MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_017491	TCC	2	6	2839724	2839729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836713
53003	NC_017491	TGC	2	6	2839768	2839773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836713
53004	NC_017491	CTT	2	6	2839780	2839785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836713
53005	NC_017491	CTT	2	6	2839825	2839830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836713
53006	NC_017491	GC	3	6	2839988	2839993	0 %	0 %	50 %	50 %	385836713
53007	NC_017491	CGC	2	6	2840002	2840007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836713
53008	NC_017491	ATG	2	6	2840037	2840042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836713
53009	NC_017491	CTT	2	6	2840126	2840131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836713
53010	NC_017491	GT	3	6	2840178	2840183	0 %	50 %	50 %	0 %	385836713
53011	NC_017491	CAT	2	6	2840201	2840206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836713
53012	NC_017491	GAA	2	6	2840231	2840236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836713
53013	NC_017491	ATC	2	6	2840322	2840327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836713
53014	NC_017491	TGC	2	6	2840493	2840498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836713
53015	NC_017491	GCT	2	6	2840596	2840601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836713
53016	NC_017491	CAA	3	9	2840612	2840620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836713
53017	NC_017491	AAGT	2	8	2840636	2840643	50 %	25 %	25 %	0 %	385836713
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53019	NC_017491	TGA	2	6	2840749	2840754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836713
53020	NC_017491	CGA	2	6	2840763	2840768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836713
53021	NC_017491	CTT	2	6	2840839	2840844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836713
53022	NC_017491	CTT	2	6	2840848	2840853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836713
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53027	NC_017491	CG	3	6	2840993	2840998	0 %	0 %	50 %	50 %	385836713
53028	NC_017491	TTA	2	6	2841072	2841077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836713
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53032	NC_017491	CAA	2	6	2841419	2841424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836713
53033	NC_017491	TGC	2	6	2841492	2841497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836713
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53035	NC_017491	GTG	2	6	2841616	2841621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53043	NC_017491	GCA	2	6	2841838	2841843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836714
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53053	NC_017491	CAT	2	6	2842240	2842245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836714
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53059	NC_017491	TGC	2	6	2842496	2842501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53076	NC_017491	TA	3	6	2843439	2843444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53088	NC_017491	GCCT	2	8	2844192	2844199	0 %	25 %	25 %	50 %	385836716
53089	NC_017491	GCC	2	6	2844265	2844270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836716
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53106	NC_017491	AGG	2	6	2844972	2844977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53107	NC_017491	AT	3	6	2844978	2844983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53108	NC_017491	A	6	6	2844995	2845000	100 %	0 %	0 %	0 %	385836717
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53116	NC_017491	CAT	2	6	2845468	2845473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836717
53117	NC_017491	AGC	2	6	2845611	2845616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836717
53118	NC_017491	CAA	2	6	2845651	2845656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836717
53119	NC_017491	GCTG	2	8	2845692	2845699	0 %	25 %	50 %	25 %	385836717
53120	NC_017491	GCA	2	6	2845813	2845818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836717
53121	NC_017491	CAC	2	6	2845834	2845839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836717
53122	NC_017491	CGT	2	6	2845983	2845988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836717
53123	NC_017491	CG	3	6	2846037	2846042	0 %	0 %	50 %	50 %	385836717
53124	NC_017491	TCA	2	6	2846129	2846134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836717
53125	NC_017491	GGC	2	6	2846219	2846224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836718
53126	NC_017491	CATC	2	8	2846268	2846275	25 %	25 %	0 %	50 %	385836718
53127	NC_017491	CAA	2	6	2846285	2846290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836718
53128	NC_017491	CAT	2	6	2846350	2846355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836718
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53131	NC_017491	GCA	2	6	2846414	2846419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836718
53132	NC_017491	CGAC	2	8	2846544	2846551	25 %	0 %	25 %	50 %	385836718
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53134	NC_017491	GCA	2	6	2846674	2846679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836718
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53137	NC_017491	TGG	2	6	2846835	2846840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836718
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53144	NC_017491	GCC	3	9	2847272	2847280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836718
53145	NC_017491	ACT	2	6	2847318	2847323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836718
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53147	NC_017491	CCGCA	2	10	2847441	2847450	20 %	0 %	20 %	60 %	385836718
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53149	NC_017491	GGC	2	6	2847515	2847520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836718
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53151	NC_017491	GTAA	2	8	2847601	2847608	50 %	25 %	25 %	0 %	385836718
53152	NC_017491	AAAAT	2	10	2847640	2847649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53153	NC_017491	CAA	2	6	2847709	2847714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53154	NC_017491	TCA	2	6	2847799	2847804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836719
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53162	NC_017491	CAT	2	6	2848169	2848174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836719
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53193	NC_017491	ATC	2	6	2849657	2849662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836721
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53198	NC_017491	ATA	2	6	2850003	2850008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836721
53199	NC_017491	CCG	3	9	2850028	2850036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836721
53200	NC_017491	TCA	2	6	2850109	2850114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836721
53201	NC_017491	GAA	2	6	2850161	2850166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836721
53202	NC_017491	GAA	2	6	2850179	2850184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836721
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53209	NC_017491	GCCG	2	8	2850703	2850710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53210	NC_017491	CTT	2	6	2850711	2850716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53211	NC_017491	GTA	2	6	2850794	2850799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836722
53212	NC_017491	CTAG	2	8	2850855	2850862	25 %	25 %	25 %	25 %	385836722
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53215	NC_017491	TTC	2	6	2851067	2851072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836722
53216	NC_017491	CGC	2	6	2851129	2851134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836722
53217	NC_017491	GCT	2	6	2851161	2851166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836722
53218	NC_017491	AACC	2	8	2851319	2851326	50 %	0 %	0 %	50 %	385836722
53219	NC_017491	GGCT	2	8	2851369	2851376	0 %	25 %	50 %	25 %	385836722
53220	NC_017491	CCAG	2	8	2851428	2851435	25 %	0 %	25 %	50 %	385836722
53221	NC_017491	GTT	2	6	2851450	2851455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836722
53222	NC_017491	TCC	3	9	2851480	2851488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53223	NC_017491	ATTT	2	8	2851504	2851511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53224	NC_017491	GC	3	6	2851543	2851548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53225	NC_017491	T	7	7	2851663	2851669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53226	NC_017491	A	6	6	2851670	2851675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53227	NC_017491	A	7	7	2851696	2851702	100 %	0 %	0 %	0 %	385836723
53228	NC_017491	GCC	2	6	2851764	2851769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836723
53229	NC_017491	ACA	2	6	2851822	2851827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836723
53230	NC_017491	TCA	2	6	2851924	2851929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836723
53231	NC_017491	TGA	2	6	2851948	2851953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836723
53232	NC_017491	TGA	2	6	2851991	2851996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836723
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53325	NC_017491	GAG	2	6	2857084	2857089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53388	NC_017491	TGCT	2	8	2859800	2859807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53389	NC_017491	CTTG	2	8	2859815	2859822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53390	NC_017491	GA	3	6	2859841	2859846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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53452	NC_017491	A	6	6	2862979	2862984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53453	NC_017491	A	6	6	2863012	2863017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53454	NC_017491	T	7	7	2863020	2863026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53455	NC_017491	ATCGG	2	10	2863107	2863116	20 %	20 %	40 %	20 %	385836736
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53464	NC_017491	AAG	2	6	2863404	2863409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836736
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