MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42003	NC_017544	T	6	6	1835100	1835105	0 %	100 %	0 %	0 %	386044112
42004	NC_017544	CTC	2	6	1835159	1835164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386044112
42005	NC_017544	TTG	2	6	1835189	1835194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044112
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42013	NC_017544	ATC	2	6	1835528	1835533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044112
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42102	NC_017544	TAA	2	6	1839433	1839438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044117
42103	NC_017544	CAT	3	9	1839472	1839480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044117
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42105	NC_017544	CTG	2	6	1839505	1839510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044117
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42108	NC_017544	TACTTT	2	12	1839594	1839605	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386044118
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42110	NC_017544	T	6	6	1839792	1839797	0 %	100 %	0 %	0 %	386044118
42111	NC_017544	AAG	2	6	1839799	1839804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044118
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42114	NC_017544	ACA	3	9	1839922	1839930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044118
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42116	NC_017544	T	7	7	1840014	1840020	0 %	100 %	0 %	0 %	386044118
42117	NC_017544	TCT	2	6	1840042	1840047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044118
42118	NC_017544	CG	3	6	1840070	1840075	0 %	0 %	50 %	50 %	386044118
42119	NC_017544	GTA	2	6	1840130	1840135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044118
42120	NC_017544	GCA	2	6	1840336	1840341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044118
42121	NC_017544	T	6	6	1840356	1840361	0 %	100 %	0 %	0 %	386044118
42122	NC_017544	TCA	3	9	1840387	1840395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044118
42123	NC_017544	T	6	6	1840403	1840408	0 %	100 %	0 %	0 %	386044118
42124	NC_017544	GTAT	2	8	1840414	1840421	25 %	50 %	25 %	0 %	386044118
42125	NC_017544	ATTT	2	8	1840455	1840462	25 %	75 %	0 %	0 %	386044118
42126	NC_017544	AGA	2	6	1840480	1840485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044118
42127	NC_017544	TCA	2	6	1840517	1840522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044118
42128	NC_017544	TGCGT	2	10	1840611	1840620	0 %	40 %	40 %	20 %	386044119
42129	NC_017544	TGT	2	6	1840696	1840701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044119
42130	NC_017544	CTTTTG	2	12	1840717	1840728	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386044119
42131	NC_017544	GAT	2	6	1840730	1840735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044119
42132	NC_017544	GAAC	2	8	1840755	1840762	50 %	0 %	25 %	25 %	386044119
42133	NC_017544	TGT	2	6	1840781	1840786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044119
42134	NC_017544	CGG	2	6	1840810	1840815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386044119
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42136	NC_017544	AAT	2	6	1840934	1840939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044119
42137	NC_017544	CT	3	6	1841015	1841020	0 %	50 %	0 %	50 %	386044119
42138	NC_017544	GCT	2	6	1841092	1841097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044119
42139	NC_017544	TTC	2	6	1841117	1841122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044119
42140	NC_017544	T	6	6	1841165	1841170	0 %	100 %	0 %	0 %	386044119
42141	NC_017544	T	6	6	1841191	1841196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42142	NC_017544	CTA	2	6	1841217	1841222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42143	NC_017544	A	7	7	1841233	1841239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42144	NC_017544	TTG	2	6	1841283	1841288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42145	NC_017544	TTA	2	6	1841302	1841307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42146	NC_017544	T	7	7	1841329	1841335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42147	NC_017544	CTT	2	6	1841383	1841388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044120
42148	NC_017544	CTA	2	6	1841401	1841406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044120
42149	NC_017544	TCT	2	6	1841436	1841441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044120
42150	NC_017544	GGCG	2	8	1841467	1841474	0 %	0 %	75 %	25 %	386044120
42151	NC_017544	GAA	2	6	1841546	1841551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044120
42152	NC_017544	GTTT	2	8	1841603	1841610	0 %	75 %	25 %	0 %	386044120
42153	NC_017544	ATC	2	6	1841619	1841624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044120
42154	NC_017544	CAT	2	6	1841756	1841761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044120
42155	NC_017544	CAAT	2	8	1841814	1841821	50 %	25 %	0 %	25 %	386044120
42156	NC_017544	T	7	7	1841821	1841827	0 %	100 %	0 %	0 %	386044120
42157	NC_017544	CTG	2	6	1841860	1841865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044120
42158	NC_017544	AT	3	6	1841895	1841900	50 %	50 %	0 %	0 %	386044120
42159	NC_017544	ATTT	2	8	1841911	1841918	25 %	75 %	0 %	0 %	386044120
42160	NC_017544	TTC	2	6	1841969	1841974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044120
42161	NC_017544	TGA	2	6	1842000	1842005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044120
