MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_017491	CCTGCT	2	12	2323577	2323588	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43502	NC_017491	TCGT	2	8	2323691	2323698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43503	NC_017491	CAT	2	6	2323791	2323796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43504	NC_017491	AAGA	2	8	2323800	2323807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43505	NC_017491	AAG	2	6	2323817	2323822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43506	NC_017491	CAAGG	2	10	2323834	2323843	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43507	NC_017491	TGA	2	6	2323844	2323849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43508	NC_017491	GCA	2	6	2323872	2323877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43509	NC_017491	TTC	2	6	2323883	2323888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43510	NC_017491	TCG	2	6	2323907	2323912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43511	NC_017491	AAC	2	6	2323961	2323966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836187
43512	NC_017491	GCG	2	6	2324022	2324027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836187
43513	NC_017491	ATTG	2	8	2324072	2324079	25 %	50 %	25 %	0 %	385836187
43514	NC_017491	A	6	6	2324271	2324276	100 %	0 %	0 %	0 %	385836187
43515	NC_017491	TAAT	2	8	2324281	2324288	50 %	50 %	0 %	0 %	385836187
43516	NC_017491	TGAT	2	8	2324389	2324396	25 %	50 %	25 %	0 %	385836187
43517	NC_017491	ATT	2	6	2324415	2324420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836187
43518	NC_017491	ATC	2	6	2324446	2324451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836187
43519	NC_017491	TTA	2	6	2324481	2324486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836187
43520	NC_017491	CAT	2	6	2324517	2324522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836187
43521	NC_017491	CAA	2	6	2324576	2324581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836187
43522	NC_017491	TCA	2	6	2324587	2324592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836187
43523	NC_017491	GAG	2	6	2324607	2324612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836187
43524	NC_017491	AGC	2	6	2324678	2324683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836187
43525	NC_017491	GTC	2	6	2324765	2324770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836187
43526	NC_017491	TTCA	2	8	2324778	2324785	25 %	50 %	0 %	25 %	385836187
43527	NC_017491	TGC	2	6	2324803	2324808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836187
43528	NC_017491	GCGG	2	8	2324893	2324900	0 %	0 %	75 %	25 %	385836187
43529	NC_017491	TCAA	2	8	2324923	2324930	50 %	25 %	0 %	25 %	385836187
43530	NC_017491	TGC	2	6	2324975	2324980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836187
43531	NC_017491	A	6	6	2325065	2325070	100 %	0 %	0 %	0 %	385836187
43532	NC_017491	A	6	6	2325091	2325096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43533	NC_017491	TCG	2	6	2325199	2325204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43534	NC_017491	CGC	2	6	2325209	2325214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836188
43535	NC_017491	CGTG	2	8	2325231	2325238	0 %	25 %	50 %	25 %	385836188
43536	NC_017491	ACA	2	6	2325321	2325326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836188
43537	NC_017491	GGA	2	6	2325343	2325348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836188
43538	NC_017491	ATG	2	6	2325378	2325383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836188
43539	NC_017491	TG	3	6	2325403	2325408	0 %	50 %	50 %	0 %	385836188
43540	NC_017491	CTT	2	6	2325427	2325432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836188
43541	NC_017491	CCA	2	6	2325442	2325447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836188
43542	NC_017491	TCT	2	6	2325489	2325494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836188
43543	NC_017491	TCA	2	6	2325537	2325542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836188
43544	NC_017491	GCA	2	6	2325576	2325581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43545	NC_017491	GCT	2	6	2325592	2325597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43546	NC_017491	ACA	2	6	2325672	2325677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836188
43547	NC_017491	TGCGCA	2	12	2325699	2325710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43548	NC_017491	GCCC	2	8	2325731	2325738	0 %	0 %	25 %	75 %	385836188
43549	NC_017491	TTAA	2	8	2325780	2325787	50 %	50 %	0 %	0 %	385836188
43550	NC_017491	CCA	2	6	2325795	2325800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836188
43551	NC_017491	CAT	2	6	2325836	2325841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836188
43552	NC_017491	GCA	3	9	2326008	2326016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43553	NC_017491	ATC	2	6	2326047	2326052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836188
43554	NC_017491	ACC	2	6	2326056	2326061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836188
43555	NC_017491	GGC	2	6	2326145	2326150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836188
43556	NC_017491	CTG	2	6	2326165	2326170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43557	NC_017491	CGG	2	6	2326189	2326194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836188
43558	NC_017491	TGC	2	6	2326232	2326237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43559	NC_017491	CAA	2	6	2326307	2326312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836188
43560	NC_017491	GTC	2	6	2326332	2326337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43561	NC_017491	CGC	2	6	2326355	2326360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836188
43562	NC_017491	TGC	2	6	2326367	2326372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836188
43563	NC_017491	GTG	2	6	2326398	2326403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836188
43564	NC_017491	TCC	2	6	2326421	2326426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43565	NC_017491	T	6	6	2326454	2326459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43566	NC_017491	GTTC	2	8	2326467	2326474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43567	NC_017491	AAT	2	6	2326579	2326584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836189
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43578	NC_017491	GCC	2	6	2327207	2327212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836189
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43584	NC_017491	T	6	6	2327434	2327439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43585	NC_017491	CTA	2	6	2327527	2327532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43586	NC_017491	TGA	2	6	2327538	2327543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43588	NC_017491	CAT	2	6	2327671	2327676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43589	NC_017491	CAA	2	6	2327677	2327682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43590	NC_017491	CT	3	6	2327696	2327701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43591	NC_017491	AGC	2	6	2327780	2327785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836190
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43594	NC_017491	AGGA	2	8	2327835	2327842	50 %	0 %	50 %	0 %	385836190
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43598	NC_017491	TTG	2	6	2327993	2327998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43599	NC_017491	TTCT	2	8	2328023	2328030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43600	NC_017491	AAG	2	6	2328055	2328060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43601	NC_017491	ATG	2	6	2328066	2328071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43602	NC_017491	ACC	2	6	2328113	2328118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43603	NC_017491	CAT	2	6	2328167	2328172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43604	NC_017491	A	6	6	2328212	2328217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43605	NC_017491	TTG	2	6	2328285	2328290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43606	NC_017491	AT	3	6	2328371	2328376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43607	NC_017491	TCAT	2	8	2328398	2328405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43608	NC_017491	AAAC	2	8	2328408	2328415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43609	NC_017491	T	6	6	2328453	2328458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43610	NC_017491	AT	3	6	2328468	2328473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43611	NC_017491	CAA	2	6	2328521	2328526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43612	NC_017491	GCC	2	6	2328795	2328800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836191
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43614	NC_017491	TTG	2	6	2328910	2328915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836191
43615	NC_017491	AAT	2	6	2328917	2328922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836191
43616	NC_017491	TCT	2	6	2328930	2328935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836191
43617	NC_017491	GT	3	6	2328943	2328948	0 %	50 %	50 %	0 %	385836191
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