MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 68579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017545	ATT	2	6	694609	694614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386046293
16003	NC_017545	CAA	2	6	694629	694634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386046293
16004	NC_017545	T	6	6	694690	694695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_017545	AAG	2	6	694755	694760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_017545	TTTA	2	8	694812	694819	25 %	75 %	0 %	0 %	386046294
16007	NC_017545	TGG	2	6	694954	694959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386046294
16008	NC_017545	AGT	2	6	694982	694987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386046294
16009	NC_017545	GAAGG	2	10	695018	695027	40 %	0 %	60 %	0 %	386046294
16010	NC_017545	AGCC	2	8	695066	695073	25 %	0 %	25 %	50 %	386046294
16011	NC_017545	TGA	2	6	695094	695099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386046294
16012	NC_017545	CAA	2	6	695111	695116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386046294
16013	NC_017545	ATT	2	6	695124	695129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386046294
16014	NC_017545	CAAA	2	8	695134	695141	75 %	0 %	0 %	25 %	386046294
16015	NC_017545	GTAG	2	8	695144	695151	25 %	25 %	50 %	0 %	386046294
16016	NC_017545	CAT	3	9	695205	695213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386046295
16017	NC_017545	ATC	2	6	695215	695220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386046295
16018	NC_017545	ATT	2	6	695251	695256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386046295
16019	NC_017545	T	6	6	695297	695302	0 %	100 %	0 %	0 %	386046295
16020	NC_017545	ATA	2	6	695392	695397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386046295
16021	NC_017545	TTAGAT	2	12	695409	695420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386046295
16022	NC_017545	AATT	2	8	695434	695441	50 %	50 %	0 %	0 %	386046295
16023	NC_017545	GAAG	2	8	695453	695460	50 %	0 %	50 %	0 %	386046295
16024	NC_017545	GAT	2	6	695499	695504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386046295
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16026	NC_017545	TCGC	2	8	695568	695575	0 %	25 %	25 %	50 %	386046295
16027	NC_017545	GGC	2	6	695613	695618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386046295
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16029	NC_017545	GTG	2	6	695733	695738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386046295
16030	NC_017545	GTAT	2	8	695761	695768	25 %	50 %	25 %	0 %	386046295
16031	NC_017545	GAA	2	6	695783	695788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386046295
16032	NC_017545	GAT	2	6	695971	695976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_017545	ATCAA	2	10	695995	696004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16034	NC_017545	ATTTT	2	10	696014	696023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_017545	TCTT	2	8	696057	696064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16036	NC_017545	ATT	2	6	696096	696101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_017545	T	7	7	696131	696137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_017545	T	6	6	696201	696206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_017545	ATA	3	9	696262	696270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_017545	ATT	2	6	696280	696285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_017545	ATG	2	6	696319	696324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_017545	AAT	2	6	696372	696377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_017545	AT	3	6	696386	696391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_017545	TTG	2	6	696459	696464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386046296
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16047	NC_017545	ACT	2	6	696609	696614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386046296
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16051	NC_017545	TGA	2	6	696690	696695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_017545	ATAA	2	8	696737	696744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_017545	TAAA	2	8	696746	696753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_017545	T	6	6	696802	696807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_017545	GAC	2	6	696810	696815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_017545	ATT	2	6	696861	696866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_017545	A	6	6	696875	696880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_017545	GAAT	2	8	696905	696912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_017545	T	7	7	697000	697006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_017545	TAAAA	2	10	697012	697021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_017545	A	8	8	697038	697045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_017545	TATTTT	2	12	697053	697064	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16091	NC_017545	TAA	2	6	698325	698330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_017545	A	6	6	698329	698334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16095	NC_017545	T	6	6	698421	698426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_017545	A	6	6	698438	698443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_017545	TTA	2	6	698452	698457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_017545	GTAT	2	8	698526	698533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_017545	GAAA	2	8	698554	698561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_017545	GTTT	2	8	698617	698624	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_017545	ATGTT	2	10	698631	698640	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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16105	NC_017545	TGGA	2	8	698829	698836	25 %	25 %	50 %	0 %	386046299
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16107	NC_017545	GGT	2	6	698952	698957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386046299
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16111	NC_017545	TGAA	2	8	699217	699224	50 %	25 %	25 %	0 %	386046299
16112	NC_017545	TTTA	2	8	699232	699239	25 %	75 %	0 %	0 %	386046299
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16495	NC_017545	TGGAA	2	10	716216	716225	40 %	20 %	40 %	0 %	386046315
16496	NC_017545	A	7	7	716259	716265	100 %	0 %	0 %	0 %	386046315
16497	NC_017545	AGA	2	6	716297	716302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386046315
16498	NC_017545	GCT	2	6	716304	716309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386046315
16499	NC_017545	TAT	2	6	716343	716348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386046315
16500	NC_017545	GAA	2	6	716349	716354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386046315

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