MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 55562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_017486	TGC	2	6	1923228	1923233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831404
44503	NC_017486	TAA	2	6	1923249	1923254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831404
44504	NC_017486	ATT	2	6	1923267	1923272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831404
44505	NC_017486	TCCC	2	8	1923280	1923287	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44506	NC_017486	ATTC	2	8	1923351	1923358	25 %	50 %	0 %	25 %	385831405
44507	NC_017486	CTTT	2	8	1923376	1923383	0 %	75 %	0 %	25 %	385831405
44508	NC_017486	TCT	2	6	1923384	1923389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831405
44509	NC_017486	ATT	2	6	1923521	1923526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831405
44510	NC_017486	TGAA	2	8	1923537	1923544	50 %	25 %	25 %	0 %	385831405
44511	NC_017486	ATGA	2	8	1923581	1923588	50 %	25 %	25 %	0 %	385831405
44512	NC_017486	A	6	6	1923692	1923697	100 %	0 %	0 %	0 %	385831405
44513	NC_017486	CATT	2	8	1923703	1923710	25 %	50 %	0 %	25 %	385831405
44514	NC_017486	GTTCCT	2	12	1923741	1923752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385831405
44515	NC_017486	ACC	2	6	1923779	1923784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385831405
44516	NC_017486	ATG	2	6	1923824	1923829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831405
44517	NC_017486	TGG	2	6	1923897	1923902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831405
44518	NC_017486	TTC	2	6	1923926	1923931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831405
44519	NC_017486	T	6	6	1923938	1923943	0 %	100 %	0 %	0 %	385831405
44520	NC_017486	TCA	2	6	1923987	1923992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831405
44521	NC_017486	TTG	2	6	1924013	1924018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831405
44522	NC_017486	CCA	2	6	1924043	1924048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44523	NC_017486	TCA	2	6	1924064	1924069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831406
44524	NC_017486	T	6	6	1924221	1924226	0 %	100 %	0 %	0 %	385831406
44525	NC_017486	GAA	2	6	1924238	1924243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831406
44526	NC_017486	TCA	2	6	1924247	1924252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831406
44527	NC_017486	TGT	2	6	1924315	1924320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831406
44528	NC_017486	TCA	2	6	1924326	1924331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831406
44529	NC_017486	TGT	2	6	1924396	1924401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831407
44530	NC_017486	ATT	2	6	1924427	1924432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831407
44531	NC_017486	ATAA	2	8	1924475	1924482	75 %	25 %	0 %	0 %	385831407
44532	NC_017486	CAATG	2	10	1924537	1924546	40 %	20 %	20 %	20 %	385831407
44533	NC_017486	TCA	3	9	1924592	1924600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831407
44534	NC_017486	TCA	2	6	1924640	1924645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831407
44535	NC_017486	T	6	6	1924735	1924740	0 %	100 %	0 %	0 %	385831407
44536	NC_017486	TCC	2	6	1924762	1924767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831408
44537	NC_017486	TCA	2	6	1924795	1924800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831408
44538	NC_017486	ATT	2	6	1924864	1924869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831408
44539	NC_017486	ATAA	2	8	1924999	1925006	75 %	25 %	0 %	0 %	385831408
44540	NC_017486	TTA	2	6	1925008	1925013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831408
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44543	NC_017486	ATT	2	6	1925124	1925129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831408
44544	NC_017486	CTT	2	6	1925249	1925254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831408
44545	NC_017486	TTC	2	6	1925304	1925309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831408
44546	NC_017486	ATA	2	6	1925349	1925354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831408
44547	NC_017486	T	6	6	1925383	1925388	0 %	100 %	0 %	0 %	385831408
44548	NC_017486	TCC	2	6	1925435	1925440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44549	NC_017486	TCT	2	6	1925492	1925497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44550	NC_017486	T	6	6	1925497	1925502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44551	NC_017486	TCC	2	6	1925605	1925610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831409
44552	NC_017486	T	6	6	1925635	1925640	0 %	100 %	0 %	0 %	385831409
44553	NC_017486	ATTTTT	2	12	1925650	1925661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385831409
44554	NC_017486	T	7	7	1925728	1925734	0 %	100 %	0 %	0 %	385831409
44555	NC_017486	CTT	2	6	1925759	1925764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831409
44556	NC_017486	TAA	2	6	1925775	1925780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831409
44557	NC_017486	T	6	6	1925964	1925969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44558	NC_017486	TCATC	2	10	1925975	1925984	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44559	NC_017486	CATG	2	8	1926015	1926022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44560	NC_017486	ATTT	2	8	1926032	1926039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44561	NC_017486	ATC	2	6	1926053	1926058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44562	NC_017486	T	6	6	1926071	1926076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44563	NC_017486	TAC	2	6	1926196	1926201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44564	NC_017486	TCT	2	6	1926213	1926218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44565	NC_017486	TTC	2	6	1926334	1926339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831410
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44567	NC_017486	TATT	2	8	1926386	1926393	25 %	75 %	0 %	0 %	385831410
44568	NC_017486	T	6	6	1926466	1926471	0 %	100 %	0 %	0 %	385831410
44569	NC_017486	T	6	6	1926544	1926549	0 %	100 %	0 %	0 %	385831411
44570	NC_017486	T	6	6	1926569	1926574	0 %	100 %	0 %	0 %	385831411
44571	NC_017486	CTC	2	6	1926602	1926607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831411
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44582	NC_017486	T	6	6	1927016	1927021	0 %	100 %	0 %	0 %	385831412
44583	NC_017486	T	6	6	1927060	1927065	0 %	100 %	0 %	0 %	385831412
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44588	NC_017486	ATT	2	6	1927263	1927268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831413
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44590	NC_017486	T	6	6	1927387	1927392	0 %	100 %	0 %	0 %	385831414
44591	NC_017486	TCA	2	6	1927399	1927404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831414
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44602	NC_017486	CT	3	6	1927772	1927777	0 %	50 %	0 %	50 %	385831414
44603	NC_017486	TTC	2	6	1927779	1927784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831414
44604	NC_017486	T	7	7	1927818	1927824	0 %	100 %	0 %	0 %	385831414
44605	NC_017486	TC	3	6	1927834	1927839	0 %	50 %	0 %	50 %	385831414
44606	NC_017486	T	6	6	1927878	1927883	0 %	100 %	0 %	0 %	385831414
44607	NC_017486	CTT	2	6	1927898	1927903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831414
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44610	NC_017486	T	6	6	1927976	1927981	0 %	100 %	0 %	0 %	385831414
44611	NC_017486	TTA	2	6	1927984	1927989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831414
44612	NC_017486	ATTT	2	8	1927994	1928001	25 %	75 %	0 %	0 %	385831414
44613	NC_017486	TTA	2	6	1928062	1928067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831414
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