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42164	NC_017544	ACG	2	6	1842215	1842220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044120
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42171	NC_017544	CGC	2	6	1842592	1842597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044120
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42178	NC_017544	A	6	6	1843113	1843118	100 %	0 %	0 %	0 %	386044120
42179	NC_017544	TGA	2	6	1843126	1843131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044120
42180	NC_017544	AG	3	6	1843157	1843162	50 %	0 %	50 %	0 %	386044120
42181	NC_017544	T	6	6	1843169	1843174	0 %	100 %	0 %	0 %	386044120
42182	NC_017544	TTC	2	6	1843232	1843237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044120
42183	NC_017544	TTC	2	6	1843349	1843354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044120
42184	NC_017544	TCAC	2	8	1843395	1843402	25 %	25 %	0 %	50 %	386044120
42185	NC_017544	TCT	2	6	1843408	1843413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044121
42186	NC_017544	GCC	2	6	1843462	1843467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044121
42187	NC_017544	TCC	2	6	1843470	1843475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386044121
42188	NC_017544	TCA	2	6	1843540	1843545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044121
42189	NC_017544	CTG	2	6	1843583	1843588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044121
42190	NC_017544	TTGC	2	8	1843595	1843602	0 %	50 %	25 %	25 %	386044121
42191	NC_017544	CCG	2	6	1843726	1843731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044121
42192	NC_017544	GCT	3	9	1843732	1843740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044121
42193	NC_017544	GCT	2	6	1843747	1843752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044121
42194	NC_017544	ACC	2	6	1843791	1843796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044121
42195	NC_017544	TGC	2	6	1843797	1843802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044121
42196	NC_017544	ATT	2	6	1843818	1843823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044121
42197	NC_017544	CAA	2	6	1843826	1843831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044121
42198	NC_017544	CTG	2	6	1843847	1843852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044121
42199	NC_017544	A	6	6	1843907	1843912	100 %	0 %	0 %	0 %	386044121
42200	NC_017544	AAG	2	6	1844035	1844040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044121
42201	NC_017544	T	6	6	1844046	1844051	0 %	100 %	0 %	0 %	386044121
42202	NC_017544	CTT	2	6	1844132	1844137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044121
42203	NC_017544	ATA	2	6	1844140	1844145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044121
42204	NC_017544	TTC	2	6	1844175	1844180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044121
42205	NC_017544	CTA	2	6	1844258	1844263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044121
42206	NC_017544	CACT	2	8	1844292	1844299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42207	NC_017544	TTTA	2	8	1844358	1844365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42208	NC_017544	ACT	2	6	1844417	1844422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044122
42209	NC_017544	TTG	2	6	1844493	1844498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044122
42210	NC_017544	TCG	2	6	1844524	1844529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044122
42211	NC_017544	TTTAC	2	10	1844533	1844542	20 %	60 %	0 %	20 %	386044122
42212	NC_017544	GCA	2	6	1844599	1844604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044122
42213	NC_017544	AAT	2	6	1844685	1844690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044122
42214	NC_017544	CCA	2	6	1844704	1844709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044122
42215	NC_017544	TTG	2	6	1844733	1844738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044122
42216	NC_017544	GGC	2	6	1844779	1844784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386044122
42217	NC_017544	CTT	2	6	1844792	1844797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044122
42218	NC_017544	ATC	2	6	1844859	1844864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044122
42219	NC_017544	CCA	2	6	1844884	1844889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044122
42220	NC_017544	GTT	2	6	1844966	1844971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044122
42221	NC_017544	AAT	2	6	1845054	1845059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044122
42222	NC_017544	ATC	2	6	1845088	1845093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044122
42223	NC_017544	TCT	2	6	1845097	1845102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42224	NC_017544	AT	3	6	1845137	1845142	50 %	50 %	0 %	0 %	386044123
42225	NC_017544	TGGT	2	8	1845153	1845160	0 %	50 %	50 %	0 %	386044123
42226	NC_017544	GTA	2	6	1845232	1845237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044123
42227	NC_017544	CAA	2	6	1845251	1845256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044123
42228	NC_017544	TCA	2	6	1845280	1845285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044123
42229	NC_017544	AGT	2	6	1845286	1845291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044123
42230	NC_017544	TTC	2	6	1845315	1845320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044123
42231	NC_017544	T	6	6	1845375	1845380	0 %	100 %	0 %	0 %	386044123
42232	NC_017544	TGC	2	6	1845450	1845455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044123
42233	NC_017544	CAG	2	6	1845509	1845514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044123
