MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018528	TG	3	6	160843	160848	0 %	50 %	50 %	0 %	403514194
3502	NC_018528	AGA	2	6	160862	160867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514194
3503	NC_018528	TAC	2	6	160983	160988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514194
3504	NC_018528	ATG	2	6	161005	161010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514194
3505	NC_018528	TGG	2	6	161075	161080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514194
3506	NC_018528	ACT	2	6	161089	161094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514194
3507	NC_018528	ATC	2	6	161364	161369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514194
3508	NC_018528	GAA	3	9	161418	161426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514194
3509	NC_018528	GAA	2	6	161429	161434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514194
3510	NC_018528	TGTT	2	8	161537	161544	0 %	75 %	25 %	0 %	403514195
3511	NC_018528	A	7	7	161579	161585	100 %	0 %	0 %	0 %	403514195
3512	NC_018528	ATT	2	6	161645	161650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514195
3513	NC_018528	TTG	2	6	161687	161692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514195
3514	NC_018528	GCT	2	6	161750	161755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514195
3515	NC_018528	AGC	2	6	161763	161768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514195
3516	NC_018528	AGA	2	6	161808	161813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514195
3517	NC_018528	ATT	2	6	161818	161823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514195
3518	NC_018528	AAG	2	6	161938	161943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514195
3519	NC_018528	A	6	6	162001	162006	100 %	0 %	0 %	0 %	403514195
3520	NC_018528	ATGA	2	8	162049	162056	50 %	25 %	25 %	0 %	403514195
3521	NC_018528	ATT	2	6	162103	162108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514195
3522	NC_018528	AGGC	2	8	162128	162135	25 %	0 %	50 %	25 %	403514195
3523	NC_018528	GTA	2	6	162139	162144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514195
3524	NC_018528	T	6	6	162200	162205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_018528	TAGG	2	8	162208	162215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_018528	GA	3	6	162222	162227	50 %	0 %	50 %	0 %	403514196
3527	NC_018528	TGAT	2	8	162275	162282	25 %	50 %	25 %	0 %	403514196
3528	NC_018528	TATTGA	2	12	162327	162338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403514196
3529	NC_018528	AGA	2	6	162339	162344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514196
3530	NC_018528	ATT	2	6	162395	162400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514196
3531	NC_018528	AATG	2	8	162445	162452	50 %	25 %	25 %	0 %	403514196
3532	NC_018528	TGC	2	6	162504	162509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514196
3533	NC_018528	AGC	2	6	162515	162520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514196
3534	NC_018528	GAA	2	6	162532	162537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514196
3535	NC_018528	GATAA	2	10	162562	162571	60 %	20 %	20 %	0 %	403514196
3536	NC_018528	AAG	2	6	162592	162597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514196
3537	NC_018528	GCTT	2	8	162668	162675	0 %	50 %	25 %	25 %	403514196
3538	NC_018528	A	6	6	162744	162749	100 %	0 %	0 %	0 %	403514196
3539	NC_018528	GAA	2	6	162757	162762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514196
3540	NC_018528	A	7	7	162791	162797	100 %	0 %	0 %	0 %	403514197
3541	NC_018528	GGC	2	6	162839	162844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514197
3542	NC_018528	GAA	2	6	162875	162880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514197
3543	NC_018528	CGG	2	6	162909	162914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514197
3544	NC_018528	GAA	2	6	163013	163018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514197
3545	NC_018528	ATG	2	6	163095	163100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514197
3546	NC_018528	GAA	2	6	163147	163152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514197
3547	NC_018528	CCG	2	6	163253	163258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403514197
3548	NC_018528	GAT	3	9	163277	163285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514197
3549	NC_018528	A	6	6	163364	163369	100 %	0 %	0 %	0 %	403514197
3550	NC_018528	GAA	2	6	163403	163408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514197
3551	NC_018528	AAG	2	6	163446	163451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514197
3552	NC_018528	T	6	6	163574	163579	0 %	100 %	0 %	0 %	403514197
3553	NC_018528	AAGG	2	8	163589	163596	50 %	0 %	50 %	0 %	403514197
3554	NC_018528	TGA	2	6	163660	163665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514197
3555	NC_018528	GGT	2	6	163691	163696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514197
3556	NC_018528	TCT	2	6	163740	163745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514197
3557	NC_018528	GCCG	2	8	163764	163771	0 %	0 %	50 %	50 %	403514197
3558	NC_018528	TTGA	2	8	163772	163779	25 %	50 %	25 %	0 %	403514197
3559	NC_018528	ATTTC	2	10	163825	163834	20 %	60 %	0 %	20 %	403514197
3560	NC_018528	ATG	2	6	163844	163849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514197
3561	NC_018528	AAG	2	6	163890	163895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514197
