MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_018528	TTA	2	6	1449459	1449464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32003	NC_018528	TAATT	2	10	1449502	1449511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32004	NC_018528	AAAT	2	8	1449515	1449522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32005	NC_018528	AGG	2	6	1449525	1449530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32006	NC_018528	TTA	2	6	1449604	1449609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515400
32007	NC_018528	ATT	2	6	1449619	1449624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515400
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32009	NC_018528	ATT	2	6	1449664	1449669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515400
32010	NC_018528	ACA	2	6	1449698	1449703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515400
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32012	NC_018528	TTA	2	6	1449743	1449748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515400
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32015	NC_018528	GGT	2	6	1449913	1449918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515400
32016	NC_018528	CAA	2	6	1449928	1449933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515400
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32021	NC_018528	AAG	2	6	1450111	1450116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515400
32022	NC_018528	ATTA	2	8	1450122	1450129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32029	NC_018528	A	6	6	1450517	1450522	100 %	0 %	0 %	0 %	403515401
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32055	NC_018528	GAA	2	6	1451846	1451851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515402
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32089	NC_018528	TAT	2	6	1453070	1453075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32091	NC_018528	CAT	2	6	1453093	1453098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32105	NC_018528	CT	3	6	1453795	1453800	0 %	50 %	0 %	50 %	403515405
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32117	NC_018528	ATC	2	6	1454454	1454459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515405
32118	NC_018528	ATT	2	6	1454527	1454532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515405
32119	NC_018528	T	6	6	1454531	1454536	0 %	100 %	0 %	0 %	403515405
32120	NC_018528	ACCTGA	2	12	1454646	1454657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403515405
32121	NC_018528	ACTA	2	8	1454664	1454671	50 %	25 %	0 %	25 %	403515405
32122	NC_018528	TTC	2	6	1454707	1454712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515405
32123	NC_018528	GTT	2	6	1454715	1454720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515405
32124	NC_018528	TCT	2	6	1454744	1454749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515405
32125	NC_018528	ACG	2	6	1454763	1454768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515405
32126	NC_018528	GGAACA	2	12	1454776	1454787	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403515405
32127	NC_018528	T	6	6	1454790	1454795	0 %	100 %	0 %	0 %	403515405
32128	NC_018528	CTT	2	6	1454840	1454845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515405
32129	NC_018528	TTACC	2	10	1454864	1454873	20 %	40 %	0 %	40 %	403515405
32130	NC_018528	ATCA	2	8	1454901	1454908	50 %	25 %	0 %	25 %	403515405
32131	NC_018528	TGA	2	6	1455016	1455021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515405
32132	NC_018528	ACAT	2	8	1455046	1455053	50 %	25 %	0 %	25 %	403515405
32133	NC_018528	CCA	2	6	1455109	1455114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515405
32134	NC_018528	TAATC	2	10	1455148	1455157	40 %	40 %	0 %	20 %	403515405
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32136	NC_018528	TTCA	2	8	1455330	1455337	25 %	50 %	0 %	25 %	403515405
32137	NC_018528	GAA	2	6	1455527	1455532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515405
32138	NC_018528	TC	3	6	1455536	1455541	0 %	50 %	0 %	50 %	403515405
32139	NC_018528	TTA	2	6	1455559	1455564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515405
32140	NC_018528	TGC	2	6	1455591	1455596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515405
32141	NC_018528	TAA	2	6	1455622	1455627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515405
32142	NC_018528	TCA	2	6	1455697	1455702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515405
32143	NC_018528	TCG	2	6	1455841	1455846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515405
32144	NC_018528	CAAA	2	8	1455905	1455912	75 %	0 %	0 %	25 %	403515405
32145	NC_018528	TAAAT	2	10	1455984	1455993	60 %	40 %	0 %	0 %	403515405
32146	NC_018528	CAC	2	6	1456079	1456084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515405
32147	NC_018528	TAA	2	6	1456107	1456112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515405
32148	NC_018528	TTCT	2	8	1456124	1456131	0 %	75 %	0 %	25 %	403515405
32149	NC_018528	ATG	2	6	1456141	1456146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515405
32150	NC_018528	CAT	2	6	1456190	1456195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515405
32151	NC_018528	T	6	6	1456295	1456300	0 %	100 %	0 %	0 %	403515405
32152	NC_018528	ACT	3	9	1456474	1456482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515405
32153	NC_018528	ATTT	2	8	1456484	1456491	25 %	75 %	0 %	0 %	403515405
32154	NC_018528	CAC	2	6	1456535	1456540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515405
32155	NC_018528	T	6	6	1456580	1456585	0 %	100 %	0 %	0 %	403515406
32156	NC_018528	ATA	2	6	1456619	1456624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515406
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32160	NC_018528	ATC	2	6	1456700	1456705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515406
32161	NC_018528	TCT	2	6	1456707	1456712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515406
32162	NC_018528	CTTATC	2	12	1456765	1456776	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403515406
