MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 57307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017949	TTA	2	6	220766	220771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853432
5003	NC_017949	GAA	2	6	220807	220812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853432
5004	NC_017949	TTG	2	6	220856	220861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853432
5005	NC_017949	ATT	2	6	220891	220896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853432
5006	NC_017949	TTA	2	6	220916	220921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853432
5007	NC_017949	CAA	2	6	220933	220938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853432
5008	NC_017949	ATG	2	6	220948	220953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853432
5009	NC_017949	AAC	2	6	220986	220991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853432
5010	NC_017949	TGA	2	6	221049	221054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853432
5011	NC_017949	TGC	2	6	221118	221123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853432
5012	NC_017949	TTG	2	6	221147	221152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853432
5013	NC_017949	TCT	2	6	221170	221175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853432
5014	NC_017949	GCT	2	6	221206	221211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853432
5015	NC_017949	TTTG	2	8	221349	221356	0 %	75 %	25 %	0 %	389853432
5016	NC_017949	ATG	2	6	221456	221461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853432
5017	NC_017949	TGG	2	6	221505	221510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853432
5018	NC_017949	TGC	2	6	221544	221549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853432
5019	NC_017949	TGG	2	6	221550	221555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853432
5020	NC_017949	TGA	2	6	221592	221597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853432
5021	NC_017949	A	6	6	221674	221679	100 %	0 %	0 %	0 %	389853432
5022	NC_017949	TGG	2	6	221799	221804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853432
5023	NC_017949	GGGAT	2	10	221815	221824	20 %	20 %	60 %	0 %	389853432
5024	NC_017949	ATG	2	6	221912	221917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853432
5025	NC_017949	AAG	2	6	221930	221935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853432
5026	NC_017949	T	6	6	222036	222041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017949	TAT	2	6	222100	222105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017949	A	6	6	222110	222115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017949	TGA	2	6	222128	222133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853433
5030	NC_017949	TGAAAA	2	12	222159	222170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	389853433
5031	NC_017949	GAA	2	6	222261	222266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853433
5032	NC_017949	A	9	9	222265	222273	100 %	0 %	0 %	0 %	389853433
5033	NC_017949	GAAG	2	8	222313	222320	50 %	0 %	50 %	0 %	389853433
5034	NC_017949	GTT	2	6	222359	222364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853433
5035	NC_017949	T	6	6	222417	222422	0 %	100 %	0 %	0 %	389853433
5036	NC_017949	TGG	2	6	222525	222530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853433
5037	NC_017949	TTA	2	6	222538	222543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853433
5038	NC_017949	CAAA	2	8	222551	222558	75 %	0 %	0 %	25 %	389853433
5039	NC_017949	GA	3	6	222609	222614	50 %	0 %	50 %	0 %	389853433
5040	NC_017949	TCA	2	6	222653	222658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853433
5041	NC_017949	GAT	2	6	222676	222681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853433
5042	NC_017949	TCG	2	6	222714	222719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853433
5043	NC_017949	TGGT	2	8	222737	222744	0 %	50 %	50 %	0 %	389853433
5044	NC_017949	ATT	2	6	222781	222786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853433
5045	NC_017949	TGA	2	6	222867	222872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853433
5046	NC_017949	ATTG	2	8	222882	222889	25 %	50 %	25 %	0 %	389853433
5047	NC_017949	AC	3	6	222890	222895	50 %	0 %	0 %	50 %	389853433
5048	NC_017949	ATT	2	6	222901	222906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853433
5049	NC_017949	AGA	2	6	222939	222944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853433
5050	NC_017949	CAC	2	6	222959	222964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389853433
5051	NC_017949	TGG	2	6	223020	223025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853433
5052	NC_017949	GTG	2	6	223049	223054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853433
5053	NC_017949	TGGT	2	8	223169	223176	0 %	50 %	50 %	0 %	389853433
5054	NC_017949	TCG	2	6	223188	223193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853433
5055	NC_017949	TTGG	2	8	223238	223245	0 %	50 %	50 %	0 %	389853433
5056	NC_017949	TTTG	2	8	223337	223344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017949	AAT	2	6	223368	223373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017949	A	6	6	223379	223384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017949	ATT	3	9	223493	223501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853434
5060	NC_017949	GAT	2	6	223505	223510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853434
5061	NC_017949	TAT	3	9	223544	223552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853434
5062	NC_017949	TGG	2	6	223558	223563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853434
5063	NC_017949	CAG	2	6	223584	223589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853434
5064	NC_017949	AAG	2	6	223590	223595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853434
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5066	NC_017949	T	7	7	223669	223675	0 %	100 %	0 %	0 %	389853434
5067	NC_017949	ATG	2	6	223701	223706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853434
5068	NC_017949	TGA	2	6	223737	223742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853434
5069	NC_017949	CTT	2	6	223858	223863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853434
5070	NC_017949	AATA	2	8	223923	223930	75 %	25 %	0 %	0 %	389853434
5071	NC_017949	AGTTT	2	10	223940	223949	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017949	AGA	2	6	224021	224026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853435
5073	NC_017949	AAGA	2	8	224032	224039	75 %	0 %	25 %	0 %	389853435
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5078	NC_017949	GAA	2	6	224388	224393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853435
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5080	NC_017949	A	6	6	224560	224565	100 %	0 %	0 %	0 %	389853435
5081	NC_017949	CAA	2	6	224725	224730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853435
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5087	NC_017949	GATT	2	8	225211	225218	25 %	50 %	25 %	0 %	389853435
5088	NC_017949	AAT	2	6	225269	225274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017949	TTA	2	6	225308	225313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017949	TCAAAA	2	12	225319	225330	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5091	NC_017949	TTG	2	6	225403	225408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853436
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5093	NC_017949	TGTT	2	8	225419	225426	0 %	75 %	25 %	0 %	389853436
5094	NC_017949	CCG	2	6	225534	225539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389853436
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5098	NC_017949	GTT	3	9	225594	225602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853436
5099	NC_017949	CTG	3	9	225637	225645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853436
5100	NC_017949	TCA	2	6	225737	225742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017949	TGA	2	6	225759	225764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017949	A	6	6	225852	225857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017949	ATAA	2	8	225871	225878	75 %	25 %	0 %	0 %	389853437
5104	NC_017949	AGA	2	6	226075	226080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853437
5105	NC_017949	A	6	6	226174	226179	100 %	0 %	0 %	0 %	389853437
5106	NC_017949	AAAT	2	8	226187	226194	75 %	25 %	0 %	0 %	389853437
5107	NC_017949	A	6	6	226198	226203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017949	A	6	6	226205	226210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017949	A	6	6	226229	226234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017949	A	6	6	226247	226252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017949	AGA	2	6	226317	226322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853438
5112	NC_017949	ACG	2	6	226329	226334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853438
5113	NC_017949	T	6	6	226346	226351	0 %	100 %	0 %	0 %	389853438
5114	NC_017949	GTC	2	6	226523	226528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853438
5115	NC_017949	GAA	2	6	226579	226584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853438
5116	NC_017949	TAT	2	6	226608	226613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853438
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5118	NC_017949	CTT	2	6	226718	226723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853438
5119	NC_017949	ATG	2	6	226750	226755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853438
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5121	NC_017949	AGA	2	6	226894	226899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853439
5122	NC_017949	AGC	2	6	226966	226971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853439
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