MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017491	CGT	2	6	155262	155267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834082
3002	NC_017491	CGGTG	2	10	155325	155334	0 %	20 %	60 %	20 %	385834082
3003	NC_017491	GCC	2	6	155361	155366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834082
3004	NC_017491	CATT	2	8	155397	155404	25 %	50 %	0 %	25 %	385834082
3005	NC_017491	TGAT	2	8	155453	155460	25 %	50 %	25 %	0 %	385834082
3006	NC_017491	TGG	2	6	155583	155588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834082
3007	NC_017491	TGAT	2	8	155672	155679	25 %	50 %	25 %	0 %	385834082
3008	NC_017491	CAC	2	6	155685	155690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834082
3009	NC_017491	AAG	2	6	155719	155724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834082
3010	NC_017491	ATG	2	6	155732	155737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834082
3011	NC_017491	TCTGGG	2	12	155874	155885	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385834082
3012	NC_017491	CCA	2	6	155999	156004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834082
3013	NC_017491	TTA	2	6	156155	156160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834082
3014	NC_017491	GAA	2	6	156226	156231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834082
3015	NC_017491	AAGG	2	8	156247	156254	50 %	0 %	50 %	0 %	385834082
3016	NC_017491	GAAC	2	8	156271	156278	50 %	0 %	25 %	25 %	385834082
3017	NC_017491	CCGATA	2	12	156344	156355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385834082
3018	NC_017491	GAA	2	6	156453	156458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834082
3019	NC_017491	GAT	2	6	156502	156507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834082
3020	NC_017491	ACTG	2	8	156573	156580	25 %	25 %	25 %	25 %	385834082
3021	NC_017491	AAG	2	6	156604	156609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834082
3022	NC_017491	TAC	2	6	156643	156648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834082
3023	NC_017491	GTC	2	6	156952	156957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834082
3024	NC_017491	CAA	2	6	156987	156992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834082
3025	NC_017491	ACGG	2	8	157007	157014	25 %	0 %	50 %	25 %	385834082
3026	NC_017491	GAA	2	6	157018	157023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834082
3027	NC_017491	ATC	2	6	157024	157029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834082
3028	NC_017491	CGC	2	6	157075	157080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834082
3029	NC_017491	ATA	2	6	157116	157121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017491	TTG	2	6	157339	157344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017491	ATT	2	6	157347	157352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017491	TCT	2	6	157369	157374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017491	CCT	2	6	157376	157381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_017491	GCG	2	6	157415	157420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017491	TGA	2	6	157689	157694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017491	GC	3	6	157699	157704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_017491	GGC	2	6	157764	157769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017491	ATCC	2	8	157829	157836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_017491	AGC	2	6	157880	157885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017491	AGG	2	6	157901	157906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017491	TCG	2	6	157907	157912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017491	GATG	2	8	157926	157933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017491	GAC	2	6	157941	157946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017491	AAGC	2	8	158027	158034	50 %	0 %	25 %	25 %	385834083
3045	NC_017491	GAT	3	9	158045	158053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834083
3046	NC_017491	GACGAG	2	12	158087	158098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385834083
3047	NC_017491	CCA	2	6	158240	158245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834083
3048	NC_017491	GCC	2	6	158292	158297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834083
3049	NC_017491	CAT	2	6	158306	158311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834083
3050	NC_017491	CAG	2	6	158317	158322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834083
3051	NC_017491	TAA	2	6	158371	158376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834083
3052	NC_017491	TCG	2	6	158397	158402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834083
3053	NC_017491	TTG	2	6	158519	158524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834083
3054	NC_017491	TG	3	6	158548	158553	0 %	50 %	50 %	0 %	385834083
3055	NC_017491	CTG	2	6	158564	158569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834083
3056	NC_017491	ACC	2	6	158595	158600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_017491	AGG	2	6	158623	158628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017491	GCAAG	2	10	158638	158647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3059	NC_017491	GC	3	6	158661	158666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_017491	A	6	6	158737	158742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017491	AAAT	2	8	158746	158753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017491	ATC	2	6	158811	158816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017491	T	7	7	158925	158931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017491	CAAA	2	8	159064	159071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_017491	CCAC	2	8	159099	159106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3066	NC_017491	A	6	6	159121	159126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017491	CACC	2	8	159174	159181	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3068	NC_017491	CGGC	2	8	159206	159213	0 %	0 %	50 %	50 %	385834084
