MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 67850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	T	6	6	158	163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017546	TACAT	2	10	228	237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017546	G	7	7	243	249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017546	CAAT	2	8	258	265	50 %	25 %	0 %	25 %	386048931
5	NC_017546	A	8	8	300	307	100 %	0 %	0 %	0 %	386048931
6	NC_017546	CAA	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048931
7	NC_017546	TAT	2	6	377	382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048931
8	NC_017546	AAT	2	6	393	398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048931
9	NC_017546	GAA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048931
10	NC_017546	GCA	2	6	642	647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048931
11	NC_017546	GGA	2	6	702	707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048931
12	NC_017546	CAA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048931
13	NC_017546	TTA	2	6	817	822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048931
14	NC_017546	ATA	2	6	835	840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048931
15	NC_017546	GAA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048931
16	NC_017546	CTTA	2	8	881	888	25 %	50 %	0 %	25 %	386048931
17	NC_017546	TGA	2	6	890	895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048931
18	NC_017546	AAG	2	6	916	921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048931
19	NC_017546	AC	3	6	952	957	50 %	0 %	0 %	50 %	386048931
20	NC_017546	ATG	2	6	961	966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048931
21	NC_017546	ATT	3	9	978	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048931
22	NC_017546	GACC	2	8	993	1000	25 %	0 %	25 %	50 %	386048931
23	NC_017546	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386048931
24	NC_017546	A	6	6	1110	1115	100 %	0 %	0 %	0 %	386048931
25	NC_017546	AGT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048931
26	NC_017546	TTC	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048931
27	NC_017546	TAA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048931
28	NC_017546	GCA	2	6	1263	1268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048931
29	NC_017546	TTA	2	6	1309	1314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048931
30	NC_017546	AAG	2	6	1330	1335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048931
31	NC_017546	CGTT	2	8	1355	1362	0 %	50 %	25 %	25 %	386048931
32	NC_017546	AGA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048931
33	NC_017546	A	7	7	1379	1385	100 %	0 %	0 %	0 %	386048931
34	NC_017546	TC	3	6	1427	1432	0 %	50 %	0 %	50 %	386048931
35	NC_017546	AG	3	6	1434	1439	50 %	0 %	50 %	0 %	386048931
36	NC_017546	TGA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048931
37	NC_017546	TGG	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048931
38	NC_017546	ACA	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048931
39	NC_017546	A	6	6	1516	1521	100 %	0 %	0 %	0 %	386048931
40	NC_017546	ACT	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048931
41	NC_017546	A	6	6	1576	1581	100 %	0 %	0 %	0 %	386048931
42	NC_017546	GCA	2	6	1680	1685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017546	CTATTA	2	12	1722	1733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017546	T	6	6	1740	1745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017546	ATTA	3	12	1746	1757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017546	A	7	7	1784	1790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017546	AAC	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048932
48	NC_017546	ATG	2	6	1915	1920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048932
49	NC_017546	ATG	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048932
50	NC_017546	AG	3	6	2009	2014	50 %	0 %	50 %	0 %	386048932
51	NC_017546	TGG	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048932
52	NC_017546	TCAA	2	8	2033	2040	50 %	25 %	0 %	25 %	386048932
53	NC_017546	CGT	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048932
54	NC_017546	AGA	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048932
55	NC_017546	ACCAA	2	10	2107	2116	60 %	0 %	0 %	40 %	386048932
56	NC_017546	CCT	2	6	2134	2139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386048932
57	NC_017546	A	6	6	2228	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	386048932
58	NC_017546	TACT	2	8	2284	2291	25 %	50 %	0 %	25 %	386048932
59	NC_017546	TGA	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048932
60	NC_017546	TAAA	2	8	2434	2441	75 %	25 %	0 %	0 %	386048932
61	NC_017546	CAA	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048932
62	NC_017546	TTAAA	2	10	2500	2509	60 %	40 %	0 %	0 %	386048932
63	NC_017546	TAT	2	6	2515	2520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048932
64	NC_017546	TAA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048932
65	NC_017546	TTA	2	6	2668	2673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048932
66	NC_017546	TCC	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386048932
67	NC_017546	GAA	2	6	2772	2777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048932
68	NC_017546	ATG	2	6	2805	2810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048932
69	NC_017546	TGA	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048932