3562	NC_018528	ATCA	2	8	163979	163986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_018528	T	6	6	164019	164024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_018528	TAA	2	6	164045	164050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_018528	AGG	2	6	164058	164063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_018528	TGA	2	6	164104	164109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514198
3567	NC_018528	TTGGA	2	10	164149	164158	20 %	40 %	40 %	0 %	403514198
3568	NC_018528	TTTA	2	8	164187	164194	25 %	75 %	0 %	0 %	403514198
3569	NC_018528	AGC	2	6	164199	164204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514198
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3572	NC_018528	TTAA	2	8	164438	164445	50 %	50 %	0 %	0 %	403514198
3573	NC_018528	TCA	2	6	164613	164618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514198
3574	NC_018528	GTT	2	6	164623	164628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514198
3575	NC_018528	GA	3	6	164660	164665	50 %	0 %	50 %	0 %	403514198
3576	NC_018528	TTC	2	6	164741	164746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514198
3577	NC_018528	ATC	2	6	164933	164938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514198
3578	NC_018528	CATTA	2	10	164968	164977	40 %	40 %	0 %	20 %	403514198
3579	NC_018528	TGG	2	6	165160	165165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514198
3580	NC_018528	TCT	2	6	165198	165203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514198
3581	NC_018528	TGA	2	6	165228	165233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514198
3582	NC_018528	ATG	2	6	165239	165244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514198
3583	NC_018528	ATTT	2	8	165251	165258	25 %	75 %	0 %	0 %	403514198
3584	NC_018528	A	7	7	165291	165297	100 %	0 %	0 %	0 %	403514198
3585	NC_018528	ATA	2	6	165350	165355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_018528	CGG	2	6	165394	165399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514199
3588	NC_018528	TAG	2	6	165514	165519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514199
3589	NC_018528	A	6	6	165587	165592	100 %	0 %	0 %	0 %	403514199
3590	NC_018528	AGA	2	6	165659	165664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
3591	NC_018528	ACTTT	2	10	165732	165741	20 %	60 %	0 %	20 %	403514199
3592	NC_018528	CTT	2	6	165754	165759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514199
3593	NC_018528	GAA	2	6	165808	165813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
3594	NC_018528	ATTC	2	8	165821	165828	25 %	50 %	0 %	25 %	403514199
3595	NC_018528	TGG	2	6	165838	165843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514199
3596	NC_018528	TAC	3	9	165865	165873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514199
3597	NC_018528	GCT	2	6	165887	165892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514199
3598	NC_018528	CAAT	2	8	165920	165927	50 %	25 %	0 %	25 %	403514199
3599	NC_018528	CTGAAG	2	12	165960	165971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514199
3600	NC_018528	ATG	2	6	165996	166001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514199
3601	NC_018528	GAA	2	6	166031	166036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
3602	NC_018528	TGA	2	6	166075	166080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514199
3603	NC_018528	CTT	2	6	166117	166122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514199
3604	NC_018528	AAG	2	6	166139	166144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
3605	NC_018528	TAAT	2	8	166155	166162	50 %	50 %	0 %	0 %	403514199
3606	NC_018528	GAA	2	6	166190	166195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
3607	NC_018528	TGAA	2	8	166200	166207	50 %	25 %	25 %	0 %	403514199
3608	NC_018528	AAGC	2	8	166349	166356	50 %	0 %	25 %	25 %	403514199
3609	NC_018528	AGT	2	6	166387	166392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514199
3610	NC_018528	TGAC	2	8	166443	166450	25 %	25 %	25 %	25 %	403514199
3611	NC_018528	GAA	2	6	166583	166588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
3612	NC_018528	GCT	2	6	166775	166780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514199
3613	NC_018528	GGT	2	6	166832	166837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514199
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3615	NC_018528	TGA	2	6	166897	166902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514199
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3617	NC_018528	TGG	2	6	166922	166927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514199
3618	NC_018528	AAG	2	6	166952	166957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
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3621	NC_018528	ATT	2	6	167110	167115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514199
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3623	NC_018528	AAG	2	6	167232	167237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514199
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3743	NC_018528	A	6	6	172690	172695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_018528	AGA	2	6	172703	172708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3745	NC_018528	ACA	2	6	172799	172804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3746	NC_018528	TCAAA	2	10	172807	172816	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3999	NC_018528	ACT	2	6	183854	183859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514215
4000	NC_018528	GTG	2	6	183938	183943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514215

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