MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_017491	CTA	2	6	2350209	2350214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44002	NC_017491	ATA	2	6	2350324	2350329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836211
44003	NC_017491	AAG	2	6	2350379	2350384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836211
44004	NC_017491	TCA	2	6	2350679	2350684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836211
44005	NC_017491	TGC	2	6	2350757	2350762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836211
44006	NC_017491	TC	3	6	2350797	2350802	0 %	50 %	0 %	50 %	385836211
44007	NC_017491	TGC	2	6	2350847	2350852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836211
44008	NC_017491	T	6	6	2350949	2350954	0 %	100 %	0 %	0 %	385836211
44009	NC_017491	TTG	2	6	2350969	2350974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836211
44010	NC_017491	CGC	2	6	2351026	2351031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836211
44011	NC_017491	T	7	7	2351108	2351114	0 %	100 %	0 %	0 %	385836211
44012	NC_017491	CTG	2	6	2351148	2351153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836211
44013	NC_017491	TGT	2	6	2351195	2351200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836211
44014	NC_017491	A	6	6	2351226	2351231	100 %	0 %	0 %	0 %	385836211
44015	NC_017491	TGC	2	6	2351273	2351278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836211
44016	NC_017491	TGC	2	6	2351303	2351308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836211
44017	NC_017491	ATTTG	2	10	2351316	2351325	20 %	60 %	20 %	0 %	385836211
44018	NC_017491	TTC	2	6	2351369	2351374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836211
44019	NC_017491	CTT	2	6	2351385	2351390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836211
44020	NC_017491	GGC	2	6	2351416	2351421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836211
44021	NC_017491	AAGAA	2	10	2351522	2351531	80 %	0 %	20 %	0 %	385836211
44022	NC_017491	ATA	2	6	2351543	2351548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836211
44023	NC_017491	ATC	2	6	2351549	2351554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836211
44024	NC_017491	T	6	6	2351602	2351607	0 %	100 %	0 %	0 %	385836211
44025	NC_017491	CAT	2	6	2351614	2351619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836211
44026	NC_017491	CTCAC	2	10	2351626	2351635	20 %	20 %	0 %	60 %	385836212
44027	NC_017491	GC	3	6	2351647	2351652	0 %	0 %	50 %	50 %	385836212
44028	NC_017491	TAA	2	6	2351654	2351659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44029	NC_017491	AAC	2	6	2351672	2351677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836212
44030	NC_017491	CAC	2	6	2351719	2351724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836212
44031	NC_017491	CAA	2	6	2351763	2351768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836212
44032	NC_017491	AAT	2	6	2351770	2351775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44033	NC_017491	CTG	2	6	2351837	2351842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836212
44034	NC_017491	ACA	2	6	2351877	2351882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836212
44035	NC_017491	GCT	2	6	2351904	2351909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836212
44036	NC_017491	TGC	2	6	2351928	2351933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836212
44037	NC_017491	CTG	2	6	2351959	2351964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836212
44038	NC_017491	A	6	6	2352078	2352083	100 %	0 %	0 %	0 %	385836212
44039	NC_017491	AT	3	6	2352110	2352115	50 %	50 %	0 %	0 %	385836212
44040	NC_017491	TGT	2	6	2352124	2352129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836212
44041	NC_017491	TAA	2	6	2352205	2352210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44042	NC_017491	T	6	6	2352290	2352295	0 %	100 %	0 %	0 %	385836212
44043	NC_017491	TTCA	2	8	2352415	2352422	25 %	50 %	0 %	25 %	385836212
44044	NC_017491	TGA	2	6	2352468	2352473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836212
44045	NC_017491	CAG	2	6	2352502	2352507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836212
44046	NC_017491	AAT	2	6	2352751	2352756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44047	NC_017491	ACGGC	2	10	2352846	2352855	20 %	0 %	40 %	40 %	385836212
44048	NC_017491	AAC	2	6	2352935	2352940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836212
44049	NC_017491	AAT	2	6	2352967	2352972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44050	NC_017491	TC	3	6	2353002	2353007	0 %	50 %	0 %	50 %	385836212
44051	NC_017491	CCG	2	6	2353012	2353017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836212
44052	NC_017491	A	7	7	2353023	2353029	100 %	0 %	0 %	0 %	385836212
44053	NC_017491	A	6	6	2353109	2353114	100 %	0 %	0 %	0 %	385836212
44054	NC_017491	GCA	2	6	2353140	2353145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836212
44055	NC_017491	CCA	2	6	2353152	2353157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836212
44056	NC_017491	ATC	2	6	2353172	2353177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836212
44057	NC_017491	TCG	2	6	2353182	2353187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836212
44058	NC_017491	TA	3	6	2353204	2353209	50 %	50 %	0 %	0 %	385836212
44059	NC_017491	AAT	2	6	2353216	2353221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44060	NC_017491	A	6	6	2353229	2353234	100 %	0 %	0 %	0 %	385836212
44061	NC_017491	AAT	2	6	2353279	2353284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44062	NC_017491	ATA	2	6	2353292	2353297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836212
44063	NC_017491	CAAA	2	8	2353329	2353336	75 %	0 %	0 %	25 %	385836212
44064	NC_017491	TCC	2	6	2353346	2353351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836212
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44068	NC_017491	CGT	2	6	2353645	2353650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836212
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44072	NC_017491	GT	3	6	2353811	2353816	0 %	50 %	50 %	0 %	385836212
