MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_018528	CAG	2	6	1879975	1879980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515802
41502	NC_018528	AGT	2	6	1880015	1880020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515802
41503	NC_018528	TCT	2	6	1880040	1880045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515802
41504	NC_018528	CAT	2	6	1880062	1880067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515802
41505	NC_018528	TGA	2	6	1880072	1880077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515802
41506	NC_018528	CCA	2	6	1880094	1880099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515802
41507	NC_018528	AAG	2	6	1880124	1880129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515802
41508	NC_018528	AGT	2	6	1880138	1880143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515802
41509	NC_018528	ATC	2	6	1880180	1880185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515802
41510	NC_018528	GAA	2	6	1880198	1880203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515802
41511	NC_018528	AGT	2	6	1880214	1880219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515802
41512	NC_018528	CACG	2	8	1880239	1880246	25 %	0 %	25 %	50 %	403515802
41513	NC_018528	GTT	2	6	1880281	1880286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515802
41514	NC_018528	AGA	2	6	1880359	1880364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515802
41515	NC_018528	ATG	2	6	1880456	1880461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515802
41516	NC_018528	TAAAAT	2	12	1880468	1880479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515802
41517	NC_018528	TCAA	2	8	1880533	1880540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41518	NC_018528	TCT	2	6	1880571	1880576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515803
41519	NC_018528	AAT	2	6	1880596	1880601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515803
41520	NC_018528	ATG	2	6	1880644	1880649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515803
41521	NC_018528	ACC	2	6	1880692	1880697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515803
41522	NC_018528	ATT	2	6	1880779	1880784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515803
41523	NC_018528	AATTT	2	10	1880831	1880840	40 %	60 %	0 %	0 %	403515803
41524	NC_018528	ACTA	2	8	1880893	1880900	50 %	25 %	0 %	25 %	403515803
41525	NC_018528	AATA	2	8	1881015	1881022	75 %	25 %	0 %	0 %	403515803
41526	NC_018528	GTA	2	6	1881059	1881064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515803
41527	NC_018528	AAAT	2	8	1881070	1881077	75 %	25 %	0 %	0 %	403515803
41528	NC_018528	TCT	2	6	1881140	1881145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515803
41529	NC_018528	CCACT	2	10	1881153	1881162	20 %	20 %	0 %	60 %	403515803
41530	NC_018528	CAA	2	6	1881166	1881171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515803
41531	NC_018528	AAT	2	6	1881184	1881189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515803
41532	NC_018528	AATT	2	8	1881300	1881307	50 %	50 %	0 %	0 %	403515803
41533	NC_018528	ACG	2	6	1881449	1881454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515803
41534	NC_018528	ATA	2	6	1881476	1881481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515803
41535	NC_018528	GAT	2	6	1881504	1881509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515803
41536	NC_018528	T	6	6	1881533	1881538	0 %	100 %	0 %	0 %	403515803
41537	NC_018528	AAAT	2	8	1881542	1881549	75 %	25 %	0 %	0 %	403515803
41538	NC_018528	TGAT	2	8	1881600	1881607	25 %	50 %	25 %	0 %	403515803
41539	NC_018528	T	6	6	1881694	1881699	0 %	100 %	0 %	0 %	403515803
41540	NC_018528	CCG	2	6	1881758	1881763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515804
41541	NC_018528	TTG	2	6	1881835	1881840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515804
41542	NC_018528	CTG	2	6	1881864	1881869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515804
41543	NC_018528	AAG	2	6	1881895	1881900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515804
41544	NC_018528	AATTG	2	10	1881929	1881938	40 %	40 %	20 %	0 %	403515804
41545	NC_018528	TAA	2	6	1881978	1881983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515804
41546	NC_018528	TCA	2	6	1882013	1882018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515804
41547	NC_018528	ACG	2	6	1882039	1882044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515804
41548	NC_018528	AAG	2	6	1882045	1882050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515804
41549	NC_018528	GTC	2	6	1882102	1882107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515804
41550	NC_018528	AAT	3	9	1882162	1882170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515804
41551	NC_018528	CTT	2	6	1882194	1882199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515804
41552	NC_018528	CAT	2	6	1882228	1882233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515804
41553	NC_018528	ATC	2	6	1882244	1882249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515804
41554	NC_018528	CTT	2	6	1882287	1882292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515804
41555	NC_018528	AGAT	2	8	1882334	1882341	50 %	25 %	25 %	0 %	403515804
41556	NC_018528	TAA	2	6	1882345	1882350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515804
41557	NC_018528	TCA	3	9	1882367	1882375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515804
41558	NC_018528	CT	3	6	1882404	1882409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41559	NC_018528	TAT	2	6	1882448	1882453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41560	NC_018528	T	6	6	1882519	1882524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41561	NC_018528	A	6	6	1882535	1882540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41562	NC_018528	TTTC	2	8	1882576	1882583	0 %	75 %	0 %	25 %	403515805
41563	NC_018528	GTA	2	6	1882601	1882606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515805
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41567	NC_018528	ATC	2	6	1882833	1882838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515805
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41570	NC_018528	ATCA	2	8	1882895	1882902	50 %	25 %	0 %	25 %	403515805
41571	NC_018528	TCA	2	6	1882938	1882943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515805
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41573	NC_018528	CAT	3	9	1882972	1882980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515805
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41578	NC_018528	ATTG	2	8	1883222	1883229	25 %	50 %	25 %	0 %	403515805
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41588	NC_018528	CTT	2	6	1883792	1883797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515805
41589	NC_018528	AGT	2	6	1883812	1883817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515805
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41592	NC_018528	AATA	2	8	1884135	1884142	75 %	25 %	0 %	0 %	403515805
41593	NC_018528	A	6	6	1884150	1884155	100 %	0 %	0 %	0 %	403515805
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41596	NC_018528	GTTT	2	8	1884396	1884403	0 %	75 %	25 %	0 %	403515805
41597	NC_018528	T	6	6	1884401	1884406	0 %	100 %	0 %	0 %	403515805
41598	NC_018528	TTC	2	6	1884449	1884454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41599	NC_018528	TTC	2	6	1884500	1884505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41600	NC_018528	GAT	2	6	1884545	1884550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41601	NC_018528	ATG	2	6	1884588	1884593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41602	NC_018528	AAG	2	6	1884625	1884630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41603	NC_018528	ATC	2	6	1884674	1884679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41604	NC_018528	ACC	2	6	1884740	1884745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41605	NC_018528	GTT	2	6	1884752	1884757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41606	NC_018528	ACC	2	6	1884758	1884763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41607	NC_018528	AGCTAC	2	12	1884830	1884841	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41608	NC_018528	TCA	2	6	1884849	1884854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41609	NC_018528	GTT	2	6	1884911	1884916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41610	NC_018528	CAT	2	6	1885006	1885011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41611	NC_018528	AGA	2	6	1885046	1885051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41612	NC_018528	CTGAT	2	10	1885084	1885093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41613	NC_018528	AAT	2	6	1885163	1885168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41614	NC_018528	CTT	2	6	1885196	1885201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41615	NC_018528	GCA	2	6	1885236	1885241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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