MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 5922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017499	TCG	2	6	21822	21827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839657
502	NC_017499	AAAT	2	8	21863	21870	75 %	25 %	0 %	0 %	385839657
503	NC_017499	AGTC	2	8	21880	21887	25 %	25 %	25 %	25 %	385839657
504	NC_017499	ATA	2	6	21893	21898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839657
505	NC_017499	GGCT	2	8	21913	21920	0 %	25 %	50 %	25 %	385839657
506	NC_017499	AGAA	2	8	21932	21939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017499	GA	3	6	21977	21982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017499	TGTAA	2	10	21987	21996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017499	AAG	2	6	22132	22137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839658
510	NC_017499	AGA	2	6	22205	22210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839658
511	NC_017499	GGTT	2	8	22216	22223	0 %	50 %	50 %	0 %	385839658
512	NC_017499	GTA	2	6	22353	22358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839658
513	NC_017499	CTA	2	6	22372	22377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839658
514	NC_017499	TAG	2	6	22459	22464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839658
515	NC_017499	TAT	2	6	22484	22489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839658
516	NC_017499	AT	3	6	22493	22498	50 %	50 %	0 %	0 %	385839658
517	NC_017499	AGT	2	6	22556	22561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839658
518	NC_017499	TGA	2	6	22604	22609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839658
519	NC_017499	GATT	2	8	22618	22625	25 %	50 %	25 %	0 %	385839658
520	NC_017499	ACA	2	6	22656	22661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839658
521	NC_017499	GAA	2	6	22704	22709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839658
522	NC_017499	T	6	6	22815	22820	0 %	100 %	0 %	0 %	385839658
523	NC_017499	CTG	2	6	22892	22897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017499	AAT	2	6	22917	22922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017499	AACA	2	8	22999	23006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_017499	A	6	6	23020	23025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017499	GTA	2	6	23051	23056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017499	TGGT	2	8	23077	23084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017499	AAC	2	6	23118	23123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017499	CAC	2	6	23147	23152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839659
531	NC_017499	ATC	2	6	23178	23183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839659
532	NC_017499	TTA	2	6	23239	23244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839659
533	NC_017499	ATC	2	6	23346	23351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839659
534	NC_017499	ATA	3	9	23409	23417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839659
535	NC_017499	GT	3	6	23430	23435	0 %	50 %	50 %	0 %	385839659
536	NC_017499	GTC	2	6	23465	23470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839659
537	NC_017499	TA	3	6	23480	23485	50 %	50 %	0 %	0 %	385839659
538	NC_017499	TTG	2	6	23508	23513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839659
539	NC_017499	TAA	2	6	23578	23583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839659
540	NC_017499	TCT	2	6	23710	23715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839659
541	NC_017499	ATT	2	6	23721	23726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839659
542	NC_017499	TTC	2	6	23733	23738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839659
543	NC_017499	CTG	2	6	23807	23812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839659
544	NC_017499	TCA	2	6	23833	23838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839659
545	NC_017499	T	6	6	23913	23918	0 %	100 %	0 %	0 %	385839659
546	NC_017499	TA	3	6	23951	23956	50 %	50 %	0 %	0 %	385839659
547	NC_017499	ATT	2	6	23982	23987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839659
548	NC_017499	GCC	2	6	24006	24011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839659
549	NC_017499	ATT	2	6	24036	24041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839659
550	NC_017499	GTA	2	6	24085	24090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839659
551	NC_017499	T	6	6	24102	24107	0 %	100 %	0 %	0 %	385839659
552	NC_017499	ATCA	2	8	24141	24148	50 %	25 %	0 %	25 %	385839659
553	NC_017499	T	6	6	24166	24171	0 %	100 %	0 %	0 %	385839659
554	NC_017499	TCA	2	6	24176	24181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839659
555	NC_017499	AT	3	6	24235	24240	50 %	50 %	0 %	0 %	385839659
556	NC_017499	GTA	2	6	24267	24272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839659
557	NC_017499	CAC	2	6	24350	24355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839659
558	NC_017499	T	6	6	24387	24392	0 %	100 %	0 %	0 %	385839659
