MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 68579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017545	GAA	2	6	22804	22809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045652
502	NC_017545	CTT	2	6	22897	22902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045652
503	NC_017545	A	6	6	22957	22962	100 %	0 %	0 %	0 %	386045652
504	NC_017545	ACA	2	6	22991	22996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045652
505	NC_017545	GAA	2	6	23022	23027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045652
506	NC_017545	A	6	6	23026	23031	100 %	0 %	0 %	0 %	386045652
507	NC_017545	A	6	6	23047	23052	100 %	0 %	0 %	0 %	386045652
508	NC_017545	AT	3	6	23085	23090	50 %	50 %	0 %	0 %	386045652
509	NC_017545	TCA	2	6	23106	23111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017545	TTTTA	2	10	23125	23134	20 %	80 %	0 %	0 %	386045653
511	NC_017545	CG	3	6	23144	23149	0 %	0 %	50 %	50 %	386045653
512	NC_017545	CAA	2	6	23166	23171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045653
513	NC_017545	T	7	7	23202	23208	0 %	100 %	0 %	0 %	386045653
514	NC_017545	GACCA	2	10	23209	23218	40 %	0 %	20 %	40 %	386045653
515	NC_017545	GTA	2	6	23228	23233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045653
516	NC_017545	ATT	2	6	23237	23242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045653
517	NC_017545	T	6	6	23318	23323	0 %	100 %	0 %	0 %	386045653
518	NC_017545	TTC	2	6	23367	23372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045653
519	NC_017545	T	6	6	23387	23392	0 %	100 %	0 %	0 %	386045653
520	NC_017545	TGGAT	2	10	23468	23477	20 %	40 %	40 %	0 %	386045653
521	NC_017545	T	6	6	23520	23525	0 %	100 %	0 %	0 %	386045653
522	NC_017545	GCA	2	6	23536	23541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045653
523	NC_017545	AGTTGC	2	12	23648	23659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386045653
524	NC_017545	TAAAGC	2	12	23701	23712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386045653
525	NC_017545	GTT	2	6	23720	23725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045653
526	NC_017545	AGCC	2	8	23766	23773	25 %	0 %	25 %	50 %	386045653
527	NC_017545	GAAC	2	8	23802	23809	50 %	0 %	25 %	25 %	386045653
528	NC_017545	GTT	2	6	23823	23828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045653
529	NC_017545	GCC	3	9	23859	23867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386045653
530	NC_017545	A	7	7	23939	23945	100 %	0 %	0 %	0 %	386045653
531	NC_017545	GAAAA	2	10	24005	24014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017545	A	6	6	24121	24126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017545	CG	3	6	24165	24170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017545	TAT	3	9	24214	24222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045654
535	NC_017545	ATTA	2	8	24238	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	386045654
536	NC_017545	A	6	6	24270	24275	100 %	0 %	0 %	0 %	386045654
537	NC_017545	AGA	2	6	24283	24288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045654
538	NC_017545	AAG	2	6	24299	24304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045654
539	NC_017545	TAC	2	6	24319	24324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045654
540	NC_017545	GTT	2	6	24326	24331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045654
541	NC_017545	GTAA	2	8	24395	24402	50 %	25 %	25 %	0 %	386045654
542	NC_017545	TAT	2	6	24406	24411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045654
543	NC_017545	GAA	2	6	24416	24421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045654
544	NC_017545	CAAAA	2	10	24469	24478	80 %	0 %	0 %	20 %	386045654
545	NC_017545	AGT	2	6	24499	24504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045654
546	NC_017545	A	6	6	24539	24544	100 %	0 %	0 %	0 %	386045654
547	NC_017545	TGA	2	6	24598	24603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045654
548	NC_017545	AAC	2	6	24623	24628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045654
549	NC_017545	AG	3	6	24745	24750	50 %	0 %	50 %	0 %	386045654
550	NC_017545	AAT	2	6	24782	24787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045654
551	NC_017545	AT	3	6	24871	24876	50 %	50 %	0 %	0 %	386045654
552	NC_017545	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045654
553	NC_017545	A	6	6	24923	24928	100 %	0 %	0 %	0 %	386045654
554	NC_017545	ATTAT	2	10	24954	24963	40 %	60 %	0 %	0 %	386045655
555	NC_017545	GCA	2	6	24965	24970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045655
556	NC_017545	AAC	2	6	25024	25029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045655
557	NC_017545	GAA	2	6	25055	25060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045655
558	NC_017545	TTG	2	6	25137	25142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045655
559	NC_017545	AGG	2	6	25257	25262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045655
560	NC_017545	ATA	2	6	25281	25286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045655
561	NC_017545	TGA	2	6	25327	25332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045655
562	NC_017545	GGA	2	6	25336	25341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045655
563	NC_017545	CAA	2	6	25412	25417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045656
564	NC_017545	TTG	2	6	25454	25459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045656
