MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	TTA	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017491	GAG	2	6	150	155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017491	GTG	2	6	347	352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833939
4	NC_017491	TCA	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833939
5	NC_017491	GCATCA	2	12	430	441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385833939
6	NC_017491	CGATGA	2	12	448	459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385833939
7	NC_017491	CAA	2	6	464	469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833939
8	NC_017491	CGG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833939
9	NC_017491	TTTA	2	8	605	612	25 %	75 %	0 %	0 %	385833939
10	NC_017491	CGG	2	6	613	618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833939
11	NC_017491	AAT	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385833939
12	NC_017491	TCCA	2	8	737	744	25 %	25 %	0 %	50 %	385833939
13	NC_017491	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833939
14	NC_017491	TTC	2	6	815	820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833939
15	NC_017491	AAG	2	6	828	833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
16	NC_017491	AAG	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
17	NC_017491	TTC	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833939
18	NC_017491	GCCT	2	8	909	916	0 %	25 %	25 %	50 %	385833939
19	NC_017491	CCG	2	6	986	991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833939
20	NC_017491	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
21	NC_017491	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
22	NC_017491	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833939
23	NC_017491	GA	3	6	1347	1352	50 %	0 %	50 %	0 %	385833939
24	NC_017491	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	385833939
25	NC_017491	ACC	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833939
26	NC_017491	CTATTA	2	12	1626	1637	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017491	TATAT	2	10	1650	1659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017491	AT	4	8	1656	1663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017491	ACG	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017491	AGG	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017491	GCT	2	6	1861	1866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
32	NC_017491	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
33	NC_017491	GC	3	6	1918	1923	0 %	0 %	50 %	50 %	385833940
34	NC_017491	TTC	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833940
35	NC_017491	AAC	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833940
36	NC_017491	CGTTGC	2	12	2205	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
37	NC_017491	CAG	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
38	NC_017491	CAT	3	9	2283	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833940
39	NC_017491	TAT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833940
40	NC_017491	AGC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
41	NC_017491	CGT	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
42	NC_017491	GAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833940
43	NC_017491	CAA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833940
44	NC_017491	A	6	6	2858	2863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017491	T	6	6	2893	2898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017491	GCA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833941
47	NC_017491	ATG	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833941
48	NC_017491	ATAG	2	8	3058	3065	50 %	25 %	25 %	0 %	385833941
49	NC_017491	TCC	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017491	GCAA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017491	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017491	TAA	2	6	3198	3203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017491	TTTA	2	8	3208	3215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017491	TAAAA	2	10	3254	3263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017491	GAT	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017491	T	6	6	3339	3344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017491	TAGGC	2	10	3465	3474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017491	G	6	6	3534	3539	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017491	T	6	6	3591	3596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017491	TAAT	2	8	3613	3620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017491	TGG	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017491	CGA	3	9	3684	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833942
63	NC_017491	CAC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833942
64	NC_017491	TGAT	2	8	3756	3763	25 %	50 %	25 %	0 %	385833942
65	NC_017491	GCG	2	6	3765	3770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833942
66	NC_017491	CGT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833942
67	NC_017491	GAT	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833942
68	NC_017491	A	6	6	3924	3929	100 %	0 %	0 %	0 %	385833943
69	NC_017491	GCAAG	2	10	3999	4008	40 %	0 %	40 %	20 %	385833943
70	NC_017491	GC	3	6	4045	4050	0 %	0 %	50 %	50 %	385833943
71	NC_017491	CAA	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833943
72	NC_017491	GC	3	6	4102	4107	0 %	0 %	50 %	50 %	385833943
73	NC_017491	ATT	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833943
74	NC_017491	TCA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833943
75	NC_017491	GATCG	2	10	4189	4198	20 %	20 %	40 %	20 %	385833943
76	NC_017491	TTTG	2	8	4242	4249	0 %	75 %	25 %	0 %	385833943
77	NC_017491	CGG	2	6	4294	4299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833943
78	NC_017491	GGC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833943
79	NC_017491	TGC	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833943
80	NC_017491	TGC	3	9	4518	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833943
81	NC_017491	CAA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833943
82	NC_017491	AGC	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
83	NC_017491	GAT	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833943
84	NC_017491	CAG	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
85	NC_017491	CAC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833943
86	NC_017491	GAC	3	9	4926	4934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
87	NC_017491	ATC	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833943
88	NC_017491	GAG	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017491	AAGA	2	8	5060	5067	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
