MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_017544	TGA	2	6	1857464	1857469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044134
42503	NC_017544	CTT	2	6	1857482	1857487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044134
42504	NC_017544	T	6	6	1857486	1857491	0 %	100 %	0 %	0 %	386044134
42505	NC_017544	TTG	2	6	1857586	1857591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044134
42506	NC_017544	CAA	2	6	1857593	1857598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044134
42507	NC_017544	T	6	6	1857624	1857629	0 %	100 %	0 %	0 %	386044134
42508	NC_017544	GTT	2	6	1857758	1857763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044134
42509	NC_017544	T	6	6	1857762	1857767	0 %	100 %	0 %	0 %	386044134
42510	NC_017544	CTG	2	6	1857809	1857814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044134
42511	NC_017544	TCA	2	6	1857818	1857823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044134
42512	NC_017544	TTCA	2	8	1857849	1857856	25 %	50 %	0 %	25 %	386044134
42513	NC_017544	GTA	2	6	1857931	1857936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044134
42514	NC_017544	CGC	2	6	1857963	1857968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044134
42515	NC_017544	TGCTA	2	10	1857975	1857984	20 %	40 %	20 %	20 %	386044134
42516	NC_017544	TGGT	2	8	1858006	1858013	0 %	50 %	50 %	0 %	386044134
42517	NC_017544	AGG	2	6	1858081	1858086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386044134
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42520	NC_017544	GAA	2	6	1858118	1858123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044134
42521	NC_017544	T	6	6	1858127	1858132	0 %	100 %	0 %	0 %	386044134
42522	NC_017544	TTC	2	6	1858137	1858142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044134
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42524	NC_017544	CTT	2	6	1858181	1858186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044134
42525	NC_017544	CTG	2	6	1858241	1858246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044134
42526	NC_017544	CATT	2	8	1858265	1858272	25 %	50 %	0 %	25 %	386044134
42527	NC_017544	ATC	2	6	1858326	1858331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044134
42528	NC_017544	TTGCAG	2	12	1858364	1858375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386044134
42529	NC_017544	T	8	8	1858434	1858441	0 %	100 %	0 %	0 %	386044134
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42533	NC_017544	T	6	6	1858621	1858626	0 %	100 %	0 %	0 %	386044134
42534	NC_017544	A	6	6	1858660	1858665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42535	NC_017544	TAT	2	6	1858676	1858681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42536	NC_017544	GAA	2	6	1858710	1858715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42537	NC_017544	A	6	6	1858755	1858760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42538	NC_017544	TTAT	2	8	1858789	1858796	25 %	75 %	0 %	0 %	386044135
42539	NC_017544	TCT	2	6	1858832	1858837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044135
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42559	NC_017544	GTT	2	6	1859668	1859673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42571	NC_017544	GCTT	2	8	1860216	1860223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42572	NC_017544	GAAAA	2	10	1860304	1860313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42573	NC_017544	CTTA	2	8	1860339	1860346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42574	NC_017544	T	7	7	1860350	1860356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42579	NC_017544	TAAC	2	8	1860630	1860637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42580	NC_017544	GAAT	2	8	1860646	1860653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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42608	NC_017544	A	6	6	1861988	1861993	100 %	0 %	0 %	0 %	386044137
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42618	NC_017544	A	6	6	1862270	1862275	100 %	0 %	0 %	0 %	386044137
42619	NC_017544	TGA	2	6	1862338	1862343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044137
42620	NC_017544	A	6	6	1862362	1862367	100 %	0 %	0 %	0 %	386044137
42621	NC_017544	T	6	6	1862391	1862396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42622	NC_017544	ACTTT	2	10	1862426	1862435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42623	NC_017544	T	6	6	1862433	1862438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42624	NC_017544	GAT	2	6	1862447	1862452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42625	NC_017544	TTA	2	6	1862468	1862473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044138
42626	NC_017544	A	6	6	1862522	1862527	100 %	0 %	0 %	0 %	386044138
42627	NC_017544	CTG	2	6	1862541	1862546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044138
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42630	NC_017544	TAG	2	6	1862707	1862712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044138
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42633	NC_017544	TAC	2	6	1862785	1862790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044138
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42640	NC_017544	AAG	2	6	1863065	1863070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42641	NC_017544	CTT	2	6	1863092	1863097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42653	NC_017544	TA	3	6	1863622	1863627	50 %	50 %	0 %	0 %	386044139
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42721	NC_017544	AGTC	2	8	1867530	1867537	25 %	25 %	25 %	25 %	386044143
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42735	NC_017544	CAA	2	6	1868110	1868115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044143
42736	NC_017544	CTT	2	6	1868160	1868165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044143
42737	NC_017544	CGA	2	6	1868222	1868227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044143
