MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017491	A	6	6	235208	235213	100 %	0 %	0 %	0 %	385834176
4502	NC_017491	CGC	2	6	235215	235220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834176
4503	NC_017491	CG	3	6	235250	235255	0 %	0 %	50 %	50 %	385834176
4504	NC_017491	GGC	2	6	235258	235263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834176
4505	NC_017491	AGC	2	6	235302	235307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834176
4506	NC_017491	GCC	2	6	235331	235336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834176
4507	NC_017491	GAA	2	6	235346	235351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834176
4508	NC_017491	AATA	2	8	235478	235485	75 %	25 %	0 %	0 %	385834176
4509	NC_017491	AAC	2	6	235512	235517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834176
4510	NC_017491	T	6	6	235550	235555	0 %	100 %	0 %	0 %	385834177
4511	NC_017491	CAA	2	6	235589	235594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834177
4512	NC_017491	CAAT	2	8	235618	235625	50 %	25 %	0 %	25 %	385834177
4513	NC_017491	GCT	2	6	235670	235675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834177
4514	NC_017491	TTG	2	6	235694	235699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834177
4515	NC_017491	ATT	2	6	235706	235711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834177
4516	NC_017491	ATT	2	6	235742	235747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834177
4517	NC_017491	ACG	2	6	235756	235761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834177
4518	NC_017491	GATG	2	8	235816	235823	25 %	25 %	50 %	0 %	385834177
4519	NC_017491	ATG	3	9	235821	235829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834177
4520	NC_017491	GAA	2	6	235886	235891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834177
4521	NC_017491	TGA	2	6	235911	235916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834177
4522	NC_017491	CAA	2	6	235949	235954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834177
4523	NC_017491	TTG	2	6	235974	235979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834177
4524	NC_017491	GCT	2	6	235993	235998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834177
4525	NC_017491	AAG	2	6	236019	236024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834177
4526	NC_017491	AGCG	2	8	236045	236052	25 %	0 %	50 %	25 %	385834177
4527	NC_017491	GTT	2	6	236065	236070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834177
4528	NC_017491	ACA	2	6	236104	236109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834177
4529	NC_017491	AAG	2	6	236174	236179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834177
4530	NC_017491	GAT	2	6	236269	236274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834177
4531	NC_017491	AGA	3	9	236305	236313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834177
4532	NC_017491	ATC	2	6	236336	236341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834177
4533	NC_017491	AGAGA	2	10	236353	236362	60 %	0 %	40 %	0 %	385834177
4534	NC_017491	AGG	2	6	236364	236369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385834177
4535	NC_017491	CCAA	2	8	236397	236404	50 %	0 %	0 %	50 %	385834178
4536	NC_017491	ACA	2	6	236423	236428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834178
4537	NC_017491	GATGCT	2	12	236486	236497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385834178
4538	NC_017491	CCA	2	6	236753	236758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834178
4539	NC_017491	CGATT	2	10	236797	236806	20 %	40 %	20 %	20 %	385834178
4540	NC_017491	ATG	2	6	236931	236936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834178
4541	NC_017491	TGAT	2	8	236961	236968	25 %	50 %	25 %	0 %	385834178
4542	NC_017491	GGCT	2	8	237027	237034	0 %	25 %	50 %	25 %	385834178
4543	NC_017491	AGG	2	6	237114	237119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385834178
4544	NC_017491	GCTG	2	8	237121	237128	0 %	25 %	50 %	25 %	385834178
4545	NC_017491	CAA	2	6	237212	237217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834179
4546	NC_017491	AAG	2	6	237286	237291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834179
4547	NC_017491	ATC	2	6	237375	237380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834179
4548	NC_017491	ATG	2	6	237465	237470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834179
4549	NC_017491	GCT	2	6	237698	237703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834179
4550	NC_017491	TGG	2	6	237727	237732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834179
4551	NC_017491	AATG	2	8	237797	237804	50 %	25 %	25 %	0 %	385834179
4552	NC_017491	GGCAAG	2	12	237921	237932	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385834179
4553	NC_017491	GAA	2	6	238060	238065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834180
4554	NC_017491	ATC	2	6	238097	238102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834180
4555	NC_017491	TGA	2	6	238152	238157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834180
4556	NC_017491	A	6	6	238187	238192	100 %	0 %	0 %	0 %	385834180
4557	NC_017491	AACA	2	8	238209	238216	75 %	0 %	0 %	25 %	385834180
4558	NC_017491	CAG	2	6	238255	238260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834181
4559	NC_017491	CCA	2	6	238348	238353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834181
4560	NC_017491	A	7	7	238425	238431	100 %	0 %	0 %	0 %	385834181
4561	NC_017491	TCAT	2	8	238432	238439	25 %	50 %	0 %	25 %	385834181
4562	NC_017491	CAA	2	6	238505	238510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834181
4563	NC_017491	TGT	2	6	238550	238555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834181
4564	NC_017491	TGA	3	9	238565	238573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834181
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4566	NC_017491	CCA	2	6	238621	238626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834181