90	NC_017491	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
91	NC_017491	AAGA	2	8	5081	5088	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
92	NC_017491	GCA	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833944
93	NC_017491	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
94	NC_017491	CAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833944
95	NC_017491	TTGAAG	2	12	5265	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
96	NC_017491	GTC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
97	NC_017491	GGT	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833944
98	NC_017491	TGGCGG	2	12	5401	5412	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385833944
99	NC_017491	CGG	2	6	5425	5430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
100	NC_017491	GTT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
101	NC_017491	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
102	NC_017491	GAGCAT	2	12	5573	5584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385833944
103	NC_017491	CCGGAT	2	12	5606	5617	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385833944
104	NC_017491	TGA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
105	NC_017491	GCG	2	6	5723	5728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
106	NC_017491	GGC	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
107	NC_017491	GAA	3	9	5791	5799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
108	NC_017491	CTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
109	NC_017491	GAT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
110	NC_017491	GTT	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
111	NC_017491	AGACCA	2	12	6105	6116	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385833944
112	NC_017491	GGT	2	6	6142	6147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833944
113	NC_017491	CAA	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
114	NC_017491	ATT	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833944
115	NC_017491	GCT	2	6	6251	6256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
116	NC_017491	AAG	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
117	NC_017491	ACA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
118	NC_017491	GGC	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
119	NC_017491	GAA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
120	NC_017491	ATC	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833944
121	NC_017491	CCGATG	2	12	6588	6599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385833944
122	NC_017491	GTT	2	6	6622	6627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
123	NC_017491	ATG	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
124	NC_017491	GCC	2	6	6775	6780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833944
125	NC_017491	GCCA	2	8	6830	6837	25 %	0 %	25 %	50 %	385833944
126	NC_017491	ACC	2	6	6848	6853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833944
127	NC_017491	CGG	2	6	6953	6958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
128	NC_017491	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
129	NC_017491	TTG	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
130	NC_017491	AAC	2	6	6995	7000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
131	NC_017491	GAG	2	6	7057	7062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017491	GAT	2	6	7078	7083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
133	NC_017491	ACGT	2	8	7184	7191	25 %	25 %	25 %	25 %	385833945
134	NC_017491	ATGA	2	8	7231	7238	50 %	25 %	25 %	0 %	385833945
135	NC_017491	AAG	2	6	7267	7272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833945
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140	NC_017491	GATT	2	8	7503	7510	25 %	50 %	25 %	0 %	385833945
141	NC_017491	GTT	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833945
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143	NC_017491	CTG	2	6	7573	7578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833945
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259	NC_017491	ATT	2	6	13636	13641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833953
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398	NC_017491	GAAA	2	8	20437	20444	75 %	0 %	25 %	0 %	385833963
399	NC_017491	AGA	2	6	20473	20478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833963
400	NC_017491	T	6	6	20484	20489	0 %	100 %	0 %	0 %	385833963
401	NC_017491	TTC	2	6	20494	20499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833963
402	NC_017491	GAA	2	6	20509	20514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833963
403	NC_017491	AAG	2	6	20536	20541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833963
404	NC_017491	CAT	2	6	20544	20549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833963
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414	NC_017491	T	6	6	21249	21254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017491	TCT	2	6	21359	21364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_017491	AT	3	6	21403	21408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_017491	GGC	2	6	21429	21434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_017491	AAT	3	9	21459	21467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017491	AAC	2	6	21486	21491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_017491	CTG	2	6	21534	21539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_017491	GGGC	2	8	21553	21560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
424	NC_017491	CAA	2	6	21569	21574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_017491	TGCG	2	8	21595	21602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
426	NC_017491	TCC	2	6	21616	21621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
427	NC_017491	ATG	2	6	21639	21644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017491	CAA	2	6	21647	21652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_017491	TTG	2	6	21772	21777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017491	AC	3	6	21790	21795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
431	NC_017491	TTTG	2	8	21816	21823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017491	GGC	2	6	21860	21865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_017491	TTGT	2	8	21913	21920	0 %	75 %	25 %	0 %	385833964
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498	NC_017491	CTTT	2	8	25241	25248	0 %	75 %	0 %	25 %	385833966
499	NC_017491	GTT	2	6	25275	25280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833966
500	NC_017491	AGC	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833966

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