42738	NC_017544	AAAGC	2	10	1868249	1868258	60 %	0 %	20 %	20 %	386044143
42739	NC_017544	CAA	2	6	1868271	1868276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044143
42740	NC_017544	GTT	2	6	1868309	1868314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044143
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42742	NC_017544	CAA	2	6	1868542	1868547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044143
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42752	NC_017544	TCAT	2	8	1868921	1868928	25 %	50 %	0 %	25 %	386044143
42753	NC_017544	T	6	6	1868959	1868964	0 %	100 %	0 %	0 %	386044143
42754	NC_017544	CAG	3	9	1869018	1869026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044143
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42756	NC_017544	TCG	2	6	1869174	1869179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044143
42757	NC_017544	CTT	3	9	1869213	1869221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044143
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42764	NC_017544	TCA	2	6	1869477	1869482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044144
42765	NC_017544	TG	3	6	1869493	1869498	0 %	50 %	50 %	0 %	386044144
42766	NC_017544	GAT	2	6	1869598	1869603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044144
42767	NC_017544	CGG	2	6	1869805	1869810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386044144
42768	NC_017544	TGT	2	6	1869814	1869819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044144
42769	NC_017544	TTTA	2	8	1869848	1869855	25 %	75 %	0 %	0 %	386044144
42770	NC_017544	GGA	2	6	1869938	1869943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386044144
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42773	NC_017544	CTG	2	6	1870018	1870023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044144
42774	NC_017544	CTT	2	6	1870045	1870050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044144
42775	NC_017544	TTTC	2	8	1870108	1870115	0 %	75 %	0 %	25 %	386044144
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42788	NC_017544	TTCG	2	8	1870669	1870676	0 %	50 %	25 %	25 %	386044145
42789	NC_017544	TA	3	6	1870692	1870697	50 %	50 %	0 %	0 %	386044145
42790	NC_017544	AGC	2	6	1870735	1870740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044145
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42801	NC_017544	GACA	2	8	1871007	1871014	50 %	0 %	25 %	25 %	386044145
42802	NC_017544	CTT	2	6	1871100	1871105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044145
42803	NC_017544	TA	3	6	1871141	1871146	50 %	50 %	0 %	0 %	386044145
42804	NC_017544	TGC	2	6	1871188	1871193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044145
42805	NC_017544	AGCT	2	8	1871224	1871231	25 %	25 %	25 %	25 %	386044145
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42820	NC_017544	CAT	2	6	1871970	1871975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044146
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42822	NC_017544	CCG	2	6	1872235	1872240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044146
42823	NC_017544	TCT	2	6	1872286	1872291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044146
42824	NC_017544	GCA	2	6	1872382	1872387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044146
42825	NC_017544	ACC	2	6	1872397	1872402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044146
42826	NC_017544	A	6	6	1872462	1872467	100 %	0 %	0 %	0 %	386044146
42827	NC_017544	T	6	6	1872504	1872509	0 %	100 %	0 %	0 %	386044146
42828	NC_017544	GCC	2	6	1872526	1872531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044146
42829	NC_017544	TAA	2	6	1872537	1872542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044146
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42831	NC_017544	T	6	6	1872658	1872663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42832	NC_017544	GT	3	6	1872667	1872672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42833	NC_017544	AAT	2	6	1872716	1872721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044147
42834	NC_017544	CTG	2	6	1872730	1872735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044147
42835	NC_017544	TGAA	2	8	1872771	1872778	50 %	25 %	25 %	0 %	386044147
42836	NC_017544	ACT	2	6	1872795	1872800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044147
42837	NC_017544	AAT	2	6	1872815	1872820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044147
42838	NC_017544	ATTTT	2	10	1872846	1872855	20 %	80 %	0 %	0 %	386044147
42839	NC_017544	ATC	2	6	1872858	1872863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044147
42840	NC_017544	TTG	2	6	1872877	1872882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044147
42841	NC_017544	CTG	2	6	1872922	1872927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044147
42842	NC_017544	CTC	2	6	1872994	1872999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386044147
42843	NC_017544	AACA	2	8	1873004	1873011	75 %	0 %	0 %	25 %	386044147
42844	NC_017544	AGT	2	6	1873058	1873063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044147
42845	NC_017544	GGT	2	6	1873068	1873073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386044147
42846	NC_017544	AAG	2	6	1873146	1873151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044147
42847	NC_017544	AGT	2	6	1873173	1873178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044147
42848	NC_017544	GAA	2	6	1873298	1873303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044147
42849	NC_017544	CAAA	2	8	1873375	1873382	75 %	0 %	0 %	25 %	386044147
42850	NC_017544	CAT	2	6	1873415	1873420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044147
42851	NC_017544	ACTGCC	2	12	1873449	1873460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386044147
42852	NC_017544	GTTC	2	8	1873487	1873494	0 %	50 %	25 %	25 %	386044147
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