70	NC_017546	A	6	6	2955	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017546	T	7	7	2991	2997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017546	ATG	2	6	3057	3062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048933
73	NC_017546	ACA	2	6	3072	3077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048933
74	NC_017546	T	7	7	3097	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	386048933
75	NC_017546	GAT	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048933
76	NC_017546	TTG	2	6	3169	3174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048933
77	NC_017546	GCT	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048933
78	NC_017546	T	7	7	3230	3236	0 %	100 %	0 %	0 %	386048933
79	NC_017546	ATT	2	6	3249	3254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048933
80	NC_017546	GGT	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048933
81	NC_017546	T	6	6	3355	3360	0 %	100 %	0 %	0 %	386048933
82	NC_017546	ATT	2	6	3366	3371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048933
83	NC_017546	CTT	2	6	3405	3410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048933
84	NC_017546	GAT	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048933
85	NC_017546	CTA	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048933
86	NC_017546	ACC	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386048933
87	NC_017546	T	7	7	3553	3559	0 %	100 %	0 %	0 %	386048933
88	NC_017546	T	6	6	3593	3598	0 %	100 %	0 %	0 %	386048933
89	NC_017546	TGT	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048933
90	NC_017546	GCT	2	6	3633	3638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048933
91	NC_017546	TAA	2	6	3835	3840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048933
92	NC_017546	CGG	2	6	3874	3879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048933
93	NC_017546	AGC	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048933
94	NC_017546	TCC	2	6	3933	3938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386048933
95	NC_017546	TTA	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048933
96	NC_017546	TTA	2	6	4105	4110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048933
97	NC_017546	TTTAT	2	10	4142	4151	20 %	80 %	0 %	0 %	386048933
98	NC_017546	TGT	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048933
99	NC_017546	TTTGT	2	10	4263	4272	0 %	80 %	20 %	0 %	386048933
100	NC_017546	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048933
101	NC_017546	A	7	7	4372	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	386048933
102	NC_017546	CGA	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048933
103	NC_017546	A	7	7	4411	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017546	T	7	7	4440	4446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017546	AATA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017546	C	6	6	4460	4465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_017546	A	7	7	4478	4484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017546	AT	3	6	4497	4502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017546	TAT	2	6	4517	4522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048934
110	NC_017546	A	7	7	4556	4562	100 %	0 %	0 %	0 %	386048934
111	NC_017546	TGAT	2	8	4638	4645	25 %	50 %	25 %	0 %	386048934
112	NC_017546	TGG	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048934
113	NC_017546	AACC	2	8	4912	4919	50 %	0 %	0 %	50 %	386048935
114	NC_017546	TGCT	2	8	4938	4945	0 %	50 %	25 %	25 %	386048935
115	NC_017546	TAT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048935
116	NC_017546	AGA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048935
117	NC_017546	ATTT	2	8	5237	5244	25 %	75 %	0 %	0 %	386048935
118	NC_017546	CAA	2	6	5276	5281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048935
119	NC_017546	TTCA	2	8	5399	5406	25 %	50 %	0 %	25 %	386048935
120	NC_017546	GCG	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048935
121	NC_017546	TCA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048935
122	NC_017546	A	6	6	5538	5543	100 %	0 %	0 %	0 %	386048935
123	NC_017546	AATC	2	8	5547	5554	50 %	25 %	0 %	25 %	386048935
124	NC_017546	GTG	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048935
125	NC_017546	GAT	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048935
126	NC_017546	GAA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048935
127	NC_017546	CTT	2	6	5738	5743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048935
128	NC_017546	GAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048935
129	NC_017546	CGA	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048935
130	NC_017546	ACA	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048935
131	NC_017546	CAA	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048935
132	NC_017546	A	7	7	5905	5911	100 %	0 %	0 %	0 %	386048935
133	NC_017546	TGA	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017546	AAAG	2	8	5942	5949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017546	AAT	2	6	5958	5963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017546	AGA	2	6	5971	5976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048936
137	NC_017546	TTG	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048936
138	NC_017546	TGA	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048936
139	NC_017546	GAAATT	2	12	6167	6178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386048936
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252	NC_017546	ACT	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048938
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