565	NC_017545	ATG	2	6	25460	25465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045656
566	NC_017545	A	6	6	25473	25478	100 %	0 %	0 %	0 %	386045656
567	NC_017545	CTG	2	6	25514	25519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045656
568	NC_017545	GCA	2	6	25552	25557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045656
569	NC_017545	AAT	2	6	25558	25563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045656
570	NC_017545	AAT	2	6	25567	25572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045656
571	NC_017545	GCA	2	6	25587	25592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045656
572	NC_017545	A	7	7	25707	25713	100 %	0 %	0 %	0 %	386045656
573	NC_017545	ATT	2	6	25751	25756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045656
574	NC_017545	A	7	7	25830	25836	100 %	0 %	0 %	0 %	386045656
575	NC_017545	AAG	2	6	25845	25850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017545	GTTA	2	8	25891	25898	25 %	50 %	25 %	0 %	386045657
577	NC_017545	TAA	2	6	25959	25964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045657
578	NC_017545	CGG	2	6	26059	26064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045657
579	NC_017545	TCG	2	6	26097	26102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045657
580	NC_017545	TCAGG	2	10	26123	26132	20 %	20 %	40 %	20 %	386045657
581	NC_017545	CAG	2	6	26262	26267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045657
582	NC_017545	CG	4	8	26310	26317	0 %	0 %	50 %	50 %	386045657
583	NC_017545	TGG	2	6	26413	26418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045657
584	NC_017545	TTC	2	6	26421	26426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045657
585	NC_017545	AGT	2	6	26428	26433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045657
586	NC_017545	CAA	2	6	26463	26468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045657
587	NC_017545	TCG	2	6	26475	26480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045657
588	NC_017545	AGC	3	9	26503	26511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045657
589	NC_017545	ATC	2	6	26564	26569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045657
590	NC_017545	CAAA	2	8	26575	26582	75 %	0 %	0 %	25 %	386045657
591	NC_017545	GAG	2	6	26633	26638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045657
592	NC_017545	AGC	2	6	26705	26710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045658
593	NC_017545	GTTG	2	8	26719	26726	0 %	50 %	50 %	0 %	386045658
594	NC_017545	GCCA	2	8	26730	26737	25 %	0 %	25 %	50 %	386045658
595	NC_017545	ATG	2	6	26760	26765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045658
596	NC_017545	TGA	3	9	26819	26827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045658
597	NC_017545	ATG	2	6	26838	26843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045658
598	NC_017545	GGT	2	6	26883	26888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045658
599	NC_017545	AAAG	2	8	26927	26934	75 %	0 %	25 %	0 %	386045658
600	NC_017545	AAG	2	6	26941	26946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045658
601	NC_017545	AT	3	6	27047	27052	50 %	50 %	0 %	0 %	386045658
602	NC_017545	TTTAC	2	10	27123	27132	20 %	60 %	0 %	20 %	386045658
603	NC_017545	GTC	2	6	27228	27233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045658
604	NC_017545	A	7	7	27387	27393	100 %	0 %	0 %	0 %	386045658
605	NC_017545	TTA	2	6	27414	27419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045658
606	NC_017545	ATT	2	6	27435	27440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045658
607	NC_017545	GGA	2	6	27480	27485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017545	T	6	6	27507	27512	0 %	100 %	0 %	0 %	386045659
609	NC_017545	GGA	2	6	27533	27538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045659
610	NC_017545	A	6	6	27544	27549	100 %	0 %	0 %	0 %	386045659
611	NC_017545	TCA	2	6	27566	27571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045659
612	NC_017545	AGC	2	6	27572	27577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045659
613	NC_017545	TGG	2	6	27583	27588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045659
614	NC_017545	ACG	2	6	27604	27609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045659
615	NC_017545	ATT	2	6	27612	27617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045659
616	NC_017545	AGG	2	6	27674	27679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045659
617	NC_017545	TTA	2	6	27697	27702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045659
618	NC_017545	CTG	2	6	27709	27714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045659
619	NC_017545	TTA	2	6	27719	27724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045659
620	NC_017545	AT	3	6	27784	27789	50 %	50 %	0 %	0 %	386045659
621	NC_017545	TTG	2	6	27871	27876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045659
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623	NC_017545	TTG	2	6	27930	27935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045659
624	NC_017545	CAA	2	6	28056	28061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045659
625	NC_017545	ACC	2	6	28106	28111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045659
626	NC_017545	TGG	2	6	28136	28141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045659
627	NC_017545	TAA	2	6	28197	28202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045659
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