MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_017544	T	6	6	2360595	2360600	0 %	100 %	0 %	0 %	386044639
54002	NC_017544	TTC	2	6	2360616	2360621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044639
54003	NC_017544	GTG	2	6	2360661	2360666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386044639
54004	NC_017544	ATCA	2	8	2360727	2360734	50 %	25 %	0 %	25 %	386044639
54005	NC_017544	T	8	8	2360745	2360752	0 %	100 %	0 %	0 %	386044639
54006	NC_017544	ATT	2	6	2360767	2360772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044639
54007	NC_017544	AGG	2	6	2360799	2360804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386044639
54008	NC_017544	TCT	2	6	2360917	2360922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044639
54009	NC_017544	A	6	6	2361034	2361039	100 %	0 %	0 %	0 %	386044639
54010	NC_017544	CTG	2	6	2361079	2361084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044639
54011	NC_017544	CCA	2	6	2361100	2361105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044639
54012	NC_017544	GCC	2	6	2361138	2361143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044639
54013	NC_017544	ATT	2	6	2361222	2361227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044640
54014	NC_017544	T	6	6	2361232	2361237	0 %	100 %	0 %	0 %	386044640
54015	NC_017544	CTT	2	6	2361289	2361294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044640
54016	NC_017544	ACA	2	6	2361348	2361353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044640
54017	NC_017544	GCA	2	6	2361378	2361383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044640
54018	NC_017544	CTT	2	6	2361397	2361402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044640
54019	NC_017544	AAT	2	6	2361506	2361511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044640
54020	NC_017544	ACT	2	6	2361603	2361608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044640
54021	NC_017544	TAAT	2	8	2361634	2361641	50 %	50 %	0 %	0 %	386044640
54022	NC_017544	TGG	2	6	2361649	2361654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386044640
54023	NC_017544	TTC	2	6	2361683	2361688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044640
54024	NC_017544	GCA	2	6	2361708	2361713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044640
54025	NC_017544	T	6	6	2361719	2361724	0 %	100 %	0 %	0 %	386044640
54026	NC_017544	TCAT	2	8	2361750	2361757	25 %	50 %	0 %	25 %	386044640
54027	NC_017544	CCG	2	6	2361795	2361800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044640
54028	NC_017544	TTC	2	6	2361824	2361829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044640
54029	NC_017544	TAATT	2	10	2361893	2361902	40 %	60 %	0 %	0 %	386044640
54030	NC_017544	ATA	2	6	2361927	2361932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044640
54031	NC_017544	GTT	2	6	2361934	2361939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044640
54032	NC_017544	ATT	2	6	2361957	2361962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044640
54033	NC_017544	CTC	2	6	2361964	2361969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54034	NC_017544	AGTT	2	8	2361977	2361984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54035	NC_017544	ATC	2	6	2361986	2361991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54036	NC_017544	TTTC	2	8	2361994	2362001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54037	NC_017544	TTCA	2	8	2362015	2362022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54038	NC_017544	AGA	2	6	2362143	2362148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54039	NC_017544	T	8	8	2362152	2362159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54040	NC_017544	AGG	2	6	2362160	2362165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54041	NC_017544	TAT	2	6	2362260	2362265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044641
54042	NC_017544	AGC	2	6	2362281	2362286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044641
54043	NC_017544	CAA	3	9	2362363	2362371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044641
54044	NC_017544	GCA	2	6	2362393	2362398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044641
54045	NC_017544	ATT	2	6	2362516	2362521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044641
54046	NC_017544	TGAGGA	2	12	2362533	2362544	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386044641
54047	NC_017544	CAA	2	6	2362579	2362584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044641
54048	NC_017544	TGG	2	6	2362587	2362592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386044641
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54050	NC_017544	CTG	2	6	2362679	2362684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044641
54051	NC_017544	AGAAA	2	10	2362749	2362758	80 %	0 %	20 %	0 %	386044641
54052	NC_017544	AGA	2	6	2362776	2362781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044641
54053	NC_017544	TGCT	2	8	2362784	2362791	0 %	50 %	25 %	25 %	386044641
54054	NC_017544	CCT	2	6	2362828	2362833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386044641
54055	NC_017544	TTA	2	6	2362952	2362957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044641
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54057	NC_017544	A	7	7	2363067	2363073	100 %	0 %	0 %	0 %	386044641
54058	NC_017544	GCC	2	6	2363074	2363079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044641
54059	NC_017544	ATCAA	2	10	2363084	2363093	60 %	20 %	0 %	20 %	386044641
54060	NC_017544	GTTTG	2	10	2363107	2363116	0 %	60 %	40 %	0 %	386044641
54061	NC_017544	A	6	6	2363141	2363146	100 %	0 %	0 %	0 %	386044641
54062	NC_017544	TAT	2	6	2363154	2363159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044641
