MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 55562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017486	GAA	2	6	541105	541110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830114
12503	NC_017486	TTG	2	6	541112	541117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385830114
12504	NC_017486	CGT	2	6	541135	541140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385830114
12505	NC_017486	AGC	2	6	541164	541169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385830114
12506	NC_017486	TTGA	2	8	541222	541229	25 %	50 %	25 %	0 %	385830114
12507	NC_017486	TGG	2	6	541230	541235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385830114
12508	NC_017486	CGT	2	6	541261	541266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385830114
12509	NC_017486	TGG	2	6	541317	541322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385830114
12510	NC_017486	ATG	2	6	541351	541356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385830114
12511	NC_017486	TGG	2	6	541359	541364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385830114
12512	NC_017486	AAG	2	6	541370	541375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830114
12513	NC_017486	CTC	2	6	541421	541426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385830114
12514	NC_017486	TG	3	6	541441	541446	0 %	50 %	50 %	0 %	385830114
12515	NC_017486	ATTG	2	8	541521	541528	25 %	50 %	25 %	0 %	385830114
12516	NC_017486	TTG	2	6	541543	541548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385830114
12517	NC_017486	GAA	2	6	541594	541599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830114
12518	NC_017486	AAG	2	6	541643	541648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830114
12519	NC_017486	GAT	2	6	541663	541668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385830114
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12521	NC_017486	AGCA	2	8	541833	541840	50 %	0 %	25 %	25 %	385830114
12522	NC_017486	A	6	6	541879	541884	100 %	0 %	0 %	0 %	385830114
12523	NC_017486	A	6	6	541895	541900	100 %	0 %	0 %	0 %	385830114
12524	NC_017486	GAA	2	6	541972	541977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830114
12525	NC_017486	TCC	2	6	542048	542053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385830114
12526	NC_017486	CTTG	2	8	542100	542107	0 %	50 %	25 %	25 %	385830114
12527	NC_017486	ACT	2	6	542111	542116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830114
12528	NC_017486	AAG	2	6	542141	542146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830114
12529	NC_017486	AATTCC	2	12	542184	542195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830114
12530	NC_017486	CTA	2	6	542217	542222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830114
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12532	NC_017486	TAAT	2	8	542362	542369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017486	T	7	7	542391	542397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_017486	T	6	6	542428	542433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_017486	A	6	6	542437	542442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_017486	ATT	2	6	542481	542486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_017486	TAA	2	6	542559	542564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385830115
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12539	NC_017486	CCAAGG	2	12	542652	542663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385830115
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12542	NC_017486	ATTA	2	8	542730	542737	50 %	50 %	0 %	0 %	385830115
12543	NC_017486	TG	3	6	542751	542756	0 %	50 %	50 %	0 %	385830115
12544	NC_017486	ATA	2	6	542774	542779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385830115
12545	NC_017486	T	6	6	542795	542800	0 %	100 %	0 %	0 %	385830115
12546	NC_017486	ATT	2	6	542802	542807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385830115
12547	NC_017486	ATT	2	6	542839	542844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385830115
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12555	NC_017486	GGCTT	2	10	543339	543348	0 %	40 %	40 %	20 %	385830115
12556	NC_017486	T	6	6	543388	543393	0 %	100 %	0 %	0 %	385830115
12557	NC_017486	TCCT	2	8	543398	543405	0 %	50 %	0 %	50 %	385830115
12558	NC_017486	T	6	6	543419	543424	0 %	100 %	0 %	0 %	385830115
12559	NC_017486	GGC	2	6	543444	543449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385830115
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12562	NC_017486	T	6	6	543536	543541	0 %	100 %	0 %	0 %	385830115
12563	NC_017486	TA	3	6	543566	543571	50 %	50 %	0 %	0 %	385830115
12564	NC_017486	TTG	2	6	543614	543619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385830115
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12582	NC_017486	ACGA	2	8	544508	544515	50 %	0 %	25 %	25 %	385830115
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12587	NC_017486	TAT	2	6	544608	544613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_017486	AT	3	6	544612	544617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_017486	AAAT	3	12	544629	544640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12591	NC_017486	TAA	2	6	544687	544692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_017486	A	6	6	544700	544705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_017486	TTTTA	2	10	544720	544729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_017486	GAA	2	6	544746	544751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_017486	GAG	2	6	544756	544761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017486	TAA	2	6	544802	544807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385830116
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12599	NC_017486	CAT	2	6	545022	545027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830116
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12605	NC_017486	TGGT	2	8	545272	545279	0 %	50 %	50 %	0 %	385830116
12606	NC_017486	GATT	2	8	545332	545339	25 %	50 %	25 %	0 %	385830116
12607	NC_017486	TTCTT	2	10	545342	545351	0 %	80 %	0 %	20 %	385830116
12608	NC_017486	TAT	2	6	545543	545548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385830116
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12610	NC_017486	CTTT	2	8	545617	545624	0 %	75 %	0 %	25 %	385830116
12611	NC_017486	ATA	2	6	545638	545643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385830116
12612	NC_017486	TTAT	2	8	545647	545654	25 %	75 %	0 %	0 %	385830116
12613	NC_017486	TTATC	2	10	545659	545668	20 %	60 %	0 %	20 %	385830116
12614	NC_017486	GGC	2	6	545675	545680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385830116
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12617	NC_017486	TTTGT	2	10	545844	545853	0 %	80 %	20 %	0 %	385830116
12618	NC_017486	TGA	2	6	545914	545919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385830116
12619	NC_017486	CAA	2	6	545920	545925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385830116
12620	NC_017486	ATTGCA	2	12	545967	545978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385830116
12621	NC_017486	ATT	2	6	545979	545984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385830116
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