559	NC_017499	ACT	2	6	24475	24480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839659
560	NC_017499	TTA	2	6	24502	24507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839659
561	NC_017499	ATC	3	9	24531	24539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839659
562	NC_017499	AATA	2	8	24549	24556	75 %	25 %	0 %	0 %	385839659
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564	NC_017499	TAA	2	6	24654	24659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839659
565	NC_017499	TAA	2	6	24669	24674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839659
566	NC_017499	TACA	2	8	24725	24732	50 %	25 %	0 %	25 %	385839659
567	NC_017499	TAAC	2	8	24770	24777	50 %	25 %	0 %	25 %	385839659
568	NC_017499	TAA	2	6	24796	24801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839659
569	NC_017499	TTAA	2	8	24809	24816	50 %	50 %	0 %	0 %	385839659
570	NC_017499	AAAG	2	8	24914	24921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017499	CAC	2	6	24945	24950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_017499	AAG	2	6	24961	24966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017499	GAA	2	6	25014	25019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839660
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576	NC_017499	GTA	2	6	25171	25176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839660
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579	NC_017499	ATT	2	6	25236	25241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839660
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581	NC_017499	TGA	3	9	25296	25304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839660
582	NC_017499	TTA	2	6	25313	25318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839660
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584	NC_017499	TGA	2	6	25422	25427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839660
585	NC_017499	ATT	2	6	25442	25447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839660
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587	NC_017499	A	6	6	25474	25479	100 %	0 %	0 %	0 %	385839660
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591	NC_017499	GAT	2	6	25605	25610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839660
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594	NC_017499	TA	3	6	25757	25762	50 %	50 %	0 %	0 %	385839660
595	NC_017499	ATT	2	6	25821	25826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839660
596	NC_017499	A	6	6	25838	25843	100 %	0 %	0 %	0 %	385839660
597	NC_017499	AAG	2	6	25855	25860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839660
598	NC_017499	ATG	2	6	25862	25867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839660
599	NC_017499	A	6	6	25870	25875	100 %	0 %	0 %	0 %	385839660
600	NC_017499	GGA	2	6	25890	25895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385839660
601	NC_017499	TGA	2	6	25971	25976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839660
602	NC_017499	GAT	2	6	26044	26049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839660
603	NC_017499	A	7	7	26116	26122	100 %	0 %	0 %	0 %	385839660
604	NC_017499	A	8	8	26169	26176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017499	AGGT	2	8	26187	26194	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017499	TAA	2	6	26203	26208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017499	ATA	2	6	26221	26226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017499	AGT	2	6	26347	26352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839661
609	NC_017499	AAT	2	6	26408	26413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839661
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611	NC_017499	T	6	6	26517	26522	0 %	100 %	0 %	0 %	385839661
612	NC_017499	TTTC	2	8	26559	26566	0 %	75 %	0 %	25 %	385839661
613	NC_017499	ATC	2	6	26596	26601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839661
614	NC_017499	TGG	2	6	26634	26639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839661
615	NC_017499	TTA	2	6	26678	26683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839661
616	NC_017499	TTG	2	6	26692	26697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839661
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618	NC_017499	CAG	2	6	26796	26801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839661
619	NC_017499	ATA	2	6	26817	26822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839661
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621	NC_017499	TCT	2	6	26853	26858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839661
622	NC_017499	TCTT	2	8	26862	26869	0 %	75 %	0 %	25 %	385839661
623	NC_017499	T	6	6	26868	26873	0 %	100 %	0 %	0 %	385839661
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628	NC_017499	ATTT	2	8	26991	26998	25 %	75 %	0 %	0 %	385839661
629	NC_017499	ATGTAA	2	12	27027	27038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385839661
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