MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017544	GCA	2	6	238309	238314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_017544	CGC	2	6	238356	238361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_017544	GAA	2	6	238368	238373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017544	TGT	2	6	238395	238400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017544	AGA	2	6	238404	238409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017544	CAG	2	6	238477	238482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017544	GC	4	8	238533	238540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_017544	AGA	2	6	238618	238623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017544	GGA	2	6	238668	238673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017544	CT	3	6	238693	238698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_017544	TGC	2	6	238813	238818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017544	GAA	2	6	238932	238937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017544	GGT	2	6	239006	239011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017544	GTC	2	6	239020	239025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017544	TCGTG	2	10	239029	239038	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5516	NC_017544	GGA	2	6	239131	239136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017544	ATC	2	6	239155	239160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017544	AC	3	6	239182	239187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_017544	AC	3	6	239351	239356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_017544	CAC	2	6	239366	239371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_017544	AGCC	2	8	239414	239421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_017544	CCT	2	6	239493	239498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_017544	AAGGAA	2	12	239503	239514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017544	TTC	2	6	239530	239535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017544	TGTT	2	8	239575	239582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017544	TAT	2	6	239629	239634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017544	ATC	2	6	239656	239661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_017544	ATC	2	6	239692	239697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_017544	AAC	2	6	239719	239724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017544	GAA	2	6	239794	239799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017544	GGA	2	6	239959	239964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017544	AGAA	2	8	239967	239974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017544	GCG	2	6	239993	239998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017544	AAG	2	6	240023	240028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017544	CTT	2	6	240033	240038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017544	AAAG	2	8	240070	240077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017544	CGG	2	6	240167	240172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017544	GGA	2	6	240199	240204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017544	AGT	2	6	240320	240325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017544	TTG	2	6	240384	240389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017544	AAGGT	2	10	240497	240506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017544	TACT	2	8	240509	240516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_017544	CACG	2	8	240530	240537	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_017544	TC	3	6	240603	240608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_017544	ACC	2	6	240782	240787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_017544	AT	3	6	240803	240808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017544	AGC	2	6	240862	240867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_017544	TGG	2	6	241022	241027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017544	AAG	2	6	241064	241069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017544	TAGGCG	2	12	241156	241167	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5551	NC_017544	ACA	2	6	241172	241177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_017544	AGTG	2	8	241269	241276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017544	GGAA	2	8	241323	241330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017544	AGT	2	6	241383	241388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017544	GAG	2	6	241421	241426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017544	GA	3	6	241444	241449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017544	GA	3	6	241523	241528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017544	CGG	2	6	241681	241686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_017544	GA	3	6	241779	241784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017544	TAGG	2	8	241897	241904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017544	GAG	2	6	241933	241938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017544	TGG	2	6	241943	241948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017544	TAC	2	6	241951	241956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_017544	CCT	2	6	242039	242044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_017544	ATGG	2	8	242080	242087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017544	GGT	2	6	242175	242180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017544	TCG	2	6	242290	242295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_017544	CGT	2	6	242370	242375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_017544	GAG	2	6	242419	242424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017544	AC	3	6	242454	242459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_017544	GTT	2	6	242473	242478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017544	TG	3	6	242505	242510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017544	C	6	6	242546	242551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5574	NC_017544	TTC	2	6	242571	242576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017544	GAT	2	6	242597	242602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017544	ATCG	2	8	242658	242665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_017544	A	6	6	242677	242682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017544	TCT	2	6	242711	242716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_017544	GA	3	6	242725	242730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017544	CAA	2	6	242740	242745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_017544	ATT	2	6	242889	242894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017544	T	7	7	242901	242907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017544	ATAA	2	8	242919	242926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_017544	AGTCAA	2	12	242971	242982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5585	NC_017544	A	6	6	242991	242996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_017544	AAG	2	6	243091	243096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042565
5587	NC_017544	TAA	2	6	243144	243149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042565
5588	NC_017544	TTG	2	6	243180	243185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042565
5589	NC_017544	GTG	4	12	243195	243206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042565
5590	NC_017544	AT	3	6	243208	243213	50 %	50 %	0 %	0 %	386042565
5591	NC_017544	ATT	2	6	243218	243223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042565
5592	NC_017544	ATGA	2	8	243233	243240	50 %	25 %	25 %	0 %	386042565
5593	NC_017544	TC	3	6	243291	243296	0 %	50 %	0 %	50 %	386042565
5594	NC_017544	GAA	3	9	243332	243340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042565
5595	NC_017544	TAA	2	6	243342	243347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042565
5596	NC_017544	GAA	2	6	243349	243354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042565
5597	NC_017544	TTTACC	2	12	243400	243411	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386042565
5598	NC_017544	TGA	2	6	243480	243485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017544	GAT	2	6	243487	243492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042566
5600	NC_017544	CAA	2	6	243533	243538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042566
5601	NC_017544	CT	3	6	243600	243605	0 %	50 %	0 %	50 %	386042566
5602	NC_017544	ATT	2	6	243806	243811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042566
5603	NC_017544	A	6	6	243833	243838	100 %	0 %	0 %	0 %	386042566
5604	NC_017544	CAG	2	6	243855	243860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042566
5605	NC_017544	GAG	2	6	243935	243940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042566
5606	NC_017544	GCT	2	6	243950	243955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042566
5607	NC_017544	TGA	2	6	243964	243969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042566
5608	NC_017544	AATG	2	8	244002	244009	50 %	25 %	25 %	0 %	386042566
5609	NC_017544	TGA	2	6	244050	244055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042567
5610	NC_017544	GAT	2	6	244057	244062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042567
5611	NC_017544	GAAG	2	8	244131	244138	50 %	0 %	50 %	0 %	386042567
5612	NC_017544	ATA	2	6	244148	244153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042567
5613	NC_017544	TGA	2	6	244167	244172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042567
5614	NC_017544	ATTTT	2	10	244175	244184	20 %	80 %	0 %	0 %	386042567
5615	NC_017544	TGG	2	6	244226	244231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042567
5616	NC_017544	ATG	2	6	244255	244260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042567
5617	NC_017544	GAA	2	6	244297	244302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042567
5618	NC_017544	TAT	2	6	244311	244316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042567
5619	NC_017544	TGAA	2	8	244319	244326	50 %	25 %	25 %	0 %	386042567
5620	NC_017544	ATT	2	6	244368	244373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042567
5621	NC_017544	TG	3	6	244465	244470	0 %	50 %	50 %	0 %	386042567
5622	NC_017544	GC	3	6	244491	244496	0 %	0 %	50 %	50 %	386042567
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5625	NC_017544	TGA	2	6	244796	244801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042567
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5629	NC_017544	TGAA	2	8	244901	244908	50 %	25 %	25 %	0 %	386042567
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