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4569	NC_017491	AAG	2	6	238717	238722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834181
4570	NC_017491	A	6	6	238747	238752	100 %	0 %	0 %	0 %	385834181
4571	NC_017491	GCA	2	6	238786	238791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834181
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4573	NC_017491	GAA	2	6	238878	238883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834181
4574	NC_017491	AAGCCG	2	12	238927	238938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834181
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4580	NC_017491	TCAT	2	8	239179	239186	25 %	50 %	0 %	25 %	385834181
4581	NC_017491	AAG	2	6	239269	239274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834181
4582	NC_017491	TGA	3	9	239378	239386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4584	NC_017491	TGC	2	6	239453	239458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834182
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4586	NC_017491	CGGC	2	8	239547	239554	0 %	0 %	50 %	50 %	385834182
4587	NC_017491	AAC	2	6	239578	239583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834182
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4590	NC_017491	GGC	2	6	239637	239642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834182
4591	NC_017491	TGA	2	6	239654	239659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834182
4592	NC_017491	CTTA	2	8	239666	239673	25 %	50 %	0 %	25 %	385834182
4593	NC_017491	AAG	2	6	239790	239795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834182
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4599	NC_017491	CGC	2	6	239994	239999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834182
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4601	NC_017491	GGC	2	6	240021	240026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834182
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4604	NC_017491	GTT	2	6	240129	240134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834182
4605	NC_017491	GCA	2	6	240158	240163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834182
4606	NC_017491	ATC	2	6	240169	240174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834182
4607	NC_017491	AAC	2	6	240227	240232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_017491	AGA	2	6	240259	240264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017491	TCT	2	6	240278	240283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_017491	T	6	6	240292	240297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017491	TGC	2	6	240301	240306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_017491	AAT	2	6	240362	240367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017491	TTTC	2	8	240469	240476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_017491	A	7	7	240506	240512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017491	GTA	2	6	240545	240550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017491	CAA	2	6	240558	240563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_017491	TGA	2	6	240634	240639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834183
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4622	NC_017491	TGA	2	6	240841	240846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834183
4623	NC_017491	TTC	2	6	240893	240898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834183
4624	NC_017491	CTG	2	6	240903	240908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834183
4625	NC_017491	TGA	2	6	240936	240941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834183
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4630	NC_017491	TGAT	2	8	241158	241165	25 %	50 %	25 %	0 %	385834183
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4644	NC_017491	T	6	6	242133	242138	0 %	100 %	0 %	0 %	385834184
4645	NC_017491	TGC	2	6	242238	242243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834184
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4647	NC_017491	CAGT	2	8	242454	242461	25 %	25 %	25 %	25 %	385834185
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4652	NC_017491	TGC	3	9	242791	242799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834185
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4676	NC_017491	ATC	2	6	244486	244491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834187
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4678	NC_017491	AAAGC	2	10	244542	244551	60 %	0 %	20 %	20 %	385834187
4679	NC_017491	TCCGG	2	10	244619	244628	0 %	20 %	40 %	40 %	385834187
4680	NC_017491	CGAAC	2	10	244715	244724	40 %	0 %	20 %	40 %	385834187
4681	NC_017491	ATG	2	6	244731	244736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834187
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4689	NC_017491	GAA	2	6	245134	245139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834187
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4692	NC_017491	GGT	2	6	245186	245191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834188
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4713	NC_017491	AAG	2	6	246342	246347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834188
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4719	NC_017491	GC	3	6	246527	246532	0 %	0 %	50 %	50 %	385834189
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4737	NC_017491	TCA	2	6	247405	247410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4741	NC_017491	GAT	2	6	247820	247825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834192
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4976	NC_017491	A	6	6	260478	260483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4982	NC_017491	GCG	2	6	260882	260887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834203
4983	NC_017491	TGA	2	6	260891	260896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834203
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