MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_017491	CTG	2	6	2219602	2219607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836092
41502	NC_017491	TG	4	8	2219713	2219720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41503	NC_017491	CG	3	6	2219787	2219792	0 %	0 %	50 %	50 %	385836093
41504	NC_017491	GCT	2	6	2219819	2219824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836093
41505	NC_017491	ATC	2	6	2219940	2219945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836093
41506	NC_017491	CGC	2	6	2219980	2219985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836093
41507	NC_017491	ATG	2	6	2220078	2220083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836093
41508	NC_017491	TTG	2	6	2220150	2220155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836093
41509	NC_017491	GCT	2	6	2220188	2220193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836093
41510	NC_017491	TGG	2	6	2220360	2220365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836093
41511	NC_017491	GCG	2	6	2220416	2220421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836093
41512	NC_017491	ATTTT	2	10	2220432	2220441	20 %	80 %	0 %	0 %	385836093
41513	NC_017491	TTG	2	6	2220483	2220488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836093
41514	NC_017491	CTA	2	6	2220545	2220550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836093
41515	NC_017491	ATC	2	6	2220567	2220572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836093
41516	NC_017491	TTC	2	6	2220654	2220659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836093
41517	NC_017491	TGAT	2	8	2220661	2220668	25 %	50 %	25 %	0 %	385836093
41518	NC_017491	AC	3	6	2220728	2220733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41519	NC_017491	T	6	6	2220751	2220756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41520	NC_017491	TTGC	2	8	2220842	2220849	0 %	50 %	25 %	25 %	385836094
41521	NC_017491	AAG	2	6	2220866	2220871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836094
41522	NC_017491	CCCA	2	8	2220878	2220885	25 %	0 %	0 %	75 %	385836094
41523	NC_017491	GTTG	2	8	2221002	2221009	0 %	50 %	50 %	0 %	385836094
41524	NC_017491	GTC	2	6	2221037	2221042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41525	NC_017491	GCC	2	6	2221043	2221048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836094
41526	NC_017491	GT	3	6	2221066	2221071	0 %	50 %	50 %	0 %	385836094
41527	NC_017491	CAAAC	2	10	2221412	2221421	60 %	0 %	0 %	40 %	385836094
41528	NC_017491	GCT	2	6	2221461	2221466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41529	NC_017491	GCA	2	6	2221473	2221478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41530	NC_017491	GCA	2	6	2221587	2221592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41531	NC_017491	CGG	2	6	2221627	2221632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836094
41532	NC_017491	CTG	2	6	2221642	2221647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41533	NC_017491	TAG	2	6	2221760	2221765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836094
41534	NC_017491	TTG	2	6	2221772	2221777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836094
41535	NC_017491	CTG	2	6	2221780	2221785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41536	NC_017491	CAAC	2	8	2221795	2221802	50 %	0 %	0 %	50 %	385836094
41537	NC_017491	GGT	2	6	2221814	2221819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836094
41538	NC_017491	GTT	2	6	2221827	2221832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836094
41539	NC_017491	CCGAT	2	10	2221885	2221894	20 %	20 %	20 %	40 %	385836094
41540	NC_017491	GCT	2	6	2221941	2221946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41541	NC_017491	GTT	2	6	2221980	2221985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836094
41542	NC_017491	ATC	2	6	2222009	2222014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836094
41543	NC_017491	GCC	2	6	2222144	2222149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836094
41544	NC_017491	CTG	3	9	2222176	2222184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41545	NC_017491	CTT	2	6	2222203	2222208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836094
41546	NC_017491	TTG	2	6	2222236	2222241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836094
41547	NC_017491	TCT	2	6	2222254	2222259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836094
41548	NC_017491	ATA	2	6	2222267	2222272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836094
41549	NC_017491	AAT	2	6	2222452	2222457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836094
41550	NC_017491	ATC	2	6	2222675	2222680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836094
41551	NC_017491	GTC	3	9	2222715	2222723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41552	NC_017491	T	6	6	2222841	2222846	0 %	100 %	0 %	0 %	385836094
41553	NC_017491	CAT	2	6	2222857	2222862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836094