54063	NC_017544	A	6	6	2363330	2363335	100 %	0 %	0 %	0 %	386044641
54064	NC_017544	AAT	2	6	2363341	2363346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044641
54065	NC_017544	TTG	2	6	2363354	2363359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044641
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54069	NC_017544	TATC	2	8	2363413	2363420	25 %	50 %	0 %	25 %	386044641
54070	NC_017544	ATTG	2	8	2363427	2363434	25 %	50 %	25 %	0 %	386044641
54071	NC_017544	TCGC	2	8	2363485	2363492	0 %	25 %	25 %	50 %	386044641
54072	NC_017544	AAT	2	6	2363514	2363519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044642
54073	NC_017544	GCT	3	9	2363545	2363553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044642
54074	NC_017544	CGT	2	6	2363591	2363596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044642
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54077	NC_017544	ATT	2	6	2363638	2363643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044642
54078	NC_017544	AAGT	2	8	2363675	2363682	50 %	25 %	25 %	0 %	386044642
54079	NC_017544	TTC	2	6	2363700	2363705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044642
54080	NC_017544	CGC	2	6	2363768	2363773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044642
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54082	NC_017544	CCA	2	6	2363809	2363814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044642
54083	NC_017544	CCA	2	6	2363852	2363857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044642
54084	NC_017544	CAT	2	6	2363891	2363896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044642
54085	NC_017544	ATTT	2	8	2363938	2363945	25 %	75 %	0 %	0 %	386044642
54086	NC_017544	CCT	2	6	2363948	2363953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54087	NC_017544	T	6	6	2363957	2363962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54088	NC_017544	CCA	2	6	2363982	2363987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54089	NC_017544	TATT	2	8	2364007	2364014	25 %	75 %	0 %	0 %	386044643
54090	NC_017544	TCT	2	6	2364164	2364169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044643
54091	NC_017544	CTT	2	6	2364171	2364176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044643
54092	NC_017544	TTC	2	6	2364226	2364231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044643
54093	NC_017544	GCC	2	6	2364256	2364261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386044643
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54100	NC_017544	GCT	2	6	2364602	2364607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044643
54101	NC_017544	GTT	2	6	2364611	2364616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044643
54102	NC_017544	GTT	2	6	2364624	2364629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044643
54103	NC_017544	TTG	2	6	2364630	2364635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044643
54104	NC_017544	ACG	2	6	2364655	2364660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044643
54105	NC_017544	TAGTTC	2	12	2364694	2364705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386044643
54106	NC_017544	TCA	2	6	2364707	2364712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044643
54107	NC_017544	TTG	2	6	2364750	2364755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044643
54108	NC_017544	AAT	2	6	2364778	2364783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044643
54109	NC_017544	GA	3	6	2364834	2364839	50 %	0 %	50 %	0 %	386044643
54110	NC_017544	TAG	2	6	2364843	2364848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044643
54111	NC_017544	CAA	2	6	2364858	2364863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044643
54112	NC_017544	CTT	2	6	2364894	2364899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044643
54113	NC_017544	GATA	2	8	2364908	2364915	50 %	25 %	25 %	0 %	386044643
54114	NC_017544	TCC	2	6	2364931	2364936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386044644
54115	NC_017544	GCA	2	6	2365003	2365008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044644
54116	NC_017544	TTTG	2	8	2365155	2365162	0 %	75 %	25 %	0 %	386044644
54117	NC_017544	ATTGA	2	10	2365381	2365390	40 %	40 %	20 %	0 %	386044644
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54119	NC_017544	T	6	6	2365480	2365485	0 %	100 %	0 %	0 %	386044644
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54233	NC_017544	A	7	7	2370814	2370820	100 %	0 %	0 %	0 %	386044650
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54354	NC_017544	GC	3	6	2376399	2376404	0 %	0 %	50 %	50 %	386044656
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54476	NC_017544	TCA	2	6	2381404	2381409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044662
54477	NC_017544	CATC	2	8	2381483	2381490	25 %	25 %	0 %	50 %	386044662
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54479	NC_017544	TTG	2	6	2381545	2381550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044662
54480	NC_017544	ATG	2	6	2381554	2381559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044662
54481	NC_017544	TAG	2	6	2381570	2381575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044662
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54483	NC_017544	TTAA	2	8	2381773	2381780	50 %	50 %	0 %	0 %	386044662
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54486	NC_017544	ACT	2	6	2381989	2381994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044662
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54499	NC_017544	TTC	2	6	2382412	2382417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044663
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