44073	NC_017491	AATTG	2	10	2353845	2353854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44074	NC_017491	A	6	6	2353881	2353886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44075	NC_017491	AT	3	6	2353976	2353981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44077	NC_017491	ATT	2	6	2354024	2354029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44078	NC_017491	TTC	2	6	2354050	2354055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44082	NC_017491	A	6	6	2354280	2354285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44083	NC_017491	ATT	2	6	2354386	2354391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836214
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44086	NC_017491	CTTTC	2	10	2354447	2354456	0 %	60 %	0 %	40 %	385836214
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44090	NC_017491	A	7	7	2354586	2354592	100 %	0 %	0 %	0 %	385836214
44091	NC_017491	TCT	2	6	2354609	2354614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836214
44092	NC_017491	AACTT	2	10	2354633	2354642	40 %	40 %	0 %	20 %	385836214
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44098	NC_017491	TTAT	2	8	2354848	2354855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44099	NC_017491	CTT	2	6	2354931	2354936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836215
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44102	NC_017491	CG	3	6	2355054	2355059	0 %	0 %	50 %	50 %	385836215
44103	NC_017491	AGC	2	6	2355076	2355081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836215
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44105	NC_017491	ACTT	2	8	2355121	2355128	25 %	50 %	0 %	25 %	385836215
44106	NC_017491	AGCTT	2	10	2355139	2355148	20 %	40 %	20 %	20 %	385836215
44107	NC_017491	ATC	2	6	2355155	2355160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836215
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44112	NC_017491	CCCG	2	8	2355465	2355472	0 %	0 %	25 %	75 %	385836215
44113	NC_017491	TTG	3	9	2355487	2355495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836215
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44226	NC_017491	TTTC	2	8	2361264	2361271	0 %	75 %	0 %	25 %	385836225
44227	NC_017491	ACTG	2	8	2361479	2361486	25 %	25 %	25 %	25 %	385836226
44228	NC_017491	TGCT	2	8	2361684	2361691	0 %	50 %	25 %	25 %	385836227
44229	NC_017491	TGA	2	6	2361746	2361751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836227
44230	NC_017491	T	7	7	2361873	2361879	0 %	100 %	0 %	0 %	385836227
44231	NC_017491	T	7	7	2361894	2361900	0 %	100 %	0 %	0 %	385836227
44232	NC_017491	TGT	2	6	2361962	2361967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836227
44233	NC_017491	TAT	2	6	2362071	2362076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44234	NC_017491	GGC	2	6	2362096	2362101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836228
44235	NC_017491	AAT	2	6	2362114	2362119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836228
44236	NC_017491	GAC	2	6	2362126	2362131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836228
44237	NC_017491	CAA	2	6	2362143	2362148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836228
44238	NC_017491	GCT	2	6	2362207	2362212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836228
44239	NC_017491	CGC	2	6	2362219	2362224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836228
44240	NC_017491	GCC	2	6	2362246	2362251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836228
44241	NC_017491	GT	3	6	2362599	2362604	0 %	50 %	50 %	0 %	385836228
44242	NC_017491	ACA	2	6	2362635	2362640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836228
44243	NC_017491	AAG	2	6	2362653	2362658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836228
44244	NC_017491	AATG	2	8	2362726	2362733	50 %	25 %	25 %	0 %	385836228
44245	NC_017491	CTG	2	6	2362746	2362751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836228
44246	NC_017491	ACCA	2	8	2362894	2362901	50 %	0 %	0 %	50 %	385836228
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44248	NC_017491	AACC	2	8	2362980	2362987	50 %	0 %	0 %	50 %	385836228
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44258	NC_017491	A	7	7	2363588	2363594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44259	NC_017491	CAA	2	6	2363680	2363685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44263	NC_017491	TCC	2	6	2364029	2364034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44264	NC_017491	TCA	2	6	2364275	2364280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44271	NC_017491	GTT	2	6	2364543	2364548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836230
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44273	NC_017491	TGACA	2	10	2364649	2364658	40 %	20 %	20 %	20 %	385836230
44274	NC_017491	CCT	2	6	2364662	2364667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44275	NC_017491	CTTT	2	8	2364904	2364911	0 %	75 %	0 %	25 %	385836231
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44279	NC_017491	GAACT	2	10	2365227	2365236	40 %	20 %	20 %	20 %	385836231
44280	NC_017491	ATCA	2	8	2365239	2365246	50 %	25 %	0 %	25 %	385836231
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44293	NC_017491	ATA	2	6	2366130	2366135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44335	NC_017491	GAT	3	9	2368445	2368453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836235
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44338	NC_017491	TCGC	2	8	2368491	2368498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44339	NC_017491	GTG	2	6	2368526	2368531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44340	NC_017491	AGCT	2	8	2368644	2368651	25 %	25 %	25 %	25 %	385836236
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44343	NC_017491	GCG	2	6	2368685	2368690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836236
44344	NC_017491	CCA	2	6	2368763	2368768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836236
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44349	NC_017491	CGG	2	6	2369069	2369074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836236
44350	NC_017491	ATTT	2	8	2369135	2369142	25 %	75 %	0 %	0 %	385836236
44351	NC_017491	CCG	2	6	2369234	2369239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836236
44352	NC_017491	CAG	2	6	2369438	2369443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836236
44353	NC_017491	TGA	2	6	2369572	2369577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836236
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44355	NC_017491	TGTT	2	8	2369600	2369607	0 %	75 %	25 %	0 %	385836236
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