32163	NC_018528	TGA	2	6	1456821	1456826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515406
32164	NC_018528	CTT	2	6	1456863	1456868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515406
32165	NC_018528	CTT	2	6	1457013	1457018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515406
32166	NC_018528	GCA	2	6	1457073	1457078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515406
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32170	NC_018528	TTA	2	6	1457270	1457275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515406
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32173	NC_018528	TGA	2	6	1457426	1457431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515406
32174	NC_018528	GCGG	2	8	1457460	1457467	0 %	0 %	75 %	25 %	403515406
32175	NC_018528	AATC	2	8	1457499	1457506	50 %	25 %	0 %	25 %	403515406
32176	NC_018528	TCA	2	6	1457573	1457578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515406
32177	NC_018528	ATC	2	6	1457593	1457598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515406
32178	NC_018528	GAA	2	6	1457602	1457607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515406
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32181	NC_018528	TCA	2	6	1457697	1457702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515406
32182	NC_018528	CATAT	2	10	1457707	1457716	40 %	40 %	0 %	20 %	403515406
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32184	NC_018528	GTT	2	6	1457724	1457729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515406
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32186	NC_018528	ACG	2	6	1457815	1457820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515406
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32189	NC_018528	ACA	2	6	1457990	1457995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515406
32190	NC_018528	TAA	2	6	1458070	1458075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515406
32191	NC_018528	ATC	2	6	1458107	1458112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515406
32192	NC_018528	CAA	3	9	1458171	1458179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515406
32193	NC_018528	GTGGC	2	10	1458212	1458221	0 %	20 %	60 %	20 %	403515406
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32195	NC_018528	TGGT	2	8	1458295	1458302	0 %	50 %	50 %	0 %	403515406
32196	NC_018528	GTA	2	6	1458310	1458315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515406
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32199	NC_018528	T	6	6	1458499	1458504	0 %	100 %	0 %	0 %	403515406
32200	NC_018528	GCCG	2	8	1458508	1458515	0 %	0 %	50 %	50 %	403515406
32201	NC_018528	CTG	2	6	1458546	1458551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515406
32202	NC_018528	TCC	2	6	1458608	1458613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32203	NC_018528	A	6	6	1458619	1458624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32204	NC_018528	TAC	2	6	1458667	1458672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32205	NC_018528	AAG	2	6	1458712	1458717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515407
32206	NC_018528	GCT	2	6	1458728	1458733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515407
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32209	NC_018528	TCA	2	6	1458842	1458847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515407
32210	NC_018528	GTG	2	6	1458891	1458896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515407
32211	NC_018528	TTTC	2	8	1458918	1458925	0 %	75 %	0 %	25 %	403515407
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32217	NC_018528	TCT	2	6	1459322	1459327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515407
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32219	NC_018528	CAAG	2	8	1459413	1459420	50 %	0 %	25 %	25 %	403515407
32220	NC_018528	AAT	2	6	1459525	1459530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515407
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32222	NC_018528	AAT	2	6	1459726	1459731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515407
32223	NC_018528	TCA	2	6	1459805	1459810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515407
32224	NC_018528	ATC	2	6	1460068	1460073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515407
32225	NC_018528	AAAT	2	8	1460074	1460081	75 %	25 %	0 %	0 %	403515407
32226	NC_018528	CTT	2	6	1460184	1460189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515407
32227	NC_018528	TCA	2	6	1460198	1460203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515407
32228	NC_018528	GATT	2	8	1460247	1460254	25 %	50 %	25 %	0 %	403515407
32229	NC_018528	AAT	2	6	1460373	1460378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515407
32230	NC_018528	ATT	2	6	1460386	1460391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515407
32231	NC_018528	ATTC	2	8	1460441	1460448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32232	NC_018528	AAT	2	6	1460449	1460454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32233	NC_018528	TTCTAT	2	12	1460480	1460491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32234	NC_018528	TAA	2	6	1460496	1460501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32235	NC_018528	TTAA	2	8	1460520	1460527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32353	NC_018528	CAT	2	6	1466757	1466762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515411
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32453	NC_018528	TTA	2	6	1471737	1471742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32455	NC_018528	A	7	7	1471828	1471834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32465	NC_018528	A	6	6	1472619	1472624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32466	NC_018528	ATG	2	6	1472627	1472632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32467	NC_018528	AGT	2	6	1472694	1472699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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