3069	NC_017491	CTT	2	6	159225	159230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834084
3070	NC_017491	AGA	2	6	159407	159412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834084
3071	NC_017491	CGC	2	6	159471	159476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834084
3072	NC_017491	CGGA	2	8	159491	159498	25 %	0 %	50 %	25 %	385834084
3073	NC_017491	ATG	2	6	159625	159630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834084
3074	NC_017491	TAA	2	6	159660	159665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834084
3075	NC_017491	TCG	2	6	159679	159684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834084
3076	NC_017491	TGC	2	6	159779	159784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834084
3077	NC_017491	TTGA	2	8	159829	159836	25 %	50 %	25 %	0 %	385834084
3078	NC_017491	GAT	2	6	159946	159951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834084
3079	NC_017491	ACAA	2	8	159966	159973	75 %	0 %	0 %	25 %	385834084
3080	NC_017491	ATA	2	6	159988	159993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834084
3081	NC_017491	CAG	2	6	160088	160093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834084
3082	NC_017491	CAA	2	6	160101	160106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834084
3083	NC_017491	CAA	2	6	160124	160129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834084
3084	NC_017491	TCCC	2	8	160188	160195	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3085	NC_017491	CTG	2	6	160447	160452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834085
3086	NC_017491	TTG	2	6	160507	160512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834085
3087	NC_017491	TCT	2	6	160574	160579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834085
3088	NC_017491	TCG	2	6	160655	160660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834085
3089	NC_017491	GCC	2	6	160702	160707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834085
3090	NC_017491	TGC	2	6	160757	160762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834085
3091	NC_017491	GCA	2	6	160886	160891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834085
3092	NC_017491	AAG	2	6	160934	160939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834085
3093	NC_017491	TGG	2	6	160992	160997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834085
3094	NC_017491	ATC	2	6	161089	161094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834085
3095	NC_017491	ATG	2	6	161111	161116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834085
3096	NC_017491	AAT	2	6	161184	161189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834085
3097	NC_017491	TCC	2	6	161237	161242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385834085
3098	NC_017491	GCA	2	6	161273	161278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834085
3099	NC_017491	T	6	6	161350	161355	0 %	100 %	0 %	0 %	385834085
3100	NC_017491	CTTT	2	8	161404	161411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_017491	T	6	6	161449	161454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017491	TGAA	2	8	161551	161558	50 %	25 %	25 %	0 %	385834086
3103	NC_017491	A	6	6	161567	161572	100 %	0 %	0 %	0 %	385834086
3104	NC_017491	GGA	2	6	161603	161608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385834086
3105	NC_017491	CTG	2	6	161632	161637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834087
3106	NC_017491	GCCG	2	8	161646	161653	0 %	0 %	50 %	50 %	385834087
3107	NC_017491	CCG	2	6	161676	161681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834087
3108	NC_017491	GT	3	6	161739	161744	0 %	50 %	50 %	0 %	385834087
3109	NC_017491	CAT	2	6	161769	161774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834087
3110	NC_017491	CAT	2	6	161869	161874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_017491	CA	3	6	161922	161927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_017491	GTG	2	6	162134	162139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834088
3113	NC_017491	CAGG	2	8	162146	162153	25 %	0 %	50 %	25 %	385834088
3114	NC_017491	TTG	2	6	162154	162159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834088
3115	NC_017491	AAG	2	6	162193	162198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834088
3116	NC_017491	TGA	2	6	162265	162270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834088
3117	NC_017491	GGC	2	6	162292	162297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834088
3118	NC_017491	TGA	2	6	162299	162304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834088
3119	NC_017491	TTC	2	6	162429	162434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834088
3120	NC_017491	GCC	2	6	162525	162530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834088
3121	NC_017491	CGC	2	6	162609	162614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834088
3122	NC_017491	CTT	2	6	162641	162646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834088
3123	NC_017491	GTT	2	6	162708	162713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834088
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3125	NC_017491	TGC	2	6	162827	162832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834088
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3233	NC_017491	GTT	2	6	168643	168648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_017491	ATA	2	6	168739	168744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_017491	T	6	6	168745	168750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_017491	T	6	6	168763	168768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_017491	GCTT	2	8	168849	168856	0 %	50 %	25 %	25 %	385834095
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3497	NC_017491	A	6	6	181475	181480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_017491	ATA	2	6	181537	181542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_017491	GTTT	2	8	181571	181578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_017491	T	7	7	181595	181601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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