42234	NC_017544	GAT	2	6	1845543	1845548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044123
42235	NC_017544	ATC	2	6	1845558	1845563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044123
42236	NC_017544	GCT	2	6	1845577	1845582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044123
42237	NC_017544	TAT	2	6	1845608	1845613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044123
42238	NC_017544	GAA	2	6	1845617	1845622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044123
42239	NC_017544	TCT	2	6	1845667	1845672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044123
42240	NC_017544	ACC	2	6	1845693	1845698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044123
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42243	NC_017544	TCA	2	6	1845805	1845810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044123
42244	NC_017544	CAA	2	6	1845812	1845817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044123
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42246	NC_017544	TAC	2	6	1845927	1845932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044123
42247	NC_017544	TCA	2	6	1845934	1845939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044123
42248	NC_017544	TTC	2	6	1845993	1845998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044123
42249	NC_017544	GTTT	2	8	1846019	1846026	0 %	75 %	25 %	0 %	386044123
42250	NC_017544	CAGTA	2	10	1846049	1846058	40 %	20 %	20 %	20 %	386044123
42251	NC_017544	GAT	2	6	1846103	1846108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044123
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42253	NC_017544	ACC	2	6	1846215	1846220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044123
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42256	NC_017544	T	6	6	1846268	1846273	0 %	100 %	0 %	0 %	386044123
42257	NC_017544	TGC	3	9	1846338	1846346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044123
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42259	NC_017544	TTC	2	6	1846455	1846460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044123
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42261	NC_017544	T	6	6	1846708	1846713	0 %	100 %	0 %	0 %	386044123
42262	NC_017544	TGC	2	6	1846743	1846748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044123
42263	NC_017544	AT	3	6	1846770	1846775	50 %	50 %	0 %	0 %	386044123
42264	NC_017544	TCC	2	6	1846790	1846795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42265	NC_017544	T	6	6	1846864	1846869	0 %	100 %	0 %	0 %	386044124
42266	NC_017544	GT	3	6	1846873	1846878	0 %	50 %	50 %	0 %	386044124
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42273	NC_017544	ATT	2	6	1847197	1847202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42274	NC_017544	T	7	7	1847201	1847207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42275	NC_017544	CCTA	2	8	1847238	1847245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42276	NC_017544	ATT	2	6	1847379	1847384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42277	NC_017544	TAAA	2	8	1847418	1847425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42278	NC_017544	AGG	2	6	1847445	1847450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42281	NC_017544	T	6	6	1847689	1847694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42282	NC_017544	TAAAA	2	10	1847703	1847712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42283	NC_017544	A	7	7	1847709	1847715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42284	NC_017544	CATTT	2	10	1847735	1847744	20 %	60 %	0 %	20 %	386044126
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42291	NC_017544	AG	3	6	1848221	1848226	50 %	0 %	50 %	0 %	386044126
42292	NC_017544	TAG	2	6	1848250	1848255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044126
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42295	NC_017544	TC	3	6	1848313	1848318	0 %	50 %	0 %	50 %	386044126
42296	NC_017544	CCA	2	6	1848360	1848365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044126
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42298	NC_017544	TAA	2	6	1848409	1848414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42299	NC_017544	CTA	2	6	1848441	1848446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42302	NC_017544	T	6	6	1848646	1848651	0 %	100 %	0 %	0 %	386044127
42303	NC_017544	ATAA	2	8	1848702	1848709	75 %	25 %	0 %	0 %	386044127
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42306	NC_017544	GTTTC	2	10	1848931	1848940	0 %	60 %	20 %	20 %	386044127
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42341	NC_017544	TTTC	2	8	1850715	1850722	0 %	75 %	0 %	25 %	386044129
42342	NC_017544	ATTA	2	8	1850746	1850753	50 %	50 %	0 %	0 %	386044129
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42344	NC_017544	T	7	7	1850780	1850786	0 %	100 %	0 %	0 %	386044129
42345	NC_017544	CTG	2	6	1850787	1850792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044129
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42347	NC_017544	TCA	2	6	1850876	1850881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044129
42348	NC_017544	AGT	2	6	1850903	1850908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044129
42349	NC_017544	GAT	2	6	1850917	1850922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044129
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42351	NC_017544	TTTTCT	2	12	1850958	1850969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386044129
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42353	NC_017544	T	6	6	1850995	1851000	0 %	100 %	0 %	0 %	386044129
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