007955	2007960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_018528	TGAT	2	8	2007965	2007972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44010	NC_018528	AAT	2	6	2007976	2007981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44011	NC_018528	C	6	6	2007986	2007991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44012	NC_018528	AGAA	2	8	2008044	2008051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44013	NC_018528	TCC	2	6	2008072	2008077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44014	NC_018528	G	6	6	2008090	2008095	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44015	NC_018528	ACAA	2	8	2008147	2008154	75 %	0 %	0 %	25 %	403515932
44016	NC_018528	AATGTT	2	12	2008165	2008176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403515932
44017	NC_018528	CAT	2	6	2008183	2008188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515932
44018	NC_018528	GAATA	2	10	2008275	2008284	60 %	20 %	20 %	0 %	403515932
44019	NC_018528	AAT	2	6	2008287	2008292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515932
44020	NC_018528	TGA	2	6	2008310	2008315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515932
44021	NC_018528	CCG	2	6	2008481	2008486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515932
44022	NC_018528	TCAA	2	8	2008556	2008563	50 %	25 %	0 %	25 %	403515932
44023	NC_018528	AT	3	6	2008607	2008612	50 %	50 %	0 %	0 %	403515932
44024	NC_018528	ATTTT	2	10	2008629	2008638	20 %	80 %	0 %	0 %	403515932
44025	NC_018528	GAAAA	2	10	2008701	2008710	80 %	0 %	20 %	0 %	403515932
44026	NC_018528	AGA	2	6	2008726	2008731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515932
44027	NC_018528	T	6	6	2008756	2008761	0 %	100 %	0 %	0 %	403515932
44028	NC_018528	A	6	6	2008861	2008866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44029	NC_018528	TAT	2	6	2008895	2008900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515933
44030	NC_018528	TAG	2	6	2008902	2008907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515933
44031	NC_018528	GAG	2	6	2008950	2008955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403515933
44032	NC_018528	T	6	6	2008971	2008976	0 %	100 %	0 %	0 %	403515933
44033	NC_018528	TGCT	2	8	2008986	2008993	0 %	50 %	25 %	25 %	403515933
44034	NC_018528	GCT	2	6	2009019	2009024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515933
44035	NC_018528	TTG	2	6	2009028	2009033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515933
44036	NC_018528	TCT	2	6	2009093	2009098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515933
44037	NC_018528	TCTT	2	8	2009177	2009184	0 %	75 %	0 %	25 %	403515933
44038	NC_018528	ATT	2	6	2009207	2009212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515933
44039	NC_018528	AT	3	6	2009245	2009250	50 %	50 %	0 %	0 %	403515933
44040	NC_018528	TGC	3	9	2009267	2009275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515933
44041	NC_018528	AAT	2	6	2009341	2009346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515933
44042	NC_018528	CAG	2	6	2009391	2009396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515933
44043	NC_018528	AAT	2	6	2009444	2009449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515933
44044	NC_018528	T	6	6	2009530	2009535	0 %	100 %	0 %	0 %	403515933
44045	NC_018528	TGGG	2	8	2009540	2009547	0 %	25 %	75 %	0 %	403515933
44046	NC_018528	TAA	2	6	2009618	2009623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515933
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44048	NC_018528	TAA	2	6	2009652	2009657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515933
44049	NC_018528	ATT	2	6	2009677	2009682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515933
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44051	NC_018528	GAT	2	6	2009775	2009780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515933
44052	NC_018528	CTT	2	6	2009817	2009822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515933
44053	NC_018528	TGT	2	6	2009839	2009844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515933
44054	NC_018528	AT	3	6	2009846	2009851	50 %	50 %	0 %	0 %	403515933
44055	NC_018528	ATCT	2	8	2009878	2009885	25 %	50 %	0 %	25 %	403515934
44056	NC_018528	T	6	6	2009912	2009917	0 %	100 %	0 %	0 %	403515934
44057	NC_018528	GAA	2	6	2009918	2009923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515934
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44060	NC_018528	ATC	3	9	2010104	2010112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515934
44061	NC_018528	GCTG	2	8	2010241	2010248	0 %	25 %	50 %	25 %	403515934
44062	NC_018528	TTG	2	6	2010266	2010271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515934
44063	NC_018528	AGT	2	6	2010286	2010291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515934
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44065	NC_018528	TCA	2	6	2010492	2010497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515934
44066	NC_018528	AT	3	6	2010524	2010529	50 %	50 %	0 %	0 %	403515934
44067	NC_018528	ACC	2	6	2010569	2010574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515934
44068	NC_018528	AT	3	6	2010658	2010663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44069	NC_018528	TAT	2	6	2010671	2010676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44070	NC_018528	TAG	2	6	2010865	2010870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515935
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44086	NC_018528	T	7	7	2011812	2011818	0 %	100 %	0 %	0 %	403515935
44087	NC_018528	CTTT	2	8	2011827	2011834	0 %	75 %	0 %	25 %	403515935
44088	NC_018528	T	6	6	2011832	2011837	0 %	100 %	0 %	0 %	403515935
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44098	NC_018528	T	6	6	2012227	2012232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44102	NC_018528	ATG	2	6	2012515	2012520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515936
44103	NC_018528	TGC	2	6	2012534	2012539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515936
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44108	NC_018528	TGA	2	6	2012830	2012835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515936
44109	NC_018528	ACG	2	6	2012845	2012850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515936
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44111	NC_018528	GCA	2	6	2012973	2012978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515936
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44113	NC_018528	TC	3	6	2013046	2013051	0 %	50 %	0 %	50 %	403515936
44114	NC_018528	AGA	2	6	2013101	2013106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515936
44115	NC_018528	T	6	6	2013144	2013149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44116	NC_018528	GCT	2	6	2013202	2013207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44117	NC_018528	CA	3	6	2013210	2013215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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44119	NC_018528	GCA	2	6	2013260	2013265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44472	NC_018528	A	7	7	2028979	2028985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44478	NC_018528	CTTTTT	2	12	2029364	2029375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403515955
44479	NC_018528	ATC	2	6	2029434	2029439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515955
44480	NC_018528	TGC	2	6	2029467	2029472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515955
44481	NC_018528	TTCTT	2	10	2029594	2029603	0 %	80 %	0 %	20 %	403515955
44482	NC_018528	CCG	2	6	2029655	2029660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515955
44483	NC_018528	ATC	2	6	2029704	2029709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515955
44484	NC_018528	CAT	2	6	2029784	2029789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515955
44485	NC_018528	CAT	2	6	2030001	2030006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515955
44486	NC_018528	AATA	2	8	2030008	2030015	75 %	25 %	0 %	0 %	403515955
44487	NC_018528	TAA	2	6	2030085	2030090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44488	NC_018528	TATCA	2	10	2030130	2030139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44489	NC_018528	T	6	6	2030154	2030159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44490	NC_018528	AT	5	10	2030176	2030185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44491	NC_018528	AAT	2	6	2030218	2030223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44492	NC_018528	TTAGTG	2	12	2030242	2030253	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44493	NC_018528	ATT	2	6	2030273	2030278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44495	NC_018528	GGT	2	6	2030406	2030411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44496	NC_018528	A	6	6	2030419	2030424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44497	NC_018528	TAT	3	9	2030497	2030505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515956
44498	NC_018528	AGC	2	6	2030560	2030565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515956
44499	NC_018528	A	6	6	2030652	2030657	100 %	0 %	0 %	0 %	403515956
44500	NC_018528	AGA	2	6	2030725	2030730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515956

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