41554	NC_017491	CTG	2	6	2222879	2222884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41555	NC_017491	CATCTT	2	12	2222902	2222913	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385836094
41556	NC_017491	TAT	2	6	2222932	2222937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836094
41557	NC_017491	GCC	2	6	2223123	2223128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836094
41558	NC_017491	TAAC	2	8	2223154	2223161	50 %	25 %	0 %	25 %	385836094
41559	NC_017491	TCG	2	6	2223196	2223201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41560	NC_017491	GTC	2	6	2223264	2223269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41561	NC_017491	TGC	2	6	2223276	2223281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41562	NC_017491	CAG	2	6	2223313	2223318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836094
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41564	NC_017491	TAA	2	6	2223415	2223420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836094
41565	NC_017491	TGAT	2	8	2223461	2223468	25 %	50 %	25 %	0 %	385836094
41566	NC_017491	ATT	2	6	2223509	2223514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836094
41567	NC_017491	CAG	2	6	2223580	2223585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41568	NC_017491	GTC	2	6	2223594	2223599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41569	NC_017491	CGC	2	6	2223805	2223810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836094
41570	NC_017491	ATA	2	6	2223884	2223889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836094
41571	NC_017491	AGTA	2	8	2223916	2223923	50 %	25 %	25 %	0 %	385836094
41572	NC_017491	ATA	2	6	2223944	2223949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836094
41573	NC_017491	CTG	2	6	2223972	2223977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41574	NC_017491	GTT	2	6	2223981	2223986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836094
41575	NC_017491	GTA	2	6	2224046	2224051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836094
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41577	NC_017491	TTGC	2	8	2224121	2224128	0 %	50 %	25 %	25 %	385836094
41578	NC_017491	ACTG	2	8	2224159	2224166	25 %	25 %	25 %	25 %	385836094
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41580	NC_017491	AAG	2	6	2224275	2224280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836094
41581	NC_017491	AT	3	6	2224284	2224289	50 %	50 %	0 %	0 %	385836094
41582	NC_017491	CAT	2	6	2224309	2224314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836094
41583	NC_017491	CAA	2	6	2224339	2224344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836094
41584	NC_017491	CAG	2	6	2224615	2224620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41585	NC_017491	AAC	2	6	2224637	2224642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836094
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41587	NC_017491	CCA	2	6	2224687	2224692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836094
41588	NC_017491	GA	3	6	2224714	2224719	50 %	0 %	50 %	0 %	385836094
41589	NC_017491	ATT	2	6	2224727	2224732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836094
41590	NC_017491	TAT	2	6	2224843	2224848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836094
41591	NC_017491	TTG	2	6	2224929	2224934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836094
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41594	NC_017491	CAT	2	6	2225200	2225205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836094
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41597	NC_017491	ACTTA	2	10	2225339	2225348	40 %	40 %	0 %	20 %	385836094
41598	NC_017491	TCT	2	6	2225377	2225382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836094
41599	NC_017491	CAA	2	6	2225395	2225400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836094
41600	NC_017491	TGA	2	6	2225476	2225481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836094
41601	NC_017491	ATA	2	6	2225564	2225569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836094
41602	NC_017491	TTG	2	6	2225574	2225579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836094
41603	NC_017491	CTG	2	6	2225617	2225622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
41604	NC_017491	GTC	2	6	2225784	2225789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836094
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41606	NC_017491	TTGG	2	8	2225862	2225869	0 %	50 %	50 %	0 %	385836094
41607	NC_017491	ATC	2	6	2225870	2225875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836094
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41611	NC_017491	TAA	2	6	2226207	2226212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836094
41612	NC_017491	GACTTT	2	12	2226272	2226283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385836094
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